MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p4

Total Repeats: 1709

< Previous1234Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1501	NC_016587	CCAT	2	8	552334	552341	25 %	25 %	0 %	50 %	375006736
1502	NC_016587	GAAC	2	8	552510	552517	50 %	0 %	25 %	25 %	375006736
1503	NC_016587	CGGC	2	8	552622	552629	0 %	0 %	50 %	50 %	375006736
1504	NC_016587	GCCC	2	8	552794	552801	0 %	0 %	25 %	75 %	375006737
1505	NC_016587	AGAT	2	8	552898	552905	50 %	25 %	25 %	0 %	375006737
1506	NC_016587	AGCC	2	8	553585	553592	25 %	0 %	25 %	50 %	375006737
1507	NC_016587	GATG	2	8	554319	554326	25 %	25 %	50 %	0 %	375006739
1508	NC_016587	GGCC	2	8	554403	554410	0 %	0 %	50 %	50 %	375006739
1509	NC_016587	CCGG	2	8	554538	554545	0 %	0 %	50 %	50 %	375006739
1510	NC_016587	CCAG	2	8	555179	555186	25 %	0 %	25 %	50 %	375006739
1511	NC_016587	CCAG	2	8	555357	555364	25 %	0 %	25 %	50 %	375006740
1512	NC_016587	GGCC	2	8	555450	555457	0 %	0 %	50 %	50 %	375006740
1513	NC_016587	GCCG	2	8	555571	555578	0 %	0 %	50 %	50 %	375006740
1514	NC_016587	CGGT	2	8	555710	555717	0 %	25 %	50 %	25 %	375006740
1515	NC_016587	AGGA	2	8	555941	555948	50 %	0 %	50 %	0 %	375006740
1516	NC_016587	GCTG	2	8	556287	556294	0 %	25 %	50 %	25 %	375006740
1517	NC_016587	GGTC	2	8	556323	556330	0 %	25 %	50 %	25 %	375006740
1518	NC_016587	GTCG	2	8	556720	556727	0 %	25 %	50 %	25 %	375006740
1519	NC_016587	CGGA	2	8	556904	556911	25 %	0 %	50 %	25 %	375006740
1520	NC_016587	ACGG	2	8	557406	557413	25 %	0 %	50 %	25 %	375006741
1521	NC_016587	GGCC	2	8	557756	557763	0 %	0 %	50 %	50 %	375006742
1522	NC_016587	CAGG	2	8	557898	557905	25 %	0 %	50 %	25 %	375006742
1523	NC_016587	ATCG	2	8	557916	557923	25 %	25 %	25 %	25 %	375006742
1524	NC_016587	CGGC	2	8	558829	558836	0 %	0 %	50 %	50 %	375006742
1525	NC_016587	CGCC	2	8	558884	558891	0 %	0 %	25 %	75 %	375006742
1526	NC_016587	TCGG	2	8	561240	561247	0 %	25 %	50 %	25 %	375006743
1527	NC_016587	GCGA	2	8	563221	563228	25 %	0 %	50 %	25 %	375006744
1528	NC_016587	CGGT	2	8	563266	563273	0 %	25 %	50 %	25 %	375006744
1529	NC_016587	GTCG	2	8	563803	563810	0 %	25 %	50 %	25 %	375006745
1530	NC_016587	GCCG	2	8	563876	563883	0 %	0 %	50 %	50 %	375006746
1531	NC_016587	ATCT	2	8	564048	564055	25 %	50 %	0 %	25 %	375006746
1532	NC_016587	ACCC	2	8	564069	564076	25 %	0 %	0 %	75 %	375006746
1533	NC_016587	CGAC	2	8	564400	564407	25 %	0 %	25 %	50 %	375006746
1534	NC_016587	GCCG	2	8	564837	564844	0 %	0 %	50 %	50 %	375006746
1535	NC_016587	GGCC	2	8	565247	565254	0 %	0 %	50 %	50 %	375006747
1536	NC_016587	TGGA	2	8	565374	565381	25 %	25 %	50 %	0 %	375006747
1537	NC_016587	GCCG	2	8	565541	565548	0 %	0 %	50 %	50 %	375006747
1538	NC_016587	GGCG	2	8	565777	565784	0 %	0 %	75 %	25 %	375006748
1539	NC_016587	ATCT	2	8	566246	566253	25 %	50 %	0 %	25 %	375006748
1540	NC_016587	GGCC	2	8	566539	566546	0 %	0 %	50 %	50 %	375006748
1541	NC_016587	CCGG	2	8	567229	567236	0 %	0 %	50 %	50 %	375006749
1542	NC_016587	ACCG	2	8	567421	567428	25 %	0 %	25 %	50 %	375006749
