MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 38394

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016445	TCA	2	6	3	8	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016445	TTG	2	6	90	95	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034409
3	NC_016445	GGC	2	6	360	365	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034409
4	NC_016445	TGC	2	6	410	415	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034409
5	NC_016445	TGT	2	6	466	471	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034409
6	NC_016445	CAT	2	6	534	539	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034409
7	NC_016445	TTG	2	6	561	566	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034410
8	NC_016445	CGG	2	6	579	584	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034410
9	NC_016445	TGC	3	9	598	606	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034410
10	NC_016445	CCA	2	6	674	679	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034410
11	NC_016445	GTG	2	6	837	842	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034410
12	NC_016445	GGC	2	6	844	849	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034410
13	NC_016445	GGC	2	6	980	985	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034410
14	NC_016445	TCT	2	6	1014	1019	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034410
15	NC_016445	GCA	2	6	1177	1182	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034410
16	NC_016445	TTC	2	6	1193	1198	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034410
17	NC_016445	GCA	2	6	1225	1230	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034410
18	NC_016445	TCT	2	6	1263	1268	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034410
19	NC_016445	GCC	2	6	1391	1396	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034410
20	NC_016445	TGT	2	6	1426	1431	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034410
21	NC_016445	TCA	2	6	1473	1478	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034410
22	NC_016445	AGC	2	6	1503	1508	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034410
23	NC_016445	TGA	2	6	1557	1562	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034410
24	NC_016445	CGA	2	6	1585	1590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034410
25	NC_016445	TGG	2	6	1684	1689	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034410
26	NC_016445	CCG	3	9	1737	1745	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034410
27	NC_016445	CTG	2	6	1811	1816	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034410
28	NC_016445	ATG	2	6	1845	1850	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034410
29	NC_016445	TTA	2	6	1899	1904	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	360034410
30	NC_016445	GCT	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016445	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016445	GCC	2	6	2296	2301	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034411
33	NC_016445	ACC	2	6	2331	2336	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034411
34	NC_016445	ATC	2	6	2357	2362	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034411
35	NC_016445	CAC	2	6	2366	2371	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034411
36	NC_016445	TAA	2	6	2407	2412	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034411
37	NC_016445	TCT	3	9	2418	2426	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034411
38	NC_016445	TTG	2	6	2474	2479	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034411
39	NC_016445	TGC	2	6	2517	2522	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034411
40	NC_016445	GCC	2	6	2561	2566	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034411
41	NC_016445	AGT	2	6	2599	2604	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034411
42	NC_016445	GCT	2	6	2730	2735	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034411
43	NC_016445	TTG	2	6	2789	2794	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034411
44	NC_016445	CGC	2	6	2822	2827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034411
45	NC_016445	TCC	2	6	3091	3096	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034412
46	NC_016445	CTT	3	9	3179	3187	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034412
47	NC_016445	GCT	2	6	3220	3225	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034412
48	NC_016445	CTT	2	6	3257	3262	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034412
49	NC_016445	CTA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016445	AAG	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016445	CTT	2	6	3633	3638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034414
52	NC_016445	ACC	2	6	4001	4006	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034414
53	NC_016445	TCT	2	6	4275	4280	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034414
54	NC_016445	GCC	2	6	4473	4478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034416
55	NC_016445	ATC	2	6	4613	4618	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034415
56	NC_016445	ATG	2	6	4667	4672	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034415
57	NC_016445	CTG	2	6	4744	4749	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034415
58	NC_016445	GCT	2	6	5007	5012	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034415
59	NC_016445	GTG	2	6	5081	5086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034415
60	NC_016445	GGC	2	6	5130	5135	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034415
61	NC_016445	ATG	2	6	5342	5347	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034415
62	NC_016445	TAA	2	6	5373	5378	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034415
63	NC_016445	GCT	2	6	5400	5405	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034415
64	NC_016445	GAT	2	6	5581	5586	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034415
65	NC_016445	GCA	2	6	5629	5634	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034415
66	NC_016445	GTT	2	6	5641	5646	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034415
67	NC_016445	CTG	2	6	5648	5653	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034415
68	NC_016445	GTG	2	6	5659	5664	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034415
69	NC_016445	TGC	2	6	5705	5710	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034415
