MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 2122

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016445	GTTCA	2	10	755	764	20 %	40 %	20 %	20 %	360034410
2	NC_016445	GACTC	2	10	1546	1555	20 %	20 %	20 %	40 %	360034410
3	NC_016445	TGAGT	2	10	4629	4638	20 %	40 %	40 %	0 %	360034415
4	NC_016445	CTGCG	2	10	6397	6406	0 %	20 %	40 %	40 %	360034417
5	NC_016445	GATCG	2	10	7485	7494	20 %	20 %	40 %	20 %	360034417
6	NC_016445	CGCTG	2	10	7905	7914	0 %	20 %	40 %	40 %	360034417
7	NC_016445	TCGAT	2	10	8586	8595	20 %	40 %	20 %	20 %	360034418
8	NC_016445	CGACA	2	10	12715	12724	40 %	0 %	20 %	40 %	360034419
9	NC_016445	GTCTG	2	10	13126	13135	0 %	40 %	40 %	20 %	360034419
10	NC_016445	TCTGG	2	10	15088	15097	0 %	40 %	40 %	20 %	360034420
11	NC_016445	GGACG	2	10	16485	16494	20 %	0 %	60 %	20 %	360034421
12	NC_016445	GTTTT	2	10	18502	18511	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016445	TATTT	2	10	19636	19645	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016445	ATCGA	2	10	21127	21136	40 %	20 %	20 %	20 %	360034425
15	NC_016445	GATGC	2	10	21633	21642	20 %	20 %	40 %	20 %	360034426
16	NC_016445	ATCTT	2	10	25171	25180	20 %	60 %	0 %	20 %	360034428
17	NC_016445	ACCAC	2	10	25427	25436	40 %	0 %	0 %	60 %	360034428
18	NC_016445	CGCGG	2	10	27337	27346	0 %	0 %	60 %	40 %	360034429
19	NC_016445	AATTC	2	10	28433	28442	40 %	40 %	0 %	20 %	360034429
20	NC_016445	AACGC	2	10	29198	29207	40 %	0 %	20 %	40 %	360034430
21	NC_016445	GTTTT	2	10	32334	32343	0 %	80 %	20 %	0 %	360034433
22	NC_016445	ACCGA	2	10	33463	33472	40 %	0 %	20 %	40 %	360034434
23	NC_016445	ACAGT	2	10	34303	34312	40 %	20 %	20 %	20 %	360034435
24	NC_016445	TTTCA	2	10	36777	36786	20 %	60 %	0 %	20 %	360034436
25	NC_016445	TTTCA	2	10	37010	37019	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016445	TTAAT	2	10	37389	37398	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016445	ATTAA	2	10	37401	37410	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016445	GTGAG	2	10	38771	38780	20 %	20 %	60 %	0 %	360034437
29	NC_016445	TTGCT	2	10	39149	39158	0 %	60 %	20 %	20 %	360034437
30	NC_016445	CATGC	2	10	39856	39865	20 %	20 %	20 %	40 %	360034437
31	NC_016445	ATGTG	2	10	39883	39892	20 %	40 %	40 %	0 %	360034437
32	NC_016445	GCCAA	2	10	40579	40588	40 %	0 %	20 %	40 %	360034437
33	NC_016445	GAATG	2	10	41690	41699	40 %	20 %	40 %	0 %	360034438
34	NC_016445	TTACC	2	10	41907	41916	20 %	40 %	0 %	40 %	360034438
35	NC_016445	ATCAG	2	10	42281	42290	40 %	20 %	20 %	20 %	360034438
36	NC_016445	CACAA	2	10	43465	43474	60 %	0 %	0 %	40 %	360034439
37	NC_016445	AGTTG	2	10	46794	46803	20 %	40 %	40 %	0 %	360034444
38	NC_016445	ACTCA	2	10	47029	47038	40 %	20 %	0 %	40 %	360034444
39	NC_016445	GTTCA	2	10	51566	51575	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
40	NC_016445	AATTT	2	10	55811	55820	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016445	ACCCG	2	10	56004	56013	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
42	NC_016445	CAACA	2	10	56852	56861	60 %	0 %	0 %	40 %	360034451
43	NC_016445	AGATC	2	10	63772	63781	40 %	20 %	20 %	20 %	360034458
44	NC_016445	TTGGT	2	10	64957	64966	0 %	60 %	40 %	0 %	360034458
45	NC_016445	AAGCG	2	10	65478	65487	40 %	0 %	40 %	20 %	360034459
46	NC_016445	AACTG	2	10	66559	66568	40 %	20 %	20 %	20 %	360034459
47	NC_016445	GCTGA	2	10	67085	67094	20 %	20 %	40 %	20 %	360034459
