MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016587	CATC	2	8	83	90	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016587	CGGA	2	8	2304	2311	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016587	TCAA	2	8	2330	2337	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016587	CAAT	2	8	2366	2373	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016587	GCCC	2	8	5980	5987	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016587	TCCC	2	8	8329	8336	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016587	GCCG	2	8	8356	8363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016587	TCCC	2	8	10995	11002	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
9	NC_016587	CCCT	2	8	15055	15062	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
10	NC_016587	GCCC	2	8	17708	17715	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_016587	GATG	2	8	17757	17764	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016587	TCCC	2	8	18946	18953	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
13	NC_016587	CCGG	2	8	22348	22355	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016587	TCCC	2	8	23571	23578	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
15	NC_016587	CCCT	2	8	26801	26808	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016587	GGGA	2	8	30987	30994	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016587	AGGC	2	8	33850	33857	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
18	NC_016587	CTTC	2	8	36443	36450	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016587	TCCG	2	8	37786	37793	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016587	TTTG	2	8	39178	39185	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016587	CCGG	2	8	39340	39347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016587	GTCA	2	8	42684	42691	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016587	CGGC	2	8	44066	44073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016587	ATCA	2	8	46308	46315	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016587	CCAG	2	8	46754	46761	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016587	ATGC	2	8	47482	47489	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
27	NC_016587	GCCC	2	8	47643	47650	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
28	NC_016587	TCTT	2	8	50180	50187	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016587	TGGC	2	8	52419	52426	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016587	ACAA	2	8	65527	65534	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016587	CCTC	2	8	67066	67073	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
32	NC_016587	GCGA	2	8	67163	67170	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016587	CCCT	2	8	67272	67279	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
34	NC_016587	TTGA	2	8	67301	67308	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016587	CCCT	2	8	68594	68601	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
36	NC_016587	GCCG	2	8	72246	72253	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016587	TCCA	2	8	72353	72360	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016587	GATC	2	8	72504	72511	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016587	GCGG	2	8	72730	72737	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016587	TGCC	2	8	72785	72792	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016587	CGGC	2	8	72910	72917	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016587	CCCT	2	8	78555	78562	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
43	NC_016587	GAGG	2	8	78660	78667	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016587	GCCG	2	8	78766	78773	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016587	CCCT	2	8	84012	84019	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
46	NC_016587	CCCA	2	8	98362	98369	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
47	NC_016587	CGCA	2	8	101412	101419	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016587	GGGC	2	8	101468	101475	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016587	TCCC	2	8	103587	103594	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
50	NC_016587	AGGG	2	8	103668	103675	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016587	CGCT	2	8	108468	108475	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016587	TTCA	2	8	108612	108619	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016587	CTTA	2	8	115205	115212	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016587	GGGC	2	8	116185	116192	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016587	GGAG	2	8	116460	116467	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016587	GATT	2	8	116740	116747	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016587	CCTC	2	8	116751	116758	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
58	NC_016587	TGGG	2	8	118171	118178	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016587	TGGC	2	8	119572	119579	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
60	NC_016587	CGTC	2	8	127652	127659	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016587	AAGA	2	8	127664	127671	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016587	GGGT	2	8	132536	132543	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016587	TGCC	2	8	132549	132556	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016587	CATC	2	8	133776	133783	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016587	CGGG	2	8	136383	136390	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
66	NC_016587	CTAA	2	8	136524	136531	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016587	GCAT	2	8	140642	140649	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016587	AAAG	2	8	140740	140747	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016587	GACG	2	8	140831	140838	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016587	GGGT	2	8	148241	148248	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016587	CGCC	2	8	155001	155008	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
72	NC_016587	GCCG	2	8	155066	155073	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016587	TGAA	2	8	158019	158026	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016587	ATTC	2	8	158684	158691	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016587	AAAT	2	8	158741	158748	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016587	GCGT	2	8	165129	165136	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016587	GCGA	2	8	167132	167139	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
78	NC_016587	CCCT	2	8	167248	167255	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
