MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 579

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016587	GGCGC	2	10	212	221	0 %	0 %	60 %	40 %	375006211
2	NC_016587	GCCGC	2	10	1213	1222	0 %	0 %	40 %	60 %	375006212
3	NC_016587	GGATG	2	10	2502	2511	20 %	20 %	60 %	0 %	375006214
4	NC_016587	CCCCT	2	10	3765	3774	0 %	20 %	0 %	80 %	375006214
5	NC_016587	CGGGT	2	10	3908	3917	0 %	20 %	60 %	20 %	375006214
6	NC_016587	ACCGC	2	10	4689	4698	20 %	0 %	20 %	60 %	375006215
7	NC_016587	GCCGC	2	10	5645	5654	0 %	0 %	40 %	60 %	375006215
8	NC_016587	CCAGC	2	10	6769	6778	20 %	0 %	20 %	60 %	375006216
9	NC_016587	GCTGC	2	10	7939	7948	0 %	20 %	40 %	40 %	375006218
10	NC_016587	CGGCG	2	10	7968	7977	0 %	0 %	60 %	40 %	375006218
11	NC_016587	GCCGG	2	10	8203	8212	0 %	0 %	60 %	40 %	375006218
12	NC_016587	AGCTC	2	10	8516	8525	20 %	20 %	20 %	40 %	375006219
13	NC_016587	CGGCA	2	10	8655	8664	20 %	0 %	40 %	40 %	375006219
14	NC_016587	GCCCC	2	10	9809	9818	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
15	NC_016587	CCCGT	2	10	9826	9835	0 %	20 %	20 %	60 %	375006221
16	NC_016587	CGGGA	2	10	11008	11017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016587	GTCCC	2	10	12259	12268	0 %	20 %	20 %	60 %	375006223
18	NC_016587	CCGCC	2	10	12316	12325	0 %	0 %	20 %	80 %	375006223
19	NC_016587	CACGG	2	10	14878	14887	20 %	0 %	40 %	40 %	375006225
20	NC_016587	TCCCG	2	10	14936	14945	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
21	NC_016587	CCTTT	2	10	15321	15330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016587	GCGCC	2	10	15545	15554	0 %	0 %	40 %	60 %	375006226
23	NC_016587	CGACC	2	10	16667	16676	20 %	0 %	20 %	60 %	375006226
24	NC_016587	CGGGA	2	10	18959	18968	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
25	NC_016587	AGCCC	2	10	19435	19444	20 %	0 %	20 %	60 %	375006228
26	NC_016587	CCCCG	2	10	20313	20322	0 %	0 %	20 %	80 %	375006229
27	NC_016587	TCCAG	2	10	21373	21382	20 %	20 %	20 %	40 %	375006230
28	NC_016587	GCCGA	2	10	21596	21605	20 %	0 %	40 %	40 %	375006231
29	NC_016587	CCGCC	2	10	21615	21624	0 %	0 %	20 %	80 %	375006231
30	NC_016587	TCGAT	2	10	26061	26070	20 %	40 %	20 %	20 %	375006235
31	NC_016587	CCGGC	2	10	26987	26996	0 %	0 %	40 %	60 %	375006236
32	NC_016587	CACGG	2	10	28248	28257	20 %	0 %	40 %	40 %	375006238
33	NC_016587	CAGAC	2	10	37217	37226	40 %	0 %	20 %	40 %	375006246
34	NC_016587	GCGGG	2	10	37840	37849	0 %	0 %	80 %	20 %	375006247
35	NC_016587	GACCG	2	10	41919	41928	20 %	0 %	40 %	40 %	375006250
36	NC_016587	GCCCC	2	10	43932	43941	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
37	NC_016587	TCTGC	2	10	45387	45396	0 %	40 %	20 %	40 %	375006253
38	NC_016587	CACGT	2	10	48117	48126	20 %	20 %	20 %	40 %	375006256
39	NC_016587	CAGCC	2	10	48138	48147	20 %	0 %	20 %	60 %	375006256
40	NC_016587	ACCGA	2	10	51836	51845	40 %	0 %	20 %	40 %	375006261
41	NC_016587	GGCAT	2	10	52707	52716	20 %	20 %	40 %	20 %	375006262
42	NC_016587	CCGCA	2	10	53156	53165	20 %	0 %	20 %	60 %	375006263
43	NC_016587	GCGTG	2	10	53410	53419	0 %	20 %	60 %	20 %	375006263