48	NC_016445	TGATT	2	10	69871	69880	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016445	GCTCT	2	10	70929	70938	0 %	40 %	20 %	40 %	360034463
50	NC_016445	ACTGC	2	10	71420	71429	20 %	20 %	20 %	40 %	360034463
51	NC_016445	GCGGT	2	10	71628	71637	0 %	20 %	60 %	20 %	360034463
52	NC_016445	GGCTC	2	10	72407	72416	0 %	20 %	40 %	40 %	360034464
53	NC_016445	TTCGA	2	10	72522	72531	20 %	40 %	20 %	20 %	360034464
54	NC_016445	GCTCA	2	10	73244	73253	20 %	20 %	20 %	40 %	360034465
55	NC_016445	TTTCT	2	10	74240	74249	0 %	80 %	0 %	20 %	360034466
56	NC_016445	TTTCA	2	10	75751	75760	20 %	60 %	0 %	20 %	360034467
57	NC_016445	CAAAC	2	10	78065	78074	60 %	0 %	0 %	40 %	360034469
58	NC_016445	ATCCA	2	10	80323	80332	40 %	20 %	0 %	40 %	Non-Coding
59	NC_016445	TGCAA	2	10	80854	80863	40 %	20 %	20 %	20 %	360034473
60	NC_016445	TGCTC	2	10	83203	83212	0 %	40 %	20 %	40 %	360034474
61	NC_016445	TTCAT	2	10	84703	84712	20 %	60 %	0 %	20 %	360034477
62	NC_016445	CTCGT	2	10	84778	84787	0 %	40 %	20 %	40 %	360034477
63	NC_016445	AGTTG	2	10	84802	84811	20 %	40 %	40 %	0 %	360034477
64	NC_016445	AGCCC	2	10	87803	87812	20 %	0 %	20 %	60 %	360034479
65	NC_016445	TTGGT	2	10	89522	89531	0 %	60 %	40 %	0 %	360034481
66	NC_016445	TCAAA	2	10	92310	92319	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
67	NC_016445	TCCTG	2	10	93084	93093	0 %	40 %	20 %	40 %	360034484
68	NC_016445	ATGGC	2	10	94005	94014	20 %	20 %	40 %	20 %	360034484
69	NC_016445	GCCGG	2	10	97317	97326	0 %	0 %	60 %	40 %	360034486
70	NC_016445	GATCG	2	10	97459	97468	20 %	20 %	40 %	20 %	360034486
71	NC_016445	TCGGA	2	10	97677	97686	20 %	20 %	40 %	20 %	360034486
72	NC_016445	TCAAG	2	10	98737	98746	40 %	20 %	20 %	20 %	360034487
73	NC_016445	GTTCA	2	10	99461	99470	20 %	40 %	20 %	20 %	360034488
74	NC_016445	CTCCC	2	10	100955	100964	0 %	20 %	0 %	80 %	360034490
75	NC_016445	AAGGC	2	10	101187	101196	40 %	0 %	40 %	20 %	360034491
76	NC_016445	TCAAA	2	10	103487	103496	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
77	NC_016445	TCCTG	2	10	104261	104270	0 %	40 %	20 %	40 %	360034493
78	NC_016445	ATGCT	2	10	107349	107358	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016445	ATCGC	2	10	109182	109191	20 %	20 %	20 %	40 %	360034499
80	NC_016445	AGCGA	2	10	110259	110268	40 %	0 %	40 %	20 %	360034500
81	NC_016445	CACAA	2	10	110830	110839	60 %	0 %	0 %	40 %	360034501
82	NC_016445	ACCGC	2	10	113154	113163	20 %	0 %	20 %	60 %	360034503
83	NC_016445	GAGAA	2	10	113869	113878	60 %	0 %	40 %	0 %	360034503
84	NC_016445	TTTTA	2	10	117811	117820	20 %	80 %	0 %	0 %	360034504
85	NC_016445	AAAGA	2	10	118110	118119	80 %	0 %	20 %	0 %	360034504
86	NC_016445	AGAAA	2	10	122149	122158	80 %	0 %	20 %	0 %	360034506
87	NC_016445	CAGAC	2	10	123849	123858	40 %	0 %	20 %	40 %	360034507
88	NC_016445	ATTGG	2	10	130167	130176	20 %	40 %	40 %	0 %	360034512
89	NC_016445	ATTTG	2	10	131335	131344	20 %	60 %	20 %	0 %	360034514
90	NC_016445	TTTCA	2	10	135746	135755	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
91	NC_016445	CGCCT	2	10	138645	138654	0 %	20 %	20 %	60 %	360034524
92	NC_016445	TGAGT	2	10	138861	138870	20 %	40 %	40 %	0 %	360034524
93	NC_016445	TTGGA	2	10	144447	144456	20 %	40 %	40 %	0 %	360034529
94	NC_016445	GTCTG	2	10	144607	144616	0 %	40 %	40 %	20 %	360034529
95	NC_016445	CACAG	2	10	145421	145430	40 %	0 %	20 %	40 %	360034529
