MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 684

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016513	TGCACG	2	12	4081	4092	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365966249
2	NC_016513	CGCTTT	2	12	6166	6177	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	365966251
3	NC_016513	TCAGCT	2	12	6440	6451	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365966251
4	NC_016513	GATTAA	2	12	8085	8096	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365966253
5	NC_016513	TTGAAT	2	12	19941	19952	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365966266
6	NC_016513	AATACA	2	12	23888	23899	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365966269
7	NC_016513	CAGCCA	2	12	28081	28092	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	365966271
8	NC_016513	ATTGAT	2	12	29061	29072	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365966273
9	NC_016513	TGAAGC	2	12	32275	32286	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	365966277
10	NC_016513	CGATTT	2	12	34513	34524	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365966280
11	NC_016513	AACTTG	2	12	36524	36535	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365966282
12	NC_016513	ACAGCG	2	12	39884	39895	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365966286
13	NC_016513	TCAAAT	2	12	40130	40141	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365966286
14	NC_016513	TGCGGG	2	12	40548	40559	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	365966288
15	NC_016513	CAGAAG	2	12	41340	41351	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365966290
16	NC_016513	TGCATT	2	12	51396	51407	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365966300
17	NC_016513	CCGCTT	2	12	51839	51850	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	365966301
18	NC_016513	TTACGG	2	12	52893	52904	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365966301
19	NC_016513	GGAAAG	2	12	53459	53470	50 %	0 %	50 %	0 %	365966301
20	NC_016513	TAGCCG	2	12	63355	63366	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365966310
21	NC_016513	GTTTAG	2	12	74039	74050	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365966322
22	NC_016513	TAAATT	2	12	84253	84264	50 %	50 %	0 %	0 %	365966334
23	NC_016513	GCGGAA	2	12	84873	84884	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	365966335
24	NC_016513	GTGGTC	2	12	88332	88343	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365966337
25	NC_016513	CTTTAC	2	12	90247	90258	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	365966338
26	NC_016513	CTTTGG	2	12	94808	94819	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	365966345
27	NC_016513	AAAGGC	2	12	96990	97001	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365966346
28	NC_016513	CACCCG	2	12	97310	97321	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	365966347
29	NC_016513	TAAACA	2	12	99380	99391	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365966348
30	NC_016513	TTATCG	2	12	100026	100037	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365966349
31	NC_016513	CGCGGA	2	12	103443	103454	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	365966352
32	NC_016513	GTCTTT	2	12	107756	107767	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	365966356
33	NC_016513	TCCGCC	2	12	113235	113246	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	365966361
34	NC_016513	GGTGTT	2	12	113549	113560	0 %	50 %	50 %	0 %	365966361
35	NC_016513	ATATTG	2	12	115766	115777	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365966364
36	NC_016513	CCGGCG	2	12	117548	117559	0 %	0 %	50 %	50 %	365966366
37	NC_016513	GGTTTC	2	12	119499	119510	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	365966368
38	NC_016513	CAAAAA	2	12	120192	120203	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365966368
39	NC_016513	GTGAAA	2	12	122850	122861	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365966371
40	NC_016513	CCGTTC	2	12	128437	128448	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	365966376
41	NC_016513	AAAAGA	2	12	132106	132117	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365966380
42	NC_016513	GACACC	2	12	140151	140162	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	365966388
43	NC_016513	AGAAAA	2	12	146608	146619	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365966395
44	NC_016513	ATGGAA	2	12	149768	149779	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365966400
45	NC_016513	TCGCAA	2	12	152440	152451	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365966404
46	NC_016513	CAATTG	2	12	154141	154152	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365966407
47	NC_016513	TTGGCG	2	12	157062	157073	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365966410
48	NC_016513	TTTAAA	2	12	162249	162260	50 %	50 %	0 %	0 %	365966415
49	NC_016513	TAACAC	2	12	164712	164723	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365966419
50	NC_016513	AATAAG	2	12	165387	165398	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365966420
51	NC_016513	TGCCGG	2	12	170317	170328	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	365966423
52	NC_016513	ATCGGT	2	12	171742	171753	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365966424
53	NC_016513	ATGGCA	2	12	175717	175728	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	365966429
54	NC_016513	GGTATT	2	12	176000	176011	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365966429
55	NC_016513	TCGCAA	2	12	176046	176057	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365966429
56	NC_016513	ATCGGC	2	12	176759	176770	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365966430
57	NC_016513	TTTGGT	2	12	178270	178281	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365966431
58	NC_016513	CATTGC	2	12	178467	178478	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365966431
59	NC_016513	TTTGGC	2	12	189036	189047	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	365966443
