MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Flavobacterium columnare ATCC 49512 chromosome

Total Repeats: 1649

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016510	ATATTT	2	12	2279	2290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016510	AGAATC	2	12	2861	2872	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365959087
3	NC_016510	TTTTTA	2	12	3143	3154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016510	CTTTTG	2	12	6695	6706	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	365959092
5	NC_016510	AAATTA	2	12	7579	7590	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959092
6	NC_016510	TTTAGG	2	12	8549	8560	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959093
7	NC_016510	AAAAAG	2	12	10681	10692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016510	ACCGTA	2	12	14786	14797	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959101
9	NC_016510	TCGTGG	2	12	16091	16102	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	365959103
10	NC_016510	GATTTA	2	12	16407	16418	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959103
11	NC_016510	ATTGGT	2	12	16626	16637	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959103
12	NC_016510	TTAATT	2	12	17357	17368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016510	ATTGTG	2	12	19447	19458	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959105
14	NC_016510	TTTAGG	2	12	22034	22045	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959110
15	NC_016510	AGGTTC	2	12	22109	22120	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365959110
16	NC_016510	GATGCT	2	12	26814	26825	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	365959114
17	NC_016510	AAGTTA	2	12	30880	30891	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365959115
18	NC_016510	ATTAAT	2	12	30895	30906	50 %	50 %	0 %	0 %	365959115
19	NC_016510	TTAATT	2	12	34657	34668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959119
20	NC_016510	GATAAT	2	12	35066	35077	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	386262269
21	NC_016510	CACGAT	2	12	36188	36199	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959121
22	NC_016510	TAGTTG	2	12	40413	40424	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	386262270
23	NC_016510	TGCACC	2	12	41482	41493	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	365959124
24	NC_016510	ATTTAT	2	12	42657	42668	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959124
25	NC_016510	AATAGA	2	12	43727	43738	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365959125
26	NC_016510	TTTGTA	2	12	43795	43806	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365959125
27	NC_016510	ATTGCA	2	12	45618	45629	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959127
28	NC_016510	TACATT	2	12	46782	46793	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959127
29	NC_016510	GACTAT	2	12	49483	49494	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959128
30	NC_016510	CAGTAA	2	12	49665	49676	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365959128
31	NC_016510	TTTTCT	2	12	50611	50622	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	365959129
32	NC_016510	CAAAAT	2	12	51176	51187	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365959129
33	NC_016510	ACAGAA	2	12	59577	59588	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959135
34	NC_016510	AAAGTA	2	12	60794	60805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016510	TATTGG	2	12	61379	61390	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959137
36	NC_016510	TAAAAC	2	12	63953	63964	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365959138
37	NC_016510	GATTTT	2	12	64630	64641	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365959139
38	NC_016510	TGAAGA	2	12	67612	67623	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365959142
39	NC_016510	AAAAAC	2	12	68166	68177	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365959142
40	NC_016510	CAATTG	2	12	71100	71111	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959144
41	NC_016510	AGAACA	2	12	73359	73370	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959146
42	NC_016510	ATTAGA	2	12	74118	74129	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365959146
43	NC_016510	AGAAGC	2	12	75000	75011	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365959146
44	NC_016510	TTCAAA	2	12	75458	75469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
45	NC_016510	GTAGAG	2	12	76657	76668	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	365959148
46	NC_016510	ACAAGA	2	12	77695	77706	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
47	NC_016510	ATCGTC	2	12	77900	77911	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	365959150
48	NC_016510	TTCCTT	2	12	78419	78430	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959151
49	NC_016510	GTTTGT	2	12	79129	79140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016510	AGGAAC	2	12	79652	79663	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	365959152
51	NC_016510	ACAATA	2	12	80306	80317	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	365959152
52	NC_016510	AATTAA	2	12	80571	80582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016510	AGGAGA	2	12	82296	82307	50 %	0 %	50 %	0 %	365959154
54	NC_016510	ACACAA	2	12	83208	83219	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	365959155
55	NC_016510	ACCCAA	2	12	83690	83701	50 %	0 %	0 %	50 %	365959155
56	NC_016510	AAATAG	3	18	89691	89708	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	365959159
57	NC_016510	TAAAAT	2	12	89736	89747	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959159
58	NC_016510	GATTTT	2	12	91221	91232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016510	CTTTAG	2	12	93647	93658	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365959161
60	NC_016510	CCTGAA	2	12	105033	105044	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959171
61	NC_016510	ATTTTT	2	12	106959	106970	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	386262272
62	NC_016510	AAAAAC	2	12	108090	108101	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365959173
63	NC_016510	AAAAGA	2	12	112755	112766	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959178
64	NC_016510	AAGAAA	2	12	112775	112786	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959178
65	NC_016510	TGAAGA	2	12	115067	115078	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365959181
66	NC_016510	TATAAT	2	12	115755	115766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016510	TTTCAA	2	12	117127	117138	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959182
