MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 2785

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016446	TCAG	2	8	776	783	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016446	ATAG	2	8	1041	1048	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016446	CTTG	2	8	1701	1708	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016446	TGGG	2	8	2026	2033	0 %	25 %	75 %	0 %	360037215
5	NC_016446	GGCT	2	8	2364	2371	0 %	25 %	50 %	25 %	360037215
6	NC_016446	TGGG	2	8	2649	2656	0 %	25 %	75 %	0 %	360037215
7	NC_016446	GCAT	2	8	3313	3320	25 %	25 %	25 %	25 %	360037216
8	NC_016446	GAGT	2	8	3517	3524	25 %	25 %	50 %	0 %	360037217
9	NC_016446	GCAA	2	8	4063	4070	50 %	0 %	25 %	25 %	360037217
10	NC_016446	ATTG	2	8	4676	4683	25 %	50 %	25 %	0 %	360037217
11	NC_016446	CAGG	2	8	4760	4767	25 %	0 %	50 %	25 %	360037217
12	NC_016446	CCAG	2	8	5222	5229	25 %	0 %	25 %	50 %	360037218
13	NC_016446	TTTG	2	8	5987	5994	0 %	75 %	25 %	0 %	360037220
14	NC_016446	GTAG	2	8	6364	6371	25 %	25 %	50 %	0 %	360037221
15	NC_016446	CATC	2	8	6521	6528	25 %	25 %	0 %	50 %	360037221
16	NC_016446	TGAA	2	8	6696	6703	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016446	ATTC	2	8	7329	7336	25 %	50 %	0 %	25 %	360037222
18	NC_016446	ATAG	2	8	7405	7412	50 %	25 %	25 %	0 %	360037223
19	NC_016446	CAGC	2	8	7914	7921	25 %	0 %	25 %	50 %	360037223
20	NC_016446	TTCA	2	8	8083	8090	25 %	50 %	0 %	25 %	360037223
21	NC_016446	TAAG	2	8	8158	8165	50 %	25 %	25 %	0 %	360037223
22	NC_016446	TACT	2	8	8680	8687	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016446	ATCA	2	8	9579	9586	50 %	25 %	0 %	25 %	360037225
24	NC_016446	ATGA	2	8	10005	10012	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016446	GTGA	2	8	10130	10137	25 %	25 %	50 %	0 %	360037226
26	NC_016446	CAGA	2	8	10286	10293	50 %	0 %	25 %	25 %	360037226
27	NC_016446	TTGC	2	8	10802	10809	0 %	50 %	25 %	25 %	360037226
28	NC_016446	GCTC	2	8	11129	11136	0 %	25 %	25 %	50 %	360037226
29	NC_016446	CATG	2	8	11439	11446	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016446	TGAT	2	8	11571	11578	25 %	50 %	25 %	0 %	360037227
31	NC_016446	ATCA	2	8	12371	12378	50 %	25 %	0 %	25 %	360037227
32	NC_016446	GAAC	2	8	12604	12611	50 %	0 %	25 %	25 %	360037227
33	NC_016446	TGAG	2	8	12669	12676	25 %	25 %	50 %	0 %	360037227
34	NC_016446	CAAA	2	8	12849	12856	75 %	0 %	0 %	25 %	360037227
35	NC_016446	GTGC	2	8	12983	12990	0 %	25 %	50 %	25 %	360037227
36	NC_016446	AGAC	2	8	13292	13299	50 %	0 %	25 %	25 %	360037227
37	NC_016446	TTAA	2	8	13372	13379	50 %	50 %	0 %	0 %	360037227
38	NC_016446	TCGT	2	8	13519	13526	0 %	50 %	25 %	25 %	360037228
39	NC_016446	CTCG	2	8	13698	13705	0 %	25 %	25 %	50 %	360037228
40	NC_016446	TTGA	2	8	14105	14112	25 %	50 %	25 %	0 %	360037228
41	NC_016446	TGCG	2	8	14694	14701	0 %	25 %	50 %	25 %	360037228
42	NC_016446	TGAC	2	8	15075	15082	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
43	NC_016446	TGCT	2	8	15197	15204	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
44	NC_016446	TTAC	2	8	15842	15849	25 %	50 %	0 %	25 %	360037229
45	NC_016446	TGGT	2	8	16386	16393	0 %	50 %	50 %	0 %	360037229
46	NC_016446	GCTC	2	8	16939	16946	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016446	TGAG	2	8	17504	17511	25 %	25 %	50 %	0 %	360037232
48	NC_016446	TCAA	2	8	17643	17650	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016446	CTTA	2	8	19127	19134	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016446	CAAT	2	8	19549	19556	50 %	25 %	0 %	25 %	360037235