60	NC_016513	TTGGGC	2	12	193613	193624	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365966446
61	NC_016513	GGTGAA	2	12	194059	194070	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	365966446
62	NC_016513	TGGCGG	2	12	196171	196182	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	365966448
63	NC_016513	CAAAGC	2	12	205887	205898	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	365966456
64	NC_016513	ACCGCC	2	12	209711	209722	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	365966460
65	NC_016513	GATTAT	2	12	209926	209937	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365966460
66	NC_016513	TCAATA	2	12	219106	219117	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365966468
67	NC_016513	TTTGAT	2	12	219408	219419	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365966468
68	NC_016513	CAAAAA	2	12	227109	227120	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365966475
69	NC_016513	AAATTT	2	12	232919	232930	50 %	50 %	0 %	0 %	365966483
70	NC_016513	ACTGGC	2	12	238053	238064	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365966488
71	NC_016513	AACTAT	2	12	240550	240561	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365966491
72	NC_016513	GAATCA	2	12	244755	244766	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365966496
73	NC_016513	CGCTTG	2	12	246583	246594	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966499
74	NC_016513	GCTTCC	2	12	246983	246994	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	365966499
75	NC_016513	GCCAAA	2	12	247613	247624	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	365966500
76	NC_016513	CAGCGG	2	12	255671	255682	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	365966510
77	NC_016513	TCGCCA	2	12	257657	257668	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	365966512
78	NC_016513	TGCCAA	2	12	257796	257807	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365966512
79	NC_016513	ACTTCA	2	12	259363	259374	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365966514
80	NC_016513	TTCGCC	2	12	263479	263490	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	365966516
81	NC_016513	ACGGGC	2	12	269169	269180	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	365966520
82	NC_016513	CTGCTA	2	12	275359	275370	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365966523
83	NC_016513	AGGTAC	2	12	275858	275869	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	365966523
84	NC_016513	CAATGG	2	12	278993	279004	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	365966523
85	NC_016513	GTGAAA	2	12	279285	279296	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365966523
86	NC_016513	CACCGC	2	12	281496	281507	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	365966524
87	NC_016513	TTCGGT	2	12	281767	281778	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	365966524
88	NC_016513	ACGAAA	2	12	286739	286750	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365966530
89	NC_016513	GATGAA	2	12	287254	287265	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365966530
90	NC_016513	AATTTT	2	12	288394	288405	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365966531
91	NC_016513	TTTAAG	2	12	290493	290504	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365966534
92	NC_016513	ACTTCT	2	12	294133	294144	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	365966537
93	NC_016513	CGGTTT	2	12	297496	297507	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	365966541
94	NC_016513	GCACGC	3	18	299701	299718	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	365966542
95	NC_016513	CGCCGT	2	12	302667	302678	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	365966546
96	NC_016513	TTGGCA	2	12	307551	307562	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365966553
97	NC_016513	ACAAAG	2	12	314873	314884	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365966561
98	NC_016513	GAAATA	2	12	316661	316672	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365966564
99	NC_016513	GGCGTT	2	12	319025	319036	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365966567
100	NC_016513	TTGCCG	2	12	336605	336616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966582
101	NC_016513	ATCGCC	2	12	338041	338052	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	365966584
102	NC_016513	ATCGCG	2	12	339569	339580	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365966587
103	NC_016513	ACCGAA	2	12	341853	341864	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	365966589
104	NC_016513	GAAAAA	2	12	347447	347458	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365966597
105	NC_016513	TCCGGT	2	12	348809	348820	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365966599
106	NC_016513	AGCAGA	2	12	350883	350894	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365966602
107	NC_016513	TATATG	2	12	354901	354912	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365966603
108	NC_016513	AAGTGG	2	12	359183	359194	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	365966604
109	NC_016513	TTACCT	2	12	360976	360987	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	365966607
110	NC_016513	ACGACC	2	12	361119	361130	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	365966607
111	NC_016513	CCTTTA	2	12	364659	364670	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	365966614
112	NC_016513	TTCGAT	2	12	364916	364927	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365966614
113	NC_016513	ACGGAT	2	12	365307	365318	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	365966615
114	NC_016513	CACCAA	2	12	371407	371418	50 %	0 %	0 %	50 %	365966622
115	NC_016513	TCCACT	2	12	373531	373542	16.67 %	33.33 %	0 %	50 %	365966623
116	NC_016513	CGGGTG	2	12	374695	374706	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	365966624
117	NC_016513	TTTGGG	2	12	375292	375303	0 %	50 %	50 %	0 %	365966625
