MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p6

Total Repeats: 117

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016588	TCGG	2	8	52	59	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016588	GACC	2	8	299	306	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016588	GCCG	2	8	504	511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016588	CCGG	2	8	524	531	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016588	TCCT	2	8	6212	6219	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016588	CGGA	2	8	7577	7584	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016588	TCAT	2	8	11682	11689	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016588	TCGA	2	8	11752	11759	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016588	GGGT	2	8	16808	16815	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016588	TCCT	2	8	24938	24945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016588	ACGC	2	8	25753	25760	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016588	CTGC	2	8	36168	36175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016588	GAAA	2	8	39000	39007	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016588	AATA	2	8	39025	39032	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016588	CAGC	2	8	39056	39063	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016588	CCTG	2	8	40629	40636	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016588	CGGC	2	8	46967	46974	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016588	TGGG	2	8	54159	54166	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016588	GGGC	2	8	54182	54189	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016588	GGGC	2	8	74839	74846	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016588	CCAT	2	8	95799	95806	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016588	CTGC	2	8	97794	97801	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016588	GGCC	2	8	97869	97876	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016588	GCCG	2	8	97899	97906	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016588	GGTC	2	8	98349	98356	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
26	NC_016588	GCCG	2	8	98403	98410	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016588	CCGG	2	8	98576	98583	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016588	CGGC	2	8	98613	98620	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016588	GCCT	2	8	98873	98880	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016588	GGGC	2	8	98925	98932	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016588	CGCC	2	8	99183	99190	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
32	NC_016588	GCCG	2	8	99195	99202	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016588	GTCG	2	8	109921	109928	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016588	GGAT	2	8	114156	114163	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016588	TGCG	2	8	120032	120039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
36	NC_016588	TCCC	2	8	124569	124576	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
37	NC_016588	GATT	2	8	125791	125798	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016588	GCGG	2	8	127062	127069	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016588	CGGC	2	8	127112	127119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016588	CGGC	2	8	136611	136618	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016588	TTCC	2	8	140705	140712	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016588	GCCA	2	8	143905	143912	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016588	CGGC	2	8	144760	144767	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016588	GGCT	2	8	145172	145179	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016588	GAAG	3	12	145323	145334	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016588	GCCA	2	8	148031	148038	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016588	ATCA	2	8	148090	148097	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016588	CTCG	2	8	148525	148532	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016588	AGCC	2	8	155570	155577	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016588	GATA	2	8	157119	157126	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016588	CATT	2	8	157249	157256	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
52	NC_016588	GTTG	2	8	159807	159814	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016588	TGCC	2	8	159839	159846	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016588	CCAG	2	8	160043	160050	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016588	TTGT	2	8	164535	164542	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016588	CGGC	2	8	166111	166118	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016588	GGCT	2	8	166300	166307	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016588	CGGC	2	8	166518	166525	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016588	GGCC	2	8	166558	166565	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016588	CGGC	2	8	166633	166640	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016588	ATCG	2	8	171291	171298	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016588	CAAC	2	8	174171	174178	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016588	CCGG	2	8	175289	175296	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016588	CTGG	2	8	179460	179467	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016588	CGCC	2	8	179605	179612	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
66	NC_016588	GCTC	2	8	183953	183960	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016588	TCCG	2	8	188758	188765	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016588	AGGA	2	8	191116	191123	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016588	CCGC	2	8	191161	191168	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_016588	ATCC	2	8	191798	191805	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016588	CCGG	3	12	191924	191935	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016588	GGCC	2	8	193439	193446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016588	GCAG	2	8	194494	194501	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016588	CCGG	2	8	194538	194545	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016588	CTCC	2	8	194565	194572	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
76	NC_016588	CCTG	2	8	194586	194593	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016588	CCGG	2	8	194607	194614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016588	GCCG	2	8	194685	194692	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016588	AATG	2	8	194741	194748	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016588	CTTT	2	8	194761	194768	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016588	AAGC	2	8	196018	196025	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016588	CCGG	2	8	206069	206076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016588	CGGG	2	8	207111	207118	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016588	CCGT	2	8	208745	208752	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016588	AATA	2	8	219587	219594	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016588	CGGC	2	8	222157	222164	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016588	GGCC	2	8	222244	222251	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016588	GGGA	2	8	223756	223763	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016588	GGGA	2	8	226726	226733	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016588	CGGC	2	8	228228	228235	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016588	GTCC	2	8	230698	230705	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016588	GCCG	2	8	231056	231063	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016588	CGCC	2	8	233861	233868	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
94	NC_016588	CGCC	2	8	233884	233891	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
95	NC_016588	GCCC	2	8	233898	233905	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_016588	TTCC	2	8	237598	237605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016588	CACC	2	8	237621	237628	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
98	NC_016588	CATG	2	8	238324	238331	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016588	TCGG	2	8	243909	243916	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016588	CCGC	2	8	244162	244169	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
101	NC_016588	TGGC	2	8	244225	244232	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016588	GCCG	2	8	248949	248956	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016588	TGCG	2	8	249032	249039	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016588	TGCC	2	8	249208	249215	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016588	TGAT	2	8	249340	249347	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016588	CGGT	2	8	249414	249421	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016588	TGCC	2	8	253244	253251	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016588	GCCT	2	8	253252	253259	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016588	GCCG	2	8	257573	257580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016588	CGCC	2	8	267663	267670	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_016588	GACC	2	8	268085	268092	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016588	TAAA	2	8	268403	268410	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016588	AATG	2	8	268626	268633	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016588	AAAT	2	8	268658	268665	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016588	AGGA	2	8	271533	271540	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016588	AGCC	2	8	277447	277454	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016588	TCGG	2	8	295124	295131	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.