MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Mono-nucleotide Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p6

Total Repeats: 118

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016588	C	6	6	3341	3346	0 %	0 %	0 %	100 %	374999500
2	NC_016588	A	6	6	4301	4306	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016588	C	6	6	5925	5930	0 %	0 %	0 %	100 %	374999501
4	NC_016588	G	6	6	8122	8127	0 %	0 %	100 %	0 %	374999504
5	NC_016588	G	6	6	8679	8684	0 %	0 %	100 %	0 %	374999505
6	NC_016588	G	6	6	10137	10142	0 %	0 %	100 %	0 %	374999506
7	NC_016588	C	6	6	17297	17302	0 %	0 %	0 %	100 %	374999510
8	NC_016588	C	6	6	17580	17585	0 %	0 %	0 %	100 %	374999510
9	NC_016588	G	6	6	20110	20115	0 %	0 %	100 %	0 %	374999510
10	NC_016588	G	6	6	22300	22305	0 %	0 %	100 %	0 %	374999513
11	NC_016588	C	6	6	26528	26533	0 %	0 %	0 %	100 %	374999515
12	NC_016588	G	6	6	27687	27692	0 %	0 %	100 %	0 %	374999516
13	NC_016588	A	6	6	28163	28168	100 %	0 %	0 %	0 %	374999517
14	NC_016588	G	6	6	29447	29452	0 %	0 %	100 %	0 %	374999517
15	NC_016588	G	8	8	29753	29760	0 %	0 %	100 %	0 %	374999517
16	NC_016588	C	7	7	31731	31737	0 %	0 %	0 %	100 %	374999519
17	NC_016588	A	6	6	39005	39010	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016588	C	6	6	44390	44395	0 %	0 %	0 %	100 %	374999533
19	NC_016588	G	6	6	48872	48877	0 %	0 %	100 %	0 %	374999538
20	NC_016588	G	6	6	54215	54220	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016588	G	6	6	56005	56010	0 %	0 %	100 %	0 %	374999544
22	NC_016588	C	6	6	57885	57890	0 %	0 %	0 %	100 %	374999545
23	NC_016588	C	6	6	58085	58090	0 %	0 %	0 %	100 %	374999546
24	NC_016588	C	6	6	58136	58141	0 %	0 %	0 %	100 %	374999546
25	NC_016588	C	6	6	59507	59512	0 %	0 %	0 %	100 %	374999547
26	NC_016588	C	7	7	64876	64882	0 %	0 %	0 %	100 %	374999551
27	NC_016588	C	6	6	67880	67885	0 %	0 %	0 %	100 %	374999552
28	NC_016588	C	6	6	71994	71999	0 %	0 %	0 %	100 %	374999554
29	NC_016588	G	6	6	74073	74078	0 %	0 %	100 %	0 %	374999554
30	NC_016588	C	6	6	77095	77100	0 %	0 %	0 %	100 %	374999558
31	NC_016588	G	6	6	79681	79686	0 %	0 %	100 %	0 %	374999560
32	NC_016588	A	6	6	93724	93729	100 %	0 %	0 %	0 %	374999560
33	NC_016588	G	6	6	94700	94705	0 %	0 %	100 %	0 %	374999560
34	NC_016588	C	6	6	96249	96254	0 %	0 %	0 %	100 %	374999561
35	NC_016588	G	6	6	98738	98743	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016588	C	7	7	103289	103295	0 %	0 %	0 %	100 %	374999568
37	NC_016588	G	6	6	103901	103906	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016588	C	6	6	105940	105945	0 %	0 %	0 %	100 %	374999570
39	NC_016588	G	6	6	106921	106926	0 %	0 %	100 %	0 %	374999571
40	NC_016588	C	6	6	109269	109274	0 %	0 %	0 %	100 %	374999575
41	NC_016588	C	8	8	109665	109672	0 %	0 %	0 %	100 %	374999575
42	NC_016588	A	6	6	110365	110370	100 %	0 %	0 %	0 %	374999577
43	NC_016588	C	6	6	112625	112630	0 %	0 %	0 %	100 %	374999579
44	NC_016588	C	6	6	113694	113699	0 %	0 %	0 %	100 %	374999579
45	NC_016588	C	6	6	114095	114100	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
46	NC_016588	C	6	6	115081	115086	0 %	0 %	0 %	100 %	374999580
47	NC_016588	C	7	7	117350	117356	0 %	0 %	0 %	100 %	374999582
48	NC_016588	G	7	7	123913	123919	0 %	0 %	100 %	0 %	374999589
49	NC_016588	C	6	6	126028	126033	0 %	0 %	0 %	100 %	374999591
50	NC_016588	C	6	6	126053	126058	0 %	0 %	0 %	100 %	374999591
51	NC_016588	G	6	6	126451	126456	0 %	0 %	100 %	0 %	374999592
52	NC_016588	C	6	6	129383	129388	0 %	0 %	0 %	100 %	374999598
53	NC_016588	G	7	7	131223	131229	0 %	0 %	100 %	0 %	374999599
54	NC_016588	C	6	6	132394	132399	0 %	0 %	0 %	100 %	374999600
55	NC_016588	C	6	6	133692	133697	0 %	0 %	0 %	100 %	374999601
56	NC_016588	C	6	6	135497	135502	0 %	0 %	0 %	100 %	374999602
57	NC_016588	T	6	6	139895	139900	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016588	T	6	6	139960	139965	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016588	C	6	6	142823	142828	0 %	0 %	0 %	100 %	374999608
60	NC_016588	C	6	6	146868	146873	0 %	0 %	0 %	100 %	374999612
