MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 628

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016446	CGCAG	2	10	4045	4054	20 %	0 %	40 %	40 %	360037217
2	NC_016446	AGCGA	2	10	9765	9774	40 %	0 %	40 %	20 %	360037225
3	NC_016446	TATGG	2	10	10937	10946	20 %	40 %	40 %	0 %	360037226
4	NC_016446	GCACT	2	10	10965	10974	20 %	20 %	20 %	40 %	360037226
5	NC_016446	AATCA	2	10	12708	12717	60 %	20 %	0 %	20 %	360037227
6	NC_016446	GCAGT	2	10	14592	14601	20 %	20 %	40 %	20 %	360037228
7	NC_016446	GTCTT	2	10	18366	18375	0 %	60 %	20 %	20 %	360037233
8	NC_016446	GATAT	2	10	19059	19068	40 %	40 %	20 %	0 %	360037234
9	NC_016446	GCGCG	2	10	21072	21081	0 %	0 %	60 %	40 %	360037235
10	NC_016446	AATCG	2	10	21551	21560	40 %	20 %	20 %	20 %	360037235
11	NC_016446	ACCCA	2	10	24740	24749	40 %	0 %	0 %	60 %	360037239
12	NC_016446	TGCTC	2	10	25716	25725	0 %	40 %	20 %	40 %	360037240
13	NC_016446	GTGGA	2	10	25936	25945	20 %	20 %	60 %	0 %	360037240
14	NC_016446	ACAAG	2	10	30156	30165	60 %	0 %	20 %	20 %	360037243
15	NC_016446	GTACG	2	10	36296	36305	20 %	20 %	40 %	20 %	360037251
16	NC_016446	CTTTT	2	10	36531	36540	0 %	80 %	0 %	20 %	360037251
17	NC_016446	ATCTC	2	10	36826	36835	20 %	40 %	0 %	40 %	360037251
18	NC_016446	CTGCT	2	10	38475	38484	0 %	40 %	20 %	40 %	360037254
19	NC_016446	CATTG	2	10	39850	39859	20 %	40 %	20 %	20 %	360037258
20	NC_016446	AAAAT	2	10	41793	41802	80 %	20 %	0 %	0 %	360037260
21	NC_016446	CAAAG	2	10	44448	44457	60 %	0 %	20 %	20 %	360037263
22	NC_016446	AGAAA	2	10	45457	45466	80 %	0 %	20 %	0 %	360037265
23	NC_016446	TTGGT	2	10	45906	45915	0 %	60 %	40 %	0 %	360037265
24	NC_016446	TGAAC	2	10	50377	50386	40 %	20 %	20 %	20 %	360037275
25	NC_016446	CTCGA	2	10	50415	50424	20 %	20 %	20 %	40 %	360037275
26	NC_016446	TCGTG	2	10	53581	53590	0 %	40 %	40 %	20 %	360037280
27	NC_016446	AAACA	2	10	63698	63707	80 %	0 %	0 %	20 %	360037297
28	NC_016446	ACTGA	2	10	66012	66021	40 %	20 %	20 %	20 %	360037303
29	NC_016446	GTAGT	2	10	66542	66551	20 %	40 %	40 %	0 %	360037304
30	NC_016446	TTCAG	2	10	67832	67841	20 %	40 %	20 %	20 %	360037307
31	NC_016446	TGAAC	2	10	69148	69157	40 %	20 %	20 %	20 %	360037310
32	NC_016446	CTCGA	2	10	69186	69195	20 %	20 %	20 %	40 %	360037310
33	NC_016446	CTCAG	2	10	71829	71838	20 %	20 %	20 %	40 %	360037313
34	NC_016446	TGCAT	2	10	72799	72808	20 %	40 %	20 %	20 %	360037314
35	NC_016446	AGAGT	2	10	73416	73425	40 %	20 %	40 %	0 %	360037315
36	NC_016446	TGAAT	2	10	75929	75938	40 %	40 %	20 %	0 %	360037321
37	NC_016446	TGCGT	2	10	76091	76100	0 %	40 %	40 %	20 %	360037322
38	NC_016446	AGAGT	2	10	76369	76378	40 %	20 %	40 %	0 %	360037323
39	NC_016446	GCTGC	2	10	83371	83380	0 %	20 %	40 %	40 %	360037333
