MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 1806

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016445	GTTCA	2	10	755	764	20 %	40 %	20 %	20 %	360034410
2	NC_016445	GACTC	2	10	1546	1555	20 %	20 %	20 %	40 %	360034410
3	NC_016445	TGAGT	2	10	4629	4638	20 %	40 %	40 %	0 %	360034415
4	NC_016445	CTGCG	2	10	6397	6406	0 %	20 %	40 %	40 %	360034417
5	NC_016445	GATCG	2	10	7485	7494	20 %	20 %	40 %	20 %	360034417
6	NC_016445	CGCTG	2	10	7905	7914	0 %	20 %	40 %	40 %	360034417
7	NC_016445	TCGAT	2	10	8586	8595	20 %	40 %	20 %	20 %	360034418
8	NC_016445	CGACA	2	10	12715	12724	40 %	0 %	20 %	40 %	360034419
9	NC_016445	GTCTG	2	10	13126	13135	0 %	40 %	40 %	20 %	360034419
10	NC_016445	TCTGG	2	10	15088	15097	0 %	40 %	40 %	20 %	360034420
11	NC_016445	GGACG	2	10	16485	16494	20 %	0 %	60 %	20 %	360034421
12	NC_016445	ATCGA	2	10	21127	21136	40 %	20 %	20 %	20 %	360034425
13	NC_016445	GATGC	2	10	21633	21642	20 %	20 %	40 %	20 %	360034426
14	NC_016445	ATCTT	2	10	25171	25180	20 %	60 %	0 %	20 %	360034428
15	NC_016445	ACCAC	2	10	25427	25436	40 %	0 %	0 %	60 %	360034428
16	NC_016445	CGCGG	2	10	27337	27346	0 %	0 %	60 %	40 %	360034429
17	NC_016445	AATTC	2	10	28433	28442	40 %	40 %	0 %	20 %	360034429
18	NC_016445	AACGC	2	10	29198	29207	40 %	0 %	20 %	40 %	360034430
19	NC_016445	GTTTT	2	10	32334	32343	0 %	80 %	20 %	0 %	360034433
20	NC_016445	ACCGA	2	10	33463	33472	40 %	0 %	20 %	40 %	360034434
21	NC_016445	ACAGT	2	10	34303	34312	40 %	20 %	20 %	20 %	360034435
22	NC_016445	TTTCA	2	10	36777	36786	20 %	60 %	0 %	20 %	360034436
23	NC_016445	GTGAG	2	10	38771	38780	20 %	20 %	60 %	0 %	360034437
24	NC_016445	TTGCT	2	10	39149	39158	0 %	60 %	20 %	20 %	360034437
25	NC_016445	CATGC	2	10	39856	39865	20 %	20 %	20 %	40 %	360034437
26	NC_016445	ATGTG	2	10	39883	39892	20 %	40 %	40 %	0 %	360034437
27	NC_016445	GCCAA	2	10	40579	40588	40 %	0 %	20 %	40 %	360034437
28	NC_016445	GAATG	2	10	41690	41699	40 %	20 %	40 %	0 %	360034438
29	NC_016445	TTACC	2	10	41907	41916	20 %	40 %	0 %	40 %	360034438
30	NC_016445	ATCAG	2	10	42281	42290	40 %	20 %	20 %	20 %	360034438
31	NC_016445	CACAA	2	10	43465	43474	60 %	0 %	0 %	40 %	360034439
32	NC_016445	AGTTG	2	10	46794	46803	20 %	40 %	40 %	0 %	360034444
33	NC_016445	ACTCA	2	10	47029	47038	40 %	20 %	0 %	40 %	360034444
34	NC_016445	CAACA	2	10	56852	56861	60 %	0 %	0 %	40 %	360034451
35	NC_016445	AGATC	2	10	63772	63781	40 %	20 %	20 %	20 %	360034458
36	NC_016445	TTGGT	2	10	64957	64966	0 %	60 %	40 %	0 %	360034458
37	NC_016445	AAGCG	2	10	65478	65487	40 %	0 %	40 %	20 %	360034459
38	NC_016445	AACTG	2	10	66559	66568	40 %	20 %	20 %	20 %	360034459
39	NC_016445	GCTGA	2	10	67085	67094	20 %	20 %	40 %	20 %	360034459
40	NC_016445	GCTCT	2	10	70929	70938	0 %	40 %	20 %	40 %	360034463
41	NC_016445	ACTGC	2	10	71420	71429	20 %	20 %	20 %	40 %	360034463
42	NC_016445	GCGGT	2	10	71628	71637	0 %	20 %	60 %	20 %	360034463
43	NC_016445	GGCTC	2	10	72407	72416	0 %	20 %	40 %	40 %	360034464
44	NC_016445	TTCGA	2	10	72522	72531	20 %	40 %	20 %	20 %	360034464
