MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 7699

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016445	CACC	2	8	625	632	25 %	0 %	0 %	75 %	360034410
2	NC_016445	ATCA	2	8	956	963	50 %	25 %	0 %	25 %	360034410
3	NC_016445	GTCG	2	8	1031	1038	0 %	25 %	50 %	25 %	360034410
4	NC_016445	ACGG	2	8	1972	1979	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016445	CATC	2	8	2227	2234	25 %	25 %	0 %	50 %	360034411
6	NC_016445	GGAT	2	8	2532	2539	25 %	25 %	50 %	0 %	360034411
7	NC_016445	GTTG	2	8	3269	3276	0 %	50 %	50 %	0 %	360034412
8	NC_016445	GCTG	2	8	4560	4567	0 %	25 %	50 %	25 %	360034415
9	NC_016445	CCTG	2	8	4686	4693	0 %	25 %	25 %	50 %	360034415
10	NC_016445	AGCA	2	8	4963	4970	50 %	0 %	25 %	25 %	360034415
11	NC_016445	TCCA	2	8	5235	5242	25 %	25 %	0 %	50 %	360034415
12	NC_016445	TGCA	2	8	5428	5435	25 %	25 %	25 %	25 %	360034415
13	NC_016445	GCTG	2	8	5449	5456	0 %	25 %	50 %	25 %	360034415
14	NC_016445	TGCG	2	8	6957	6964	0 %	25 %	50 %	25 %	360034417
15	NC_016445	GCAC	2	8	7161	7168	25 %	0 %	25 %	50 %	360034417
16	NC_016445	TGAT	2	8	7318	7325	25 %	50 %	25 %	0 %	360034417
17	NC_016445	CAAA	2	8	7367	7374	75 %	0 %	0 %	25 %	360034417
18	NC_016445	TGGC	2	8	7551	7558	0 %	25 %	50 %	25 %	360034417
19	NC_016445	GCCG	2	8	7728	7735	0 %	0 %	50 %	50 %	360034417
20	NC_016445	CGAG	2	8	7882	7889	25 %	0 %	50 %	25 %	360034417
21	NC_016445	TCAG	2	8	8077	8084	25 %	25 %	25 %	25 %	360034417
22	NC_016445	GGGC	2	8	8308	8315	0 %	0 %	75 %	25 %	360034417
23	NC_016445	CTGG	2	8	8506	8513	0 %	25 %	50 %	25 %	360034418
24	NC_016445	TATC	2	8	8578	8585	25 %	50 %	0 %	25 %	360034418
25	NC_016445	GTTG	2	8	8998	9005	0 %	50 %	50 %	0 %	360034418
26	NC_016445	TTTA	2	8	9267	9274	25 %	75 %	0 %	0 %	360034418
27	NC_016445	CAGC	2	8	9557	9564	25 %	0 %	25 %	50 %	360034418
28	NC_016445	GAAA	2	8	9592	9599	75 %	0 %	25 %	0 %	360034418
29	NC_016445	CTCG	2	8	9646	9653	0 %	25 %	25 %	50 %	360034418
30	NC_016445	GCTC	2	8	10021	10028	0 %	25 %	25 %	50 %	360034418
31	NC_016445	TCAC	2	8	10160	10167	25 %	25 %	0 %	50 %	360034418
32	NC_016445	CCGA	2	8	10724	10731	25 %	0 %	25 %	50 %	360034418
33	NC_016445	CTTG	2	8	10807	10814	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016445	TGGG	2	8	11219	11226	0 %	25 %	75 %	0 %	360034419
35	NC_016445	CGAC	2	8	11516	11523	25 %	0 %	25 %	50 %	360034419
36	NC_016445	TTAC	2	8	12540	12547	25 %	50 %	0 %	25 %	360034419
37	NC_016445	TTCC	2	8	12681	12688	0 %	50 %	0 %	50 %	360034419
38	NC_016445	TGGG	2	8	13304	13311	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016445	CAAC	2	8	14300	14307	50 %	0 %	0 %	50 %	360034420
40	NC_016445	GTGC	2	8	14569	14576	0 %	25 %	50 %	25 %	360034420
41	NC_016445	TTTC	2	8	15071	15078	0 %	75 %	0 %	25 %	360034420
42	NC_016445	CAAG	2	8	15228	15235	50 %	0 %	25 %	25 %	360034420
43	NC_016445	CCAA	2	8	15772	15779	50 %	0 %	0 %	50 %	360034420
44	NC_016445	GCGT	2	8	15836	15843	0 %	25 %	50 %	25 %	360034420
45	NC_016445	TACC	2	8	16071	16078	25 %	25 %	0 %	50 %	360034420
46	NC_016445	TCGG	2	8	16213	16220	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
47	NC_016445	ATCC	2	8	16687	16694	25 %	25 %	0 %	50 %	360034421
48	NC_016445	ATCA	2	8	17233	17240	50 %	25 %	0 %	25 %	360034423
49	NC_016445	ATGT	2	8	17438	17445	25 %	50 %	25 %	0 %	360034423