1543	NC_016587	GGGC	2	8	567564	567571	0 %	0 %	75 %	25 %	375006749
1544	NC_016587	CGGC	2	8	567793	567800	0 %	0 %	50 %	50 %	375006750
1545	NC_016587	GCCG	2	8	567847	567854	0 %	0 %	50 %	50 %	375006750
1546	NC_016587	GTCG	2	8	569100	569107	0 %	25 %	50 %	25 %	375006751
1547	NC_016587	AGCG	2	8	569179	569186	25 %	0 %	50 %	25 %	375006751
1548	NC_016587	GCCG	2	8	569325	569332	0 %	0 %	50 %	50 %	375006751
1549	NC_016587	CCAC	2	8	569613	569620	25 %	0 %	0 %	75 %	375006752
1550	NC_016587	GGCG	2	8	569930	569937	0 %	0 %	75 %	25 %	375006752
1551	NC_016587	CGGG	2	8	570253	570260	0 %	0 %	75 %	25 %	375006752
1552	NC_016587	GCCC	2	8	570385	570392	0 %	0 %	25 %	75 %	375006753
1553	NC_016587	ATGC	2	8	571207	571214	25 %	25 %	25 %	25 %	375006754
1554	NC_016587	TCCG	2	8	571436	571443	0 %	25 %	25 %	50 %	375006754
1555	NC_016587	CTGC	2	8	571983	571990	0 %	25 %	25 %	50 %	375006754
1556	NC_016587	GGCG	2	8	572539	572546	0 %	0 %	75 %	25 %	375006755
1557	NC_016587	CACC	2	8	572629	572636	25 %	0 %	0 %	75 %	375006755
1558	NC_016587	CTGC	2	8	572892	572899	0 %	25 %	25 %	50 %	375006755
1559	NC_016587	CCAG	2	8	574165	574172	25 %	0 %	25 %	50 %	375006756
1560	NC_016587	GGCC	2	8	574226	574233	0 %	0 %	50 %	50 %	375006756
1561	NC_016587	GCCG	2	8	576742	576749	0 %	0 %	50 %	50 %	375006758
1562	NC_016587	CGTC	2	8	576808	576815	0 %	25 %	25 %	50 %	375006758
1563	NC_016587	GGCC	2	8	577189	577196	0 %	0 %	50 %	50 %	375006758
1564	NC_016587	GGCT	2	8	577362	577369	0 %	25 %	50 %	25 %	375006758
1565	NC_016587	GACC	2	8	577591	577598	25 %	0 %	25 %	50 %	375006758
1566	NC_016587	GCAC	2	8	577949	577956	25 %	0 %	25 %	50 %	375006758
1567	NC_016587	CGGC	2	8	579156	579163	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1568	NC_016587	TCGG	2	8	579271	579278	0 %	25 %	50 %	25 %	375006759
1569	NC_016587	GTCG	2	8	579654	579661	0 %	25 %	50 %	25 %	375006759
1570	NC_016587	ACCG	2	8	579742	579749	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1571	NC_016587	GCCG	2	8	579813	579820	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1572	NC_016587	GACG	2	8	580467	580474	25 %	0 %	50 %	25 %	375006759
1573	NC_016587	CGGG	2	8	580937	580944	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1574	NC_016587	GCGG	2	8	582838	582845	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1575	NC_016587	CCGC	2	8	583022	583029	0 %	0 %	25 %	75 %	375006759
1576	NC_016587	CCGG	2	8	584110	584117	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1577	NC_016587	ACCG	2	8	584425	584432	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1578	NC_016587	CGCA	2	8	586906	586913	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1579	NC_016587	ACGG	2	8	586970	586977	25 %	0 %	50 %	25 %	375006759
1580	NC_016587	GCCA	2	8	587056	587063	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1581	NC_016587	CACC	2	8	587213	587220	25 %	0 %	0 %	75 %	375006759
1582	NC_016587	GACG	2	8	587313	587320	25 %	0 %	50 %	25 %	375006759
