MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p1

Total Repeats: 940

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016585	ACGCG	2	10	321	330	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016585	TGATT	2	10	368	377	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016585	TCCCG	2	10	1341	1350	0 %	20 %	20 %	60 %	374998024
4	NC_016585	CACGA	2	10	2228	2237	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
5	NC_016585	CCGAA	2	10	3122	3131	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016585	CGCGG	2	10	4022	4031	0 %	0 %	60 %	40 %	374998025
7	NC_016585	CCGCT	2	10	4162	4171	0 %	20 %	20 %	60 %	374998025
8	NC_016585	ACCGC	2	10	7526	7535	20 %	0 %	20 %	60 %	374998027
9	NC_016585	CCGAT	2	10	12270	12279	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
10	NC_016585	ATCCG	2	10	13686	13695	20 %	20 %	20 %	40 %	374998029
11	NC_016585	CCGGC	2	10	13821	13830	0 %	0 %	40 %	60 %	374998029
12	NC_016585	GGCCG	3	15	15949	15963	0 %	0 %	60 %	40 %	374998033
13	NC_016585	GGTCG	2	10	17657	17666	0 %	20 %	60 %	20 %	374998034
14	NC_016585	CGATC	2	10	18022	18031	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016585	GCCGG	2	10	18971	18980	0 %	0 %	60 %	40 %	374998036
16	NC_016585	CGGCC	2	10	19273	19282	0 %	0 %	40 %	60 %	374998036
17	NC_016585	CGCAG	2	10	19920	19929	20 %	0 %	40 %	40 %	374998037
18	NC_016585	CCGCG	2	10	20528	20537	0 %	0 %	40 %	60 %	374998037
19	NC_016585	GCCGC	2	10	20904	20913	0 %	0 %	40 %	60 %	374998037
20	NC_016585	GGAAG	2	10	20943	20952	40 %	0 %	60 %	0 %	374998037
21	NC_016585	GGGCC	2	10	23994	24003	0 %	0 %	60 %	40 %	374998039
22	NC_016585	GCAGG	2	10	26146	26155	20 %	0 %	60 %	20 %	374998041
23	NC_016585	GCCGC	2	10	26872	26881	0 %	0 %	40 %	60 %	374998042
24	NC_016585	GTGCC	2	10	27796	27805	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
25	NC_016585	GCGCC	2	10	28336	28345	0 %	0 %	40 %	60 %	374998043
26	NC_016585	GCTCC	2	10	32291	32300	0 %	20 %	20 %	60 %	374998046
27	NC_016585	CCGCC	2	10	33397	33406	0 %	0 %	20 %	80 %	374998047
28	NC_016585	CGGCC	2	10	33916	33925	0 %	0 %	40 %	60 %	374998047
29	NC_016585	CGCGC	2	10	33930	33939	0 %	0 %	40 %	60 %	374998047
30	NC_016585	CGGGC	2	10	34961	34970	0 %	0 %	60 %	40 %	374998048
31	NC_016585	GCCCA	2	10	35145	35154	20 %	0 %	20 %	60 %	374998049
32	NC_016585	GCTGA	2	10	35490	35499	20 %	20 %	40 %	20 %	374998049
33	NC_016585	CGGCC	2	10	35507	35516	0 %	0 %	40 %	60 %	374998049
34	NC_016585	AGCGC	2	10	35789	35798	20 %	0 %	40 %	40 %	374998049
35	NC_016585	CAGGA	2	10	35863	35872	40 %	0 %	40 %	20 %	374998049
36	NC_016585	CCGCC	2	10	37526	37535	0 %	0 %	20 %	80 %	374998049
37	NC_016585	GGGGC	2	10	37800	37809	0 %	0 %	80 %	20 %	374998050
38	NC_016585	ATCAA	2	10	38639	38648	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
39	NC_016585	GCGCC	2	10	39788	39797	0 %	0 %	40 %	60 %	374998051
40	NC_016585	TGCGC	2	10	40974	40983	0 %	20 %	40 %	40 %	374998053
