MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p

Total Repeats: 38

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016591	CAAGC	2	10	27893	27902	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016591	TTTTG	2	10	38901	38910	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016591	GTTTC	2	10	52164	52173	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016591	GGGCG	2	10	70082	70091	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016591	CTGGG	2	10	70263	70272	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016591	CATTT	2	10	83454	83463	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016591	TGGCA	2	10	85758	85767	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016591	CAATG	2	10	86109	86118	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016591	CCGCA	2	10	94251	94260	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016591	TCGCG	2	10	94473	94482	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016591	CGACC	2	10	94696	94705	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_016591	GGAGA	2	10	98027	98036	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016591	CAGTG	2	10	112132	112141	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016591	CTTTT	2	10	133241	133250	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016591	CTGTT	2	10	137433	137442	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016591	TGCGC	2	10	147408	147417	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016591	CGAAA	2	10	148692	148701	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016591	GGGGT	2	10	166311	166320	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016591	GGTGA	2	10	167412	167421	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016591	AGTCA	2	10	177733	177742	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016591	TTTTC	2	10	183367	183376	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016591	TTTTC	2	10	191488	191497	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016591	CGGCG	2	10	194409	194418	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016591	ATGGC	2	10	195427	195436	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016591	CTTCG	2	10	222255	222264	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016591	AGGTG	2	10	231211	231220	20 %	20 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016591	CAGGG	2	10	247574	247583	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016591	TTTTC	2	10	262779	262788	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016591	TTTGA	2	10	299633	299642	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016591	AGGCT	2	10	299703	299712	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016591	GTGAT	2	10	302422	302431	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016591	CTTTT	2	10	325620	325629	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
33	NC_016591	CGAGT	2	10	329212	329221	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
34	NC_016591	TCGAA	2	10	333233	333242	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016591	TGCGC	2	10	350773	350782	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016591	CGAAT	2	10	353644	353653	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
37	NC_016591	GCAAT	2	10	355113	355122	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016591	ATTTT	2	10	355311	355320	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.