MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Aggregatibacter actinomycetemcomitans ANH9381 chromosome

Total Repeats: 29055

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
29001	NC_016513	ACC	2	6	2132557	2132562	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	365968297
29002	NC_016513	TTG	2	6	2132651	2132656	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365968297
29003	NC_016513	CAA	2	6	2132822	2132827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365968297
29004	NC_016513	GAA	2	6	2132831	2132836	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365968297
29005	NC_016513	ATC	3	9	2132879	2132887	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365968297
29006	NC_016513	CAT	2	6	2132977	2132982	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365968297
29007	NC_016513	TTG	2	6	2133159	2133164	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365968297
29008	NC_016513	AGG	2	6	2133210	2133215	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365968297
29009	NC_016513	AAT	2	6	2133220	2133225	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365968298
29010	NC_016513	TTC	2	6	2133235	2133240	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365968298
29011	NC_016513	ATT	2	6	2133274	2133279	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29012	NC_016513	TAC	2	6	2133477	2133482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365968298
29013	NC_016513	ATT	2	6	2133503	2133508	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29014	NC_016513	ATT	2	6	2133582	2133587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29015	NC_016513	CAA	2	6	2133592	2133597	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365968298
29016	NC_016513	GAT	2	6	2133641	2133646	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365968298
29017	NC_016513	ACT	2	6	2133655	2133660	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365968298
29018	NC_016513	ATT	2	6	2133832	2133837	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29019	NC_016513	ATT	2	6	2133855	2133860	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29020	NC_016513	CAG	2	6	2133906	2133911	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365968298
29021	NC_016513	TTC	2	6	2134006	2134011	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365968298
29022	NC_016513	ATG	2	6	2134119	2134124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365968298
29023	NC_016513	CGT	2	6	2134130	2134135	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365968298
29024	NC_016513	TTA	2	6	2134136	2134141	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29025	NC_016513	CAA	2	6	2134142	2134147	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365968298
29026	NC_016513	ATG	2	6	2134255	2134260	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365968298
29027	NC_016513	ATT	2	6	2134278	2134283	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29028	NC_016513	CTA	2	6	2134374	2134379	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365968298
29029	NC_016513	GTC	2	6	2134450	2134455	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	365968298
29030	NC_016513	GAA	3	9	2134558	2134566	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365968298
29031	NC_016513	ATT	2	6	2134573	2134578	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29032	NC_016513	TTA	2	6	2134684	2134689	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29033	NC_016513	GTT	2	6	2134705	2134710	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	365968298
29034	NC_016513	AAG	2	6	2135063	2135068	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365968298
29035	NC_016513	GCA	2	6	2135097	2135102	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365968298
29036	NC_016513	CTA	2	6	2135138	2135143	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365968298
29037	NC_016513	TTA	2	6	2135216	2135221	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29038	NC_016513	TAA	2	6	2135391	2135396	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365968298
29039	NC_016513	TTA	2	6	2135440	2135445	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29040	NC_016513	CCG	2	6	2135465	2135470	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365968298
29041	NC_016513	ATT	2	6	2135536	2135541	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365968298
29042	NC_016513	CGA	2	6	2135565	2135570	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	365968298
29043	NC_016513	GGA	2	6	2135664	2135669	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	365968298
29044	NC_016513	ACA	2	6	2135822	2135827	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365968298
29045	NC_016513	TAA	2	6	2135844	2135849	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365968298
29046	NC_016513	GTG	2	6	2135966	2135971	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	365968298
29047	NC_016513	AGG	2	6	2136029	2136034	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
29048	NC_016513	ATA	2	6	2136035	2136040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365968299
29049	NC_016513	CCG	2	6	2136106	2136111	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	365968299
29050	NC_016513	AAT	2	6	2136154	2136159	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365968299
29051	NC_016513	TCA	2	6	2136303	2136308	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365968299
29052	NC_016513	AGA	2	6	2136445	2136450	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	365968299
29053	NC_016513	ATC	2	6	2136583	2136588	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
29054	NC_016513	CCG	2	6	2136623	2136628	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
29055	NC_016513	CGT	2	6	2136683	2136688	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding

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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.