MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p2

Total Repeats: 325

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016586	GCGA	2	8	491	498	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016586	CAGA	2	8	1169	1176	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
3	NC_016586	GGTG	2	8	1178	1185	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016586	AAAG	2	8	1313	1320	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016586	TTGG	2	8	4184	4191	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016586	CCGG	2	8	5573	5580	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016586	CGAG	2	8	6748	6755	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016586	GAAC	2	8	11122	11129	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016586	AACG	2	8	11238	11245	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016586	GTGA	2	8	11465	11472	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016586	GGAC	2	8	11777	11784	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016586	TGCA	2	8	11875	11882	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016586	ACGG	2	8	12686	12693	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016586	GGAA	2	8	12934	12941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016586	GCGA	2	8	13426	13433	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016586	CAGA	2	8	14104	14111	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016586	GGTG	2	8	14113	14120	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016586	AAAG	2	8	14248	14255	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016586	CATC	2	8	16692	16699	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016586	GACA	2	8	16709	16716	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016586	CAAC	2	8	31941	31948	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016586	GGTC	2	8	32382	32389	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016586	TCAG	2	8	32654	32661	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016586	GTCT	2	8	35968	35975	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
25	NC_016586	CGCC	2	8	36061	36068	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
26	NC_016586	CCGC	2	8	36342	36349	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016586	CGGC	2	8	36734	36741	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016586	GCCG	2	8	39215	39222	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016586	TCCT	2	8	39253	39260	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016586	CGCC	2	8	40252	40259	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
31	NC_016586	GCTC	2	8	40293	40300	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016586	GATT	2	8	43425	43432	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016586	CGTT	2	8	43449	43456	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016586	GCCG	2	8	44548	44555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016586	CCGG	2	8	44852	44859	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016586	GAAG	2	8	44954	44961	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016586	CGGC	2	8	55394	55401	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016586	CGGC	2	8	60077	60084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016586	CCGT	2	8	62907	62914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016586	CCGG	2	8	63081	63088	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016586	GCCC	2	8	64560	64567	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
42	NC_016586	ACGT	2	8	64734	64741	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016586	GGCA	2	8	64934	64941	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016586	TCAA	2	8	65065	65072	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016586	AAGG	2	8	65211	65218	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016586	GTTG	2	8	78135	78142	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016586	CAAC	2	8	78153	78160	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016586	CCGG	2	8	79943	79950	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016586	CGAG	2	8	80215	80222	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016586	GCTG	2	8	80223	80230	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016586	GATG	2	8	80629	80636	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016586	TACG	2	8	80795	80802	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016586	CCTC	2	8	81058	81065	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_016586	CCGA	2	8	96401	96408	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016586	GATC	2	8	97090	97097	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016586	ATTC	2	8	97257	97264	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016586	GCCA	2	8	99491	99498	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016586	GGGC	2	8	100760	100767	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016586	CGGC	2	8	100794	100801	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016586	GGGC	2	8	101060	101067	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016586	CAGC	2	8	102791	102798	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016586	CTCG	2	8	102799	102806	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016586	CCGG	2	8	103071	103078	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016586	GCAG	2	8	103648	103655	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
65	NC_016586	CGGC	2	8	104095	104102	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016586	TCTT	2	8	104908	104915	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016586	GACC	2	8	105001	105008	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016586	GTCA	2	8	105030	105037	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
69	NC_016586	CGCC	2	8	112675	112682	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
70	NC_016586	GTCG	2	8	112731	112738	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
71	NC_016586	GCGT	2	8	112795	112802	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