96	NC_016445	GGAGC	2	10	146782	146791	20 %	0 %	60 %	20 %	360034529
97	NC_016445	TATCA	2	10	147874	147883	40 %	40 %	0 %	20 %	360034530
98	NC_016445	TTGTT	2	10	157196	157205	0 %	80 %	20 %	0 %	360034540
99	NC_016445	TGGCT	2	10	159171	159180	0 %	40 %	40 %	20 %	360034542
100	NC_016445	AATCA	2	10	159253	159262	60 %	20 %	0 %	20 %	360034542
101	NC_016445	AGCGC	2	10	159845	159854	20 %	0 %	40 %	40 %	360034543
102	NC_016445	AATCA	2	10	160230	160239	60 %	20 %	0 %	20 %	360034543
103	NC_016445	AGCAG	2	10	162081	162090	40 %	0 %	40 %	20 %	360034545
104	NC_016445	CAGTC	2	10	162172	162181	20 %	20 %	20 %	40 %	360034545
105	NC_016445	GCTAC	2	10	164670	164679	20 %	20 %	20 %	40 %	360034548
106	NC_016445	AGTAA	2	10	165703	165712	60 %	20 %	20 %	0 %	360034549
107	NC_016445	GATCA	2	10	167003	167012	40 %	20 %	20 %	20 %	360034551
108	NC_016445	TGGGT	2	10	173516	173525	0 %	40 %	60 %	0 %	360034558
109	NC_016445	AATCA	2	10	177142	177151	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
110	NC_016445	TGTGT	2	10	180328	180337	0 %	60 %	40 %	0 %	360034565
111	NC_016445	CAGAT	2	10	181218	181227	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
112	NC_016445	TTGGG	2	10	184271	184280	0 %	40 %	60 %	0 %	360034568
113	NC_016445	TTGAT	2	10	185906	185915	20 %	60 %	20 %	0 %	360034570
114	NC_016445	GTGTG	2	10	186447	186456	0 %	40 %	60 %	0 %	360034570
115	NC_016445	GTGCT	2	10	186590	186599	0 %	40 %	40 %	20 %	360034570
116	NC_016445	GTGAT	2	10	189577	189586	20 %	40 %	40 %	0 %	360034572
117	NC_016445	GAATA	2	10	189843	189852	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016445	GATCA	2	10	190362	190371	40 %	20 %	20 %	20 %	360034573
119	NC_016445	TTTCA	2	10	190481	190490	20 %	60 %	0 %	20 %	360034573
120	NC_016445	TCCAT	2	10	193534	193543	20 %	40 %	0 %	40 %	360034577
121	NC_016445	GATTG	2	10	194202	194211	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016445	TGATT	2	10	194329	194338	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016445	CGAAT	2	10	196459	196468	40 %	20 %	20 %	20 %	360034582
124	NC_016445	TGAAA	2	10	197934	197943	60 %	20 %	20 %	0 %	360034583
125	NC_016445	TTTCA	2	10	198943	198952	20 %	60 %	0 %	20 %	360034584
126	NC_016445	ATGTG	2	10	199606	199615	20 %	40 %	40 %	0 %	360034585
127	NC_016445	AGCAG	2	10	200249	200258	40 %	0 %	40 %	20 %	360034586
128	NC_016445	TTGGC	2	10	204802	204811	0 %	40 %	40 %	20 %	360034590
129	NC_016445	CTGAT	2	10	207666	207675	20 %	40 %	20 %	20 %	360034592
130	NC_016445	CAACC	2	10	208207	208216	40 %	0 %	0 %	60 %	360034592
131	NC_016445	GTTTG	2	10	208603	208612	0 %	60 %	40 %	0 %	360034592
132	NC_016445	ACTCG	2	10	210892	210901	20 %	20 %	20 %	40 %	360034595
133	NC_016445	GAACG	2	10	211730	211739	40 %	0 %	40 %	20 %	360034597
134	NC_016445	ACACC	2	10	212355	212364	40 %	0 %	0 %	60 %	360034597
135	NC_016445	CGCGA	2	10	212936	212945	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
136	NC_016445	GCTAT	2	10	212966	212975	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
137	NC_016445	CGCGG	2	10	214236	214245	0 %	0 %	60 %	40 %	360034599
138	NC_016445	TCTCT	2	10	214421	214430	0 %	60 %	0 %	40 %	360034599
139	NC_016445	TTTTG	2	10	215061	215070	0 %	80 %	20 %	0 %	360034599
140	NC_016445	ATTGC	2	10	218993	219002	20 %	40 %	20 %	20 %	360034603
141	NC_016445	CACTT	2	10	222884	222893	20 %	40 %	0 %	40 %	360034606
