MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Desulfosporosinus orientis DSM 765 chromosome

Total Repeats: 4010

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016584	TTCAA	2	10	154	163	40 %	40 %	0 %	20 %	374992781
2	NC_016584	TTTAT	2	10	760	769	20 %	80 %	0 %	0 %	374992782
3	NC_016584	TAATC	2	10	1948	1957	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
4	NC_016584	TTTTC	2	10	3588	3597	0 %	80 %	0 %	20 %	374992784
5	NC_016584	GATTT	2	10	3831	3840	20 %	60 %	20 %	0 %	374992784
6	NC_016584	AATTA	2	10	7517	7526	60 %	40 %	0 %	0 %	374992787
7	NC_016584	GAAAA	2	10	7647	7656	80 %	0 %	20 %	0 %	374992787
8	NC_016584	TTCTT	2	10	8467	8476	0 %	80 %	0 %	20 %	374992787
9	NC_016584	TATCA	2	10	9679	9688	40 %	40 %	0 %	20 %	374992788
10	NC_016584	GATGT	2	10	10301	10310	20 %	40 %	40 %	0 %	374992789
11	NC_016584	GTTTG	2	10	10870	10879	0 %	60 %	40 %	0 %	374992790
12	NC_016584	GTCTT	2	10	11085	11094	0 %	60 %	20 %	20 %	374992790
13	NC_016584	ATTCA	2	10	13420	13429	40 %	40 %	0 %	20 %	374992792
14	NC_016584	GGTAA	2	10	14345	14354	40 %	20 %	40 %	0 %	374992792
15	NC_016584	AAAAT	2	10	15707	15716	80 %	20 %	0 %	0 %	374992793
16	NC_016584	TAAAT	2	10	17940	17949	60 %	40 %	0 %	0 %	374992794
17	NC_016584	AGAAA	2	10	18024	18033	80 %	0 %	20 %	0 %	374992794
18	NC_016584	ATGTC	2	10	20205	20214	20 %	40 %	20 %	20 %	374992797
19	NC_016584	TTCCT	2	10	20313	20322	0 %	60 %	0 %	40 %	374992797
20	NC_016584	TTTTG	2	10	24977	24986	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016584	ATTAT	2	10	25138	25147	40 %	60 %	0 %	0 %	374992800
22	NC_016584	ATTTT	2	10	25446	25455	20 %	80 %	0 %	0 %	374992800
23	NC_016584	TAAAA	2	10	25571	25580	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016584	TTTAA	2	10	25896	25905	40 %	60 %	0 %	0 %	374992801
25	NC_016584	CTTGG	2	10	26135	26144	0 %	40 %	40 %	20 %	374992801
26	NC_016584	TTCTT	2	10	28808	28817	0 %	80 %	0 %	20 %	374992803
27	NC_016584	CTTAA	2	10	30882	30891	40 %	40 %	0 %	20 %	374992805
28	NC_016584	AACAA	2	10	31364	31373	80 %	0 %	0 %	20 %	374992805
29	NC_016584	ATCTT	2	10	31976	31985	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016584	GGTTT	2	10	32429	32438	0 %	60 %	40 %	0 %	374992807
31	NC_016584	TTTGA	2	10	32585	32594	20 %	60 %	20 %	0 %	374992807
32	NC_016584	CCTCT	2	10	33036	33045	0 %	40 %	0 %	60 %	374992807
33	NC_016584	TTTAA	2	10	34109	34118	40 %	60 %	0 %	0 %	374992808
34	NC_016584	AATAA	2	10	34776	34785	80 %	20 %	0 %	0 %	374992809
35	NC_016584	GTAGA	2	10	34807	34816	40 %	20 %	40 %	0 %	374992809
36	NC_016584	AAAGA	2	10	35232	35241	80 %	0 %	20 %	0 %	374992809
37	NC_016584	AATGA	2	10	37588	37597	60 %	20 %	20 %	0 %	374992813
38	NC_016584	AGCAA	2	10	38313	38322	60 %	0 %	20 %	20 %	374992813
39	NC_016584	GGGCT	2	10	40834	40843	0 %	20 %	60 %	20 %	374992816
40	NC_016584	CGCGC	2	10	41294	41303	0 %	0 %	40 %	60 %	374992816
41	NC_016584	TTATG	2	10	41690	41699	20 %	60 %	20 %	0 %	374992816
42	NC_016584	CTTCG	2	10	41961	41970	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
43	NC_016584	GGGTT	2	10	43638	43647	0 %	40 %	60 %	0 %	374992818
44	NC_016584	TACAA	2	10	43922	43931	60 %	20 %	0 %	20 %	374992818
45	NC_016584	AAGGC	2	10	44045	44054	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016584	GGAGA	2	10	46078	46087	40 %	0 %	60 %	0 %	374992821
47	NC_016584	TAACT	2	10	47080	47089	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
48	NC_016584	GAATG	2	10	49550	49559	40 %	20 %	40 %	0 %	374992826
49	NC_016584	CGGAA	2	10	50173	50182	40 %	0 %	40 %	20 %	374992826
50	NC_016584	AACCT	2	10	50564	50573	40 %	20 %	0 %	40 %	374992826
