MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 93

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016587	GCCCC	2	10	9809	9818	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
2	NC_016587	CGGGA	2	10	11008	11017	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016587	TCCCG	2	10	14936	14945	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
4	NC_016587	CCTTT	2	10	15321	15330	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016587	CGGGA	2	10	18959	18968	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
6	NC_016587	GCCCC	2	10	43932	43941	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
7	NC_016587	ATTCG	2	10	53678	53687	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
8	NC_016587	TCAGG	2	10	57188	57197	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016587	GGCCC	2	10	62050	62059	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016587	GCTTC	2	10	72270	72279	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
11	NC_016587	CGGCG	2	10	72417	72426	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
12	NC_016587	GGGGC	2	10	73175	73184	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016587	AGGGG	2	10	80209	80218	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016587	GCAGG	2	10	101432	101441	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
15	NC_016587	GGCCG	2	10	108533	108542	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016587	GGGGA	2	10	121902	121911	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016587	GCGGG	2	10	125169	125178	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
18	NC_016587	AACAC	2	10	136293	136302	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
19	NC_016587	GTCAT	2	10	158478	158487	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
20	NC_016587	GGGCG	2	10	164319	164328	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
21	NC_016587	CTATT	2	10	183006	183015	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016587	ACACG	2	10	185071	185080	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
23	NC_016587	GAACG	2	10	203458	203467	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016587	CCCCG	2	10	208922	208931	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
25	NC_016587	GGGTG	2	10	219815	219824	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016587	GGGGA	2	10	219875	219884	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016587	AGCGG	2	10	227493	227502	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016587	AGGGC	2	10	227519	227528	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
29	NC_016587	GGCGC	2	10	228765	228774	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
30	NC_016587	CACTC	2	10	238137	238146	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
31	NC_016587	CCGCA	2	10	247700	247709	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016587	CCGGG	2	10	248037	248046	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016587	GTCCC	2	10	251327	251336	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
34	NC_016587	GGGTG	2	10	263347	263356	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016587	TCCCC	2	10	263651	263660	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
36	NC_016587	GGGGA	2	10	263670	263679	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016587	CGGGT	2	10	267533	267542	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016587	TCGGT	2	10	271734	271743	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016587	TCGGT	2	10	271748	271757	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016587	CCGCT	3	15	274727	274741	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
41	NC_016587	GCCGG	2	10	276224	276233	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
42	NC_016587	CGGGA	2	10	281633	281642	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016587	TTTCC	2	10	296574	296583	0 %	60 %	0 %	40 %	Non-Coding
44	NC_016587	GCGGG	2	10	301579	301588	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016587	TCCCG	2	10	305679	305688	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
46	NC_016587	TCACA	2	10	317960	317969	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
47	NC_016587	GGGCG	3	15	318761	318775	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016587	CGCTT	2	10	319441	319450	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
49	NC_016587	CCAGG	2	10	324211	324220	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
50	NC_016587	TCCCG	2	10	326237	326246	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
51	NC_016587	CGGCC	2	10	331433	331442	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
52	NC_016587	CGACA	2	10	332875	332884	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016587	CACCG	2	10	335996	336005	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
54	NC_016587	TCGGA	2	10	336244	336253	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
55	NC_016587	CGGGG	2	10	344366	344375	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
56	NC_016587	GGGGT	2	10	347126	347135	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016587	AGTCC	2	10	353742	353751	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
58	NC_016587	GTTTC	2	10	381650	381659	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
59	NC_016587	TCCTG	2	10	385052	385061	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
60	NC_016587	CGGGA	2	10	390890	390899	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
61	NC_016587	GGACC	2	10	399308	399317	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
62	NC_016587	GCGGG	2	10	415670	415679	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
63	NC_016587	CCGCC	2	10	418025	418034	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
64	NC_016587	TCCAG	2	10	431492	431501	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
65	NC_016587	GCTTT	2	10	432852	432861	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
66	NC_016587	CCGAG	2	10	437283	437292	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
67	NC_016587	GCAAA	2	10	444372	444381	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
68	NC_016587	GGCGC	2	10	449841	449850	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
69	NC_016587	TGGGG	2	10	451490	451499	0 %	20 %	80 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016587	TCCCC	2	10	454335	454344	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
71	NC_016587	GCGGG	2	10	479553	479562	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
72	NC_016587	CGGAG	2	10	490500	490509	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
73	NC_016587	TGCGC	2	10	490518	490527	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
74	NC_016587	CGCAA	2	10	491129	491138	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
75	NC_016587	CGGGA	2	10	495350	495359	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
76	NC_016587	GCCCC	2	10	514383	514392	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
77	NC_016587	CTATC	2	10	515074	515083	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
78	NC_016587	CCGCC	2	10	529723	529732	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
79	NC_016587	CTGGC	2	10	541943	541952	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016587	GTTGG	2	10	541954	541963	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016587	GGCAC	2	10	542801	542810	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016587	TGCAT	2	10	542848	542857	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
83	NC_016587	TGGCT	2	10	546846	546855	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
84	NC_016587	GCCTC	2	10	550604	550613	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
85	NC_016587	CCGCC	2	10	562577	562586	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
86	NC_016587	CGCGA	2	10	611803	611812	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016587	TCCGT	2	10	616317	616326	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
88	NC_016587	CTGCG	2	10	619230	619239	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016587	CCGGA	2	10	619527	619536	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
90	NC_016587	TCCCG	2	10	620662	620671	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
91	NC_016587	AAGCC	2	10	637429	637438	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
92	NC_016587	CGTTT	2	10	638455	638464	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
93	NC_016587	TCCCC	2	10	640404	640413	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.