142	NC_016445	AAAAG	2	10	223800	223809	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
143	NC_016445	AGCCA	2	10	224918	224927	40 %	0 %	20 %	40 %	360034608
144	NC_016445	CAGTA	2	10	227077	227086	40 %	20 %	20 %	20 %	360034610
145	NC_016445	AAGTA	2	10	229489	229498	60 %	20 %	20 %	0 %	360034612
146	NC_016445	GGTGA	2	10	230084	230093	20 %	20 %	60 %	0 %	360034612
147	NC_016445	ATGCC	2	10	232020	232029	20 %	20 %	20 %	40 %	360034613
148	NC_016445	GTGTG	2	10	232959	232968	0 %	40 %	60 %	0 %	360034614
149	NC_016445	CAAAA	2	10	234411	234420	80 %	0 %	0 %	20 %	360034616
150	NC_016445	TCGTT	2	10	235252	235261	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
151	NC_016445	GCGCA	2	10	237828	237837	20 %	0 %	40 %	40 %	360034620
152	NC_016445	ATCGC	2	10	238298	238307	20 %	20 %	20 %	40 %	360034620
153	NC_016445	AGTCG	2	10	243329	243338	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
154	NC_016445	GAAAC	2	10	245307	245316	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
155	NC_016445	AGCGG	2	10	245442	245451	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
156	NC_016445	TCCGC	2	10	245510	245519	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
157	NC_016445	GCAAC	2	10	246117	246126	40 %	0 %	20 %	40 %	360034624
158	NC_016445	TGCTT	2	10	246467	246476	0 %	60 %	20 %	20 %	360034624
159	NC_016445	CTTTG	2	10	249627	249636	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
160	NC_016445	GCGCG	2	10	250417	250426	0 %	0 %	60 %	40 %	360034628
161	NC_016445	GTTGC	2	10	252977	252986	0 %	40 %	40 %	20 %	360034631
162	NC_016445	GCTTT	2	10	256156	256165	0 %	60 %	20 %	20 %	360034632
163	NC_016445	AGTTT	2	10	257872	257881	20 %	60 %	20 %	0 %	360034633
164	NC_016445	ATTGA	2	10	258015	258024	40 %	40 %	20 %	0 %	360034633
165	NC_016445	CGCTT	2	10	259222	259231	0 %	40 %	20 %	40 %	360034634
166	NC_016445	CGGTG	2	10	260204	260213	0 %	20 %	60 %	20 %	360034634
167	NC_016445	AGGTG	2	10	260713	260722	20 %	20 %	60 %	0 %	360034635
168	NC_016445	CATCT	2	10	262295	262304	20 %	40 %	0 %	40 %	360034637
169	NC_016445	AATTA	2	10	266193	266202	60 %	40 %	0 %	0 %	360034641
170	NC_016445	GCATG	2	10	267759	267768	20 %	20 %	40 %	20 %	360034642
171	NC_016445	CGTTG	2	10	267783	267792	0 %	40 %	40 %	20 %	360034642
172	NC_016445	GGCTT	2	10	269077	269086	0 %	40 %	40 %	20 %	360034644
173	NC_016445	TGGTG	2	10	269105	269114	0 %	40 %	60 %	0 %	360034644
174	NC_016445	GCCGA	2	10	269678	269687	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
175	NC_016445	TGGCT	2	10	269703	269712	0 %	40 %	40 %	20 %	360034645
176	NC_016445	GCGAT	2	10	271469	271478	20 %	20 %	40 %	20 %	360034647
177	NC_016445	GTGAT	2	10	275460	275469	20 %	40 %	40 %	0 %	360034651
178	NC_016445	GGTGC	2	10	275696	275705	0 %	20 %	60 %	20 %	360034651
179	NC_016445	GATCA	2	10	281203	281212	40 %	20 %	20 %	20 %	360034658
180	NC_016445	GCTGA	2	10	282150	282159	20 %	20 %	40 %	20 %	360034659
181	NC_016445	TCAAA	2	10	287266	287275	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
182	NC_016445	ACCTT	2	10	288570	288579	20 %	40 %	0 %	40 %	360034665
183	NC_016445	CTGCA	2	10	294096	294105	20 %	20 %	20 %	40 %	360034670
184	NC_016445	ATGGA	2	10	294650	294659	40 %	20 %	40 %	0 %	360034671
185	NC_016445	GTTTT	2	10	295484	295493	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
186	NC_016445	CATTT	2	10	297225	297234	20 %	60 %	0 %	20 %	360034673