51	NC_016584	ATGTT	2	10	53846	53855	20 %	60 %	20 %	0 %	374992828
52	NC_016584	CCGGC	2	10	57505	57514	0 %	0 %	40 %	60 %	374992832
53	NC_016584	ATTGT	2	10	59944	59953	20 %	60 %	20 %	0 %	374992836
54	NC_016584	TTTAA	2	10	60747	60756	40 %	60 %	0 %	0 %	374992836
55	NC_016584	GTCGT	2	10	64320	64329	0 %	40 %	40 %	20 %	374992838
56	NC_016584	TCAAC	2	10	66163	66172	40 %	20 %	0 %	40 %	374992839
57	NC_016584	GGTTT	2	10	67831	67840	0 %	60 %	40 %	0 %	374992843
58	NC_016584	TAAAG	2	10	69229	69238	60 %	20 %	20 %	0 %	374992846
59	NC_016584	GGAGA	2	10	70154	70163	40 %	0 %	60 %	0 %	374992847
60	NC_016584	CTTTC	2	10	70457	70466	0 %	60 %	0 %	40 %	374992847
61	NC_016584	TAAAG	2	10	70629	70638	60 %	20 %	20 %	0 %	374992847
62	NC_016584	TGGGT	2	10	72616	72625	0 %	40 %	60 %	0 %	374992848
63	NC_016584	AAAGC	2	10	75947	75956	60 %	0 %	20 %	20 %	374992850
64	NC_016584	GTATG	2	10	77822	77831	20 %	40 %	40 %	0 %	374992851
65	NC_016584	CCCTT	2	10	79880	79889	0 %	40 %	0 %	60 %	374992854
66	NC_016584	ATGTT	2	10	80353	80362	20 %	60 %	20 %	0 %	374992855
67	NC_016584	TCTCT	2	10	81746	81755	0 %	60 %	0 %	40 %	374992857
68	NC_016584	AAGGG	2	10	85914	85923	40 %	0 %	60 %	0 %	374992862
69	NC_016584	AATTG	2	10	88269	88278	40 %	40 %	20 %	0 %	374992864
70	NC_016584	GAATG	2	10	88609	88618	40 %	20 %	40 %	0 %	374992864
71	NC_016584	AATGA	2	10	91116	91125	60 %	20 %	20 %	0 %	374992867
72	NC_016584	TAGTA	2	10	93852	93861	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016584	TCGTG	2	10	95250	95259	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
74	NC_016584	GAAGC	2	10	95436	95445	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
75	NC_016584	CCGTA	2	10	97759	97768	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
76	NC_016584	AGAGG	2	10	97987	97996	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016584	TTGAA	2	10	98016	98025	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016584	GACAG	2	10	98183	98192	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016584	TCGGA	2	10	98865	98874	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
80	NC_016584	TATAA	2	10	99548	99557	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016584	AAATA	2	10	100363	100372	80 %	20 %	0 %	0 %	374992871
82	NC_016584	ATGAA	2	10	103498	103507	60 %	20 %	20 %	0 %	374992875
83	NC_016584	CTGGT	2	10	103967	103976	0 %	40 %	40 %	20 %	374992876
84	NC_016584	TCGTG	2	10	110729	110738	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
85	NC_016584	GAAGC	2	10	110915	110924	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
86	NC_016584	CCGTA	2	10	113239	113248	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
87	NC_016584	AGAGG	2	10	113467	113476	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016584	TTGAA	2	10	113496	113505	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016584	GACAG	2	10	113663	113672	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
90	NC_016584	TCGGA	2	10	114345	114354	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016584	AATTA	2	10	116207	116216	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016584	CGAAT	2	10	116891	116900	40 %	20 %	20 %	20 %	374992881
93	NC_016584	AGAAA	2	10	117646	117655	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016584	GCAAG	2	10	118537	118546	40 %	0 %	40 %	20 %	374992882
95	NC_016584	AAAGA	2	10	123996	124005	80 %	0 %	20 %	0 %	374992885
96	NC_016584	TCGTC	2	10	124490	124499	0 %	40 %	20 %	40 %	374992886
97	NC_016584	TAAAG	2	10	124784	124793	60 %	20 %	20 %	0 %	374992886