79	NC_016587	GGCC	2	8	181901	181908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016587	CGGC	2	8	181953	181960	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016587	GCCG	2	8	183041	183048	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016587	GGCC	2	8	183062	183069	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016587	GCGG	2	8	183077	183084	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016587	AAGG	2	8	184753	184760	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016587	GAGG	2	8	186306	186313	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016587	CCCT	2	8	186411	186418	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_016587	CCGA	2	8	188171	188178	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
88	NC_016587	AGGC	2	8	192865	192872	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016587	GAAT	2	8	198350	198357	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016587	GCGG	2	8	198480	198487	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
91	NC_016587	GATG	2	8	199032	199039	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016587	GGGA	2	8	203441	203448	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016587	TTGG	2	8	204720	204727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016587	GGCC	2	8	204839	204846	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016587	GCCG	2	8	204952	204959	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016587	GTCG	2	8	205687	205694	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016587	CGGG	2	8	208955	208962	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016587	GCGG	2	8	212781	212788	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016587	CCCT	2	8	219848	219855	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
100	NC_016587	TCCC	2	8	219914	219921	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
101	NC_016587	CCCT	2	8	220970	220977	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
102	NC_016587	GGGA	2	8	221070	221077	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016587	TTGC	2	8	224321	224328	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
104	NC_016587	CGAC	2	8	226456	226463	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016587	CCGG	2	8	226490	226497	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016587	CCGA	2	8	226523	226530	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016587	GGGC	2	8	230636	230643	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016587	AACA	2	8	230657	230664	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016587	GGGA	2	8	234916	234923	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016587	CCGC	2	8	238287	238294	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
111	NC_016587	CTCC	2	8	245292	245299	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
112	NC_016587	TCCC	3	12	245316	245327	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
113	NC_016587	GGCC	2	8	245397	245404	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016587	AGGG	2	8	245422	245429	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016587	CGGG	2	8	247739	247746	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016587	GCGG	2	8	249663	249670	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016587	GAGG	2	8	249722	249729	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016587	CCGG	2	8	250143	250150	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016587	TGCG	2	8	251266	251273	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016587	CCGA	2	8	251355	251362	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016587	TCGG	2	8	260479	260486	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
122	NC_016587	CCCT	2	8	260514	260521	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
123	NC_016587	CATC	2	8	260613	260620	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016587	ACGG	2	8	263465	263472	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
125	NC_016587	AGGC	2	8	263505	263512	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016587	CGGC	2	8	264039	264046	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016587	TCGA	2	8	267657	267664	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016587	TGGG	2	8	267712	267719	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016587	GCCG	2	8	271779	271786	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016587	GCTG	3	12	274571	274582	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016587	GGGC	2	8	274707	274714	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016587	GCCG	2	8	276301	276308	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016587	GCCG	2	8	276311	276318	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016587	TCGG	2	8	276340	276347	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016587	GTCG	2	8	277797	277804	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016587	ATGA	2	8	278146	278153	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
137	NC_016587	TGCC	2	8	278204	278211	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016587	CTTC	2	8	278883	278890	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016587	CGGC	2	8	278898	278905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016587	CCCT	2	8	281621	281628	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
141	NC_016587	CGGA	2	8	284011	284018	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016587	CGCA	2	8	284037	284044	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016587	TCCC	2	8	287733	287740	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
144	NC_016587	AGGG	2	8	287829	287836	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016587	CACC	2	8	296520	296527	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
146	NC_016587	CAAC	2	8	296632	296639	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016587	AATG	2	8	296688	296695	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016587	GCCC	2	8	297351	297358	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
149	NC_016587	TGGG	2	8	299028	299035	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016587	CGGA	2	8	299063	299070	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016587	TGCC	2	8	304185	304192	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016587	CCCT	2	8	305799	305806	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
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301	NC_016587	GCCG	2	8	643282	643289	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
302	NC_016587	GCCC	2	8	643330	643337	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
303	NC_016587	CCCG	2	8	643486	643493	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
304	NC_016587	CCCT	2	8	645223	645230	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.