50	NC_016445	CTCG	2	8	17518	17525	0 %	25 %	25 %	50 %	360034423
51	NC_016445	TGTC	2	8	17568	17575	0 %	50 %	25 %	25 %	360034423
52	NC_016445	GAAA	2	8	18727	18734	75 %	0 %	25 %	0 %	360034424
53	NC_016445	GTAA	2	8	19606	19613	50 %	25 %	25 %	0 %	360034424
54	NC_016445	TGCT	2	8	19661	19668	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
55	NC_016445	GAAA	2	8	19695	19702	75 %	0 %	25 %	0 %	360034425
56	NC_016445	TATT	2	8	19999	20006	25 %	75 %	0 %	0 %	360034425
57	NC_016445	TGTC	2	8	21413	21420	0 %	50 %	25 %	25 %	360034426
58	NC_016445	TGAT	2	8	22240	22247	25 %	50 %	25 %	0 %	360034426
59	NC_016445	GCAG	2	8	22298	22305	25 %	0 %	50 %	25 %	360034426
60	NC_016445	TTCG	2	8	23086	23093	0 %	50 %	25 %	25 %	360034427
61	NC_016445	TCGA	2	8	23462	23469	25 %	25 %	25 %	25 %	360034427
62	NC_016445	ACGC	2	8	23859	23866	25 %	0 %	25 %	50 %	360034427
63	NC_016445	CTGC	2	8	24046	24053	0 %	25 %	25 %	50 %	360034428
64	NC_016445	GATC	2	8	24212	24219	25 %	25 %	25 %	25 %	360034428
65	NC_016445	CCAG	2	8	24279	24286	25 %	0 %	25 %	50 %	360034428
66	NC_016445	TTGG	2	8	25488	25495	0 %	50 %	50 %	0 %	360034428
67	NC_016445	AACA	2	8	26049	26056	75 %	0 %	0 %	25 %	360034428
68	NC_016445	GTGA	2	8	26273	26280	25 %	25 %	50 %	0 %	360034428
69	NC_016445	TAGT	2	8	26341	26348	25 %	50 %	25 %	0 %	360034428
70	NC_016445	TGTC	2	8	27510	27517	0 %	50 %	25 %	25 %	360034429
71	NC_016445	TTGA	2	8	27604	27611	25 %	50 %	25 %	0 %	360034429
72	NC_016445	GGCG	2	8	27645	27652	0 %	0 %	75 %	25 %	360034429
73	NC_016445	GCAT	2	8	27764	27771	25 %	25 %	25 %	25 %	360034429
74	NC_016445	CTGC	2	8	27785	27792	0 %	25 %	25 %	50 %	360034429
75	NC_016445	TGCA	2	8	27910	27917	25 %	25 %	25 %	25 %	360034429
76	NC_016445	CTGG	2	8	27973	27980	0 %	25 %	50 %	25 %	360034429
77	NC_016445	ATCA	2	8	28330	28337	50 %	25 %	0 %	25 %	360034429
78	NC_016445	GTAA	2	8	29551	29558	50 %	25 %	25 %	0 %	360034431
79	NC_016445	CTTG	2	8	30688	30695	0 %	50 %	25 %	25 %	360034431
80	NC_016445	TGGT	2	8	31035	31042	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
81	NC_016445	CATT	2	8	31052	31059	25 %	50 %	0 %	25 %	360034431
82	NC_016445	AGCG	2	8	31422	31429	25 %	0 %	50 %	25 %	360034432
83	NC_016445	CGTG	2	8	31440	31447	0 %	25 %	50 %	25 %	360034432
84	NC_016445	TGAG	2	8	31779	31786	25 %	25 %	50 %	0 %	360034432
85	NC_016445	CACC	2	8	31953	31960	25 %	0 %	0 %	75 %	360034432
86	NC_016445	CGGT	2	8	32226	32233	0 %	25 %	50 %	25 %	360034433
87	NC_016445	TCAA	2	8	32432	32439	50 %	25 %	0 %	25 %	360034433
88	NC_016445	TTTC	2	8	32856	32863	0 %	75 %	0 %	25 %	360034433
89	NC_016445	CTTG	2	8	33197	33204	0 %	50 %	25 %	25 %	360034434
90	NC_016445	AGGA	2	8	33424	33431	50 %	0 %	50 %	0 %	360034434
91	NC_016445	GCGA	2	8	33596	33603	25 %	0 %	50 %	25 %	360034434
92	NC_016445	ACCA	2	8	34846	34853	50 %	0 %	0 %	50 %	360034435
93	NC_016445	TTGA	2	8	34896	34903	25 %	50 %	25 %	0 %	360034435
94	NC_016445	AGTC	2	8	35816	35823	25 %	25 %	25 %	25 %	360034436
95	NC_016445	ATGG	2	8	37023	37030	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016445	ACCT	2	8	37061	37068	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016445	TACT	2	8	37306	37313	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