45	NC_016445	GCTCA	2	10	73244	73253	20 %	20 %	20 %	40 %	360034465
46	NC_016445	TTTCT	2	10	74240	74249	0 %	80 %	0 %	20 %	360034466
47	NC_016445	TTTCA	2	10	75751	75760	20 %	60 %	0 %	20 %	360034467
48	NC_016445	CAAAC	2	10	78065	78074	60 %	0 %	0 %	40 %	360034469
49	NC_016445	TGCAA	2	10	80854	80863	40 %	20 %	20 %	20 %	360034473
50	NC_016445	TGCTC	2	10	83203	83212	0 %	40 %	20 %	40 %	360034474
51	NC_016445	TTCAT	2	10	84703	84712	20 %	60 %	0 %	20 %	360034477
52	NC_016445	CTCGT	2	10	84778	84787	0 %	40 %	20 %	40 %	360034477
53	NC_016445	AGTTG	2	10	84802	84811	20 %	40 %	40 %	0 %	360034477
54	NC_016445	AGCCC	2	10	87803	87812	20 %	0 %	20 %	60 %	360034479
55	NC_016445	TTGGT	2	10	89522	89531	0 %	60 %	40 %	0 %	360034481
56	NC_016445	TCCTG	2	10	93084	93093	0 %	40 %	20 %	40 %	360034484
57	NC_016445	ATGGC	2	10	94005	94014	20 %	20 %	40 %	20 %	360034484
58	NC_016445	GCCGG	2	10	97317	97326	0 %	0 %	60 %	40 %	360034486
59	NC_016445	GATCG	2	10	97459	97468	20 %	20 %	40 %	20 %	360034486
60	NC_016445	TCGGA	2	10	97677	97686	20 %	20 %	40 %	20 %	360034486
61	NC_016445	TCAAG	2	10	98737	98746	40 %	20 %	20 %	20 %	360034487
62	NC_016445	GTTCA	2	10	99461	99470	20 %	40 %	20 %	20 %	360034488
63	NC_016445	CTCCC	2	10	100955	100964	0 %	20 %	0 %	80 %	360034490
64	NC_016445	AAGGC	2	10	101187	101196	40 %	0 %	40 %	20 %	360034491
65	NC_016445	TCCTG	2	10	104261	104270	0 %	40 %	20 %	40 %	360034493
66	NC_016445	ATCGC	2	10	109182	109191	20 %	20 %	20 %	40 %	360034499
67	NC_016445	AGCGA	2	10	110259	110268	40 %	0 %	40 %	20 %	360034500
68	NC_016445	CACAA	2	10	110830	110839	60 %	0 %	0 %	40 %	360034501
69	NC_016445	ACCGC	2	10	113154	113163	20 %	0 %	20 %	60 %	360034503
70	NC_016445	GAGAA	2	10	113869	113878	60 %	0 %	40 %	0 %	360034503
71	NC_016445	TTTTA	2	10	117811	117820	20 %	80 %	0 %	0 %	360034504
72	NC_016445	AAAGA	2	10	118110	118119	80 %	0 %	20 %	0 %	360034504
73	NC_016445	AGAAA	2	10	122149	122158	80 %	0 %	20 %	0 %	360034506
74	NC_016445	CAGAC	2	10	123849	123858	40 %	0 %	20 %	40 %	360034507
75	NC_016445	ATTGG	2	10	130167	130176	20 %	40 %	40 %	0 %	360034512
76	NC_016445	ATTTG	2	10	131335	131344	20 %	60 %	20 %	0 %	360034514
77	NC_016445	CGCCT	2	10	138645	138654	0 %	20 %	20 %	60 %	360034524
78	NC_016445	TGAGT	2	10	138861	138870	20 %	40 %	40 %	0 %	360034524
79	NC_016445	TTGGA	2	10	144447	144456	20 %	40 %	40 %	0 %	360034529
80	NC_016445	GTCTG	2	10	144607	144616	0 %	40 %	40 %	20 %	360034529
81	NC_016445	CACAG	2	10	145421	145430	40 %	0 %	20 %	40 %	360034529
82	NC_016445	GGAGC	2	10	146782	146791	20 %	0 %	60 %	20 %	360034529
83	NC_016445	TATCA	2	10	147874	147883	40 %	40 %	0 %	20 %	360034530
84	NC_016445	TTGTT	2	10	157196	157205	0 %	80 %	20 %	0 %	360034540
85	NC_016445	TGGCT	2	10	159171	159180	0 %	40 %	40 %	20 %	360034542
86	NC_016445	AATCA	2	10	159253	159262	60 %	20 %	0 %	20 %	360034542
87	NC_016445	AGCGC	2	10	159845	159854	20 %	0 %	40 %	40 %	360034543
88	NC_016445	AATCA	2	10	160230	160239	60 %	20 %	0 %	20 %	360034543
89	NC_016445	AGCAG	2	10	162081	162090	40 %	0 %	40 %	20 %	360034545