70	NC_016445	CAC	2	6	5858	5863	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034415
71	NC_016445	CTG	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016445	CAC	2	6	5971	5976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016445	ATT	2	6	5982	5987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016445	TGT	2	6	6004	6009	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034417
75	NC_016445	GCA	2	6	6173	6178	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
76	NC_016445	GCA	2	6	6349	6354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
77	NC_016445	GTG	2	6	6423	6428	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034417
78	NC_016445	TGA	2	6	6542	6547	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034417
79	NC_016445	TCT	2	6	6584	6589	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034417
80	NC_016445	GCA	2	6	6590	6595	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
81	NC_016445	GCC	2	6	6630	6635	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034417
82	NC_016445	CGC	2	6	6716	6721	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034417
83	NC_016445	GCA	2	6	6722	6727	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
84	NC_016445	CGG	3	9	6745	6753	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034417
85	NC_016445	GGC	2	6	6754	6759	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034417
86	NC_016445	AGC	2	6	6916	6921	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
87	NC_016445	AGC	3	9	6988	6996	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
88	NC_016445	TTG	2	6	7134	7139	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034417
89	NC_016445	TGC	2	6	7223	7228	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034417
90	NC_016445	TGC	2	6	7231	7236	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034417
91	NC_016445	ACA	2	6	7328	7333	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034417
92	NC_016445	GCA	2	6	7349	7354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
93	NC_016445	GTC	2	6	7357	7362	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034417
94	NC_016445	CTG	2	6	7377	7382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034417
95	NC_016445	CAG	2	6	7497	7502	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034417
96	NC_016445	CAA	2	6	7509	7514	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	360034417
97	NC_016445	CCG	3	9	7576	7584	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034417
98	NC_016445	TCG	2	6	7778	7783	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034417
99	NC_016445	AGA	2	6	7928	7933	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034417
100	NC_016445	CAT	2	6	8109	8114	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034417
101	NC_016445	CTG	2	6	8115	8120	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034417
102	NC_016445	GTG	2	6	8241	8246	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034417
103	NC_016445	AAG	2	6	8323	8328	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034417
104	NC_016445	GAT	2	6	8373	8378	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034417
105	NC_016445	AGT	2	6	8438	8443	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034418
106	NC_016445	TCC	2	6	8489	8494	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	360034418
107	NC_016445	TCT	2	6	8765	8770	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034418
108	NC_016445	CCG	2	6	8791	8796	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034418
109	NC_016445	AGC	2	6	8958	8963	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
110	NC_016445	CAC	2	6	9057	9062	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034418
111	NC_016445	TGG	2	6	9081	9086	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034418
112	NC_016445	CAG	2	6	9134	9139	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
113	NC_016445	ATC	2	6	9212	9217	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034418
114	NC_016445	TTG	2	6	9371	9376	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034418
115	NC_016445	CTT	2	6	9396	9401	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	360034418
116	NC_016445	GCG	2	6	9439	9444	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034418
117	NC_016445	TGA	2	6	9462	9467	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034418
118	NC_016445	CGG	2	6	9787	9792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034418
119	NC_016445	CGA	2	6	10117	10122	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
120	NC_016445	GAC	2	6	10324	10329	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
121	NC_016445	CAG	2	6	10387	10392	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
122	NC_016445	GCA	2	6	10394	10399	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
123	NC_016445	ACC	2	6	10472	10477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034418
124	NC_016445	GAT	2	6	10493	10498	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034418
125	NC_016445	CAG	2	6	10694	10699	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
126	NC_016445	CAG	2	6	10706	10711	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034418
127	NC_016445	GCG	2	6	10773	10778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
128	NC_016445	GAC	2	6	10792	10797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
129	NC_016445	TGC	2	6	10846	10851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016445	TTC	2	6	10872	10877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016445	TGA	2	6	10997	11002	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034419
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133	NC_016445	ATC	2	6	11188	11193	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034419
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165	NC_016445	ATG	2	6	13377	13382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
166	NC_016445	GAA	2	6	13675	13680	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034420
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192	NC_016445	TCA	2	6	16234	16239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
193	NC_016445	TCG	2	6	16377	16382	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034421