187	NC_016445	GAAGA	2	10	299572	299581	60 %	0 %	40 %	0 %	360034675
188	NC_016445	GTGAA	2	10	300302	300311	40 %	20 %	40 %	0 %	360034675
189	NC_016445	ATTGG	2	10	304081	304090	20 %	40 %	40 %	0 %	360034678
190	NC_016445	GATTC	2	10	304433	304442	20 %	40 %	20 %	20 %	360034678
191	NC_016445	TGATC	2	10	304997	305006	20 %	40 %	20 %	20 %	360034679
192	NC_016445	TGGCT	2	10	305939	305948	0 %	40 %	40 %	20 %	360034679
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194	NC_016445	GTGAG	2	10	307178	307187	20 %	20 %	60 %	0 %	360034680
195	NC_016445	GTTGC	2	10	307536	307545	0 %	40 %	40 %	20 %	360034680
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199	NC_016445	GCTCA	2	10	317696	317705	20 %	20 %	20 %	40 %	360034690
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201	NC_016445	AGCCA	2	10	318169	318178	40 %	0 %	20 %	40 %	360034691
202	NC_016445	GGCTG	2	10	318438	318447	0 %	20 %	60 %	20 %	360034691
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211	NC_016445	GATCT	2	10	328545	328554	20 %	40 %	20 %	20 %	360034700
212	NC_016445	GAGTG	2	10	330313	330322	20 %	20 %	60 %	0 %	360034702
213	NC_016445	ATTAT	2	10	331316	331325	40 %	60 %	0 %	0 %	360034703
214	NC_016445	TTATT	2	10	331347	331356	20 %	80 %	0 %	0 %	360034703
215	NC_016445	ACCGC	2	10	331708	331717	20 %	0 %	20 %	60 %	360034703
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220	NC_016445	CTGCC	2	10	335973	335982	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
221	NC_016445	CTTCA	2	10	337784	337793	20 %	40 %	0 %	40 %	360034711
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230	NC_016445	TTGAT	2	10	350563	350572	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
231	NC_016445	CTCAC	2	10	351412	351421	20 %	20 %	0 %	60 %	360034724
232	NC_016445	ATAAG	2	10	352634	352643	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
233	NC_016445	AAATT	2	10	352704	352713	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
234	NC_016445	TAATA	2	10	353137	353146	60 %	40 %	0 %	0 %	360034727
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243	NC_016445	GCTAA	2	10	362356	362365	40 %	20 %	20 %	20 %	360034730
244	NC_016445	GTTTG	2	10	363199	363208	0 %	60 %	40 %	0 %	Non-Coding
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247	NC_016445	TGAAT	2	10	367714	367723	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
248	NC_016445	GTTAT	2	10	369209	369218	20 %	60 %	20 %	0 %	360034736
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255	NC_016445	ATATA	2	10	375133	375142	60 %	40 %	0 %	0 %	360034742
256	NC_016445	AGGAT	2	10	375299	375308	40 %	20 %	40 %	0 %	360034743
257	NC_016445	GATAT	2	10	376673	376682	40 %	40 %	20 %	0 %	360034744
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259	NC_016445	TTATC	2	10	377223	377232	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
260	NC_016445	TTATT	2	10	378475	378484	20 %	80 %	0 %	0 %	360034746
261	NC_016445	CTTTA	2	10	378566	378575	20 %	60 %	0 %	20 %	360034746
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263	NC_016445	TATTT	2	10	381893	381902	20 %	80 %	0 %	0 %	360034748
264	NC_016445	ATATT	2	10	382013	382022	40 %	60 %	0 %	0 %	360034748
265	NC_016445	AATTA	2	10	383152	383161	60 %	40 %	0 %	0 %	360034750
266	NC_016445	AATTC	2	10	386538	386547	40 %	40 %	0 %	20 %	360034751
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