98	NC_016445	CAAA	2	8	37445	37452	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016445	CTGA	2	8	37455	37462	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
100	NC_016445	ACCT	2	8	37689	37696	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016445	CGAG	2	8	37995	38002	25 %	0 %	50 %	25 %	360034437
102	NC_016445	TAAA	2	8	38571	38578	75 %	25 %	0 %	0 %	360034437
103	NC_016445	TTGT	2	8	38803	38810	0 %	75 %	25 %	0 %	360034437
104	NC_016445	TCGC	2	8	39236	39243	0 %	25 %	25 %	50 %	360034437
105	NC_016445	AAAC	2	8	40215	40222	75 %	0 %	0 %	25 %	360034437
106	NC_016445	TAAG	2	8	40834	40841	50 %	25 %	25 %	0 %	360034437
107	NC_016445	CGCC	2	8	41024	41031	0 %	0 %	25 %	75 %	360034437
108	NC_016445	AAGT	2	8	41398	41405	50 %	25 %	25 %	0 %	360034437
109	NC_016445	GGAT	2	8	41752	41759	25 %	25 %	50 %	0 %	360034438
110	NC_016445	TGTC	2	8	41826	41833	0 %	50 %	25 %	25 %	360034438
111	NC_016445	AGTA	2	8	42236	42243	50 %	25 %	25 %	0 %	360034438
112	NC_016445	TGAA	2	8	42570	42577	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016445	ATAG	2	8	42864	42871	50 %	25 %	25 %	0 %	360034439
114	NC_016445	GCCA	2	8	42965	42972	25 %	0 %	25 %	50 %	360034439
115	NC_016445	ACCA	2	8	43592	43599	50 %	0 %	0 %	50 %	360034439
116	NC_016445	GCTT	2	8	44027	44034	0 %	50 %	25 %	25 %	360034441
117	NC_016445	TTGG	2	8	44740	44747	0 %	50 %	50 %	0 %	360034441
118	NC_016445	GGTG	2	8	44963	44970	0 %	25 %	75 %	0 %	360034441
119	NC_016445	TTGA	2	8	46285	46292	25 %	50 %	25 %	0 %	360034444
120	NC_016445	AGCG	2	8	46319	46326	25 %	0 %	50 %	25 %	360034444
121	NC_016445	TGAT	2	8	47073	47080	25 %	50 %	25 %	0 %	360034445
122	NC_016445	GATT	2	8	47247	47254	25 %	50 %	25 %	0 %	360034445
123	NC_016445	TGAA	2	8	47448	47455	50 %	25 %	25 %	0 %	360034445
124	NC_016445	TCGC	2	8	47874	47881	0 %	25 %	25 %	50 %	360034445
125	NC_016445	TTGG	2	8	48143	48150	0 %	50 %	50 %	0 %	360034445
126	NC_016445	GTTT	2	8	48522	48529	0 %	75 %	25 %	0 %	360034445
127	NC_016445	TGAA	2	8	48801	48808	50 %	25 %	25 %	0 %	360034445
128	NC_016445	GATT	2	8	49171	49178	25 %	50 %	25 %	0 %	360034445
129	NC_016445	CACT	2	8	49398	49405	25 %	25 %	0 %	50 %	360034445
130	NC_016445	AAGG	2	8	49493	49500	50 %	0 %	50 %	0 %	360034445
131	NC_016445	ATTG	2	8	49840	49847	25 %	50 %	25 %	0 %	360034445
132	NC_016445	CTTG	2	8	50109	50116	0 %	50 %	25 %	25 %	360034445
133	NC_016445	ATTG	2	8	50266	50273	25 %	50 %	25 %	0 %	360034446
134	NC_016445	CAGT	2	8	50353	50360	25 %	25 %	25 %	25 %	360034446
135	NC_016445	CGTG	2	8	50384	50391	0 %	25 %	50 %	25 %	360034446
136	NC_016445	TGGA	2	8	50693	50700	25 %	25 %	50 %	0 %	360034446
137	NC_016445	TCCG	2	8	52489	52496	0 %	25 %	25 %	50 %	360034447
138	NC_016445	ATAA	2	8	52907	52914	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016445	AACA	2	8	53083	53090	75 %	0 %	0 %	25 %	360034448
140	NC_016445	GCTG	2	8	53616	53623	0 %	25 %	50 %	25 %	360034448
141	NC_016445	CTGG	2	8	53912	53919	0 %	25 %	50 %	25 %	360034448
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263	NC_016445	GGCA	2	8	99723	99730	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
264	NC_016445	TGTA	2	8	99772	99779	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
265	NC_016445	GCGG	2	8	99996	100003	0 %	0 %	75 %	25 %	360034489
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