90	NC_016445	CAGTC	2	10	162172	162181	20 %	20 %	20 %	40 %	360034545
91	NC_016445	GCTAC	2	10	164670	164679	20 %	20 %	20 %	40 %	360034548
92	NC_016445	AGTAA	2	10	165703	165712	60 %	20 %	20 %	0 %	360034549
93	NC_016445	GATCA	2	10	167003	167012	40 %	20 %	20 %	20 %	360034551
94	NC_016445	TGGGT	2	10	173516	173525	0 %	40 %	60 %	0 %	360034558
95	NC_016445	TGTGT	2	10	180328	180337	0 %	60 %	40 %	0 %	360034565
96	NC_016445	TTGGG	2	10	184271	184280	0 %	40 %	60 %	0 %	360034568
97	NC_016445	TTGAT	2	10	185906	185915	20 %	60 %	20 %	0 %	360034570
98	NC_016445	GTGTG	2	10	186447	186456	0 %	40 %	60 %	0 %	360034570
99	NC_016445	GTGCT	2	10	186590	186599	0 %	40 %	40 %	20 %	360034570
100	NC_016445	GTGAT	2	10	189577	189586	20 %	40 %	40 %	0 %	360034572
101	NC_016445	GATCA	2	10	190362	190371	40 %	20 %	20 %	20 %	360034573
102	NC_016445	TTTCA	2	10	190481	190490	20 %	60 %	0 %	20 %	360034573
103	NC_016445	TCCAT	2	10	193534	193543	20 %	40 %	0 %	40 %	360034577
104	NC_016445	CGAAT	2	10	196459	196468	40 %	20 %	20 %	20 %	360034582
105	NC_016445	TGAAA	2	10	197934	197943	60 %	20 %	20 %	0 %	360034583
106	NC_016445	TTTCA	2	10	198943	198952	20 %	60 %	0 %	20 %	360034584
107	NC_016445	ATGTG	2	10	199606	199615	20 %	40 %	40 %	0 %	360034585
108	NC_016445	AGCAG	2	10	200249	200258	40 %	0 %	40 %	20 %	360034586
109	NC_016445	TTGGC	2	10	204802	204811	0 %	40 %	40 %	20 %	360034590
110	NC_016445	CTGAT	2	10	207666	207675	20 %	40 %	20 %	20 %	360034592
111	NC_016445	CAACC	2	10	208207	208216	40 %	0 %	0 %	60 %	360034592
112	NC_016445	GTTTG	2	10	208603	208612	0 %	60 %	40 %	0 %	360034592
113	NC_016445	ACTCG	2	10	210892	210901	20 %	20 %	20 %	40 %	360034595
114	NC_016445	GAACG	2	10	211730	211739	40 %	0 %	40 %	20 %	360034597
115	NC_016445	ACACC	2	10	212355	212364	40 %	0 %	0 %	60 %	360034597
116	NC_016445	CGCGG	2	10	214236	214245	0 %	0 %	60 %	40 %	360034599
117	NC_016445	TCTCT	2	10	214421	214430	0 %	60 %	0 %	40 %	360034599
118	NC_016445	TTTTG	2	10	215061	215070	0 %	80 %	20 %	0 %	360034599
119	NC_016445	ATTGC	2	10	218993	219002	20 %	40 %	20 %	20 %	360034603
120	NC_016445	CACTT	2	10	222884	222893	20 %	40 %	0 %	40 %	360034606
121	NC_016445	AGCCA	2	10	224918	224927	40 %	0 %	20 %	40 %	360034608
122	NC_016445	CAGTA	2	10	227077	227086	40 %	20 %	20 %	20 %	360034610
123	NC_016445	AAGTA	2	10	229489	229498	60 %	20 %	20 %	0 %	360034612
124	NC_016445	GGTGA	2	10	230084	230093	20 %	20 %	60 %	0 %	360034612
125	NC_016445	ATGCC	2	10	232020	232029	20 %	20 %	20 %	40 %	360034613
126	NC_016445	GTGTG	2	10	232959	232968	0 %	40 %	60 %	0 %	360034614
127	NC_016445	CAAAA	2	10	234411	234420	80 %	0 %	0 %	20 %	360034616
128	NC_016445	GCGCA	2	10	237828	237837	20 %	0 %	40 %	40 %	360034620
129	NC_016445	ATCGC	2	10	238298	238307	20 %	20 %	20 %	40 %	360034620
130	NC_016445	GCAAC	2	10	246117	246126	40 %	0 %	20 %	40 %	360034624
131	NC_016445	TGCTT	2	10	246467	246476	0 %	60 %	20 %	20 %	360034624
132	NC_016445	GCGCG	2	10	250417	250426	0 %	0 %	60 %	40 %	360034628