41	NC_016585	CCAGC	2	10	43678	43687	20 %	0 %	20 %	60 %	374998055
42	NC_016585	CCCAG	2	10	44087	44096	20 %	0 %	20 %	60 %	374998056
43	NC_016585	CGATG	2	10	44115	44124	20 %	20 %	40 %	20 %	374998056
44	NC_016585	CCGCG	2	10	46404	46413	0 %	0 %	40 %	60 %	374998058
45	NC_016585	CTGCG	2	10	47150	47159	0 %	20 %	40 %	40 %	374998058
46	NC_016585	ACGGC	2	10	48149	48158	20 %	0 %	40 %	40 %	374998058
47	NC_016585	GCCCC	2	10	48213	48222	0 %	0 %	20 %	80 %	374998058
48	NC_016585	CTCCC	2	10	51477	51486	0 %	20 %	0 %	80 %	374998059
49	NC_016585	CGGGC	2	10	51501	51510	0 %	0 %	60 %	40 %	374998059
50	NC_016585	AGCGG	2	10	51916	51925	20 %	0 %	60 %	20 %	374998059
51	NC_016585	CCCTC	2	10	52283	52292	0 %	20 %	0 %	80 %	374998060
52	NC_016585	CGAGC	2	10	52401	52410	20 %	0 %	40 %	40 %	374998060
53	NC_016585	CGACC	2	10	52545	52554	20 %	0 %	20 %	60 %	374998060
54	NC_016585	GGACT	2	10	54464	54473	20 %	20 %	40 %	20 %	374998061
55	NC_016585	GACAG	2	10	55572	55581	40 %	0 %	40 %	20 %	374998062
56	NC_016585	GCCGC	2	10	55633	55642	0 %	0 %	40 %	60 %	374998062
57	NC_016585	CTGCC	2	10	55959	55968	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
58	NC_016585	CCCTC	2	10	56457	56466	0 %	20 %	0 %	80 %	374998063
59	NC_016585	GTGCG	2	10	57439	57448	0 %	20 %	60 %	20 %	374998064
60	NC_016585	GTCCT	2	10	57673	57682	0 %	40 %	20 %	40 %	374998064
61	NC_016585	GCCCC	2	10	58427	58436	0 %	0 %	20 %	80 %	374998065
62	NC_016585	CCTGC	2	10	60196	60205	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
63	NC_016585	TGCGC	2	10	61040	61049	0 %	20 %	40 %	40 %	374998067
64	NC_016585	CGCGA	2	10	61191	61200	20 %	0 %	40 %	40 %	374998067
65	NC_016585	CCCGA	2	10	61533	61542	20 %	0 %	20 %	60 %	374998067
66	NC_016585	CTTCG	2	10	62125	62134	0 %	40 %	20 %	40 %	374998068
67	NC_016585	CACAG	2	10	62584	62593	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016585	CCGGT	2	10	64214	64223	0 %	20 %	40 %	40 %	374998069
69	NC_016585	CAGGG	2	10	65291	65300	20 %	0 %	60 %	20 %	374998070
70	NC_016585	CCGGC	2	10	67059	67068	0 %	0 %	40 %	60 %	374998070
71	NC_016585	GGCGC	2	10	67269	67278	0 %	0 %	60 %	40 %	374998070
72	NC_016585	CCGCC	2	10	67616	67625	0 %	0 %	20 %	80 %	374998070
73	NC_016585	GCCCG	2	10	67902	67911	0 %	0 %	40 %	60 %	374998070
74	NC_016585	TCCTG	2	10	69288	69297	0 %	40 %	20 %	40 %	374998071
75	NC_016585	TGGCG	2	10	69593	69602	0 %	20 %	60 %	20 %	374998071
76	NC_016585	GGGGA	2	10	72515	72524	20 %	0 %	80 %	0 %	374998074
77	NC_016585	CGGCG	2	10	72874	72883	0 %	0 %	60 %	40 %	374998074
78	NC_016585	AAAAT	2	10	74155	74164	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016585	AGCCA	2	10	74237	74246	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
80	NC_016585	GCTTC	2	10	77019	77028	0 %	40 %	20 %	40 %	374998078
81	NC_016585	ACGGA	2	10	80466	80475	40 %	0 %	40 %	20 %	374998081
82	NC_016585	CCGTC	2	10	81419	81428	0 %	20 %	20 %	60 %	374998082
83	NC_016585	GGCGC	2	10	81711	81720	0 %	0 %	60 %	40 %	374998082