1583	NC_016587	ACCG	2	8	587374	587381	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1584	NC_016587	CGGC	2	8	587816	587823	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1585	NC_016587	GGGC	2	8	587840	587847	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1586	NC_016587	CGGC	3	12	588429	588440	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1587	NC_016587	GGCG	2	8	588474	588481	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1588	NC_016587	CGGC	2	8	588626	588633	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1589	NC_016587	TCGA	2	8	588694	588701	25 %	25 %	25 %	25 %	375006759
1590	NC_016587	CGAC	2	8	589280	589287	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1591	NC_016587	GGCG	2	8	589771	589778	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1592	NC_016587	GCGA	2	8	590026	590033	25 %	0 %	50 %	25 %	375006759
1593	NC_016587	GACC	2	8	590742	590749	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1594	NC_016587	GGCG	2	8	590940	590947	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1595	NC_016587	CCGG	2	8	592094	592101	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1596	NC_016587	GCGG	2	8	592444	592451	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1597	NC_016587	TCAG	2	8	592694	592701	25 %	25 %	25 %	25 %	375006759
1598	NC_016587	GGCC	2	8	593517	593524	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1599	NC_016587	CTAT	2	8	594293	594300	25 %	50 %	0 %	25 %	375006759
1600	NC_016587	CGGC	2	8	594395	594402	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1601	NC_016587	GGGC	2	8	594557	594564	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1602	NC_016587	GACG	2	8	595033	595040	25 %	0 %	50 %	25 %	375006759
1603	NC_016587	CCGC	2	8	595094	595101	0 %	0 %	25 %	75 %	375006759
1604	NC_016587	TCCA	2	8	595156	595163	25 %	25 %	0 %	50 %	375006759
1605	NC_016587	GCCA	2	8	595261	595268	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1606	NC_016587	CCGG	2	8	595815	595822	0 %	0 %	50 %	50 %	375006759
1607	NC_016587	GCGG	2	8	596607	596614	0 %	0 %	75 %	25 %	375006759
1608	NC_016587	CGGA	2	8	596957	596964	25 %	0 %	50 %	25 %	375006759
1609	NC_016587	ACCG	2	8	597595	597602	25 %	0 %	25 %	50 %	375006759
1610	NC_016587	CGCC	2	8	597627	597634	0 %	0 %	25 %	75 %	375006759
1611	NC_016587	GGTT	2	8	597791	597798	0 %	50 %	50 %	0 %	375006759
1612	NC_016587	TCCG	2	8	597861	597868	0 %	25 %	25 %	50 %	375006759
1613	NC_016587	GCCG	2	8	599278	599285	0 %	0 %	50 %	50 %	375006761
1614	NC_016587	GCTG	2	8	599329	599336	0 %	25 %	50 %	25 %	375006761
1615	NC_016587	GCCC	2	8	599408	599415	0 %	0 %	25 %	75 %	375006761
1616	NC_016587	GCCG	2	8	599422	599429	0 %	0 %	50 %	50 %	375006761
1617	NC_016587	CCAC	2	8	599777	599784	25 %	0 %	0 %	75 %	375006761
1618	NC_016587	CGGC	2	8	599905	599912	0 %	0 %	50 %	50 %	375006761
1619	NC_016587	GTGG	2	8	600303	600310	0 %	25 %	75 %	0 %	375006762
1620	NC_016587	GGCT	2	8	600709	600716	0 %	25 %	50 %	25 %	375006762
1621	NC_016587	GAAG	2	8	600924	600931	50 %	0 %	50 %	0 %	375006762
