MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_3p

Total Repeats: 73

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016592	AAGA	2	8	5309	5316	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016592	TGCG	2	8	11931	11938	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016592	AATC	2	8	12016	12023	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016592	GCCT	2	8	17421	17428	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016592	AAGA	2	8	17487	17494	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016592	GATA	2	8	18266	18273	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016592	TAAG	2	8	18606	18613	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016592	GCTG	2	8	18675	18682	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016592	CAAT	2	8	18707	18714	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016592	CAGC	2	8	20255	20262	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016592	CAGT	2	8	20302	20309	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016592	GCAG	2	8	21905	21912	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016592	GATT	2	8	22006	22013	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016592	GAGC	2	8	22188	22195	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016592	TTGC	2	8	22261	22268	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016592	AACG	2	8	24555	24562	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016592	CGGG	2	8	27598	27605	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016592	ACGA	2	8	28191	28198	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
19	NC_016592	TTCT	2	8	28716	28723	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016592	AAAC	2	8	34826	34833	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016592	TTGC	2	8	34911	34918	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016592	GGAC	2	8	47893	47900	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016592	CATC	2	8	47991	47998	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016592	AGCA	2	8	48055	48062	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016592	ATAC	2	8	48063	48070	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016592	GGCA	2	8	48118	48125	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016592	TCGC	2	8	49525	49532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016592	CGTG	2	8	50085	50092	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016592	CATG	2	8	50094	50101	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016592	GCGA	2	8	50252	50259	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016592	CGAC	2	8	50463	50470	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016592	TCCT	2	8	50854	50861	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016592	ATGA	2	8	51275	51282	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016592	GATC	2	8	51496	51503	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016592	CAAG	2	8	51718	51725	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016592	CATC	2	8	52009	52016	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016592	TCGA	2	8	52086	52093	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016592	CTTC	2	8	52868	52875	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016592	CTGC	2	8	53060	53067	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016592	CCCA	2	8	53326	53333	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
41	NC_016592	TCGC	2	8	53493	53500	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016592	ACGC	2	8	53694	53701	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016592	CGAC	2	8	58197	58204	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016592	CGGA	2	8	62102	62109	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016592	CGAT	2	8	62507	62514	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016592	TCGA	2	8	65486	65493	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016592	GACA	2	8	65680	65687	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016592	TGGG	2	8	65839	65846	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016592	CGGC	2	8	71021	71028	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016592	GAGG	2	8	74765	74772	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016592	TGCC	2	8	74866	74873	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016592	CGAG	2	8	80885	80892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016592	TAGT	2	8	82550	82557	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016592	AGCA	2	8	86032	86039	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016592	CAGA	2	8	86469	86476	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016592	CAAA	2	8	87550	87557	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016592	CAGC	2	8	92007	92014	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016592	CCGG	2	8	92082	92089	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016592	GAAA	2	8	98853	98860	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016592	CTTC	2	8	106182	106189	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016592	GACT	2	8	106248	106255	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016592	ATCT	2	8	108089	108096	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016592	GCTT	2	8	108193	108200	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016592	ATCT	2	8	108503	108510	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016592	GCTC	2	8	109565	109572	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016592	ACCA	2	8	111977	111984	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016592	ATCA	2	8	112690	112697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016592	CCCG	2	8	112826	112833	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
69	NC_016592	AGCG	2	8	113125	113132	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016592	CGCT	2	8	113640	113647	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016592	ACCG	2	8	113841	113848	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016592	CCGC	2	8	114515	114522	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
73	NC_016592	GCAG	2	8	114939	114946	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.