44	NC_016587	ATTCG	2	10	53678	53687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016587	TCCGC	2	10	54634	54643	0 %	20 %	20 %	60 %	375006264
46	NC_016587	TCGCG	2	10	54869	54878	0 %	20 %	40 %	40 %	375006265
47	NC_016587	GCCCC	2	10	56425	56434	0 %	0 %	20 %	80 %	375006267
48	NC_016587	TCAGG	2	10	57188	57197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016587	CGGCG	3	15	57381	57395	0 %	0 %	60 %	40 %	375006268
50	NC_016587	CGCGG	2	10	57908	57917	0 %	0 %	60 %	40 %	375006268
51	NC_016587	GCCCT	2	10	58090	58099	0 %	20 %	20 %	60 %	375006268
52	NC_016587	CCCCG	2	10	58101	58110	0 %	0 %	20 %	80 %	375006268
53	NC_016587	GGCCC	2	10	58636	58645	0 %	0 %	40 %	60 %	375006269
54	NC_016587	CCGCC	2	10	59966	59975	0 %	0 %	20 %	80 %	375006270
55	NC_016587	GGATG	2	10	60655	60664	20 %	20 %	60 %	0 %	375006270
56	NC_016587	GCCCC	2	10	61012	61021	0 %	0 %	20 %	80 %	375006271
57	NC_016587	GGCCC	2	10	62050	62059	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016587	GCTCC	2	10	62384	62393	0 %	20 %	20 %	60 %	375006272
59	NC_016587	CCCGC	2	10	63605	63614	0 %	0 %	20 %	80 %	375006275
60	NC_016587	CCGTG	2	10	64133	64142	0 %	20 %	40 %	40 %	375006275
61	NC_016587	ACGGC	2	10	64972	64981	20 %	0 %	40 %	40 %	375006276
62	NC_016587	GCGCC	2	10	65746	65755	0 %	0 %	40 %	60 %	375006277
63	NC_016587	CCCGG	2	10	69318	69327	0 %	0 %	40 %	60 %	375006279
64	NC_016587	CGATC	2	10	69636	69645	20 %	20 %	20 %	40 %	375006280
65	NC_016587	CCCCT	2	10	71075	71084	0 %	20 %	0 %	80 %	375006281
66	NC_016587	GCTTC	2	10	72270	72279	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016587	CGGCG	2	10	72417	72426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016587	GGGGC	2	10	73175	73184	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
69	NC_016587	ATCCA	2	10	73472	73481	40 %	20 %	0 %	40 %	375006283
70	NC_016587	CGACC	2	10	74662	74671	20 %	0 %	20 %	60 %	375006283
71	NC_016587	GGGAA	2	10	75168	75177	40 %	0 %	60 %	0 %	375006283
72	NC_016587	AGGGC	2	10	76915	76924	20 %	0 %	60 %	20 %	375006283
73	NC_016587	CCCGG	2	10	76997	77006	0 %	0 %	40 %	60 %	375006283
74	NC_016587	ACGGC	2	10	79372	79381	20 %	0 %	40 %	40 %	375006284
75	NC_016587	AGGGG	2	10	80209	80218	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016587	GTGCT	2	10	81009	81018	0 %	40 %	40 %	20 %	375006286
77	NC_016587	AACCG	2	10	81206	81215	40 %	0 %	20 %	40 %	375006286
78	NC_016587	AGGGA	2	10	83913	83922	40 %	0 %	60 %	0 %	375006286
79	NC_016587	GCCCC	2	10	85759	85768	0 %	0 %	20 %	80 %	375006287
80	NC_016587	TCTGG	2	10	88121	88130	0 %	40 %	40 %	20 %	375006289
81	NC_016587	GCAAG	2	10	88915	88924	40 %	0 %	40 %	20 %	375006289
82	NC_016587	TGCCG	2	10	91784	91793	0 %	20 %	40 %	40 %	375006293
83	NC_016587	CCACC	2	10	91925	91934	20 %	0 %	0 %	80 %	375006293
84	NC_016587	ACGCC	2	10	91943	91952	20 %	0 %	20 %	60 %	375006293
85	NC_016587	GCTGG	2	10	92078	92087	0 %	20 %	60 %	20 %	375006293
86	NC_016587	CCCGC	2	10	92436	92445	0 %	0 %	20 %	80 %	375006293
87	NC_016587	GGCGC	2	10	92674	92683	0 %	0 %	60 %	40 %	375006293
88	NC_016587	CCGGC	2	10	93597	93606	0 %	0 %	40 %	60 %	375006294