1622	NC_016587	CCTG	2	8	601151	601158	0 %	25 %	25 %	50 %	375006762
1623	NC_016587	GAGT	2	8	601330	601337	25 %	25 %	50 %	0 %	375006762
1624	NC_016587	CTGG	2	8	601998	602005	0 %	25 %	50 %	25 %	375006764
1625	NC_016587	GCGA	2	8	602094	602101	25 %	0 %	50 %	25 %	375006764
1626	NC_016587	GGGC	2	8	604138	604145	0 %	0 %	75 %	25 %	375006765
1627	NC_016587	GGGC	2	8	604329	604336	0 %	0 %	75 %	25 %	375006765
1628	NC_016587	CAGG	2	8	604420	604427	25 %	0 %	50 %	25 %	375006765
1629	NC_016587	CGGC	2	8	605190	605197	0 %	0 %	50 %	50 %	375006766
1630	NC_016587	CATC	2	8	605386	605393	25 %	25 %	0 %	50 %	375006766
1631	NC_016587	CCGG	2	8	605632	605639	0 %	0 %	50 %	50 %	375006766
1632	NC_016587	CGAC	2	8	605770	605777	25 %	0 %	25 %	50 %	375006766
1633	NC_016587	GCCC	2	8	606144	606151	0 %	0 %	25 %	75 %	375006767
1634	NC_016587	AGGA	2	8	606251	606258	50 %	0 %	50 %	0 %	375006767
1635	NC_016587	GCGG	2	8	606976	606983	0 %	0 %	75 %	25 %	375006768
1636	NC_016587	CACC	2	8	607925	607932	25 %	0 %	0 %	75 %	375006769
1637	NC_016587	GGTC	2	8	608402	608409	0 %	25 %	50 %	25 %	375006770
1638	NC_016587	CCAG	2	8	609406	609413	25 %	0 %	25 %	50 %	375006771
1639	NC_016587	GGCG	2	8	612561	612568	0 %	0 %	75 %	25 %	375006775
1640	NC_016587	CCCG	2	8	612603	612610	0 %	0 %	25 %	75 %	375006775
1641	NC_016587	GGCC	2	8	612753	612760	0 %	0 %	50 %	50 %	375006775
1642	NC_016587	CGGA	2	8	612779	612786	25 %	0 %	50 %	25 %	375006775
1643	NC_016587	ACCG	2	8	613291	613298	25 %	0 %	25 %	50 %	375006775
1644	NC_016587	CCGG	2	8	613634	613641	0 %	0 %	50 %	50 %	375006775
1645	NC_016587	TGGT	2	8	613670	613677	0 %	50 %	50 %	0 %	375006775
1646	NC_016587	GGCC	2	8	613919	613926	0 %	0 %	50 %	50 %	375006776
1647	NC_016587	AGGA	2	8	614347	614354	50 %	0 %	50 %	0 %	375006776
1648	NC_016587	CGGC	2	8	614663	614670	0 %	0 %	50 %	50 %	375006776
1649	NC_016587	GCCG	2	8	615660	615667	0 %	0 %	50 %	50 %	375006778
1650	NC_016587	CCGG	2	8	615913	615920	0 %	0 %	50 %	50 %	375006778
1651	NC_016587	CGGC	2	8	616208	616215	0 %	0 %	50 %	50 %	375006778
1652	NC_016587	CCAG	2	8	616289	616296	25 %	0 %	25 %	50 %	375006778
1653	NC_016587	CCAT	2	8	616309	616316	25 %	25 %	0 %	50 %	375006778
1654	NC_016587	AGCG	2	8	616769	616776	25 %	0 %	50 %	25 %	375006779
1655	NC_016587	CCGG	2	8	617530	617537	0 %	0 %	50 %	50 %	375006780
1656	NC_016587	TGCC	2	8	618829	618836	0 %	25 %	25 %	50 %	375006781
1657	NC_016587	GGCC	2	8	618914	618921	0 %	0 %	50 %	50 %	375006781
1658	NC_016587	CGCC	2	8	618944	618951	0 %	0 %	25 %	75 %	375006781
1659	NC_016587	CGGC	2	8	620062	620069	0 %	0 %	50 %	50 %	375006783
1660	NC_016587	CCGG	2	8	620140	620147	0 %	0 %	50 %	50 %	375006783
1661	NC_016587	CGGC	2	8	620339	620346	0 %	0 %	50 %	50 %	375006783
1662	NC_016587	TCGC	2	8	620528	620535	0 %	25 %	25 %	50 %	375006783
1663	NC_016587	CGCC	2	8	621020	621027	0 %	0 %	25 %	75 %	375006784
1664	NC_016587	CGCC	2	8	621425	621432	0 %	0 %	25 %	75 %	375006784
1665	NC_016587	CTGG	2	8	621537	621544	0 %	25 %	50 %	25 %	375006784
1666	NC_016587	CGCC	2	8	621551	621558	0 %	0 %	25 %	75 %	375006784
