MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 2

Total Repeats: 304

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016446	GT	3	6	1722	1727	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016446	GC	3	6	1782	1787	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016446	TG	3	6	6687	6692	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016446	CA	3	6	8613	8618	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016446	GA	3	6	9965	9970	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016446	GC	3	6	9988	9993	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016446	AC	3	6	16483	16488	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016446	CT	3	6	16969	16974	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016446	TG	3	6	24335	24340	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016446	GT	3	6	25083	25088	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016446	CA	3	6	26658	26663	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
12	NC_016446	CA	3	6	32892	32897	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
13	NC_016446	GA	3	6	35750	35755	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016446	TC	3	6	37483	37488	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016446	GT	3	6	38354	38359	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016446	CG	3	6	39224	39229	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016446	CA	3	6	39650	39655	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
18	NC_016446	TC	3	6	42048	42053	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016446	CG	3	6	42485	42490	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016446	GT	3	6	43434	43439	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016446	CG	3	6	43545	43550	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016446	GT	3	6	43969	43974	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016446	GA	3	6	43977	43982	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016446	CG	3	6	49495	49500	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016446	CG	3	6	50180	50185	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
26	NC_016446	CG	3	6	51843	51848	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016446	TC	3	6	51940	51945	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016446	CG	3	6	53709	53714	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016446	CA	3	6	55774	55779	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016446	CG	3	6	58870	58875	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016446	CG	3	6	60438	60443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016446	CG	3	6	60966	60971	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
33	NC_016446	CT	3	6	62910	62915	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016446	TG	3	6	63062	63067	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016446	CA	3	6	65346	65351	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016446	GT	3	6	65475	65480	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016446	CG	3	6	66114	66119	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016446	CG	3	6	67588	67593	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
39	NC_016446	GT	3	6	68884	68889	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016446	CG	3	6	68952	68957	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016446	CG	3	6	69611	69616	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016446	CG	3	6	70368	70373	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016446	CG	3	6	70898	70903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016446	GC	3	6	75297	75302	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016446	CG	3	6	76460	76465	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016446	CG	3	6	77786	77791	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016446	AT	4	8	80975	80982	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016446	GC	3	6	81463	81468	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016446	CG	3	6	83711	83716	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016446	TG	3	6	85130	85135	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016446	TG	3	6	85300	85305	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016446	AC	4	8	85624	85631	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016446	GT	3	6	86462	86467	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016446	AC	4	8	86680	86687	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016446	GT	4	8	88188	88195	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016446	TG	3	6	88197	88202	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016446	TG	3	6	89477	89482	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016446	TC	3	6	89902	89907	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016446	GT	3	6	90198	90203	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016446	CG	3	6	91773	91778	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016446	CT	3	6	92777	92782	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016446	TG	3	6	92929	92934	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016446	TG	3	6	93565	93570	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016446	GT	3	6	101724	101729	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016446	CG	3	6	102923	102928	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016446	AT	3	6	105344	105349	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016446	TG	3	6	105613	105618	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016446	CT	3	6	111442	111447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016446	TC	3	6	112170	112175	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016446	GT	3	6	112680	112685	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016446	CG	3	6	113327	113332	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016446	CT	3	6	113423	113428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016446	AG	3	6	113593	113598	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016446	AT	3	6	114681	114686	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016446	AC	4	8	114792	114799	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016446	CG	3	6	114829	114834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016446	CG	3	6	115338	115343	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016446	CG	3	6	120363	120368	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016446	CG	3	6	123215	123220	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
80	NC_016446	CG	3	6	126005	126010	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016446	CG	3	6	127898	127903	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
82	NC_016446	CG	3	6	128438	128443	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016446	TC	3	6	132491	132496	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016446	GT	3	6	134152	134157	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016446	CG	3	6	134220	134225	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016446	TA	3	6	140780	140785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016446	GA	3	6	140824	140829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016446	CT	3	6	157423	157428	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016446	AT	3	6	158738	158743	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016446	AT	3	6	158780	158785	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016446	AT	3	6	161544	161549	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016446	AT	3	6	161749	161754	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016446	GC	3	6	161803	161808	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016446	GA	3	6	163948	163953	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016446	TA	3	6	164124	164129	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016446	AC	3	6	171881	171886	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016446	TC	3	6	172221	172226	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
98	NC_016446	CA	3	6	180539	180544	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016446	TG	3	6	180549	180554	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016446	AG	3	6	182445	182450	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016446	AG	3	6	182506	182511	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
102	NC_016446	AG	3	6	186069	186074	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016446	CT	3	6	188519	188524	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016446	TA	3	6	191404	191409	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016446	TG	3	6	200606	200611	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016446	CA	3	6	200640	200645	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016446	AG	3	6	208368	208373	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016446	GT	3	6	208417	208422	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
109	NC_016446	CT	3	6	215268	215273	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016446	GC	3	6	233227	233232	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016446	CT	3	6	234218	234223	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016446	TA	3	6	247827	247832	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016446	GC	3	6	248569	248574	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016446	GC	3	6	257141	257146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016446	CT	3	6	257441	257446	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
116	NC_016446	TC	3	6	263303	263308	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016446	TC	3	6	269334	269339	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016446	CA	3	6	273069	273074	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016446	AG	3	6	277464	277469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016446	AT	3	6	292091	292096	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016446	AG	3	6	292100	292105	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016446	AT	3	6	292106	292111	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016446	CA	4	8	293305	293312	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016446	AG	3	6	296898	296903	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016446	TG	3	6	300914	300919	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016446	AC	3	6	305820	305825	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016446	AG	3	6	307369	307374	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016446	CT	3	6	308418	308423	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016446	AC	3	6	312108	312113	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
130	NC_016446	AG	4	8	316846	316853	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016446	AC	3	6	337723	337728	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
132	NC_016446	TA	3	6	339248	339253	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_016446	AT	3	6	339261	339266	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016446	TA	3	6	358854	358859	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016446	TC	3	6	360270	360275	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016446	GC	3	6	377839	377844	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016446	TC	3	6	378768	378773	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
138	NC_016446	GA	4	8	388624	388631	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016446	CT	4	8	391447	391454	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
140	NC_016446	AG	3	6	397367	397372	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016446	GA	3	6	399195	399200	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
142	NC_016446	GA	3	6	400092	400097	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016446	AC	3	6	409076	409081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
144	NC_016446	CT	3	6	415730	415735	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016446	GA	3	6	423975	423980	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016446	CA	3	6	429359	429364	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016446	TG	3	6	434025	434030	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016446	CA	3	6	435076	435081	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016446	CG	3	6	441780	441785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
150	NC_016446	GT	3	6	445808	445813	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016446	AT	3	6	445814	445819	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
152	NC_016446	TG	3	6	447013	447018	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_016446	CA	4	8	452922	452929	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
154	NC_016446	AC	3	6	453846	453851	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
155	NC_016446	AT	3	6	455670	455675	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.