MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 115

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016513	TTTTAT	2	12	588	599	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016513	TTAATC	2	12	1089	1100	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016513	GCGGTA	2	12	1517	1528	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016513	GAAAAA	2	12	8898	8909	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016513	AATATA	2	12	65366	65377	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016513	AATAAA	2	12	68128	68139	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016513	GAATAA	2	12	93209	93220	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016513	TTTTAT	2	12	110464	110475	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016513	TATAAA	2	12	148364	148375	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016513	CTGAAA	2	12	240659	240670	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
11	NC_016513	TTTCTT	2	12	266169	266180	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016513	TAAAAG	2	12	349705	349716	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016513	CGCTTT	2	12	391803	391814	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016513	ATTTCA	2	12	392931	392942	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
15	NC_016513	CTCTGT	2	12	394781	394792	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
16	NC_016513	CTTTCG	2	12	394811	394822	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016513	GCCTTC	2	12	396265	396276	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016513	TTTATT	2	12	401309	401320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016513	AATAAA	2	12	406523	406534	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016513	GACAGT	2	12	444512	444523	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016513	CGGCAT	2	12	481930	481941	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016513	TTTGAA	2	12	508011	508022	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016513	TTTATC	2	12	540743	540754	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
24	NC_016513	CGCTTT	2	12	541795	541806	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016513	ATTTCA	2	12	542922	542933	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016513	CTCTGT	2	12	544773	544784	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016513	CTTTCG	2	12	544803	544814	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016513	GCCTTC	2	12	546256	546267	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016513	GTAAGA	2	12	560670	560681	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016513	TGCAAT	2	12	562413	562424	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016513	AATAAA	2	12	584626	584637	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016513	TAAATT	2	12	593932	593943	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016513	ATAGTG	2	12	622774	622785	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016513	TTTTTA	2	12	631309	631320	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016513	TTAGTT	2	12	665498	665509	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016513	ATGTTA	2	12	672949	672960	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016513	GACTGT	2	12	685245	685256	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016513	CAAAAG	2	12	711857	711868	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
39	NC_016513	TCTTAC	2	12	721959	721970	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_016513	TTGCGA	2	12	726218	726229	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
41	NC_016513	AAAAAT	2	12	727224	727235	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016513	ATGGTG	2	12	727495	727506	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016513	GTAAGA	2	12	732432	732443	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016513	CGCTTT	2	12	734256	734267	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016513	ATTTCA	2	12	735383	735394	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
46	NC_016513	CTCTGT	2	12	737234	737245	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016513	CTTTCG	2	12	737264	737275	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016513	GCCTTC	2	12	738717	738728	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016513	ACCTAA	2	12	790863	790874	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016513	TTTTAA	2	12	808651	808662	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016513	CTATGG	2	12	816846	816857	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016513	AGCAAG	2	12	967131	967142	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
53	NC_016513	AAGCAA	2	12	972928	972939	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
54	NC_016513	TAAAAA	2	12	978234	978245	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016513	TGGTTT	2	12	981692	981703	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016513	GCTTTA	2	12	1033769	1033780	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
57	NC_016513	ATCAAT	2	12	1076266	1076277	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016513	GTTTAT	2	12	1167365	1167376	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016513	CGAAGG	2	12	1172110	1172121	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
60	NC_016513	AGCGAA	2	12	1173745	1173756	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016513	GACAGA	2	12	1173776	1173787	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
62	NC_016513	TGAAAT	2	12	1175628	1175639	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016513	AAAGAG	2	12	1176606	1176617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016513	GAAAGC	2	12	1176754	1176765	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016513	GATTTT	2	12	1176997	1177008	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016513	TGATTT	2	12	1185187	1185198	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016513	AGAGAA	2	12	1284682	1284693	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016513	CAAAAG	2	12	1353232	1353243	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
69	NC_016513	TTAATT	2	12	1360139	1360150	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016513	AGCGTT	2	12	1379919	1379930	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
71	NC_016513	CACGGA	2	12	1379998	1380009	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016513	ATTTTT	2	12	1393469	1393480	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016513	ATTAAT	2	12	1411534	1411545	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016513	AGAAAA	2	12	1411847	1411858	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016513	TTTGAT	2	12	1429674	1429685	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016513	CACTTT	2	12	1459234	1459245	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016513	TGATCA	2	12	1504614	1504625	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
78	NC_016513	CAAAAC	2	12	1515529	1515540	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016513	AAACGT	2	12	1517833	1517844	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016513	TTAGTA	2	12	1517881	1517892	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016513	GAAAAA	2	12	1519455	1519466	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016513	TTATGA	2	12	1573882	1573893	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016513	TTATTT	2	12	1635406	1635417	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016513	CAAAAA	2	12	1661452	1661463	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
85	NC_016513	GTCATA	4	24	1673117	1673140	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
86	NC_016513	AATAAA	2	12	1676684	1676695	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016513	GATATT	2	12	1683632	1683643	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016513	CGCTTT	2	12	1701261	1701272	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016513	ATTTCA	2	12	1702389	1702400	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016513	CTCTGT	2	12	1704240	1704251	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016513	CTTTCG	2	12	1704270	1704281	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016513	GCCTTC	2	12	1705906	1705917	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016513	GATCAC	2	12	1737372	1737383	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016513	AATTTA	2	12	1769595	1769606	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016513	TTGGTT	2	12	1777442	1777453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016513	ATTCAC	2	12	1793943	1793954	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016513	ATTTCA	2	12	1799681	1799692	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
98	NC_016513	CTCTGT	2	12	1801532	1801543	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016513	CTTTCG	2	12	1801562	1801573	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
100	NC_016513	GCCTTC	2	12	1803198	1803209	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016513	AGAATT	2	12	1804103	1804114	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016513	TTTTAA	2	12	1824618	1824629	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016513	TCGAAA	2	12	1859311	1859322	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016513	AATTGT	2	12	1864761	1864772	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016513	TTATCA	2	12	1883775	1883786	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
106	NC_016513	TCTTAA	2	12	1905114	1905125	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
107	NC_016513	TAGAAA	2	12	1909973	1909984	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016513	CATCTA	2	12	1970638	1970649	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016513	ATCACA	2	12	1992086	1992097	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_016513	ACAATA	2	12	2014782	2014793	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
111	NC_016513	TCAATT	2	12	2023745	2023756	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
112	NC_016513	ATTAAC	2	12	2062785	2062796	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
113	NC_016513	ATTATA	2	12	2079941	2079952	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016513	TTAAAA	2	12	2099880	2099891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016513	AAAAAG	2	12	2116436	2116447	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.