1667	NC_016587	CGGC	2	8	621653	621660	0 %	0 %	50 %	50 %	375006784
1668	NC_016587	GGGC	2	8	621849	621856	0 %	0 %	75 %	25 %	375006784
1669	NC_016587	CGGC	3	12	621871	621882	0 %	0 %	50 %	50 %	375006784
1670	NC_016587	GGAC	2	8	622197	622204	25 %	0 %	50 %	25 %	375006785
1671	NC_016587	GCCC	2	8	622489	622496	0 %	0 %	25 %	75 %	375006785
1672	NC_016587	AGCC	2	8	622667	622674	25 %	0 %	25 %	50 %	375006785
1673	NC_016587	CCGT	2	8	623115	623122	0 %	25 %	25 %	50 %	375006785
1674	NC_016587	CGCC	2	8	623981	623988	0 %	0 %	25 %	75 %	375006785
1675	NC_016587	GGCC	2	8	625990	625997	0 %	0 %	50 %	50 %	375006787
1676	NC_016587	CGGT	2	8	626032	626039	0 %	25 %	50 %	25 %	375006787
1677	NC_016587	CCCG	2	8	626420	626427	0 %	0 %	25 %	75 %	375006787
1678	NC_016587	CATG	2	8	626860	626867	25 %	25 %	25 %	25 %	375006788
1679	NC_016587	CCAC	2	8	628123	628130	25 %	0 %	0 %	75 %	375006789
1680	NC_016587	CGCC	2	8	628817	628824	0 %	0 %	25 %	75 %	375006790
1681	NC_016587	GCCG	2	8	628988	628995	0 %	0 %	50 %	50 %	375006790
1682	NC_016587	CGGC	2	8	629459	629466	0 %	0 %	50 %	50 %	375006790
1683	NC_016587	CGCC	2	8	629553	629560	0 %	0 %	25 %	75 %	375006790
1684	NC_016587	GGCC	2	8	629597	629604	0 %	0 %	50 %	50 %	375006790
1685	NC_016587	GCCG	2	8	629642	629649	0 %	0 %	50 %	50 %	375006790
1686	NC_016587	GCTC	2	8	629723	629730	0 %	25 %	25 %	50 %	375006790
1687	NC_016587	CGGC	2	8	630579	630586	0 %	0 %	50 %	50 %	375006791
1688	NC_016587	CGGG	2	8	631618	631625	0 %	0 %	75 %	25 %	375006792
1689	NC_016587	GCCC	2	8	631878	631885	0 %	0 %	25 %	75 %	375006792
1690	NC_016587	GCCG	2	8	632263	632270	0 %	0 %	50 %	50 %	375006792
1691	NC_016587	GATC	2	8	632502	632509	25 %	25 %	25 %	25 %	375006792
1692	NC_016587	TCGG	2	8	632690	632697	0 %	25 %	50 %	25 %	375006792
1693	NC_016587	CCTT	2	8	633750	633757	0 %	50 %	0 %	50 %	375006793
1694	NC_016587	GCCG	2	8	633865	633872	0 %	0 %	50 %	50 %	375006793
1695	NC_016587	GGCC	2	8	636212	636219	0 %	0 %	50 %	50 %	375006795
1696	NC_016587	CGGC	2	8	636268	636275	0 %	0 %	50 %	50 %	375006795
1697	NC_016587	GCCG	2	8	636720	636727	0 %	0 %	50 %	50 %	375006795
1698	NC_016587	TCGC	2	8	637846	637853	0 %	25 %	25 %	50 %	375006796
1699	NC_016587	CGGA	2	8	640257	640264	25 %	0 %	50 %	25 %	375006797
1700	NC_016587	CCGC	2	8	640507	640514	0 %	0 %	25 %	75 %	375006798
1701	NC_016587	CCGC	2	8	641491	641498	0 %	0 %	25 %	75 %	375006799
1702	NC_016587	CCGG	2	8	641531	641538	0 %	0 %	50 %	50 %	375006799
1703	NC_016587	AGGC	2	8	642291	642298	25 %	0 %	50 %	25 %	375006799
1704	NC_016587	GGTC	2	8	642715	642722	0 %	25 %	50 %	25 %	375006800
1705	NC_016587	CGAC	2	8	642832	642839	25 %	0 %	25 %	50 %	375006800
1706	NC_016587	CGCC	2	8	643766	643773	0 %	0 %	25 %	75 %	375006801
1707	NC_016587	CGGC	2	8	644254	644261	0 %	0 %	50 %	50 %	375006801
1708	NC_016587	CAGC	2	8	644750	644757	25 %	0 %	25 %	50 %	375006801
1709	NC_016587	TGCC	2	8	645145	645152	0 %	25 %	25 %	50 %	375006801

< Previous1234Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.