98	NC_016584	AAGAT	2	10	128672	128681	60 %	20 %	20 %	0 %	374992891
99	NC_016584	CATTC	2	10	129445	129454	20 %	40 %	0 %	40 %	374992891
100	NC_016584	AGGAA	2	10	129864	129873	60 %	0 %	40 %	0 %	374992891
101	NC_016584	CCAGT	2	10	132096	132105	20 %	20 %	20 %	40 %	374992894
102	NC_016584	AAAAG	2	10	132340	132349	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016584	ATGAA	2	10	133842	133851	60 %	20 %	20 %	0 %	374992896
104	NC_016584	GAAAA	2	10	134702	134711	80 %	0 %	20 %	0 %	374992897
105	NC_016584	GTTTT	2	10	135028	135037	0 %	80 %	20 %	0 %	374992898
106	NC_016584	GTTTT	2	10	135361	135370	0 %	80 %	20 %	0 %	374992898
107	NC_016584	GGAAT	2	10	137526	137535	40 %	20 %	40 %	0 %	374992899
108	NC_016584	TTAGA	2	10	138062	138071	40 %	40 %	20 %	0 %	374992899
109	NC_016584	CATGG	2	10	138218	138227	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016584	GAAAG	2	10	138993	139002	60 %	0 %	40 %	0 %	374992900
111	NC_016584	ACTCG	2	10	139344	139353	20 %	20 %	20 %	40 %	374992900
112	NC_016584	CCTTG	2	10	141039	141048	0 %	40 %	20 %	40 %	374992901
113	NC_016584	TGACC	2	10	143664	143673	20 %	20 %	20 %	40 %	374992902
114	NC_016584	GGCCG	2	10	144841	144850	0 %	0 %	60 %	40 %	374992902
115	NC_016584	TTGGG	2	10	146455	146464	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016584	GAGAA	2	10	147433	147442	60 %	0 %	40 %	0 %	374992903
117	NC_016584	TACCG	2	10	147848	147857	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
118	NC_016584	TCGTG	2	10	149317	149326	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
119	NC_016584	GAAGC	2	10	149503	149512	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
120	NC_016584	CAACC	2	10	150316	150325	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
121	NC_016584	CCGTA	2	10	151827	151836	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
122	NC_016584	AGAGG	2	10	152055	152064	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016584	TTGAA	2	10	152084	152093	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016584	GACAG	2	10	152251	152260	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
125	NC_016584	TCGGA	2	10	152933	152942	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
126	NC_016584	CAAGG	2	10	153454	153463	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
127	NC_016584	CAAAG	2	10	153568	153577	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016584	TCGAA	2	10	154121	154130	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
129	NC_016584	TTTAT	2	10	155769	155778	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016584	TCTGT	2	10	155832	155841	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
131	NC_016584	CTAAT	2	10	159043	159052	40 %	40 %	0 %	20 %	374992905
132	NC_016584	AAGCA	2	10	161191	161200	60 %	0 %	20 %	20 %	374992907
133	NC_016584	AGGAT	2	10	161349	161358	40 %	20 %	40 %	0 %	374992907
134	NC_016584	TCCTG	2	10	161458	161467	0 %	40 %	20 %	40 %	374992907
135	NC_016584	GCTGA	2	10	161636	161645	20 %	20 %	40 %	20 %	374992907
136	NC_016584	CCCTG	2	10	162570	162579	0 %	20 %	20 %	60 %	374992908
137	NC_016584	AACAG	2	10	163495	163504	60 %	0 %	20 %	20 %	374992908
138	NC_016584	ATATG	2	10	163712	163721	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016584	GAGTT	2	10	164665	164674	20 %	40 %	40 %	0 %	374992911
140	NC_016584	TGCAA	2	10	166346	166355	40 %	20 %	20 %	20 %	374992911
141	NC_016584	GTTGT	2	10	167012	167021	0 %	60 %	40 %	0 %	374992911
142	NC_016584	CAAAC	2	10	167143	167152	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
143	NC_016584	TACTA	2	10	167918	167927	40 %	40 %	0 %	20 %	374992912