133	NC_016445	GTTGC	2	10	252977	252986	0 %	40 %	40 %	20 %	360034631
134	NC_016445	GCTTT	2	10	256156	256165	0 %	60 %	20 %	20 %	360034632
135	NC_016445	AGTTT	2	10	257872	257881	20 %	60 %	20 %	0 %	360034633
136	NC_016445	ATTGA	2	10	258015	258024	40 %	40 %	20 %	0 %	360034633
137	NC_016445	CGCTT	2	10	259222	259231	0 %	40 %	20 %	40 %	360034634
138	NC_016445	CGGTG	2	10	260204	260213	0 %	20 %	60 %	20 %	360034634
139	NC_016445	AGGTG	2	10	260713	260722	20 %	20 %	60 %	0 %	360034635
140	NC_016445	CATCT	2	10	262295	262304	20 %	40 %	0 %	40 %	360034637
141	NC_016445	AATTA	2	10	266193	266202	60 %	40 %	0 %	0 %	360034641
142	NC_016445	GCATG	2	10	267759	267768	20 %	20 %	40 %	20 %	360034642
143	NC_016445	CGTTG	2	10	267783	267792	0 %	40 %	40 %	20 %	360034642
144	NC_016445	GGCTT	2	10	269077	269086	0 %	40 %	40 %	20 %	360034644
145	NC_016445	TGGTG	2	10	269105	269114	0 %	40 %	60 %	0 %	360034644
146	NC_016445	TGGCT	2	10	269703	269712	0 %	40 %	40 %	20 %	360034645
147	NC_016445	GCGAT	2	10	271469	271478	20 %	20 %	40 %	20 %	360034647
148	NC_016445	GTGAT	2	10	275460	275469	20 %	40 %	40 %	0 %	360034651
149	NC_016445	GGTGC	2	10	275696	275705	0 %	20 %	60 %	20 %	360034651
150	NC_016445	GATCA	2	10	281203	281212	40 %	20 %	20 %	20 %	360034658
151	NC_016445	GCTGA	2	10	282150	282159	20 %	20 %	40 %	20 %	360034659
152	NC_016445	ACCTT	2	10	288570	288579	20 %	40 %	0 %	40 %	360034665
153	NC_016445	CTGCA	2	10	294096	294105	20 %	20 %	20 %	40 %	360034670
154	NC_016445	ATGGA	2	10	294650	294659	40 %	20 %	40 %	0 %	360034671
155	NC_016445	CATTT	2	10	297225	297234	20 %	60 %	0 %	20 %	360034673
156	NC_016445	GAAGA	2	10	299572	299581	60 %	0 %	40 %	0 %	360034675
157	NC_016445	GTGAA	2	10	300302	300311	40 %	20 %	40 %	0 %	360034675
158	NC_016445	ATTGG	2	10	304081	304090	20 %	40 %	40 %	0 %	360034678
159	NC_016445	GATTC	2	10	304433	304442	20 %	40 %	20 %	20 %	360034678
160	NC_016445	TGATC	2	10	304997	305006	20 %	40 %	20 %	20 %	360034679
161	NC_016445	TGGCT	2	10	305939	305948	0 %	40 %	40 %	20 %	360034679
162	NC_016445	TGAGA	2	10	306892	306901	40 %	20 %	40 %	0 %	360034680
163	NC_016445	GTGAG	2	10	307178	307187	20 %	20 %	60 %	0 %	360034680
164	NC_016445	GTTGC	2	10	307536	307545	0 %	40 %	40 %	20 %	360034680
165	NC_016445	TTTTA	2	10	309997	310006	20 %	80 %	0 %	0 %	360034683
166	NC_016445	CCAAG	2	10	315151	315160	40 %	0 %	20 %	40 %	360034688
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168	NC_016445	GCTCA	2	10	317696	317705	20 %	20 %	20 %	40 %	360034690
169	NC_016445	TTCCC	2	10	318016	318025	0 %	40 %	0 %	60 %	360034691
170	NC_016445	AGCCA	2	10	318169	318178	40 %	0 %	20 %	40 %	360034691
171	NC_016445	GGCTG	2	10	318438	318447	0 %	20 %	60 %	20 %	360034691
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173	NC_016445	TTTAG	2	10	321294	321303	20 %	60 %	20 %	0 %	360034694
174	NC_016445	GACGC	2	10	322080	322089	20 %	0 %	40 %	40 %	360034694
175	NC_016445	GTGAT	2	10	322370	322379	20 %	40 %	40 %	0 %	360034695
176	NC_016445	CTGAT	2	10	325320	325329	20 %	40 %	20 %	20 %	360034698
