MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p6

Total Repeats: 215

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016588	TCTGG	2	10	2859	2868	0 %	40 %	40 %	20 %	374999499
2	NC_016588	CCCGA	2	10	2893	2902	20 %	0 %	20 %	60 %	374999499
3	NC_016588	CCGGC	2	10	3034	3043	0 %	0 %	40 %	60 %	374999499
4	NC_016588	GGCGA	2	10	3722	3731	20 %	0 %	60 %	20 %	374999500
5	NC_016588	GGCTG	2	10	5378	5387	0 %	20 %	60 %	20 %	374999501
6	NC_016588	CGGCC	2	10	5520	5529	0 %	0 %	40 %	60 %	374999501
7	NC_016588	GGGCG	2	10	5695	5704	0 %	0 %	80 %	20 %	374999501
8	NC_016588	GCCGG	2	10	7474	7483	0 %	0 %	60 %	40 %	374999503
9	NC_016588	GAGCG	2	10	7497	7506	20 %	0 %	60 %	20 %	374999503
10	NC_016588	CGAAG	2	10	7750	7759	40 %	0 %	40 %	20 %	374999504
11	NC_016588	TCCGG	2	10	9631	9640	0 %	20 %	40 %	40 %	374999506
12	NC_016588	TGGCG	2	10	10618	10627	0 %	20 %	60 %	20 %	374999506
13	NC_016588	CAGCA	2	10	11928	11937	40 %	0 %	20 %	40 %	374999507
14	NC_016588	TGGCC	2	10	12242	12251	0 %	20 %	40 %	40 %	374999507
15	NC_016588	CCGCC	2	10	13297	13306	0 %	0 %	20 %	80 %	374999507
16	NC_016588	GAAGC	2	10	15451	15460	40 %	0 %	40 %	20 %	374999509
17	NC_016588	GCTCT	2	10	15809	15818	0 %	40 %	20 %	40 %	374999509
18	NC_016588	CCCGT	2	10	17137	17146	0 %	20 %	20 %	60 %	374999510
19	NC_016588	CGGAC	2	10	17229	17238	20 %	0 %	40 %	40 %	374999510
20	NC_016588	GCCGC	2	10	17809	17818	0 %	0 %	40 %	60 %	374999510
21	NC_016588	TGCCG	2	10	18626	18635	0 %	20 %	40 %	40 %	374999510
22	NC_016588	GGCCG	2	10	19047	19056	0 %	0 %	60 %	40 %	374999510
23	NC_016588	GGCGC	2	10	19120	19129	0 %	0 %	60 %	40 %	374999510
24	NC_016588	GGGCA	2	10	19710	19719	20 %	0 %	60 %	20 %	374999510
25	NC_016588	CCCCG	2	10	19786	19795	0 %	0 %	20 %	80 %	374999510
26	NC_016588	CAGTT	2	10	22431	22440	20 %	40 %	20 %	20 %	374999513
27	NC_016588	ACCGC	2	10	24774	24783	20 %	0 %	20 %	60 %	374999514
28	NC_016588	GCCGA	2	10	24834	24843	20 %	0 %	40 %	40 %	374999514
29	NC_016588	GCTTC	2	10	27977	27986	0 %	40 %	20 %	40 %	374999517
30	NC_016588	CGCCC	2	10	28864	28873	0 %	0 %	20 %	80 %	374999517
31	NC_016588	AATAG	2	10	30397	30406	60 %	20 %	20 %	0 %	374999517
32	NC_016588	GTGCC	2	10	31719	31728	0 %	20 %	40 %	40 %	374999519
33	NC_016588	GGTCC	2	10	35215	35224	0 %	20 %	40 %	40 %	374999522
34	NC_016588	GGACT	2	10	37229	37238	20 %	20 %	40 %	20 %	374999523
35	NC_016588	CAGGG	2	10	37534	37543	20 %	0 %	60 %	20 %	374999524
36	NC_016588	GAGCG	2	10	38206	38215	20 %	0 %	60 %	20 %	374999525
37	NC_016588	GACCA	2	10	38339	38348	40 %	0 %	20 %	40 %	374999525
38	NC_016588	CACCG	2	10	38377	38386	20 %	0 %	20 %	60 %	374999525
39	NC_016588	CGAGC	2	10	38866	38875	20 %	0 %	40 %	40 %	374999526
40	NC_016588	CATGA	2	10	41833	41842	40 %	20 %	20 %	20 %	374999530
41	NC_016588	GGCGC	2	10	42877	42886	0 %	0 %	60 %	40 %	374999531
42	NC_016588	GCCGG	2	10	50082	50091	0 %	0 %	60 %	40 %	374999539
43	NC_016588	TCGCG	2	10	50780	50789	0 %	20 %	40 %	40 %	374999539
44	NC_016588	TCGCC	2	10	51117	51126	0 %	20 %	20 %	60 %	374999539
45	NC_016588	CGGAC	2	10	51438	51447	20 %	0 %	40 %	40 %	374999539