51	NC_016446	GTCA	2	8	21470	21477	25 %	25 %	25 %	25 %	360037235
52	NC_016446	GGCA	2	8	22013	22020	25 %	0 %	50 %	25 %	360037235
53	NC_016446	GTGA	2	8	22243	22250	25 %	25 %	50 %	0 %	360037236
54	NC_016446	CAGC	2	8	23088	23095	25 %	0 %	25 %	50 %	360037238
55	NC_016446	AGCA	2	8	23659	23666	50 %	0 %	25 %	25 %	360037238
56	NC_016446	CAAT	2	8	24266	24273	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016446	CATC	2	8	24440	24447	25 %	25 %	0 %	50 %	360037239
58	NC_016446	TCGC	2	8	24566	24573	0 %	25 %	25 %	50 %	360037239
59	NC_016446	CGTG	2	8	24816	24823	0 %	25 %	50 %	25 %	360037239
60	NC_016446	AGTG	2	8	24990	24997	25 %	25 %	50 %	0 %	360037239
61	NC_016446	CTGC	2	8	25678	25685	0 %	25 %	25 %	50 %	360037240
62	NC_016446	AAGC	2	8	26033	26040	50 %	0 %	25 %	25 %	360037240
63	NC_016446	AAGG	2	8	26449	26456	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016446	CCTT	2	8	26461	26468	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016446	TATT	2	8	26622	26629	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016446	GAAT	2	8	26633	26640	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016446	CTAT	2	8	26797	26804	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016446	AGTT	2	8	27105	27112	25 %	50 %	25 %	0 %	360037241
69	NC_016446	CAAG	2	8	27385	27392	50 %	0 %	25 %	25 %	360037241
70	NC_016446	GGCT	2	8	27612	27619	0 %	25 %	50 %	25 %	360037241
71	NC_016446	ATCA	2	8	28451	28458	50 %	25 %	0 %	25 %	360037242
72	NC_016446	AGCG	2	8	28466	28473	25 %	0 %	50 %	25 %	360037242
73	NC_016446	ACCA	2	8	28547	28554	50 %	0 %	0 %	50 %	360037242
74	NC_016446	CTCA	2	8	28643	28650	25 %	25 %	0 %	50 %	360037242
75	NC_016446	CCAT	2	8	28860	28867	25 %	25 %	0 %	50 %	360037242
76	NC_016446	AGTT	2	8	30018	30025	25 %	50 %	25 %	0 %	360037243
77	NC_016446	GATG	2	8	30034	30041	25 %	25 %	50 %	0 %	360037243
78	NC_016446	GTAC	2	8	30081	30088	25 %	25 %	25 %	25 %	360037243
79	NC_016446	CTAG	2	8	30996	31003	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016446	CAAA	2	8	31608	31615	75 %	0 %	0 %	25 %	360037244
81	NC_016446	TGAC	2	8	31646	31653	25 %	25 %	25 %	25 %	360037245
82	NC_016446	TTTC	2	8	31699	31706	0 %	75 %	0 %	25 %	360037245
83	NC_016446	CTAT	2	8	32499	32506	25 %	50 %	0 %	25 %	360037246
84	NC_016446	GCTA	2	8	32606	32613	25 %	25 %	25 %	25 %	360037246
85	NC_016446	ATTG	2	8	32748	32755	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016446	CTTG	2	8	33170	33177	0 %	50 %	25 %	25 %	360037247
87	NC_016446	AAAG	2	8	33347	33354	75 %	0 %	25 %	0 %	360037247
88	NC_016446	TGGT	2	8	33746	33753	0 %	50 %	50 %	0 %	360037247
89	NC_016446	CGTG	2	8	34365	34372	0 %	25 %	50 %	25 %	360037247
90	NC_016446	TTGG	2	8	34544	34551	0 %	50 %	50 %	0 %	360037247
91	NC_016446	GTAC	2	8	34761	34768	25 %	25 %	25 %	25 %	360037247
92	NC_016446	GATC	2	8	36026	36033	25 %	25 %	25 %	25 %	360037250
93	NC_016446	AATG	2	8	36340	36347	50 %	25 %	25 %	0 %	360037251
94	NC_016446	TGAG	2	8	36932	36939	25 %	25 %	50 %	0 %	360037251
95	NC_016446	GTTG	2	8	37201	37208	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016446	ATTA	2	8	37326	37333	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016446	GTAG	2	8	37451	37458	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016446	ATTT	2	8	37581	37588	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016446	AGCG	2	8	37676	37683	25 %	0 %	50 %	25 %	360037252