61	NC_016588	T	6	6	149177	149182	0 %	100 %	0 %	0 %	374999613
62	NC_016588	G	7	7	149957	149963	0 %	0 %	100 %	0 %	374999613
63	NC_016588	C	6	6	151651	151656	0 %	0 %	0 %	100 %	374999615
64	NC_016588	G	7	7	152526	152532	0 %	0 %	100 %	0 %	374999616
65	NC_016588	C	6	6	161527	161532	0 %	0 %	0 %	100 %	374999628
66	NC_016588	C	6	6	162061	162066	0 %	0 %	0 %	100 %	374999629
67	NC_016588	C	6	6	162952	162957	0 %	0 %	0 %	100 %	374999629
68	NC_016588	C	6	6	163261	163266	0 %	0 %	0 %	100 %	374999630
69	NC_016588	T	6	6	163957	163962	0 %	100 %	0 %	0 %	374999630
70	NC_016588	T	6	6	164360	164365	0 %	100 %	0 %	0 %	374999631
71	NC_016588	G	6	6	167150	167155	0 %	0 %	100 %	0 %	374999634
72	NC_016588	G	6	6	172842	172847	0 %	0 %	100 %	0 %	374999637
73	NC_016588	C	6	6	173414	173419	0 %	0 %	0 %	100 %	374999638
74	NC_016588	G	6	6	175387	175392	0 %	0 %	100 %	0 %	374999641
75	NC_016588	G	6	6	179481	179486	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016588	C	6	6	182169	182174	0 %	0 %	0 %	100 %	374999645
77	NC_016588	C	7	7	188096	188102	0 %	0 %	0 %	100 %	374999650
78	NC_016588	G	6	6	190221	190226	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016588	G	7	7	193390	193396	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016588	T	6	6	195298	195303	0 %	100 %	0 %	0 %	374999656
81	NC_016588	C	6	6	196297	196302	0 %	0 %	0 %	100 %	374999657
82	NC_016588	C	6	6	199264	199269	0 %	0 %	0 %	100 %	374999661
83	NC_016588	C	6	6	201137	201142	0 %	0 %	0 %	100 %	374999661
84	NC_016588	C	6	6	201307	201312	0 %	0 %	0 %	100 %	374999662
85	NC_016588	C	6	6	202499	202504	0 %	0 %	0 %	100 %	374999662
86	NC_016588	C	6	6	202768	202773	0 %	0 %	0 %	100 %	374999663
87	NC_016588	A	7	7	205752	205758	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016588	A	6	6	205773	205778	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016588	G	6	6	206091	206096	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016588	T	6	6	208675	208680	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016588	T	6	6	211070	211075	0 %	100 %	0 %	0 %	374999670
92	NC_016588	A	6	6	212801	212806	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016588	A	6	6	219477	219482	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016588	A	6	6	219813	219818	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016588	G	6	6	223013	223018	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016588	G	6	6	223239	223244	0 %	0 %	100 %	0 %	374999678
97	NC_016588	C	6	6	223696	223701	0 %	0 %	0 %	100 %	374999678
98	NC_016588	C	7	7	225058	225064	0 %	0 %	0 %	100 %	374999679
99	NC_016588	G	6	6	229612	229617	0 %	0 %	100 %	0 %	374999684
100	NC_016588	A	6	6	230841	230846	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016588	C	6	6	231994	231999	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
102	NC_016588	C	6	6	232190	232195	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
103	NC_016588	C	6	6	235238	235243	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
104	NC_016588	C	6	6	235251	235256	0 %	0 %	0 %	100 %	374999691
105	NC_016588	C	6	6	236957	236962	0 %	0 %	0 %	100 %	374999691
106	NC_016588	G	6	6	237267	237272	0 %	0 %	100 %	0 %	374999691
107	NC_016588	G	6	6	240682	240687	0 %	0 %	100 %	0 %	374999694
108	NC_016588	C	6	6	241630	241635	0 %	0 %	0 %	100 %	374999695
109	NC_016588	A	6	6	242233	242238	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016588	C	6	6	245910	245915	0 %	0 %	0 %	100 %	374999699
111	NC_016588	G	6	6	248244	248249	0 %	0 %	100 %	0 %	374999700
112	NC_016588	G	6	6	249294	249299	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016588	A	6	6	252362	252367	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016588	G	6	6	262893	262898	0 %	0 %	100 %	0 %	374999713
115	NC_016588	G	6	6	266959	266964	0 %	0 %	100 %	0 %	374999715
116	NC_016588	A	6	6	267207	267212	100 %	0 %	0 %	0 %	374999715
117	NC_016588	G	6	6	267246	267251	0 %	0 %	100 %	0 %	374999715
118	NC_016588	T	6	6	274250	274255	0 %	100 %	0 %	0 %	374999718

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.