89	NC_016587	CCGCC	2	10	93611	93620	0 %	0 %	20 %	80 %	375006294
90	NC_016587	GACGG	2	10	94138	94147	20 %	0 %	60 %	20 %	375006294
91	NC_016587	TCGCC	2	10	94161	94170	0 %	20 %	20 %	60 %	375006295
92	NC_016587	GCCGC	2	10	95782	95791	0 %	0 %	40 %	60 %	375006296
93	NC_016587	GCTCG	2	10	99374	99383	0 %	20 %	40 %	40 %	375006300
94	NC_016587	GCAGG	2	10	101432	101441	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
95	NC_016587	AGCTC	2	10	103029	103038	20 %	20 %	20 %	40 %	375006303
96	NC_016587	GCCGG	2	10	104863	104872	0 %	0 %	60 %	40 %	375006305
97	NC_016587	CCGTT	2	10	105694	105703	0 %	40 %	20 %	40 %	375006306
98	NC_016587	CTCGA	2	10	106634	106643	20 %	20 %	20 %	40 %	375006306
99	NC_016587	AAGCC	2	10	107214	107223	40 %	0 %	20 %	40 %	375006306
100	NC_016587	GGCCG	2	10	108533	108542	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
101	NC_016587	ACCGA	2	10	108889	108898	40 %	0 %	20 %	40 %	375006309
102	NC_016587	TCGGT	2	10	110426	110435	0 %	40 %	40 %	20 %	375006309
103	NC_016587	GCGAC	2	10	110450	110459	20 %	0 %	40 %	40 %	375006309
104	NC_016587	CCGCT	2	10	111857	111866	0 %	20 %	20 %	60 %	375006311
105	NC_016587	CCGAC	2	10	112640	112649	20 %	0 %	20 %	60 %	375006312
106	NC_016587	CCGGC	2	10	114916	114925	0 %	0 %	40 %	60 %	375006314
107	NC_016587	GGACG	2	10	115880	115889	20 %	0 %	60 %	20 %	375006315
108	NC_016587	CCGGC	2	10	117434	117443	0 %	0 %	40 %	60 %	375006316
109	NC_016587	CCCCG	2	10	117930	117939	0 %	0 %	20 %	80 %	375006316
110	NC_016587	GGCCG	2	10	118263	118272	0 %	0 %	60 %	40 %	375006317
111	NC_016587	CGGCA	2	10	118345	118354	20 %	0 %	40 %	40 %	375006317
112	NC_016587	TCCAC	2	10	118536	118545	20 %	20 %	0 %	60 %	375006317
113	NC_016587	GGGGA	2	10	121902	121911	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016587	CGACG	2	10	122023	122032	20 %	0 %	40 %	40 %	375006322
115	NC_016587	GGCCG	2	10	122855	122864	0 %	0 %	60 %	40 %	375006323
116	NC_016587	GGGGT	2	10	122958	122967	0 %	20 %	80 %	0 %	375006323
117	NC_016587	CTGGG	2	10	123103	123112	0 %	20 %	60 %	20 %	375006323
118	NC_016587	CGCCA	2	10	123167	123176	20 %	0 %	20 %	60 %	375006323
119	NC_016587	CGCGG	2	10	123489	123498	0 %	0 %	60 %	40 %	375006323
120	NC_016587	GAGCG	2	10	124031	124040	20 %	0 %	60 %	20 %	375006323
121	NC_016587	CCGAT	2	10	124605	124614	20 %	20 %	20 %	40 %	375006324
122	NC_016587	GCGGG	2	10	125169	125178	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
123	NC_016587	GCGGG	2	10	125355	125364	0 %	0 %	80 %	20 %	375006325
124	NC_016587	GTCCG	2	10	126001	126010	0 %	20 %	40 %	40 %	375006326
125	NC_016587	CTGGT	2	10	126997	127006	0 %	40 %	40 %	20 %	375006327
126	NC_016587	GCTCT	2	10	129850	129859	0 %	40 %	20 %	40 %	375006331
127	NC_016587	GGGCG	2	10	131434	131443	0 %	0 %	80 %	20 %	375006333
128	NC_016587	GCATC	2	10	133933	133942	20 %	20 %	20 %	40 %	375006337
129	NC_016587	GCGCC	2	10	133964	133973	0 %	0 %	40 %	60 %	375006337
130	NC_016587	GGCCG	2	10	134249	134258	0 %	0 %	60 %	40 %	375006337
131	NC_016587	AACAC	2	10	136293	136302	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