177	NC_016445	TGAAA	2	10	325425	325434	60 %	20 %	20 %	0 %	360034698
178	NC_016445	CGGCG	2	10	327063	327072	0 %	0 %	60 %	40 %	360034700
179	NC_016445	CATCG	2	10	328302	328311	20 %	20 %	20 %	40 %	360034700
180	NC_016445	GATCT	2	10	328545	328554	20 %	40 %	20 %	20 %	360034700
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182	NC_016445	ATTAT	2	10	331316	331325	40 %	60 %	0 %	0 %	360034703
183	NC_016445	TTATT	2	10	331347	331356	20 %	80 %	0 %	0 %	360034703
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187	NC_016445	CCATG	2	10	335115	335124	20 %	20 %	20 %	40 %	360034708
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199	NC_016445	GATTC	2	10	354015	354024	20 %	40 %	20 %	20 %	360034727
200	NC_016445	TAGAA	2	10	356856	356865	60 %	20 %	20 %	0 %	360034728
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203	NC_016445	TTTCT	2	10	358114	358123	0 %	80 %	0 %	20 %	360034729
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230	NC_016445	GCTCA	2	10	394738	394747	20 %	20 %	20 %	40 %	360034758
231	NC_016445	GCTGA	2	10	395467	395476	20 %	20 %	40 %	20 %	360034758
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244	NC_016445	GTTCA	2	10	416156	416165	20 %	40 %	20 %	20 %	360034782
245	NC_016445	TAACA	2	10	418095	418104	60 %	20 %	0 %	20 %	360034784
246	NC_016445	CAAAT	2	10	418469	418478	60 %	20 %	0 %	20 %	360034786
247	NC_016445	GTGAT	2	10	419748	419757	20 %	40 %	40 %	0 %	360034787
248	NC_016445	TATCG	2	10	420059	420068	20 %	40 %	20 %	20 %	360034787
249	NC_016445	CGGTG	2	10	422458	422467	0 %	20 %	60 %	20 %	360034791
250	NC_016445	ATCGC	2	10	423019	423028	20 %	20 %	20 %	40 %	360034793
251	NC_016445	CAGAT	2	10	426678	426687	40 %	20 %	20 %	20 %	360034796
252	NC_016445	TTGCT	2	10	428948	428957	0 %	60 %	20 %	20 %	360034799
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254	NC_016445	TTTGT	2	10	432286	432295	0 %	80 %	20 %	0 %	360034802
255	NC_016445	GTTCA	2	10	435591	435600	20 %	40 %	20 %	20 %	360034806
256	NC_016445	GGCTG	2	10	436098	436107	0 %	20 %	60 %	20 %	360034806
257	NC_016445	TTTTA	2	10	438458	438467	20 %	80 %	0 %	0 %	360034808
258	NC_016445	CAGCG	2	10	441713	441722	20 %	0 %	40 %	40 %	360034810
259	NC_016445	CACCG	2	10	444116	444125	20 %	0 %	20 %	60 %	360034813
260	NC_016445	TTTCG	2	10	444882	444891	0 %	60 %	20 %	20 %	360034814
261	NC_016445	TTCTT	2	10	446068	446077	0 %	80 %	0 %	20 %	360034816
262	NC_016445	TTTTC	2	10	450763	450772	0 %	80 %	0 %	20 %	360034819
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264	NC_016445	CAGCT	2	10	453739	453748	20 %	20 %	20 %	40 %	360034821
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383	NC_016445	CACCG	2	10	671101	671110	20 %	0 %	20 %	60 %	360035029
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389	NC_016445	GACCA	2	10	690211	690220	40 %	0 %	20 %	40 %	360035047
390	NC_016445	CGAAG	2	10	690322	690331	40 %	0 %	40 %	20 %	360035047
391	NC_016445	ACCAA	2	10	692842	692851	60 %	0 %	0 %	40 %	360035048
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