68	NC_016510	GCTTGT	2	12	120423	120434	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	365959186
69	NC_016510	AATTGT	2	12	121421	121432	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959186
70	NC_016510	GAAACA	2	12	125352	125363	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959187
71	NC_016510	ATTTTA	2	12	127114	127125	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	365959189
72	NC_016510	AAAAGA	2	12	127478	127489	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	365959189
73	NC_016510	CAAGTC	2	12	128481	128492	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959190
74	NC_016510	CAATGC	2	12	128549	128560	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	365959190
75	NC_016510	GATTTC	2	12	133604	133615	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	365959194
76	NC_016510	AAATTC	2	12	133783	133794	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365959194
77	NC_016510	TACTTA	2	12	135789	135800	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959196
78	NC_016510	GTATAT	2	12	140569	140580	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959201
79	NC_016510	AGAATG	2	12	141584	141595	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	365959202
80	NC_016510	AACGAA	2	12	141596	141607	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959202
81	NC_016510	TCTTTT	2	12	142404	142415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
82	NC_016510	TAACCA	2	12	142781	142792	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365959203
83	NC_016510	GCTCCT	2	12	143134	143145	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	365959203
84	NC_016510	TAAAAA	2	12	144093	144104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016510	AAATTT	2	12	144553	144564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016510	TCACCA	2	12	146560	146571	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	365959205
87	NC_016510	TTAAAT	2	12	147518	147529	50 %	50 %	0 %	0 %	365959206
88	NC_016510	TTTTTA	2	12	156105	156116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016510	TTTCCT	2	12	157060	157071	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	365959215
90	NC_016510	GAAAAT	2	12	159056	159067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016510	TCTAAT	2	12	172723	172734	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	365959216
92	NC_016510	ATTTCT	2	12	173176	173187	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365959216
93	NC_016510	TTGTTT	2	12	173568	173579	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	365959217
94	NC_016510	ATTAAA	2	12	173768	173779	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959217
95	NC_016510	GATGTT	2	12	176670	176681	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	365959220
96	NC_016510	GTATAG	2	12	177082	177093	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	365959220
97	NC_016510	TTTTTA	2	12	177829	177840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016510	GATTTT	2	12	180256	180267	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365959222
99	NC_016510	TATTTT	2	12	181158	181169	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	365959223
100	NC_016510	AAATAT	2	12	181815	181826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016510	CTAATG	2	12	184318	184329	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	365959226
102	NC_016510	ACAACT	2	12	185386	185397	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365959227
103	NC_016510	ATGTAT	2	12	185675	185686	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959227
104	NC_016510	AAAATA	2	12	190277	190288	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	365959232
105	NC_016510	TAAAAG	2	12	191916	191927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016510	AGGAGA	2	12	192606	192617	50 %	0 %	50 %	0 %	365959234
107	NC_016510	AATTCA	2	12	193810	193821	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	365959235
108	NC_016510	TGTAAT	2	12	195133	195144	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959237
109	NC_016510	ATTTAA	2	12	195784	195795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016510	AATTAG	2	12	196850	196861	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	365959238
111	NC_016510	GCTGAG	2	12	197512	197523	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	365959238
112	NC_016510	TTTCTA	2	12	198115	198126	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	365959239
113	NC_016510	AACAAA	2	12	201673	201684	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	365959243
114	NC_016510	GCAGAA	2	12	203949	203960	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	386262276
115	NC_016510	TCAAAA	2	12	203969	203980	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	386262276
116	NC_016510	TGAGTA	2	12	204037	204048	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	386262276
117	NC_016510	AAAAGC	2	12	206981	206992	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	365959247
118	NC_016510	TATAAA	2	12	207297	207308	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	365959247
119	NC_016510	AATTAT	2	12	208426	208437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016510	ATTGAA	2	12	208475	208486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016510	CCTAAA	2	12	210877	210888	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	365959250
122	NC_016510	TAATTG	2	12	213856	213867	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	365959252
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126	NC_016510	TTTATC	2	12	220485	220496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
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238	NC_016510	AGCTGG	2	12	446926	446937	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	365959459
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478	NC_016510	TTGATT	2	12	893591	893602	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	365959830
479	NC_016510	AGCTAA	2	12	896107	896118	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	365959832
480	NC_016510	TCAATG	2	12	896961	896972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
481	NC_016510	TCAATG	2	12	896974	896985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
482	NC_016510	TTCAAT	2	12	897005	897016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
483	NC_016510	AATCCT	2	12	898527	898538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	365959834
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