46	NC_016588	CGGCC	2	10	51585	51594	0 %	0 %	40 %	60 %	374999539
47	NC_016588	GCCGC	2	10	51618	51627	0 %	0 %	40 %	60 %	374999539
48	NC_016588	GGCCG	2	10	54648	54657	0 %	0 %	60 %	40 %	374999542
49	NC_016588	TCCGC	2	10	55985	55994	0 %	20 %	20 %	60 %	374999544
50	NC_016588	GGCCG	2	10	57379	57388	0 %	0 %	60 %	40 %	374999545
51	NC_016588	CCTGC	2	10	57751	57760	0 %	20 %	20 %	60 %	374999545
52	NC_016588	ACCGC	2	10	58310	58319	20 %	0 %	20 %	60 %	374999546
53	NC_016588	GATGC	2	10	58864	58873	20 %	20 %	40 %	20 %	374999546
54	NC_016588	CAGGA	2	10	62821	62830	40 %	0 %	40 %	20 %	374999550
55	NC_016588	GCAGC	2	10	62946	62955	20 %	0 %	40 %	40 %	374999550
56	NC_016588	GGATG	2	10	66747	66756	20 %	20 %	60 %	0 %	374999552
57	NC_016588	GCCGC	2	10	67425	67434	0 %	0 %	40 %	60 %	374999552
58	NC_016588	GCCGG	2	10	67894	67903	0 %	0 %	60 %	40 %	374999552
59	NC_016588	GGCGT	2	10	70272	70281	0 %	20 %	60 %	20 %	374999553
60	NC_016588	TTCAT	2	10	71716	71725	20 %	60 %	0 %	20 %	374999553
61	NC_016588	CGCGC	2	10	72193	72202	0 %	0 %	40 %	60 %	374999554
62	NC_016588	GGGCT	2	10	74428	74437	0 %	20 %	60 %	20 %	374999555
63	NC_016588	ATCGG	2	10	74705	74714	20 %	20 %	40 %	20 %	374999556
64	NC_016588	ATCCG	2	10	74808	74817	20 %	20 %	20 %	40 %	374999556
65	NC_016588	GCGAC	2	10	77195	77204	20 %	0 %	40 %	40 %	374999559
66	NC_016588	CGCGG	2	10	77307	77316	0 %	0 %	60 %	40 %	374999559
67	NC_016588	ACCGC	2	10	83109	83118	20 %	0 %	20 %	60 %	374999560
68	NC_016588	CCGGT	2	10	88474	88483	0 %	20 %	40 %	40 %	374999560
69	NC_016588	CCGCC	2	10	92014	92023	0 %	0 %	20 %	80 %	374999560
70	NC_016588	TTCGA	2	10	94524	94533	20 %	40 %	20 %	20 %	374999560
71	NC_016588	GGGAA	2	10	99573	99582	40 %	0 %	60 %	0 %	374999564
72	NC_016588	GCCGC	2	10	101067	101076	0 %	0 %	40 %	60 %	374999565
73	NC_016588	CCCCG	2	10	102223	102232	0 %	0 %	20 %	80 %	374999567
74	NC_016588	TCCGG	2	10	102469	102478	0 %	20 %	40 %	40 %	374999567
75	NC_016588	CGTCG	2	10	102600	102609	0 %	20 %	40 %	40 %	374999567
76	NC_016588	GGCGC	2	10	106240	106249	0 %	0 %	60 %	40 %	374999571
77	NC_016588	GAACG	2	10	106514	106523	40 %	0 %	40 %	20 %	374999571
78	NC_016588	CTCGT	2	10	108554	108563	0 %	40 %	20 %	40 %	374999575
79	NC_016588	GGCCA	2	10	111502	111511	20 %	0 %	40 %	40 %	374999578
80	NC_016588	GCCGG	2	10	111742	111751	0 %	0 %	60 %	40 %	374999578
81	NC_016588	CTTCG	2	10	113735	113744	0 %	40 %	20 %	40 %	374999579
82	NC_016588	CCGCC	2	10	114525	114534	0 %	0 %	20 %	80 %	374999580
83	NC_016588	TCCCT	2	10	115690	115699	0 %	40 %	0 %	60 %	374999581
84	NC_016588	GGCGG	2	10	115756	115765	0 %	0 %	80 %	20 %	374999581
85	NC_016588	AGGAC	2	10	116042	116051	40 %	0 %	40 %	20 %	374999581
86	NC_016588	GGCGG	2	10	117884	117893	0 %	0 %	80 %	20 %	374999582
87	NC_016588	GCGGG	2	10	118122	118131	0 %	0 %	80 %	20 %	374999583
88	NC_016588	AGGAC	2	10	120574	120583	40 %	0 %	40 %	20 %	374999585
89	NC_016588	CGGAT	2	10	121008	121017	20 %	20 %	40 %	20 %	374999586
90	NC_016588	GGTCC	2	10	121065	121074	0 %	20 %	40 %	40 %	374999586
91	NC_016588	CCAAT	2	10	122687	122696	40 %	20 %	0 %	40 %	374999588