84	NC_016585	TGCGG	2	10	82204	82213	0 %	20 %	60 %	20 %	374998082
85	NC_016585	TCTGA	2	10	83987	83996	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016585	TCCCC	2	10	84055	84064	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
87	NC_016585	CGCGC	2	10	84480	84489	0 %	0 %	40 %	60 %	374998084
88	NC_016585	GCGCC	2	10	87319	87328	0 %	0 %	40 %	60 %	374998086
89	NC_016585	CATGA	2	10	87607	87616	40 %	20 %	20 %	20 %	374998086
90	NC_016585	GTCCT	2	10	88678	88687	0 %	40 %	20 %	40 %	374998088
91	NC_016585	CAGGG	2	10	90131	90140	20 %	0 %	60 %	20 %	374998090
92	NC_016585	CAGCG	2	10	90350	90359	20 %	0 %	40 %	40 %	374998091
93	NC_016585	GCGCC	2	10	90703	90712	0 %	0 %	40 %	60 %	374998091
94	NC_016585	CCGTC	2	10	90837	90846	0 %	20 %	20 %	60 %	374998091
95	NC_016585	GCCCC	2	10	91504	91513	0 %	0 %	20 %	80 %	374998092
96	NC_016585	GGCGC	2	10	92504	92513	0 %	0 %	60 %	40 %	374998093
97	NC_016585	GGCCC	2	10	92567	92576	0 %	0 %	40 %	60 %	374998093
98	NC_016585	GGCAT	2	10	92686	92695	20 %	20 %	40 %	20 %	374998093
99	NC_016585	ACGGC	2	10	92805	92814	20 %	0 %	40 %	40 %	374998093
100	NC_016585	CGGGC	2	10	94876	94885	0 %	0 %	60 %	40 %	374998095
101	NC_016585	CAGAC	2	10	95642	95651	40 %	0 %	20 %	40 %	374998096
102	NC_016585	CCGGC	2	10	97134	97143	0 %	0 %	40 %	60 %	374998099
103	NC_016585	GGCCA	2	10	99745	99754	20 %	0 %	40 %	40 %	374998102
104	NC_016585	TTTGC	2	10	99899	99908	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016585	CGACC	2	10	100035	100044	20 %	0 %	20 %	60 %	374998103
106	NC_016585	AGGGC	2	10	100203	100212	20 %	0 %	60 %	20 %	374998103
107	NC_016585	GGTCA	2	10	100839	100848	20 %	20 %	40 %	20 %	374998104
108	NC_016585	GGGGA	2	10	103002	103011	20 %	0 %	80 %	0 %	374998106
109	NC_016585	CGGCT	2	10	103284	103293	0 %	20 %	40 %	40 %	374998106
110	NC_016585	GTGCG	2	10	103702	103711	0 %	20 %	60 %	20 %	374998106
111	NC_016585	ACCCT	2	10	104716	104725	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
112	NC_016585	CCGCG	2	10	105653	105662	0 %	0 %	40 %	60 %	374998108
113	NC_016585	CCCGG	2	10	106211	106220	0 %	0 %	40 %	60 %	374998108
114	NC_016585	GCGGG	2	10	106957	106966	0 %	0 %	80 %	20 %	374998108
115	NC_016585	GAGCA	2	10	107220	107229	40 %	0 %	40 %	20 %	374998108
116	NC_016585	ACCGC	2	10	109313	109322	20 %	0 %	20 %	60 %	374998109
117	NC_016585	TGCCG	2	10	110823	110832	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016585	GCCGG	2	10	114562	114571	0 %	0 %	60 %	40 %	374998111
119	NC_016585	AGGGC	2	10	116361	116370	20 %	0 %	60 %	20 %	374998113
120	NC_016585	ACGGC	2	10	116507	116516	20 %	0 %	40 %	40 %	374998113
121	NC_016585	CGCGG	2	10	116988	116997	0 %	0 %	60 %	40 %	374998113
122	NC_016585	GGGCC	2	10	119965	119974	0 %	0 %	60 %	40 %	374998115
123	NC_016585	TTCCG	2	10	122258	122267	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
124	NC_016585	CGCGC	2	10	123733	123742	0 %	0 %	40 %	60 %	374998120
