MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Enterobacter cloacae EcWSU1 chromosome

Total Repeats: 123

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016514	ATTTTC	2	12	46474	46485	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016514	ACCGGC	2	12	55473	55484	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016514	GCCGGG	2	12	67864	67875	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016514	CAAAAG	2	12	97147	97158	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016514	AGGGGA	2	12	130598	130609	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016514	GATCGT	2	12	273849	273860	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016514	GTCTTT	2	12	302029	302040	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016514	AGCATC	2	12	374257	374268	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
9	NC_016514	TTTTTA	2	12	389654	389665	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016514	TGTTTC	2	12	424263	424274	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016514	TCGCTG	2	12	461836	461847	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016514	GATCCC	2	12	489189	489200	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016514	GTTAAC	2	12	533808	533819	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
14	NC_016514	CCTCTC	2	12	547467	547478	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_016514	TCTTAT	2	12	553663	553674	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016514	ATATTT	2	12	603149	603160	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016514	TTCACA	2	12	605348	605359	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016514	AATGAT	2	12	607773	607784	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016514	GCATCA	2	12	652410	652421	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016514	TGTTAT	2	12	725782	725793	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016514	TTTTTA	2	12	748036	748047	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016514	TAGCAG	2	12	810761	810772	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
23	NC_016514	TCTCCC	2	12	959708	959719	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
24	NC_016514	CGTTTT	2	12	1026720	1026731	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016514	GAAAAA	2	12	1044378	1044389	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016514	TACTGG	2	12	1118328	1118339	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
27	NC_016514	TATTTA	2	12	1148042	1148053	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016514	ATTTTT	2	12	1159742	1159753	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016514	TGACAT	2	12	1201240	1201251	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
30	NC_016514	GGGAGA	2	12	1216194	1216205	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016514	TTTTGC	2	12	1311959	1311970	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
32	NC_016514	ATGTTG	2	12	1315981	1315992	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016514	ATTTGT	2	12	1323922	1323933	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016514	CTGTTA	2	12	1422818	1422829	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
35	NC_016514	AAAAAC	2	12	1526818	1526829	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016514	TTCAGA	2	12	1617818	1617829	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016514	AAATGC	2	12	1766246	1766257	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016514	TCTGCA	2	12	1813064	1813075	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016514	ACTTGT	2	12	1819979	1819990	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
40	NC_016514	TAACCC	2	12	1846002	1846013	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016514	TTTCCA	2	12	1924405	1924416	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016514	AGTCTT	2	12	1936386	1936397	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
43	NC_016514	TCCATT	2	12	2021984	2021995	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016514	CATTCT	2	12	2132835	2132846	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016514	TTTATA	2	12	2191456	2191467	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016514	GCCAGT	2	12	2313243	2313254	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016514	CCGCTC	2	12	2317260	2317271	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
48	NC_016514	AATTTA	2	12	2317994	2318005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016514	CTTTCT	2	12	2331978	2331989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016514	TTTCAT	2	12	2341035	2341046	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
51	NC_016514	AATCCA	2	12	2386247	2386258	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016514	CGTCAT	2	12	2387073	2387084	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016514	GTAGAT	2	12	2392697	2392708	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016514	GGCTAT	2	12	2405502	2405513	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
55	NC_016514	TAAAAA	2	12	2444772	2444783	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016514	TAAAAA	2	12	2444840	2444851	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016514	GGTATG	2	12	2489367	2489378	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016514	TTGGGT	2	12	2513770	2513781	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016514	AAACTG	2	12	2518502	2518513	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016514	CATCGC	2	12	2581376	2581387	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016514	TTTATT	2	12	2666144	2666155	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016514	TCATTG	2	12	2739443	2739454	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
63	NC_016514	ACCATC	2	12	2741183	2741194	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016514	TCAGCA	2	12	2744086	2744097	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016514	AACATT	2	12	2747209	2747220	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016514	TGAAAC	2	12	2754887	2754898	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
67	NC_016514	CAAATC	2	12	2781511	2781522	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
68	NC_016514	GGTGAA	2	12	2784203	2784214	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016514	ATAAAA	2	12	2846041	2846052	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016514	TGGACA	2	12	2947753	2947764	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016514	GACGGG	3	18	3027127	3027144	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
72	NC_016514	TGAAAT	2	12	3033776	3033787	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016514	GCGCAG	2	12	3034554	3034565	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016514	GATTCG	2	12	3038120	3038131	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016514	GAAAGT	2	12	3189986	3189997	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016514	CGCATC	2	12	3194783	3194794	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016514	TGATTT	2	12	3223186	3223197	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016514	ACCCGT	2	12	3267088	3267099	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016514	TAACAA	2	12	3296993	3297004	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016514	AAAATT	2	12	3303206	3303217	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016514	TTGATT	2	12	3368730	3368741	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016514	CAAGTG	2	12	3381324	3381335	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
83	NC_016514	AAACCG	2	12	3433512	3433523	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016514	ACGTTT	2	12	3518065	3518076	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016514	TTTGTT	2	12	3533897	3533908	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016514	ATAAAA	2	12	3633460	3633471	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016514	AAATGT	2	12	3645375	3645386	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016514	GCAAAA	2	12	3651202	3651213	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
89	NC_016514	GAGGGA	2	12	3662257	3662268	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016514	TTATCG	2	12	3666919	3666930	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
91	NC_016514	CATTTT	2	12	3739310	3739321	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016514	GGGATC	2	12	3761014	3761025	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
93	NC_016514	AGGACG	2	12	3790556	3790567	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
94	NC_016514	TCTCCC	2	12	3866170	3866181	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
95	NC_016514	CAGAAA	2	12	3873890	3873901	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
96	NC_016514	TCATAT	2	12	3905717	3905728	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
97	NC_016514	CTTTTG	2	12	3907586	3907597	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016514	AGGGTG	2	12	3918296	3918307	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016514	ATCTGC	2	12	3956301	3956312	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016514	AAATAA	2	12	3982574	3982585	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016514	ATTAAT	2	12	3994281	3994292	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016514	GGGGAT	2	12	4038476	4038487	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016514	AATGAT	2	12	4042353	4042364	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
104	NC_016514	ATATTT	2	12	4093966	4093977	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016514	CAGCGT	2	12	4093985	4093996	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
106	NC_016514	TTTTAT	2	12	4096917	4096928	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016514	ACCATC	2	12	4096973	4096984	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
108	NC_016514	CAGGCA	2	12	4197268	4197279	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016514	TTCTGC	2	12	4202348	4202359	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016514	AGAAAG	2	12	4236141	4236152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016514	GCTTTT	2	12	4241597	4241608	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016514	TTCTGT	2	12	4288873	4288884	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016514	ACATTC	2	12	4333914	4333925	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016514	AGTGTG	2	12	4352968	4352979	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016514	TGCTTT	2	12	4384727	4384738	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
116	NC_016514	ATTTTC	2	12	4409099	4409110	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
117	NC_016514	AAAGTA	2	12	4432534	4432545	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016514	GGGAGA	2	12	4453856	4453867	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016514	TGGCTG	2	12	4535646	4535657	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016514	CCTGCA	2	12	4573240	4573251	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016514	GTTACG	2	12	4600735	4600746	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
122	NC_016514	TCAACG	2	12	4716217	4716228	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016514	TCGCCC	2	12	4717692	4717703	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.