144	NC_016584	AATGA	2	10	170206	170215	60 %	20 %	20 %	0 %	374992913
145	NC_016584	GGTAC	2	10	171468	171477	20 %	20 %	40 %	20 %	374992914
146	NC_016584	CGGAA	2	10	171937	171946	40 %	0 %	40 %	20 %	374992915
147	NC_016584	AATGC	2	10	172335	172344	40 %	20 %	20 %	20 %	374992915
148	NC_016584	GATGA	2	10	177710	177719	40 %	20 %	40 %	0 %	374992920
149	NC_016584	CTAGA	2	10	180937	180946	40 %	20 %	20 %	20 %	374992920
150	NC_016584	TGCAC	2	10	181622	181631	20 %	20 %	20 %	40 %	374992921
151	NC_016584	GAAAA	2	10	185343	185352	80 %	0 %	20 %	0 %	374992924
152	NC_016584	ATAAA	2	10	189915	189924	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016584	GGAAG	2	10	191235	191244	40 %	0 %	60 %	0 %	374992930
154	NC_016584	CTCTT	2	10	191246	191255	0 %	60 %	0 %	40 %	374992930
155	NC_016584	TGGTT	2	10	192518	192527	0 %	60 %	40 %	0 %	374992931
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159	NC_016584	GTTTT	2	10	199423	199432	0 %	80 %	20 %	0 %	374992941
160	NC_016584	TTTCC	2	10	199915	199924	0 %	60 %	0 %	40 %	374992942
161	NC_016584	TAATA	2	10	205723	205732	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
162	NC_016584	TCAAG	3	15	206126	206140	40 %	20 %	20 %	20 %	374992946
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164	NC_016584	TCCAT	2	10	207191	207200	20 %	40 %	0 %	40 %	374992948
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172	NC_016584	TGGAA	2	10	220775	220784	40 %	20 %	40 %	0 %	374992963
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174	NC_016584	GCGGT	2	10	224561	224570	0 %	20 %	60 %	20 %	374992970
175	NC_016584	AAGTA	2	10	224807	224816	60 %	20 %	20 %	0 %	374992970
176	NC_016584	AGAAT	2	10	224927	224936	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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178	NC_016584	GGCAG	2	10	227176	227185	20 %	0 %	60 %	20 %	374992971
179	NC_016584	CTGAG	2	10	229364	229373	20 %	20 %	40 %	20 %	374992972
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187	NC_016584	GTTAT	2	10	242891	242900	20 %	60 %	20 %	0 %	374992990
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189	NC_016584	GAGCA	2	10	252434	252443	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
190	NC_016584	TAAAA	2	10	253324	253333	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
191	NC_016584	GGAAA	2	10	258162	258171	60 %	0 %	40 %	0 %	374993016
192	NC_016584	TTTAG	2	10	260039	260048	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
193	NC_016584	CAGGA	2	10	260184	260193	40 %	0 %	40 %	20 %	374993019
194	NC_016584	GAATT	2	10	267556	267565	40 %	40 %	20 %	0 %	374993024
195	NC_016584	AAATT	2	10	270155	270164	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
196	NC_016584	AGGGC	2	10	271262	271271	20 %	0 %	60 %	20 %	374993026
197	NC_016584	TATAC	2	10	272508	272517	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
198	NC_016584	TTAAT	2	10	272533	272542	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
199	NC_016584	ACCAA	2	10	274203	274212	60 %	0 %	0 %	40 %	374993029
200	NC_016584	TTTTA	2	10	275599	275608	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
201	NC_016584	CCTTT	2	10	275925	275934	0 %	60 %	0 %	40 %	374993030
202	NC_016584	ACTTA	2	10	276123	276132	40 %	40 %	0 %	20 %	374993030
203	NC_016584	GAAAA	2	10	276939	276948	80 %	0 %	20 %	0 %	374993030
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211	NC_016584	TGGTT	2	10	288863	288872	0 %	60 %	40 %	0 %	374993040
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216	NC_016584	ATGAA	2	10	293843	293852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
