MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p1

Total Repeats: 57

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016585	ATCGGG	2	12	14285	14296	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016585	CCCGGC	2	12	30533	30544	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
3	NC_016585	CATGTC	2	12	42022	42033	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016585	CGGGCA	2	12	54631	54642	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016585	CCGGTG	2	12	58201	58212	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016585	CCGGCC	2	12	64708	64719	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
7	NC_016585	TAGGGT	2	12	84137	84148	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016585	CGCTTG	2	12	100610	100621	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016585	ATGCAC	2	12	124591	124602	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016585	CGGCTT	2	12	142816	142827	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016585	CGGCGA	2	12	143215	143226	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016585	CCCTTT	2	12	167105	167116	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016585	CTCGCG	2	12	169587	169598	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016585	CTGGGG	2	12	184074	184085	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016585	GTCGAT	2	12	188319	188330	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016585	CAACTC	2	12	189920	189931	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016585	CCGCCT	2	12	236768	236779	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_016585	CATGCG	2	12	270480	270491	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016585	TCCGGT	2	12	284744	284755	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016585	TCCGGA	2	12	298831	298842	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016585	CGATCC	2	12	303907	303918	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016585	CAACCG	2	12	303932	303943	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016585	AAGCCG	2	12	306670	306681	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016585	CCGATT	2	12	321955	321966	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016585	GCTGCG	2	12	336178	336189	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016585	GTTGAC	2	12	345954	345965	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016585	ATGCAA	2	12	379709	379720	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
28	NC_016585	GCTCCG	2	12	380951	380962	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016585	TCCACC	2	12	404136	404147	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
30	NC_016585	GGGGGC	2	12	404506	404517	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016585	TGCGAC	2	12	408980	408991	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_016585	CACATG	2	12	409072	409083	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_016585	GCAGTG	2	12	409111	409122	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016585	GATCGG	2	12	416223	416234	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016585	GGGCCG	2	12	441826	441837	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
36	NC_016585	TCGACA	2	12	442045	442056	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016585	GGCAGG	2	12	442372	442383	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016585	CGCCCG	2	12	442418	442429	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
39	NC_016585	TTATGG	2	12	479894	479905	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016585	CCCATT	2	12	524646	524657	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016585	TCCGGG	2	12	529054	529065	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016585	GCCGCA	2	12	538937	538948	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016585	GCCGGC	2	12	561645	561656	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016585	TCGCAC	2	12	633770	633781	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016585	CCGGAA	2	12	670407	670418	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016585	ATTCCA	2	12	707465	707476	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016585	CCCGGA	2	12	750697	750708	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016585	CCGGGG	2	12	805064	805075	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016585	GCACTC	2	12	858163	858174	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016585	GCCTGT	2	12	925099	925110	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016585	TTCCGT	2	12	937567	937578	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016585	CGGGGC	2	12	949730	949741	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016585	ATCGGC	2	12	967527	967538	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016585	GCTCCG	2	12	976008	976019	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016585	ATTTTC	2	12	1002251	1002262	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
56	NC_016585	TGGCGT	2	12	1013570	1013581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016585	CCCGGA	2	12	1039493	1039504	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.