MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Burkholderia sp. YI23 plasmid byi_2p

Total Repeats: 180

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016591	GCTG	2	8	359	366	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016591	CCCA	2	8	727	734	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016591	GCCC	2	8	765	772	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
4	NC_016591	CGGC	2	8	1418	1425	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016591	AGAA	2	8	2909	2916	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016591	TTTC	2	8	3009	3016	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016591	CGGC	2	8	3730	3737	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016591	CCAG	2	8	9211	9218	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016591	CGCT	2	8	11104	11111	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016591	GTTC	2	8	11130	11137	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016591	TCGG	2	8	12225	12232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016591	GCAG	2	8	12579	12586	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016591	CGCC	2	8	15187	15194	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
14	NC_016591	TCAA	2	8	15328	15335	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016591	CTTG	2	8	15338	15345	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016591	GCGG	2	8	17541	17548	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016591	GCTC	2	8	21152	21159	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016591	TAAT	2	8	24979	24986	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016591	TGAC	2	8	27710	27717	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016591	TGTC	2	8	28467	28474	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016591	TCGA	2	8	28614	28621	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016591	ACGA	2	8	32198	32205	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016591	CTTC	2	8	38877	38884	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016591	CCTT	2	8	38971	38978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016591	TTTC	2	8	40748	40755	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016591	TATT	2	8	42544	42551	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016591	CCGC	2	8	43706	43713	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_016591	CCCT	2	8	43788	43795	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
29	NC_016591	CATC	2	8	48711	48718	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016591	GCCT	2	8	49362	49369	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016591	TTCC	2	8	51698	51705	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016591	TACG	2	8	51743	51750	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016591	GTAT	2	8	51800	51807	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016591	CGGC	2	8	51851	51858	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016591	GCTT	2	8	52179	52186	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016591	TCTG	2	8	52410	52417	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016591	GAAA	2	8	53214	53221	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016591	GACC	2	8	55368	55375	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016591	GGAT	2	8	55393	55400	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016591	TCGA	2	8	56230	56237	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016591	CAAA	2	8	56599	56606	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
42	NC_016591	TTGA	2	8	57100	57107	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016591	GTAT	2	8	59008	59015	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016591	AGGA	2	8	59081	59088	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016591	AGAA	2	8	64293	64300	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016591	ATCG	2	8	65543	65550	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016591	GCGG	2	8	70060	70067	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016591	TGGA	2	8	70518	70525	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016591	GTAT	2	8	71859	71866	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016591	AACC	2	8	74581	74588	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016591	TCTG	2	8	74721	74728	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016591	CGGC	2	8	74815	74822	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016591	CAAC	2	8	74877	74884	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016591	CTTT	2	8	76350	76357	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016591	GAAT	2	8	82389	82396	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016591	CGCA	2	8	82581	82588	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016591	AGGA	2	8	83870	83877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016591	CGGC	2	8	85309	85316	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016591	TTTC	2	8	91223	91230	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016591	TTTG	2	8	91388	91395	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016591	TATG	2	8	94321	94328	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016591	GCTG	2	8	94513	94520	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016591	AATG	2	8	113747	113754	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016591	ACGG	2	8	117441	117448	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016591	TCCA	2	8	118776	118783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016591	TTGC	2	8	121310	121317	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016591	CAGC	2	8	124331	124338	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016591	CTGC	2	8	124842	124849	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016591	GATC	2	8	126336	126343	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016591	ATTC	2	8	126554	126561	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016591	CGAA	2	8	126645	126652	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016591	GCGA	2	8	127866	127873	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016591	CGAA	2	8	128097	128104	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016591	CCGT	2	8	129188	129195	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016591	CTCG	2	8	133253	133260	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016591	CTTG	2	8	133266	133273	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016591	GCTG	2	8	136607	136614	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016591	GCGA	2	8	137621	137628	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016591	AGAT	2	8	137685	137692	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016591	CGCA	2	8	137768	137775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016591	CCCG	2	8	140740	140747	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