72	NC_016586	CGGA	2	8	113157	113164	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016586	GCCA	2	8	113759	113766	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016586	GTCA	2	8	114310	114317	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016586	ACGG	2	8	114574	114581	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016586	CCGG	2	8	114786	114793	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016586	CCTG	2	8	115137	115144	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016586	AAAG	2	8	117317	117324	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016586	GTAT	2	8	117384	117391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016586	AAAG	2	8	117639	117646	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016586	GATC	2	8	117720	117727	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016586	CGAG	2	8	117820	117827	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016586	CGGG	2	8	119207	119214	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016586	CTCC	2	8	119609	119616	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
85	NC_016586	GCAT	2	8	128412	128419	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016586	CGGC	2	8	129139	129146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016586	TTTC	2	8	138545	138552	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016586	ACAA	2	8	139815	139822	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016586	TCGA	2	8	139983	139990	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016586	TCCC	2	8	140097	140104	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
91	NC_016586	GGAA	2	8	157500	157507	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016586	GGGA	2	8	167152	167159	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016586	GGGC	2	8	169241	169248	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016586	CGTC	2	8	169300	169307	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016586	CCGC	2	8	170611	170618	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
96	NC_016586	GCTG	2	8	171333	171340	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
97	NC_016586	GGAT	2	8	176487	176494	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016586	GCCG	2	8	176706	176713	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016586	GCCG	2	8	176874	176881	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016586	GCTG	2	8	184379	184386	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016586	CATC	2	8	184525	184532	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016586	CCCG	2	8	187738	187745	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
103	NC_016586	CATC	2	8	196245	196252	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016586	GCCG	2	8	197906	197913	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016586	CGGG	2	8	204052	204059	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016586	GACC	2	8	204238	204245	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016586	GTCC	2	8	204986	204993	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016586	GAGG	2	8	205251	205258	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016586	CGTC	2	8	208073	208080	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016586	TCGG	2	8	208477	208484	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016586	CGGC	2	8	214425	214432	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016586	CTTC	2	8	216632	216639	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016586	TTCG	2	8	218021	218028	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016586	TTCC	2	8	227160	227167	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016586	GGCG	2	8	227687	227694	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016586	TATC	2	8	230006	230013	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016586	TCCG	2	8	230139	230146	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016586	TGCC	2	8	232168	232175	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016586	CAGG	2	8	232346	232353	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016586	CGGG	2	8	232370	232377	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016586	CACG	2	8	232441	232448	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016586	CGGC	2	8	232500	232507	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
123	NC_016586	AGAA	2	8	235714	235721	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016586	CATC	2	8	235784	235791	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016586	CGCC	2	8	237575	237582	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
126	NC_016586	CTTT	2	8	237737	237744	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
127	NC_016586	GGCA	2	8	237896	237903	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016586	GCGG	2	8	241510	241517	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
129	NC_016586	GCCC	2	8	241527	241534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
130	NC_016586	ACCG	2	8	246778	246785	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
131	NC_016586	CGAG	2	8	246812	246819	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016586	GCAA	2	8	248869	248876	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016586	GGAC	2	8	254203	254210	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016586	CGTC	2	8	254232	254239	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016586	CCAG	2	8	259327	259334	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016586	CGGC	2	8	259582	259589	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016586	GAGG	2	8	266365	266372	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
138	NC_016586	CCGT	2	8	268747	268754	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016586	CTCC	2	8	269010	269017	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
140	NC_016586	ACGA	2	8	270998	271005	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016586	CGAC	2	8	272134	272141	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016586	CCCT	2	8	278786	278793	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
143	NC_016586	AGGG	2	8	278875	278882	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016586	GAGG	2	8	283666	283673	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
145	NC_016586	CTTT	2	8	285992	285999	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
146	NC_016586	ATGG	2	8	286007	286014	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
147	NC_016586	GCTC	2	8	286369	286376	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016586	TTAC	2	8	286894	286901	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
149	NC_016586	GAAA	2	8	287182	287189	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016586	TTGC	2	8	287277	287284	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
151	NC_016586	TAGT	2	8	287672	287679	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016586	GCTG	2	8	288104	288111	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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301	NC_016586	GGGC	2	8	711016	711023	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.