40	NC_016446	GGTTT	2	10	91638	91647	0 %	60 %	40 %	0 %	360037345
41	NC_016446	CATCA	2	10	94862	94871	40 %	20 %	0 %	40 %	360037348
42	NC_016446	TAATT	2	10	94916	94925	40 %	60 %	0 %	0 %	360037348
43	NC_016446	ATCAA	2	10	98357	98366	60 %	20 %	0 %	20 %	360037351
44	NC_016446	AGCTT	2	10	98902	98911	20 %	40 %	20 %	20 %	360037352
45	NC_016446	GAACA	2	10	98922	98931	60 %	0 %	20 %	20 %	360037352
46	NC_016446	TGAAC	2	10	99270	99279	40 %	20 %	20 %	20 %	360037353
47	NC_016446	CTCGA	2	10	99308	99317	20 %	20 %	20 %	40 %	360037353
48	NC_016446	TGAGT	2	10	99784	99793	20 %	40 %	40 %	0 %	360037354
49	NC_016446	TTTTA	2	10	99964	99973	20 %	80 %	0 %	0 %	360037355
50	NC_016446	GAAAG	2	10	101329	101338	60 %	0 %	40 %	0 %	360037359
51	NC_016446	ACTGA	2	10	102261	102270	40 %	20 %	20 %	20 %	360037360
52	NC_016446	TTCAT	2	10	103949	103958	20 %	60 %	0 %	20 %	360037363
53	NC_016446	CTTTG	2	10	104957	104966	0 %	60 %	20 %	20 %	360037365
54	NC_016446	CATCC	2	10	105766	105775	20 %	20 %	0 %	60 %	360037366
55	NC_016446	GGATT	2	10	109384	109393	20 %	40 %	40 %	0 %	360037370
56	NC_016446	ACTGT	2	10	110178	110187	20 %	40 %	20 %	20 %	360037371
57	NC_016446	GTGAT	2	10	115602	115611	20 %	40 %	40 %	0 %	360037376
58	NC_016446	AAATG	2	10	115741	115750	60 %	20 %	20 %	0 %	360037376
59	NC_016446	AGCTC	2	10	115839	115848	20 %	20 %	20 %	40 %	360037377
60	NC_016446	AGCTT	2	10	118964	118973	20 %	40 %	20 %	20 %	360037381
61	NC_016446	GAACA	2	10	118984	118993	60 %	0 %	20 %	20 %	360037381
62	NC_016446	AAACT	2	10	119267	119276	60 %	20 %	0 %	20 %	360037381
63	NC_016446	TTCAG	2	10	120002	120011	20 %	40 %	20 %	20 %	360037383
64	NC_016446	GTTTT	2	10	123575	123584	0 %	80 %	20 %	0 %	360037391
65	NC_016446	CGTGT	2	10	126615	126624	0 %	40 %	40 %	20 %	360037397
66	NC_016446	ATATC	2	10	128920	128929	40 %	40 %	0 %	20 %	360037399
67	NC_016446	TGGGT	2	10	129934	129943	0 %	40 %	60 %	0 %	360037401
68	NC_016446	TAAGT	2	10	131199	131208	40 %	40 %	20 %	0 %	360037402
69	NC_016446	TTCAG	2	10	135116	135125	20 %	40 %	20 %	20 %	360037409
70	NC_016446	CTCAT	2	10	137501	137510	20 %	40 %	0 %	40 %	360037414
71	NC_016446	AAACA	2	10	138374	138383	80 %	0 %	0 %	20 %	360037414
72	NC_016446	TGTGC	2	10	139785	139794	0 %	40 %	40 %	20 %	360037414
73	NC_016446	ATCGC	2	10	141769	141778	20 %	20 %	20 %	40 %	360037415
74	NC_016446	GTGTG	2	10	142223	142232	0 %	40 %	60 %	0 %	360037415
75	NC_016446	AACGT	2	10	142675	142684	40 %	20 %	20 %	20 %	360037415
76	NC_016446	TACTG	2	10	144580	144589	20 %	40 %	20 %	20 %	360037417
77	NC_016446	GCAGA	2	10	144599	144608	40 %	0 %	40 %	20 %	360037417
78	NC_016446	CAGCG	2	10	147957	147966	20 %	0 %	40 %	40 %	360037421
79	NC_016446	GATGT	2	10	149653	149662	20 %	40 %	40 %	0 %	360037422
