MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Azospirillum lipoferum 4B plasmid AZO_p1

Total Repeats: 476

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016585	CTTT	2	8	77	84	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016585	CACC	2	8	212	219	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
3	NC_016585	GTCT	2	8	220	227	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016585	TCGC	2	8	916	923	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016585	CCGT	2	8	1655	1662	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016585	TGCA	2	8	2464	2471	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016585	GTCC	2	8	2562	2569	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016585	CGTT	2	8	3101	3108	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016585	CGTT	2	8	3224	3231	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016585	CCCG	2	8	3471	3478	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
11	NC_016585	GTCG	2	8	3556	3563	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016585	AGGC	2	8	7766	7773	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016585	TTCT	2	8	7872	7879	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
14	NC_016585	TTGC	2	8	7899	7906	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
15	NC_016585	TCCC	2	8	12241	12248	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016585	TCGG	2	8	12255	12262	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016585	AGGG	2	8	12351	12358	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016585	CCGG	2	8	12503	12510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016585	CCTG	2	8	14240	14247	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016585	TCCC	2	8	27815	27822	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
21	NC_016585	AGGG	2	8	27900	27907	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016585	GAAC	2	8	34404	34411	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016585	GCCC	2	8	40659	40666	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
24	NC_016585	GCCG	2	8	52108	52115	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016585	CCGG	2	8	54503	54510	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016585	GCCG	2	8	54531	54538	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016585	GCCG	2	8	54584	54591	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016585	GTCG	2	8	55881	55888	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016585	GGTC	2	8	56075	56082	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016585	GGGC	2	8	57894	57901	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016585	CGTC	2	8	62645	62652	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016585	TAGA	2	8	68716	68723	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016585	TGCG	2	8	68792	68799	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016585	TGTA	2	8	68908	68915	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016585	CGTC	2	8	69923	69930	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016585	CAAT	2	8	70268	70275	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016585	CAGC	2	8	82356	82363	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016585	CCTT	2	8	82598	82605	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016585	AAGG	2	8	82645	82652	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016585	GTCC	2	8	83979	83986	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016585	CATC	2	8	88511	88518	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016585	CCAT	2	8	90220	90227	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016585	GCCA	2	8	95016	95023	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016585	CCGC	2	8	95029	95036	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
45	NC_016585	CCGC	2	8	95678	95685	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
46	NC_016585	CCGT	2	8	95738	95745	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016585	GCTT	2	8	96065	96072	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
48	NC_016585	GGAT	2	8	96103	96110	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016585	CTTT	2	8	98658	98665	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016585	CCCG	2	8	99958	99965	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_016585	CTGC	2	8	101422	101429	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016585	CCGG	2	8	110813	110820	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016585	CCGT	2	8	110849	110856	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016585	CCAG	2	8	110916	110923	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016585	GATG	2	8	110962	110969	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016585	CAAC	2	8	119404	119411	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
57	NC_016585	AGCA	2	8	121908	121915	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
58	NC_016585	GGCA	2	8	122316	122323	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
59	NC_016585	TTTG	2	8	122381	122388	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016585	ACCT	2	8	124686	124693	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016585	GATT	2	8	127384	127391	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016585	CCGG	2	8	127442	127449	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016585	CCGG	2	8	127572	127579	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016585	CTGC	2	8	127877	127884	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016585	GCCG	2	8	133340	133347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016585	CAGG	2	8	133443	133450	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016585	GCCC	2	8	133496	133503	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_016585	ATGG	2	8	133526	133533	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016585	GAAT	2	8	133714	133721	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016585	GAAT	2	8	137765	137772	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016585	TTGA	2	8	140189	140196	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016585	TGGA	2	8	142841	142848	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016585	GACC	2	8	143116	143123	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
74	NC_016585	GACC	2	8	143149	143156	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016585	ACTG	2	8	163963	163970	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
76	NC_016585	GGCG	2	8	164108	164115	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
77	NC_016585	CAAC	2	8	164142	164149	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016585	CTGC	2	8	167134	167141	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016585	GACA	2	8	168323	168330	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016585	GCCG	2	8	168586	168593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016585	GGTG	2	8	168876	168883	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016585	CCTC	2	8	168899	168906	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
83	NC_016585	CAGC	2	8	169671	169678	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016585	GATG	2	8	170062	170069	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016585	TACG	2	8	170228	170235	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
86	NC_016585	CCTC	2	8	170491	170498	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
87	NC_016585	CCGC	2	8	171113	171120	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