132	NC_016587	GGACG	2	10	138145	138154	20 %	0 %	60 %	20 %	375006342
133	NC_016587	CGGCG	2	10	138599	138608	0 %	0 %	60 %	40 %	375006342
134	NC_016587	TCCAT	2	10	139257	139266	20 %	40 %	0 %	40 %	375006342
135	NC_016587	CACGG	2	10	139974	139983	20 %	0 %	40 %	40 %	375006342
136	NC_016587	TCGCG	2	10	141000	141009	0 %	20 %	40 %	40 %	375006343
137	NC_016587	CGGGC	2	10	141356	141365	0 %	0 %	60 %	40 %	375006343
138	NC_016587	GTCGG	2	10	142190	142199	0 %	20 %	60 %	20 %	375006343
139	NC_016587	AGGTG	2	10	143080	143089	20 %	20 %	60 %	0 %	375006344
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146	NC_016587	GTCAT	2	10	158478	158487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
147	NC_016587	GAAGC	2	10	164000	164009	40 %	0 %	40 %	20 %	375006363
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152	NC_016587	GCGCG	2	10	178161	178170	0 %	0 %	60 %	40 %	375006373
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156	NC_016587	TGCAG	2	10	184805	184814	20 %	20 %	40 %	20 %	375006379
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241	NC_016587	TCGGT	2	10	271748	271757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
242	NC_016587	AAGGC	2	10	272350	272359	40 %	0 %	40 %	20 %	375006466
243	NC_016587	CCGCT	3	15	274727	274741	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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247	NC_016587	CGGCG	2	10	279125	279134	0 %	0 %	60 %	40 %	375006476
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250	NC_016587	CGGGA	2	10	281633	281642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
251	NC_016587	TCGCG	2	10	283343	283352	0 %	20 %	40 %	40 %	375006480
252	NC_016587	GGCTC	2	10	284627	284636	0 %	20 %	40 %	40 %	375006482
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254	NC_016587	TCGAA	2	10	285794	285803	40 %	20 %	20 %	20 %	375006482
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261	NC_016587	TTTCC	2	10	296574	296583	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
262	NC_016587	GCGGG	2	10	301579	301588	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
263	NC_016587	GCCGC	2	10	301883	301892	0 %	0 %	40 %	60 %	375006495
264	NC_016587	GCCCC	2	10	302098	302107	0 %	0 %	20 %	80 %	375006495
265	NC_016587	ACCGG	2	10	302835	302844	20 %	0 %	40 %	40 %	375006496
266	NC_016587	GCGCG	2	10	303146	303155	0 %	0 %	60 %	40 %	375006496
267	NC_016587	GCCGC	2	10	303420	303429	0 %	0 %	40 %	60 %	375006496
268	NC_016587	TCCCG	2	10	305679	305688	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
269	NC_016587	CGCTG	2	10	306254	306263	0 %	20 %	40 %	40 %	375006500
270	NC_016587	CGACC	2	10	306437	306446	20 %	0 %	20 %	60 %	375006500
271	NC_016587	CGGGC	2	10	306963	306972	0 %	0 %	60 %	40 %	375006500
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291	NC_016587	CATGA	2	10	325463	325472	40 %	20 %	20 %	20 %	375006519
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302	NC_016587	TCGGA	2	10	336244	336253	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
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