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198	NC_016445	GAT	2	6	16904	16909	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034422
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241	NC_016445	TGC	4	12	20438	20449	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034425
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243	NC_016445	GTC	2	6	20468	20473	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034425
244	NC_016445	ACC	2	6	20650	20655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034425
245	NC_016445	TGC	2	6	20700	20705	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034425
246	NC_016445	AAT	2	6	20758	20763	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034425
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250	NC_016445	CGG	2	6	20966	20971	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034425
251	NC_016445	GCA	2	6	20981	20986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034425
252	NC_016445	GGC	2	6	21027	21032	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034425
253	NC_016445	CCG	2	6	21090	21095	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034425
254	NC_016445	TTG	2	6	21115	21120	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034425
255	NC_016445	TGC	2	6	21161	21166	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034425
256	NC_016445	GGC	2	6	21234	21239	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034425
257	NC_016445	CTG	2	6	21330	21335	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034426
258	NC_016445	ACC	2	6	21447	21452	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034426
259	NC_016445	TGC	2	6	21475	21480	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034426
260	NC_016445	AGC	2	6	21550	21555	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034426
261	NC_016445	AGG	2	6	21655	21660	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	360034426
262	NC_016445	CAG	3	9	21738	21746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034426
263	NC_016445	TGA	2	6	21797	21802	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034426
264	NC_016445	CAG	2	6	21870	21875	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034426
265	NC_016445	AAG	2	6	21910	21915	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	360034426
266	NC_016445	TGA	2	6	21943	21948	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034426
267	NC_016445	GTG	2	6	21952	21957	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034426
268	NC_016445	CCG	2	6	21976	21981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034426
269	NC_016445	TAC	2	6	21990	21995	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034426
270	NC_016445	GGT	2	6	22091	22096	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034426
271	NC_016445	CTG	2	6	22146	22151	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034426
272	NC_016445	AGC	2	6	22207	22212	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034426
273	NC_016445	TTC	2	6	22427	22432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
274	NC_016445	GAT	2	6	22459	22464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
275	NC_016445	GAT	2	6	22475	22480	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034427
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277	NC_016445	TAA	2	6	22558	22563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	360034427
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279	NC_016445	TCA	2	6	22703	22708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034427
280	NC_016445	CCA	2	6	22821	22826	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034427
281	NC_016445	GCC	2	6	22882	22887	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	360034427
282	NC_016445	CGG	2	6	22983	22988	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	360034427
283	NC_016445	CAC	2	6	23026	23031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034427
284	NC_016445	CAG	2	6	23056	23061	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034427
285	NC_016445	GTA	3	9	23062	23070	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034427
286	NC_016445	GAT	2	6	23119	23124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034427
287	NC_016445	ACC	2	6	23233	23238	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034427
288	NC_016445	TGA	2	6	23388	23393	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034427
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290	NC_016445	TGA	2	6	23421	23426	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034427
291	NC_016445	TGC	2	6	23501	23506	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034427
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295	NC_016445	CAC	2	6	23680	23685	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034427
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299	NC_016445	CCA	2	6	23817	23822	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	360034427
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320	NC_016445	GTA	2	6	25824	25829	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034428
321	NC_016445	ATC	2	6	25842	25847	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034428
322	NC_016445	GTA	2	6	25854	25859	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034428
323	NC_016445	TGG	2	6	26063	26068	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	360034428
324	NC_016445	CAT	2	6	26192	26197	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	360034428
325	NC_016445	TGA	2	6	26375	26380	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034428
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327	NC_016445	GAA	2	6	26516	26521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
328	NC_016445	CAG	2	6	26578	26583	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	360034429
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332	NC_016445	TGA	2	6	26993	26998	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	360034429
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373	NC_016445	TGT	2	6	30570	30575	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	360034431
374	NC_016445	CGT	2	6	30634	30639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	360034431
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