118	NC_016513	CGGTGA	2	12	376913	376924	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	365966626
119	NC_016513	TCAATA	2	12	381984	381995	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365966632
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121	NC_016513	TATCCG	2	12	383200	383211	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365966634
122	NC_016513	CCGACG	2	12	383777	383788	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	365966634
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124	NC_016513	GCAATA	2	12	386137	386148	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365966638
125	NC_016513	GGAAAG	2	12	387717	387728	50 %	0 %	50 %	0 %	365966641
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220	NC_016513	TGATAA	2	12	666917	666928	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365966907
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224	NC_016513	TCAAAA	2	12	675899	675910	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365966916
225	NC_016513	TTGAAC	2	12	678258	678269	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365966919
226	NC_016513	CCCGCT	2	12	678525	678536	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	365966920
227	NC_016513	TCGTCC	2	12	679195	679206	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	365966920
228	NC_016513	TAAAAT	2	12	683945	683956	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365966925
229	NC_016513	CGTCTT	2	12	684762	684773	0 %	50 %	16.67 %	33.33 %	365966926
230	NC_016513	TTTTTC	2	12	685722	685733	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	365966927
231	NC_016513	CGATAC	2	12	686720	686731	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365966928
232	NC_016513	CACGTT	2	12	687969	687980	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365966928
233	NC_016513	TTTTTC	2	12	689914	689925	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	365966929
234	NC_016513	GGCAGT	2	12	690178	690189	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	365966929
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293	NC_016513	ATGACC	2	12	898286	898297	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365967169
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330	NC_016513	TGGCGA	2	12	1010595	1010606	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	365967272
331	NC_016513	CATTAG	2	12	1015209	1015220	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365967275
332	NC_016513	ATCGGC	2	12	1019267	1019278	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	365967279
333	NC_016513	TTGCCG	2	12	1019559	1019570	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365967279
334	NC_016513	GTCGGT	2	12	1023780	1023791	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365967283
335	NC_016513	GGCGGT	2	12	1023792	1023803	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	365967283
336	NC_016513	TTGGTT	2	12	1024465	1024476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365967283
337	NC_016513	GAAAAC	2	12	1026342	1026353	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365967285
338	NC_016513	AGGCGA	2	12	1027926	1027937	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	365967286
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340	NC_016513	TATGAT	2	12	1032770	1032781	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365967291
341	NC_016513	GCATTG	2	12	1044002	1044013	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365967302
342	NC_016513	GGAACA	2	12	1044877	1044888	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365967303
343	NC_016513	GCCCAA	2	12	1047004	1047015	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	365967305
344	NC_016513	ACATGG	2	12	1047797	1047808	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	365967306
345	NC_016513	CGTAAC	2	12	1049726	1049737	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365967308
346	NC_016513	CTGTTT	2	12	1057139	1057150	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	365967317
347	NC_016513	CATTCG	2	12	1057780	1057791	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365967317
348	NC_016513	CGTTGG	2	12	1059570	1059581	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365967319
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439	NC_016513	ATTTGT	2	12	1352589	1352600	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365967594
440	NC_016513	CGGGCG	2	12	1356281	1356292	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	365967600
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442	NC_016513	CAGGAA	2	12	1360796	1360807	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365967603
443	NC_016513	AAGCCG	2	12	1362210	1362221	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365967604
444	NC_016513	CACCGC	2	12	1362329	1362340	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	365967604
445	NC_016513	GCGCCG	2	12	1367679	1367690	0 %	0 %	50 %	50 %	365967608
446	NC_016513	TGAATC	2	12	1368379	1368390	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365967608
447	NC_016513	CCAAAT	2	12	1370038	1370049	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365967611
448	NC_016513	GATGCG	2	12	1373289	1373300	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	365967612
449	NC_016513	CGACCA	2	12	1374564	1374575	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	365967613
450	NC_016513	CCGCAC	2	12	1375500	1375511	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	365967614
451	NC_016513	AGATTT	2	12	1375851	1375862	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365967614
452	NC_016513	AATGTT	2	12	1378520	1378531	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365967616
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454	NC_016513	ACCGAA	2	12	1383734	1383745	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	365967621
455	NC_016513	GGTGCG	2	12	1388759	1388770	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	365967625
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