MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 37

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016446	GTTTGG	2	12	39273	39284	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016446	GTTTGG	2	12	61015	61026	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016446	GAGTTT	2	12	63972	63983	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016446	GTTTGG	2	12	70947	70958	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016446	GGTTGT	2	12	84994	85005	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016446	GTTTGG	2	12	112840	112851	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016446	ATTTTA	2	12	116880	116891	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016446	TAGTGA	2	12	155273	155284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016446	TAGTGG	2	12	184439	184450	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016446	TGGTTA	2	12	284959	284970	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016446	GATCAA	2	12	293376	293387	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
12	NC_016446	TCTTTT	2	12	295080	295091	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016446	AAACTC	2	12	296747	296758	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016446	AAATAA	2	12	330944	330955	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016446	CAAATA	2	12	331218	331229	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016446	CAACCC	2	12	378206	378217	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_016446	GACACT	2	12	388265	388276	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016446	AAAACC	2	12	405103	405114	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_016446	AGGAAT	2	12	420191	420202	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016446	CTAAGC	2	12	484326	484337	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_016446	CAATAA	2	12	512288	512299	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
22	NC_016446	AAATTA	2	12	532962	532973	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016446	TTATTG	2	12	545560	545571	16.67 %	66.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016446	AATCAC	2	12	641152	641163	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016446	TAGAAA	2	12	687022	687033	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016446	CACAGA	2	12	701436	701447	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016446	AAAATT	2	12	716408	716419	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016446	AAAATG	2	12	728624	728635	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016446	TCCGCT	2	12	740052	740063	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016446	TTCATA	2	12	821144	821155	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	Non-Coding
31	NC_016446	AATAAA	2	12	859394	859405	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016446	ATATTT	2	12	952905	952916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016446	AAGTGA	2	12	968060	968071	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016446	TGTTGA	2	12	969257	969268	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016446	TTATTT	2	12	974792	974803	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016446	GAAGGA	2	12	1016745	1016756	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016446	GATGGA	2	12	1031474	1031485	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.