MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_3p

Total Repeats: 332

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016592	CAT	2	6	1203	1208	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016592	ACG	2	6	1532	1537	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016592	CGA	2	6	13058	13063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016592	TCG	2	6	13089	13094	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016592	CAA	2	6	13106	13111	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016592	GCT	2	6	13265	13270	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016592	TAT	2	6	13284	13289	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016592	ACA	2	6	13303	13308	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016592	CCG	2	6	16526	16531	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
10	NC_016592	CGC	2	6	16637	16642	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016592	CGA	2	6	16686	16691	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016592	TTC	2	6	16787	16792	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016592	GCT	2	6	16808	16813	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016592	GAG	2	6	16841	16846	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016592	TCT	2	6	16870	16875	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016592	GTC	2	6	17391	17396	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016592	GCC	2	6	17401	17406	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016592	ACG	2	6	17468	17473	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016592	AAT	2	6	17479	17484	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016592	GCC	2	6	18311	18316	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016592	GTT	2	6	18369	18374	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016592	CGG	2	6	18430	18435	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016592	CGT	3	9	18597	18605	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016592	CAA	2	6	18655	18660	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016592	GAA	2	6	18811	18816	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016592	CGC	2	6	19778	19783	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
27	NC_016592	CGA	2	6	19819	19824	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016592	CGA	2	6	19983	19988	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016592	GAG	2	6	20030	20035	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016592	GTC	2	6	20083	20088	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016592	TTC	2	6	20089	20094	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016592	CGC	2	6	21713	21718	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016592	CGA	2	6	21777	21782	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016592	GCG	2	6	21817	21822	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016592	CGA	2	6	21866	21871	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016592	AGG	2	6	21898	21903	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016592	CAT	2	6	22021	22026	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016592	CTG	2	6	22144	22149	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016592	TGC	2	6	22182	22187	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016592	TCA	2	6	22215	22220	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016592	GTT	2	6	22249	22254	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016592	TGC	2	6	22367	22372	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016592	GAT	2	6	22838	22843	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016592	GTG	2	6	22853	22858	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016592	TCA	2	6	22987	22992	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016592	GCG	2	6	23240	23245	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016592	AGT	2	6	23952	23957	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016592	CGT	2	6	24531	24536	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016592	ACA	2	6	24565	24570	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016592	CGT	2	6	26916	26921	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016592	CGA	2	6	26995	27000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016592	AGG	2	6	27078	27083	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016592	GCC	2	6	27098	27103	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016592	GCG	2	6	27460	27465	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016592	GGC	2	6	27516	27521	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016592	CTC	2	6	27527	27532	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_016592	GTG	2	6	27553	27558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016592	AGC	2	6	27586	27591	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016592	GGA	2	6	27609	27614	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016592	TGA	2	6	27651	27656	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016592	GGC	2	6	28050	28055	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_016592	CCG	2	6	28065	28070	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016592	GAA	2	6	28097	28102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016592	TTG	2	6	28154	28159	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016592	CGA	2	6	28307	28312	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016592	GCT	2	6	28730	28735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
67	NC_016592	GTC	2	6	28760	28765	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016592	AGC	2	6	28767	28772	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016592	CCG	2	6	30187	30192	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016592	TCA	2	6	32023	32028	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016592	CCG	2	6	32826	32831	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016592	CTG	2	6	32856	32861	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
73	NC_016592	CTT	2	6	32877	32882	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016592	GTG	2	6	34871	34876	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016592	GCC	2	6	35041	35046	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016592	ACG	2	6	35206	35211	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016592	GCC	2	6	35239	35244	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
78	NC_016592	GCC	2	6	35251	35256	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
79	NC_016592	TCA	2	6	35279	35284	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016592	AGC	2	6	35285	35290	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016592	CGA	2	6	35318	35323	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016592	CGA	2	6	35341	35346	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016592	CGA	2	6	35383	35388	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016592	CCG	2	6	35415	35420	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
85	NC_016592	GGC	2	6	45060	45065	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016592	TCG	3	9	45073	45081	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016592	GGC	2	6	46988	46993	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016592	CGG	2	6	47912	47917	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016592	CGT	2	6	47970	47975	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016592	GGC	2	6	48009	48014	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016592	ACA	2	6	48074	48079	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016592	GCA	2	6	48095	48100	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
93	NC_016592	ACG	2	6	48134	48139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016592	GAA	2	6	49402	49407	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016592	CTT	2	6	49438	49443	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016592	CAC	2	6	49507	49512	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016592	ATT	2	6	49597	49602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016592	GCG	2	6	49622	49627	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016592	CGC	2	6	49723	49728	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016592	GCC	2	6	49774	49779	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_016592	CGG	2	6	49806	49811	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016592	GCT	2	6	49827	49832	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016592	CGC	2	6	49900	49905	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
104	NC_016592	TCT	2	6	49919	49924	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_016592	GCG	2	6	49929	49934	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016592	CAG	2	6	50008	50013	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016592	GCC	2	6	50037	50042	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016592	GCA	2	6	50127	50132	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016592	CGA	2	6	50209	50214	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016592	CTC	2	6	50217	50222	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
111	NC_016592	CAG	2	6	50245	50250	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016592	CGG	2	6	50268	50273	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016592	GCG	2	6	50349	50354	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016592	CGG	2	6	50377	50382	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_016592	CGA	2	6	50436	50441	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
116	NC_016592	CGC	2	6	50443	50448	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
117	NC_016592	CGC	2	6	50477	50482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
118	NC_016592	GCC	2	6	50492	50497	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
119	NC_016592	GCC	2	6	50507	50512	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
120	NC_016592	GCC	2	6	50541	50546	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
121	NC_016592	GGC	2	6	50710	50715	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_016592	ATC	2	6	50734	50739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016592	GAC	2	6	50869	50874	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016592	GTC	2	6	50930	50935	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016592	CTT	2	6	50938	50943	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
126	NC_016592	TCG	2	6	50958	50963	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016592	TTC	2	6	50966	50971	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016592	TCC	2	6	51057	51062	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016592	CAG	2	6	51098	51103	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016592	GCT	2	6	51127	51132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016592	GTC	2	6	51197	51202	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
132	NC_016592	CGG	2	6	51295	51300	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016592	CGG	2	6	51406	51411	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_016592	TAA	2	6	51415	51420	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016592	TCG	2	6	51567	51572	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
136	NC_016592	GAA	2	6	51727	51732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016592	CTT	2	6	51992	51997	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016592	TTC	2	6	52028	52033	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
139	NC_016592	ACA	2	6	52063	52068	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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278	NC_016592	GGA	2	6	109596	109601	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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280	NC_016592	CTA	2	6	111993	111998	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.