82	NC_016591	CAGC	2	8	142780	142787	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016591	AGAA	2	8	144605	144612	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016591	CTCG	2	8	145201	145208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016591	GTTT	2	8	145711	145718	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016591	AACG	2	8	148572	148579	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016591	CGGG	2	8	153769	153776	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016591	CGTC	2	8	155936	155943	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016591	CGTG	2	8	158351	158358	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016591	CATC	2	8	160717	160724	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016591	TTGA	2	8	162492	162499	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016591	TTGG	2	8	166225	166232	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016591	GCGT	2	8	170914	170921	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016591	GGGC	2	8	174099	174106	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016591	GTTT	2	8	176431	176438	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016591	CGCT	2	8	178742	178749	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016591	CCAA	2	8	179305	179312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016591	TCGC	2	8	179437	179444	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016591	TCAA	2	8	179645	179652	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016591	AGCC	2	8	181956	181963	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016591	CGGA	2	8	183100	183107	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016591	CTTA	2	8	186731	186738	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_016591	ATCA	2	8	190531	190538	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016591	GGCA	2	8	191324	191331	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016591	TGGT	2	8	192525	192532	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016591	ACGT	2	8	193206	193213	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016591	TACG	2	8	194770	194777	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016591	CGAC	2	8	195312	195319	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016591	GTTC	3	12	195369	195380	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016591	TCTG	2	8	195382	195389	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016591	CACG	2	8	195613	195620	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016591	ACCC	2	8	195651	195658	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_016591	ACCA	2	8	196522	196529	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016591	AGCA	2	8	201457	201464	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016591	ATTG	2	8	201713	201720	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016591	GCCG	2	8	210044	210051	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016591	GGCA	2	8	214512	214519	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016591	GGCA	2	8	220956	220963	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016591	GAAG	2	8	224359	224366	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016591	TCGC	2	8	231145	231152	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016591	GGGC	2	8	231337	231344	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016591	CGGG	2	8	232117	232124	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016591	CCCG	2	8	232185	232192	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
124	NC_016591	CCGG	2	8	241968	241975	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016591	ATGT	2	8	244225	244232	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016591	AAAG	2	8	248831	248838	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016591	GCAC	2	8	249392	249399	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016591	GACG	2	8	249400	249407	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016591	ATCA	2	8	251084	251091	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016591	ATAC	2	8	251097	251104	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016591	GGTT	2	8	260042	260049	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016591	GCCA	2	8	261428	261435	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016591	ACCC	2	8	262744	262751	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
134	NC_016591	GTCA	2	8	262765	262772	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016591	ACCT	2	8	264720	264727	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016591	TATT	2	8	264947	264954	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016591	CCTT	2	8	271918	271925	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016591	CAAA	2	8	281632	281639	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016591	GCCC	2	8	285469	285476	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
140	NC_016591	GCCC	2	8	288084	288091	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
141	NC_016591	TCGT	2	8	289318	289325	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016591	GCGG	2	8	299376	299383	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016591	TCAA	2	8	299424	299431	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
144	NC_016591	TGAG	2	8	302372	302379	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016591	ATCC	2	8	303593	303600	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016591	CATC	2	8	303823	303830	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016591	TATT	2	8	303833	303840	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016591	ACGA	2	8	303872	303879	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016591	TCGC	2	8	311041	311048	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016591	ATCG	2	8	314978	314985	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016591	ACTG	2	8	315219	315226	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
152	NC_016591	GTCT	2	8	316168	316175	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016591	GGCC	2	8	319399	319406	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016591	AAAG	2	8	326308	326315	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
155	NC_016591	CGGG	2	8	326327	326334	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
156	NC_016591	AGCA	2	8	326801	326808	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
157	NC_016591	GAGT	2	8	327349	327356	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
158	NC_016591	AAAG	2	8	327621	327628	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016591	CAAC	2	8	327680	327687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
160	NC_016591	AGTT	2	8	329142	329149	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
161	NC_016591	TCAA	2	8	329900	329907	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
162	NC_016591	ACAT	2	8	331746	331753	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
163	NC_016591	CGTC	2	8	333158	333165	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
164	NC_016591	CGGC	2	8	333347	333354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
165	NC_016591	CGTC	2	8	333764	333771	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
166	NC_016591	CTCG	2	8	333820	333827	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
167	NC_016591	TTCG	2	8	333977	333984	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
168	NC_016591	CATC	2	8	338611	338618	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
169	NC_016591	AATT	2	8	339787	339794	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
170	NC_016591	TCGC	2	8	341649	341656	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
171	NC_016591	GTCA	2	8	341657	341664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
172	NC_016591	GCCG	2	8	341893	341900	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
173	NC_016591	GCTT	2	8	342098	342105	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
174	NC_016591	GCCT	2	8	344895	344902	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
175	NC_016591	CCTG	2	8	347643	347650	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
176	NC_016591	TGCG	2	8	350844	350851	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
177	NC_016591	TCTT	2	8	352570	352577	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
178	NC_016591	CGAC	2	8	353399	353406	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
179	NC_016591	TGCT	2	8	353521	353528	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
180	NC_016591	GGCG	2	8	353722	353729	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.