125	NC_016585	CTGAA	2	10	124080	124089	40 %	20 %	20 %	20 %	374998121
126	NC_016585	TGTGG	2	10	126750	126759	0 %	40 %	60 %	0 %	374998125
127	NC_016585	ACGGC	2	10	128377	128386	20 %	0 %	40 %	40 %	374998127
128	NC_016585	ATCCG	2	10	128463	128472	20 %	20 %	20 %	40 %	374998127
129	NC_016585	GGAAA	2	10	128643	128652	60 %	0 %	40 %	0 %	374998128
130	NC_016585	GTGAT	2	10	128725	128734	20 %	40 %	40 %	0 %	374998128
131	NC_016585	TATAT	2	10	129247	129256	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016585	TCCTA	2	10	130487	130496	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
133	NC_016585	ACGAA	2	10	130552	130561	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
134	NC_016585	CCTCG	2	10	132196	132205	0 %	20 %	20 %	60 %	374998132
135	NC_016585	CTGAT	2	10	133882	133891	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
136	NC_016585	TCCGG	2	10	133989	133998	0 %	20 %	40 %	40 %	374998134
137	NC_016585	TTGGC	2	10	134047	134056	0 %	40 %	40 %	20 %	374998134
138	NC_016585	CCGGG	2	10	134422	134431	0 %	0 %	60 %	40 %	374998134
139	NC_016585	ATCGG	2	10	134616	134625	20 %	20 %	40 %	20 %	374998134
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244	NC_016585	GCCGG	2	10	270648	270657	0 %	0 %	60 %	40 %	374998230
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250	NC_016585	GCGCT	2	10	275870	275879	0 %	20 %	40 %	40 %	374998233
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254	NC_016585	GCCGA	2	10	282113	282122	20 %	0 %	40 %	40 %	374998238
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262	NC_016585	CCCGT	2	10	287615	287624	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
263	NC_016585	ATCAG	2	10	287942	287951	40 %	20 %	20 %	20 %	374998244
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267	NC_016585	CACCG	2	10	292012	292021	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
268	NC_016585	AGAGC	2	10	293382	293391	40 %	0 %	40 %	20 %	374998248
269	NC_016585	CATCG	2	10	294600	294609	20 %	20 %	20 %	40 %	374998249
270	NC_016585	GTCCA	2	10	294635	294644	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
271	NC_016585	GCGGA	2	10	294936	294945	20 %	0 %	60 %	20 %	374998250
272	NC_016585	GCAGA	2	10	294992	295001	40 %	0 %	40 %	20 %	374998250
273	NC_016585	AGGGC	2	10	295153	295162	20 %	0 %	60 %	20 %	374998250
274	NC_016585	CCGGA	2	10	295296	295305	20 %	0 %	40 %	40 %	374998250
275	NC_016585	GTTAT	2	10	295448	295457	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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382	NC_016585	GTCCG	2	10	418855	418864	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
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384	NC_016585	GACGG	2	10	419533	419542	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
385	NC_016585	CGGCC	2	10	420115	420124	0 %	0 %	40 %	60 %	374998363
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