92	NC_016588	CCGGC	2	10	124721	124730	0 %	0 %	40 %	60 %	374999590
93	NC_016588	CCCAG	2	10	125468	125477	20 %	0 %	20 %	60 %	374999590
94	NC_016588	GGGCC	2	10	125890	125899	0 %	0 %	60 %	40 %	374999591
95	NC_016588	CCCCG	2	10	126568	126577	0 %	0 %	20 %	80 %	374999593
96	NC_016588	CCCGG	2	10	126838	126847	0 %	0 %	40 %	60 %	374999593
97	NC_016588	GGGCG	2	10	129447	129456	0 %	0 %	80 %	20 %	374999598
98	NC_016588	CCGCG	2	10	129681	129690	0 %	0 %	40 %	60 %	374999598
99	NC_016588	GTGGG	2	10	129887	129896	0 %	20 %	80 %	0 %	374999598
100	NC_016588	GGCCC	2	10	130044	130053	0 %	0 %	40 %	60 %	374999598
101	NC_016588	CGCAG	2	10	130215	130224	20 %	0 %	40 %	40 %	374999598
102	NC_016588	CCGCC	2	10	131169	131178	0 %	0 %	20 %	80 %	374999599
103	NC_016588	GAACC	2	10	131634	131643	40 %	0 %	20 %	40 %	374999599
104	NC_016588	TCGCC	2	10	132022	132031	0 %	20 %	20 %	60 %	374999600
105	NC_016588	TGGGG	2	10	132498	132507	0 %	20 %	80 %	0 %	374999600
106	NC_016588	CGCGG	2	10	132796	132805	0 %	0 %	60 %	40 %	374999600
107	NC_016588	GCCCG	2	10	133657	133666	0 %	0 %	40 %	60 %	374999601
108	NC_016588	GCCGG	2	10	134317	134326	0 %	0 %	60 %	40 %	374999602
109	NC_016588	GCCGC	2	10	134701	134710	0 %	0 %	40 %	60 %	374999602
110	NC_016588	TCCGC	2	10	135440	135449	0 %	20 %	20 %	60 %	374999602
111	NC_016588	CGAGG	2	10	135890	135899	20 %	0 %	60 %	20 %	374999602
112	NC_016588	GCTGC	2	10	137515	137524	0 %	20 %	40 %	40 %	374999604
113	NC_016588	GCCAC	2	10	138974	138983	20 %	0 %	20 %	60 %	374999605
114	NC_016588	GCGCC	2	10	141276	141285	0 %	0 %	40 %	60 %	374999608
115	NC_016588	GGTCG	2	10	141474	141483	0 %	20 %	60 %	20 %	374999608
116	NC_016588	GATAA	2	10	145875	145884	60 %	20 %	20 %	0 %	374999611
117	NC_016588	GAGCG	2	10	147132	147141	20 %	0 %	60 %	20 %	374999612
118	NC_016588	CATGC	2	10	147253	147262	20 %	20 %	20 %	40 %	374999612
119	NC_016588	CGGCA	2	10	147636	147645	20 %	0 %	40 %	40 %	374999612
120	NC_016588	GCCGA	2	10	149254	149263	20 %	0 %	40 %	40 %	374999613
121	NC_016588	CGCAC	2	10	151699	151708	20 %	0 %	20 %	60 %	374999615
122	NC_016588	CAGCA	2	10	153183	153192	40 %	0 %	20 %	40 %	374999617
123	NC_016588	GGGCG	2	10	154199	154208	0 %	0 %	80 %	20 %	374999617
124	NC_016588	GCCGG	2	10	154949	154958	0 %	0 %	60 %	40 %	374999620
125	NC_016588	CGCAA	2	10	155086	155095	40 %	0 %	20 %	40 %	374999621
126	NC_016588	CGCAG	2	10	156281	156290	20 %	0 %	40 %	40 %	374999622
127	NC_016588	CTTGA	2	10	157556	157565	20 %	40 %	20 %	20 %	374999624
128	NC_016588	GCCAG	2	10	158533	158542	20 %	0 %	40 %	40 %	374999625
129	NC_016588	CGTCC	2	10	161356	161365	0 %	20 %	20 %	60 %	374999628
130	NC_016588	GCCCT	2	10	161405	161414	0 %	20 %	20 %	60 %	374999628
131	NC_016588	ATGGG	2	10	162484	162493	20 %	20 %	60 %	0 %	374999629
132	NC_016588	GAATG	2	10	163672	163681	40 %	20 %	40 %	0 %	374999630
133	NC_016588	CGGGC	2	10	164832	164841	0 %	0 %	60 %	40 %	374999632
134	NC_016588	CCAGC	2	10	164869	164878	20 %	0 %	20 %	60 %	374999632
135	NC_016588	GCGCA	2	10	167124	167133	20 %	0 %	40 %	40 %	374999634
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.