88	NC_016585	CGTT	2	8	171417	171424	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016585	AAAC	2	8	181857	181864	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016585	TTTA	2	8	181921	181928	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016585	CAAC	2	8	181975	181982	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016585	GGAT	2	8	182095	182102	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016585	GAGG	2	8	182887	182894	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016585	ACGT	2	8	183149	183156	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016585	CATC	2	8	183316	183323	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016585	CCGC	2	8	183578	183585	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
97	NC_016585	CGAC	2	8	183768	183775	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016585	ACCC	2	8	188540	188547	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
99	NC_016585	CCAT	2	8	188762	188769	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016585	CGGT	2	8	188978	188985	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016585	CCGT	2	8	189392	189399	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016585	GATG	2	8	189421	189428	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016585	CGGC	2	8	189470	189477	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016585	CCGC	2	8	189631	189638	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
105	NC_016585	CGCC	2	8	193907	193914	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
106	NC_016585	GACG	2	8	194053	194060	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016585	GAGG	2	8	202720	202727	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016585	CCCT	2	8	207129	207136	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
109	NC_016585	CGGC	2	8	207153	207160	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016585	GGGA	2	8	207250	207257	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016585	ACGA	2	8	207319	207326	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016585	AGGG	2	8	208662	208669	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016585	GCCG	2	8	209608	209615	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016585	GGCC	2	8	209625	209632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016585	CAGG	2	8	210065	210072	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016585	GGAG	2	8	210157	210164	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016585	AGGG	2	8	217394	217401	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016585	AAGG	2	8	219149	219156	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016585	CGGC	2	8	223972	223979	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016585	CCGG	2	8	232014	232021	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016585	CCGC	2	8	237902	237909	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
122	NC_016585	GAGC	2	8	237953	237960	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016585	CAAC	2	8	240618	240625	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016585	GCCG	2	8	243451	243458	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016585	TCCA	2	8	243463	243470	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
126	NC_016585	CCGG	2	8	262741	262748	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016585	CGGC	2	8	265809	265816	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016585	TGAT	2	8	265917	265924	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016585	CAAA	2	8	270465	270472	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016585	TGCG	2	8	272588	272595	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016585	AGGG	2	8	273182	273189	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016585	CCCT	2	8	273206	273213	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
133	NC_016585	CGGA	2	8	276833	276840	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
134	NC_016585	CCGG	2	8	276866	276873	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
135	NC_016585	AGGG	2	8	279912	279919	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016585	GGCG	2	8	284832	284839	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016585	CGGT	2	8	284900	284907	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016585	CCGG	2	8	285429	285436	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
139	NC_016585	GAAA	2	8	289144	289151	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
140	NC_016585	CTTT	2	8	289173	289180	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016585	GGGC	2	8	291334	291341	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
142	NC_016585	CTGG	2	8	291582	291589	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016585	GCCA	2	8	294659	294666	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016585	GCGG	2	8	294732	294739	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016585	CGGC	2	8	295543	295550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
146	NC_016585	GCCT	2	8	295567	295574	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016585	CGGC	2	8	296758	296765	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016585	CATC	2	8	297076	297083	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016585	GGAA	2	8	297130	297137	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016585	GGAG	2	8	298888	298895	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016585	GCCG	2	8	303223	303230	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
152	NC_016585	CGGG	3	12	303275	303286	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
153	NC_016585	GCCG	3	12	303299	303310	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016585	CGGC	2	8	303625	303632	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
155	NC_016585	CCGG	2	8	304278	304285	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
156	NC_016585	GCCG	2	8	304347	304354	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
157	NC_016585	GCAT	2	8	304380	304387	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
158	NC_016585	TGGG	2	8	304792	304799	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
159	NC_016585	TCCC	2	8	304837	304844	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
160	NC_016585	ATGC	2	8	306562	306569	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
161	NC_016585	TCAA	2	8	306683	306690	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
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164	NC_016585	AAAC	2	8	309389	309396	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
165	NC_016585	GATG	2	8	310458	310465	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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167	NC_016585	GCCG	2	8	311626	311633	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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170	NC_016585	GGGC	2	8	312274	312281	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
171	NC_016585	TCCC	2	8	317246	317253	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
172	NC_016585	TGCG	2	8	323210	323217	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
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179	NC_016585	TGTC	2	8	332405	332412	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
180	NC_016585	GATC	2	8	337591	337598	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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189	NC_016585	TTCG	2	8	352908	352915	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
190	NC_016585	GATT	2	8	353443	353450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
191	NC_016585	GCCG	2	8	353489	353496	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.