100	NC_016446	AACA	2	8	37696	37703	75 %	0 %	0 %	25 %	360037252
101	NC_016446	GTTT	2	8	38503	38510	0 %	75 %	25 %	0 %	360037254
102	NC_016446	CTTT	2	8	39022	39029	0 %	75 %	0 %	25 %	360037255
103	NC_016446	GGCG	2	8	39309	39316	0 %	0 %	75 %	25 %	360037256
104	NC_016446	TAAA	2	8	40223	40230	75 %	25 %	0 %	0 %	360037258
105	NC_016446	GGCG	2	8	40346	40353	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
106	NC_016446	GCAC	2	8	40998	41005	25 %	0 %	25 %	50 %	360037259
107	NC_016446	AAAG	2	8	41357	41364	75 %	0 %	25 %	0 %	360037260
108	NC_016446	GAAT	2	8	41623	41630	50 %	25 %	25 %	0 %	360037260
109	NC_016446	GATT	2	8	41733	41740	25 %	50 %	25 %	0 %	360037260
110	NC_016446	GGCG	2	8	42034	42041	0 %	0 %	75 %	25 %	360037261
111	NC_016446	CAAA	2	8	42410	42417	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016446	GGCG	2	8	42569	42576	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016446	TCAG	2	8	42811	42818	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016446	GGCG	2	8	43092	43099	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016446	CTTT	2	8	43344	43351	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016446	GGCG	2	8	43629	43636	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
117	NC_016446	GGCG	2	8	44163	44170	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016446	TACA	2	8	44756	44763	50 %	25 %	0 %	25 %	360037263
119	NC_016446	GGCG	2	8	44977	44984	0 %	0 %	75 %	25 %	360037264
120	NC_016446	AGTT	2	8	44996	45003	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016446	GCTC	2	8	45275	45282	0 %	25 %	25 %	50 %	360037265
122	NC_016446	GTAC	2	8	45497	45504	25 %	25 %	25 %	25 %	360037265
123	NC_016446	TCGT	2	8	46462	46469	0 %	50 %	25 %	25 %	360037267
124	NC_016446	GGCG	2	8	47224	47231	0 %	0 %	75 %	25 %	360037269
125	NC_016446	GGCG	2	8	47727	47734	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
126	NC_016446	TCAA	2	8	48085	48092	50 %	25 %	0 %	25 %	360037271
127	NC_016446	GGCG	2	8	48536	48543	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016446	AGCA	2	8	48702	48709	50 %	0 %	25 %	25 %	360037272
129	NC_016446	GGCG	2	8	49578	49585	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016446	AAAG	2	8	49819	49826	75 %	0 %	25 %	0 %	360037274
131	NC_016446	GGCC	2	8	50141	50148	0 %	0 %	50 %	50 %	360037274
132	NC_016446	GGCG	2	8	50264	50271	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016446	GGAA	2	8	50532	50539	50 %	0 %	50 %	0 %	360037275
134	NC_016446	AATA	2	8	50802	50809	75 %	25 %	0 %	0 %	360037275
135	NC_016446	GGCG	2	8	50923	50930	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016446	GTTT	2	8	50997	51004	0 %	75 %	25 %	0 %	360037276
137	NC_016446	TATC	2	8	51164	51171	25 %	50 %	0 %	25 %	360037276
138	NC_016446	GGCG	2	8	51926	51933	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016446	GCTT	2	8	52240	52247	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016446	GGCG	2	8	52462	52469	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016446	CAAA	2	8	52913	52920	75 %	0 %	0 %	25 %	360037278
142	NC_016446	GGCG	2	8	53055	53062	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016446	TCTT	2	8	53315	53322	0 %	75 %	0 %	25 %	360037279
144	NC_016446	TGCA	2	8	53638	53645	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
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