80	NC_016446	AGGCA	2	10	150987	150996	40 %	0 %	40 %	20 %	360037424
81	NC_016446	TCGGG	2	10	159238	159247	0 %	20 %	60 %	20 %	360037428
82	NC_016446	CAATT	2	10	159885	159894	40 %	40 %	0 %	20 %	360037428
83	NC_016446	CAAAG	2	10	160407	160416	60 %	0 %	20 %	20 %	360037429
84	NC_016446	AAAAC	2	10	161340	161349	80 %	0 %	0 %	20 %	360037429
85	NC_016446	GGCTT	2	10	168505	168514	0 %	40 %	40 %	20 %	360037433
86	NC_016446	GTGAG	2	10	168909	168918	20 %	20 %	60 %	0 %	360037433
87	NC_016446	GCTTG	2	10	170886	170895	0 %	40 %	40 %	20 %	360037434
88	NC_016446	TTCGA	2	10	170931	170940	20 %	40 %	20 %	20 %	360037434
89	NC_016446	ATCTC	2	10	176243	176252	20 %	40 %	0 %	40 %	360037441
90	NC_016446	CGCAG	2	10	176742	176751	20 %	0 %	40 %	40 %	360037442
91	NC_016446	TGACT	2	10	176840	176849	20 %	40 %	20 %	20 %	360037442
92	NC_016446	ATCAC	2	10	177432	177441	40 %	20 %	0 %	40 %	360037443
93	NC_016446	CTTGG	2	10	177469	177478	0 %	40 %	40 %	20 %	360037443
94	NC_016446	CTGAA	2	10	178036	178045	40 %	20 %	20 %	20 %	360037443
95	NC_016446	AAAGC	2	10	179018	179027	60 %	0 %	20 %	20 %	360037445
96	NC_016446	CTGCG	2	10	181211	181220	0 %	20 %	40 %	40 %	360037447
97	NC_016446	CGCGG	2	10	181572	181581	0 %	0 %	60 %	40 %	360037447
98	NC_016446	GCGCA	2	10	182705	182714	20 %	0 %	40 %	40 %	360037448
99	NC_016446	GGTGA	2	10	183407	183416	20 %	20 %	60 %	0 %	360037448
100	NC_016446	TGCCG	2	10	183844	183853	0 %	20 %	40 %	40 %	360037448
101	NC_016446	GATGT	2	10	185445	185454	20 %	40 %	40 %	0 %	360037449
102	NC_016446	GATTC	2	10	185463	185472	20 %	40 %	20 %	20 %	360037449
103	NC_016446	ACCTT	2	10	186468	186477	20 %	40 %	0 %	40 %	360037451
104	NC_016446	ACCAA	2	10	187401	187410	60 %	0 %	0 %	40 %	360037452
105	NC_016446	CAAAC	2	10	188741	188750	60 %	0 %	0 %	40 %	360037454
106	NC_016446	GCAAA	2	10	189145	189154	60 %	0 %	20 %	20 %	360037454
107	NC_016446	TACGT	2	10	189299	189308	20 %	40 %	20 %	20 %	360037454
108	NC_016446	AAATC	2	10	190578	190587	60 %	20 %	0 %	20 %	360037454
109	NC_016446	ATTGA	2	10	197053	197062	40 %	40 %	20 %	0 %	360037459
110	NC_016446	GGGCG	2	10	197633	197642	0 %	0 %	80 %	20 %	360037460
111	NC_016446	CCGTT	2	10	197999	198008	0 %	40 %	20 %	40 %	360037460
112	NC_016446	CCCAG	2	10	204252	204261	20 %	0 %	20 %	60 %	360037466
113	NC_016446	AGCTG	2	10	205579	205588	20 %	20 %	40 %	20 %	360037467
114	NC_016446	ACTTT	2	10	211085	211094	20 %	60 %	0 %	20 %	360037474
115	NC_016446	CTGGT	2	10	212888	212897	0 %	40 %	40 %	20 %	360037475
116	NC_016446	AACTC	2	10	213356	213365	40 %	20 %	0 %	40 %	360037475
117	NC_016446	CAACC	2	10	215813	215822	40 %	0 %	0 %	60 %	360037477
118	NC_016446	CAAAT	2	10	216427	216436	60 %	20 %	0 %	20 %	360037477