217	NC_016584	TCTGG	2	10	294227	294236	0 %	40 %	40 %	20 %	374993048
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232	NC_016584	GTTGG	2	10	321428	321437	0 %	40 %	60 %	0 %	374993069
233	NC_016584	GTTCT	2	10	324736	324745	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
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247	NC_016584	CTAAA	2	10	342186	342195	60 %	20 %	0 %	20 %	374993087
248	NC_016584	CGTGC	2	10	344170	344179	0 %	20 %	40 %	40 %	374993089
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252	NC_016584	GGACC	2	10	349151	349160	20 %	0 %	40 %	40 %	374993092
253	NC_016584	GACAA	2	10	349585	349594	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
254	NC_016584	GCATG	2	10	350650	350659	20 %	20 %	40 %	20 %	374993093
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256	NC_016584	GAGAT	2	10	353684	353693	40 %	20 %	40 %	0 %	374993097
257	NC_016584	CAAGG	2	10	353815	353824	40 %	0 %	40 %	20 %	374993097
258	NC_016584	CTTTT	2	10	353977	353986	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
259	NC_016584	GATTT	2	10	354611	354620	20 %	60 %	20 %	0 %	374993099
260	NC_016584	AGACT	2	10	356206	356215	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
261	NC_016584	CTTTT	2	10	358059	358068	0 %	80 %	0 %	20 %	374993102
262	NC_016584	TGAAG	2	10	361526	361535	40 %	20 %	40 %	0 %	374993105
263	NC_016584	AGACA	2	10	361719	361728	60 %	0 %	20 %	20 %	374993105
264	NC_016584	CAGCT	2	10	363200	363209	20 %	20 %	20 %	40 %	374993106
265	NC_016584	CATAA	2	10	364153	364162	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
266	NC_016584	GATGT	2	10	365680	365689	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
267	NC_016584	GTATC	2	10	368622	368631	20 %	40 %	20 %	20 %	374993110
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269	NC_016584	GGGCG	2	10	371106	371115	0 %	0 %	80 %	20 %	374993111
270	NC_016584	GTATT	2	10	373749	373758	20 %	60 %	20 %	0 %	374993113
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273	NC_016584	AATCC	2	10	382501	382510	40 %	20 %	0 %	40 %	374993123
274	NC_016584	TGAAT	2	10	384251	384260	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
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286	NC_016584	GTACG	2	10	405068	405077	20 %	20 %	40 %	20 %	374993141
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290	NC_016584	CAAAG	2	10	418648	418657	60 %	0 %	20 %	20 %	374993148
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293	NC_016584	GTCCA	2	10	421909	421918	20 %	20 %	20 %	40 %	374993149
294	NC_016584	TGGTT	2	10	422384	422393	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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296	NC_016584	GTTAT	2	10	423836	423845	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
297	NC_016584	ATTGA	2	10	423975	423984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
298	NC_016584	CTTAT	2	10	424915	424924	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
299	NC_016584	TCTTT	2	10	428267	428276	0 %	80 %	0 %	20 %	374993155
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384	NC_016584	GATTC	2	10	529693	529702	20 %	40 %	20 %	20 %	374993251
385	NC_016584	CAAAT	2	10	531212	531221	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
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398	NC_016584	AAAAG	2	10	547615	547624	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_016584	TGTCC	2	10	557891	557900	0 %	40 %	20 %	40 %	374993282
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