MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p6

Total Repeats: 41

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016588	GCAAG	2	10	356	365	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
2	NC_016588	CGGGG	2	10	548	557	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016588	GCGGG	2	10	4238	4247	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016588	TTCGG	2	10	23903	23912	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016588	CCGCC	2	10	35047	35056	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
6	NC_016588	AGGAA	2	10	37423	37432	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016588	GCCCC	2	10	63819	63828	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
8	NC_016588	CGCGG	2	10	68703	68712	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
9	NC_016588	TCATC	2	10	95087	95096	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016588	TGCAA	2	10	95151	95160	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016588	CGAGG	2	10	95332	95341	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
12	NC_016588	CAGCG	2	10	97984	97993	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016588	GGCAT	2	10	98548	98557	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
14	NC_016588	GACGG	2	10	113949	113958	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016588	GTCCT	2	10	125695	125704	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016588	GCCTG	2	10	129365	129374	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016588	GAAGG	2	10	159764	159773	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016588	ATGGT	2	10	164549	164558	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016588	TCGTG	2	10	166871	166880	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016588	TCGCG	2	10	166935	166944	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016588	CACCG	2	10	168551	168560	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
22	NC_016588	CGGGC	2	10	174036	174045	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016588	TTGCC	2	10	177930	177939	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016588	GGAGG	2	10	179473	179482	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016588	CCGGG	2	10	188790	188799	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
26	NC_016588	TCCGT	2	10	191124	191133	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016588	CAGGC	2	10	219437	219446	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
28	NC_016588	GGCAG	2	10	219447	219456	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016588	GGCCC	2	10	225658	225667	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
30	NC_016588	CCGTT	2	10	228163	228172	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016588	GTCCG	2	10	237512	237521	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016588	CTCCC	2	10	242513	242522	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
33	NC_016588	GCCCG	2	10	244015	244024	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
34	NC_016588	CCATG	2	10	252376	252385	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
35	NC_016588	CCGGT	2	10	253271	253280	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016588	AGGAG	2	10	268206	268215	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016588	TGAAG	2	10	269180	269189	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016588	ATAAG	2	10	275463	275472	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016588	CTTCC	2	10	284129	284138	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
40	NC_016588	AAGGG	2	10	292929	292938	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016588	CCAGC	2	10	295072	295081	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.