MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum brasilense Sp245 plasmid AZOBR_p1

Total Repeats: 33088

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
33001	NC_016594	CGC	2	6	1760689	1760694	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378900
33002	NC_016594	CGG	2	6	1760715	1760720	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378900
33003	NC_016594	CAG	2	6	1760776	1760781	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378900
33004	NC_016594	CGT	2	6	1760802	1760807	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378900
33005	NC_016594	GCG	2	6	1760822	1760827	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378900
33006	NC_016594	TTG	3	9	1760831	1760839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392378900
33007	NC_016594	TCC	2	6	1760957	1760962	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	392378900
33008	NC_016594	CTG	2	6	1760992	1760997	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378900
33009	NC_016594	GCG	2	6	1761059	1761064	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378900
33010	NC_016594	GCC	2	6	1761082	1761087	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378900
33011	NC_016594	GTG	2	6	1761116	1761121	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392378900
33012	NC_016594	CAG	2	6	1761133	1761138	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378900
33013	NC_016594	GGC	2	6	1761229	1761234	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378900
33014	NC_016594	TGC	2	6	1761338	1761343	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378900
33015	NC_016594	ACC	2	6	1761401	1761406	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392378900
33016	NC_016594	GCC	2	6	1761427	1761432	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378900
33017	NC_016594	TTG	2	6	1761449	1761454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	392378900
33018	NC_016594	GCC	2	6	1761463	1761468	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378900
33019	NC_016594	GTG	2	6	1761479	1761484	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392378900
33020	NC_016594	GTC	2	6	1761526	1761531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378900
33021	NC_016594	CAC	3	9	1761559	1761567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392378900
33022	NC_016594	CCA	2	6	1761651	1761656	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392378900
33023	NC_016594	GTC	2	6	1761673	1761678	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378900
33024	NC_016594	GCC	2	6	1761682	1761687	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378900
33025	NC_016594	CGG	2	6	1761707	1761712	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378900
33026	NC_016594	GGC	2	6	1761972	1761977	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378901
33027	NC_016594	CGG	2	6	1762003	1762008	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378901
33028	NC_016594	CGG	2	6	1762034	1762039	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378901
33029	NC_016594	GCT	2	6	1762043	1762048	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378901
33030	NC_016594	CGA	2	6	1762157	1762162	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378901
33031	NC_016594	GCT	2	6	1762168	1762173	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378901
33032	NC_016594	GCG	2	6	1762232	1762237	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378901
33033	NC_016594	CGC	2	6	1762308	1762313	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378901
33034	NC_016594	CCG	2	6	1762326	1762331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378901
33035	NC_016594	CTT	2	6	1762452	1762457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392378902
33036	NC_016594	CAT	2	6	1762490	1762495	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392378902
33037	NC_016594	CGC	2	6	1762540	1762545	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378903
33038	NC_016594	CGT	2	6	1762591	1762596	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378903
33039	NC_016594	GCT	2	6	1762636	1762641	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378903
33040	NC_016594	ACC	2	6	1762650	1762655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392378903
33041	NC_016594	CGG	2	6	1762674	1762679	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378903
33042	NC_016594	CCG	2	6	1762723	1762728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378903
33043	NC_016594	ACC	2	6	1762749	1762754	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392378903
33044	NC_016594	ACG	2	6	1763097	1763102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378904
33045	NC_016594	CCG	2	6	1763190	1763195	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378904
33046	NC_016594	GAG	2	6	1763200	1763205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392378904
33047	NC_016594	CGG	2	6	1763238	1763243	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378904
33048	NC_016594	ACG	3	9	1763309	1763317	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378904
33049	NC_016594	TCA	2	6	1763318	1763323	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	392378904
33050	NC_016594	GAA	2	6	1763454	1763459	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392378904
33051	NC_016594	CGG	2	6	1763466	1763471	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378904
33052	NC_016594	TCG	2	6	1763480	1763485	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378904
33053	NC_016594	ACA	2	6	1763531	1763536	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392378904
33054	NC_016594	GAT	2	6	1763539	1763544	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392378904
33055	NC_016594	GCG	2	6	1763564	1763569	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378904
33056	NC_016594	GGC	2	6	1763613	1763618	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378904
33057	NC_016594	AAC	2	6	1763653	1763658	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	392378904
33058	NC_016594	CGG	2	6	1763693	1763698	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378904
33059	NC_016594	GCC	2	6	1763779	1763784	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378904
33060	NC_016594	AGG	3	9	1763894	1763902	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392378904
33061	NC_016594	CTG	2	6	1763953	1763958	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378904
33062	NC_016594	GTG	2	6	1764016	1764021	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392378904
33063	NC_016594	GCA	2	6	1764042	1764047	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378904
33064	NC_016594	CGG	2	6	1764065	1764070	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378904
33065	NC_016594	GAC	2	6	1764101	1764106	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378904
33066	NC_016594	CCA	2	6	1764215	1764220	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	392378905
33067	NC_016594	CGA	2	6	1764333	1764338	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378905
33068	NC_016594	CGC	2	6	1764474	1764479	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378905
33069	NC_016594	GGT	2	6	1764486	1764491	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	392378905
33070	NC_016594	TTC	2	6	1764583	1764588	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	392378905
33071	NC_016594	GAA	2	6	1764600	1764605	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392378905
33072	NC_016594	TCG	2	6	1764827	1764832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378905
33073	NC_016594	GCC	2	6	1764886	1764891	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378905
33074	NC_016594	CGG	2	6	1764909	1764914	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378905
33075	NC_016594	GCC	3	9	1764955	1764963	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378905
33076	NC_016594	CGC	2	6	1764969	1764974	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378905
33077	NC_016594	GCA	2	6	1764975	1764980	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	392378905
33078	NC_016594	GTC	2	6	1765027	1765032	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378905
33079	NC_016594	TGA	2	6	1765064	1765069	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392378905
33080	NC_016594	CCG	2	6	1765188	1765193	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378905
33081	NC_016594	CGC	3	9	1765248	1765256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	392378905
33082	NC_016594	CTG	2	6	1765261	1765266	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	392378905
33083	NC_016594	AAG	2	6	1765348	1765353	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392378905
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33085	NC_016594	TGA	2	6	1765421	1765426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	392378905
33086	NC_016594	GCG	2	6	1765549	1765554	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	392378905
33087	NC_016594	AAG	2	6	1765555	1765560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	392378905
33088	NC_016594	AGG	2	6	1765578	1765583	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	392378905

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.