MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Flavobacterium columnare ATCC 49512 chromosome

Total Repeats: 237

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016510	ATATTT	2	12	2279	2290	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016510	TTTTTA	2	12	3143	3154	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016510	AAAAAG	2	12	10681	10692	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016510	TTAATT	2	12	17357	17368	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016510	AAAGTA	2	12	60794	60805	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016510	TTCAAA	2	12	75458	75469	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016510	ACAAGA	2	12	77695	77706	66.67 %	0 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016510	GTTTGT	2	12	79129	79140	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016510	AATTAA	2	12	80571	80582	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016510	GATTTT	2	12	91221	91232	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016510	TATAAT	2	12	115755	115766	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016510	TCTTTT	2	12	142404	142415	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016510	TAAAAA	2	12	144093	144104	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016510	AAATTT	2	12	144553	144564	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016510	TTTTTA	2	12	156105	156116	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016510	GAAAAT	2	12	159056	159067	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016510	TTTTTA	2	12	177829	177840	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016510	AAATAT	2	12	181815	181826	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016510	TAAAAG	2	12	191916	191927	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016510	ATTTAA	2	12	195784	195795	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016510	AATTAT	2	12	208426	208437	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016510	ATTGAA	2	12	208475	208486	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016510	TAAAAT	2	12	220231	220242	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016510	TTTATC	2	12	220485	220496	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
25	NC_016510	TCAAAT	2	12	223019	223030	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
26	NC_016510	ATAAAA	2	12	229641	229652	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016510	GTATTT	2	12	238180	238191	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016510	TCGAAC	2	12	248472	248483	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016510	TTGGTT	2	12	257403	257414	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016510	TATATT	2	12	278640	278651	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016510	TTATTT	2	12	284173	284184	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016510	GTTTTT	2	12	284405	284416	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016510	AATTCT	2	12	298328	298339	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
34	NC_016510	TAGTTT	2	12	300825	300836	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016510	TAAAAA	2	12	305869	305880	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016510	TTTTTA	2	12	339292	339303	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016510	TTAAAA	2	12	339481	339492	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016510	AGTAAT	2	12	350185	350196	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016510	TTATTG	2	12	358747	358758	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016510	AATATA	2	12	361525	361536	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016510	AAAAAG	2	12	373880	373891	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016510	TGTGGT	2	12	391626	391637	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016510	GCTTTT	2	12	393757	393768	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
44	NC_016510	TTTTAA	2	12	412804	412815	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016510	TTTTTA	2	12	416499	416510	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016510	AAAATT	2	12	425175	425186	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016510	AACAAA	2	12	427713	427724	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
48	NC_016510	TATTTT	2	12	427837	427848	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016510	TACAAA	2	12	435565	435576	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
50	NC_016510	TTAAAT	2	12	442590	442601	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016510	ATATAG	2	12	449673	449684	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016510	TATTTG	2	12	472859	472870	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016510	ATTTTA	2	12	482812	482823	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016510	AGTTTT	2	12	489816	489827	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016510	AATTAT	2	12	501215	501226	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016510	AAAATA	2	12	501986	501997	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016510	ATTCTT	2	12	528863	528874	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
58	NC_016510	ATTCTA	2	12	538267	538278	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016510	AGGGTT	2	12	577360	577371	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016510	AGGTCT	2	12	593851	593862	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
61	NC_016510	AATTTT	2	12	614496	614507	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016510	AGGGTT	2	12	615290	615301	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016510	AAATAT	2	12	625774	625785	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016510	TAAAAT	2	12	629046	629057	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016510	TTCCTC	2	12	630801	630812	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016510	ATTTTA	2	12	642687	642698	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016510	TATTTT	2	12	647648	647659	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016510	TTTTAA	2	12	673552	673563	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016510	ATATCA	2	12	675619	675630	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
70	NC_016510	GTTTAT	2	12	684559	684570	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016510	TAAAAA	2	12	745905	745916	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016510	TAAAAA	2	12	756275	756286	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016510	GTGTTT	2	12	760101	760112	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016510	ATAAAA	2	12	761701	761712	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016510	ATAATT	2	12	764073	764084	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016510	TTTTGG	2	12	764585	764596	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016510	TGAAAA	2	12	794374	794385	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016510	TTATAA	2	12	795744	795755	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016510	CTGAAA	2	12	797477	797488	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
80	NC_016510	AAAAGG	2	12	806909	806920	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016510	AGTTTT	2	12	806940	806951	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016510	AAATTT	2	12	808927	808938	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
83	NC_016510	TTGGTT	2	12	830793	830804	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016510	GTTGCC	2	12	831299	831310	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016510	GTAGGT	2	12	831647	831658	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016510	TGTAGG	2	12	831865	831876	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016510	TCATAT	2	12	832161	832172	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
88	NC_016510	TAGGTA	2	12	833100	833111	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016510	TCGTTT	2	12	833267	833278	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016510	GAATAG	2	12	834118	834129	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016510	ATTTCT	2	12	835322	835333	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
92	NC_016510	TTGTTT	2	12	836318	836329	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016510	AATTCC	2	12	837071	837082	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016510	TAAAAT	2	12	847685	847696	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016510	TTAAAT	2	12	870164	870175	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016510	TAAAAA	2	12	878918	878929	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016510	AAGGAA	2	12	890207	890218	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016510	CAGCAA	2	12	890327	890338	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016510	TCAATG	2	12	896961	896972	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
100	NC_016510	TCAATG	2	12	896974	896985	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
101	NC_016510	TTCAAT	2	12	897005	897016	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
102	NC_016510	CTTTTT	2	12	932296	932307	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
103	NC_016510	TTTTAC	2	12	934607	934618	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
104	NC_016510	ATAGTT	2	12	941829	941840	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016510	ATAAAA	2	12	949383	949394	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016510	TCAACA	2	12	957960	957971	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016510	TAAAAA	2	12	971113	971124	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016510	TAAAAT	2	12	998914	998925	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016510	TTTTAT	2	12	1023457	1023468	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016510	AGTATT	2	12	1032873	1032884	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016510	TTTTTA	2	12	1052703	1052714	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016510	ATTTTT	2	12	1055523	1055534	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016510	TAAAAC	2	12	1094912	1094923	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016510	TGAATA	2	12	1113381	1113392	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016510	GTAAAA	2	12	1121314	1121325	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016510	TTTGTA	2	12	1134393	1134404	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016510	AAATTT	2	12	1160765	1160776	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016510	TAAAAA	2	12	1160861	1160872	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016510	GCATTT	2	12	1161420	1161431	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
120	NC_016510	TAGAGC	2	12	1164916	1164927	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
121	NC_016510	TATTTG	2	12	1186290	1186301	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016510	TTCCAT	2	12	1211651	1211662	16.67 %	50 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016510	AAATTA	2	12	1212092	1212103	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016510	TTTATT	2	12	1222225	1222236	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016510	ATTTCT	2	12	1240076	1240087	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
126	NC_016510	AAAATA	2	12	1259552	1259563	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016510	ACGTGA	2	12	1286910	1286921	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
128	NC_016510	AAATAT	2	12	1300374	1300385	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016510	TAAAGT	2	12	1305149	1305160	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016510	AAATAT	2	12	1309781	1309792	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016510	AGATTG	2	12	1315104	1315115	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.