119	NC_016446	AAACC	2	10	216941	216950	60 %	0 %	0 %	40 %	360037477
120	NC_016446	GCATT	2	10	217961	217970	20 %	40 %	20 %	20 %	360037478
121	NC_016446	CGCAC	2	10	217984	217993	20 %	0 %	20 %	60 %	360037478
122	NC_016446	TGGCT	2	10	219930	219939	0 %	40 %	40 %	20 %	360037480
123	NC_016446	AAGCA	2	10	220763	220772	60 %	0 %	20 %	20 %	360037481
124	NC_016446	TTGCC	2	10	220824	220833	0 %	40 %	20 %	40 %	360037481
125	NC_016446	GCCGT	2	10	222157	222166	0 %	20 %	40 %	40 %	360037483
126	NC_016446	TGCTT	2	10	222284	222293	0 %	60 %	20 %	20 %	360037483
127	NC_016446	AGCGC	2	10	224812	224821	20 %	0 %	40 %	40 %	360037486
128	NC_016446	TGGTG	2	10	225476	225485	0 %	40 %	60 %	0 %	360037488
129	NC_016446	CCAAG	2	10	227064	227073	40 %	0 %	20 %	40 %	360037489
130	NC_016446	CTTGG	2	10	230076	230085	0 %	40 %	40 %	20 %	360037491
131	NC_016446	CACAC	2	10	232392	232401	40 %	0 %	0 %	60 %	360037493
132	NC_016446	TCAGT	2	10	233316	233325	20 %	40 %	20 %	20 %	360037495
133	NC_016446	GGTTG	2	10	235070	235079	0 %	40 %	60 %	0 %	360037496
134	NC_016446	CAAAT	2	10	239703	239712	60 %	20 %	0 %	20 %	360037500
135	NC_016446	GATAG	2	10	240932	240941	40 %	20 %	40 %	0 %	360037501
136	NC_016446	CGATG	2	10	242524	242533	20 %	20 %	40 %	20 %	360037502
137	NC_016446	TCAGC	2	10	242589	242598	20 %	20 %	20 %	40 %	360037502
138	NC_016446	ACCTT	2	10	243466	243475	20 %	40 %	0 %	40 %	360037503
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140	NC_016446	GCTGC	2	10	244163	244172	0 %	20 %	40 %	40 %	360037503
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145	NC_016446	AGTCC	2	10	252268	252277	20 %	20 %	20 %	40 %	360037514
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151	NC_016446	CATCG	2	10	259760	259769	20 %	20 %	20 %	40 %	360037521
152	NC_016446	CGCAG	2	10	260283	260292	20 %	0 %	40 %	40 %	360037521
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155	NC_016446	ATTGG	2	10	263555	263564	20 %	40 %	40 %	0 %	360037523
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167	NC_016446	GCGCA	2	10	284708	284717	20 %	0 %	40 %	40 %	360037546
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251	NC_016446	TCGAT	2	10	426093	426102	20 %	40 %	20 %	20 %	360037682
252	NC_016446	TAGTG	2	10	426843	426852	20 %	40 %	40 %	0 %	360037683
253	NC_016446	GTTCA	2	10	426864	426873	20 %	40 %	20 %	20 %	360037683
254	NC_016446	CCTAG	2	10	427870	427879	20 %	20 %	20 %	40 %	360037684
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257	NC_016446	AAGTG	2	10	432952	432961	40 %	20 %	40 %	0 %	360037687
258	NC_016446	GGTTT	2	10	434265	434274	0 %	60 %	40 %	0 %	360037690
259	NC_016446	GATAA	2	10	435624	435633	60 %	20 %	20 %	0 %	360037691
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