MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 3581

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016445	TCA	2	6	3	8	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_016445	GCT	2	6	1951	1956	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_016445	TAA	2	6	1990	1995	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016445	CTA	2	6	3420	3425	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016445	AAG	2	6	3478	3483	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016445	CTG	2	6	5878	5883	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016445	CAC	2	6	5971	5976	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
8	NC_016445	ATT	2	6	5982	5987	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016445	GCG	2	6	10773	10778	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
10	NC_016445	GAC	2	6	10792	10797	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_016445	TGC	2	6	10846	10851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016445	TTC	2	6	10872	10877	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
13	NC_016445	ATG	2	6	13377	13382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016445	TCA	2	6	16234	16239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016445	TTG	2	6	16715	16720	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016445	GAC	2	6	16841	16846	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
17	NC_016445	TTC	2	6	22427	22432	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016445	GAT	2	6	22459	22464	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016445	CGT	2	6	26499	26504	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016445	GAA	2	6	26516	26521	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016445	GCT	2	6	31101	31106	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
22	NC_016445	GAC	2	6	35233	35238	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_016445	AAC	2	6	35258	35263	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
24	NC_016445	GGC	2	6	35281	35286	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016445	TCA	2	6	37035	37040	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
26	NC_016445	TTG	2	6	37421	37426	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016445	TGC	2	6	37473	37478	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016445	AAG	2	6	37514	37519	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016445	TTG	2	6	37631	37636	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016445	GTT	2	6	37707	37712	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016445	GTT	2	6	37764	37769	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016445	GGT	2	6	37869	37874	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016445	GAG	2	6	41441	41446	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016445	GTG	2	6	43913	43918	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016445	CGC	2	6	45432	45437	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
36	NC_016445	GCA	2	6	45457	45462	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_016445	GTT	2	6	45479	45484	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016445	ATT	2	6	51586	51591	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016445	CCA	2	6	54408	54413	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
40	NC_016445	TGC	2	6	54422	54427	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016445	CAA	2	6	54488	54493	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016445	TTA	2	6	55521	55526	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016445	TTG	2	6	55615	55620	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016445	TTG	2	6	55742	55747	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016445	GAT	2	6	55946	55951	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016445	AGA	2	6	56982	56987	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016445	GTG	2	6	57017	57022	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016445	GTA	2	6	57722	57727	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016445	AAT	2	6	60633	60638	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016445	TGT	2	6	62069	62074	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
51	NC_016445	TGA	2	6	62201	62206	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016445	CAA	2	6	62224	62229	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016445	ATC	2	6	62695	62700	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016445	TTG	2	6	62701	62706	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016445	AGC	2	6	62741	62746	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016445	TCG	2	6	62755	62760	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016445	GGA	2	6	64991	64996	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016445	ACT	2	6	67703	67708	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
59	NC_016445	GTT	2	6	67733	67738	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016445	TCG	2	6	69550	69555	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016445	AGT	2	6	69642	69647	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016445	CCG	2	6	69657	69662	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_016445	TAG	2	6	69850	69855	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016445	ACA	2	6	72062	72067	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_016445	ATA	2	6	72083	72088	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016445	ATG	2	6	72149	72154	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016445	TTA	2	6	73582	73587	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016445	TGA	2	6	74986	74991	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016445	CCA	2	6	76995	77000	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016445	TAC	2	6	79082	79087	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
71	NC_016445	CGA	2	6	79102	79107	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
72	NC_016445	ATG	2	6	79266	79271	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016445	GTC	2	6	80378	80383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016445	ACC	2	6	83636	83641	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
75	NC_016445	CAC	2	6	83652	83657	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016445	ATG	2	6	83721	83726	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016445	ATG	2	6	83884	83889	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016445	TCT	2	6	83984	83989	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
79	NC_016445	CAA	2	6	84017	84022	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
80	NC_016445	TGA	2	6	84024	84029	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016445	GAT	2	6	84037	84042	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016445	CAA	2	6	84329	84334	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016445	AGC	2	6	84369	84374	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
84	NC_016445	TAA	2	6	86432	86437	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016445	GTT	2	6	86449	86454	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016445	AAC	2	6	86471	86476	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_016445	ACT	2	6	86499	86504	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_016445	TAC	2	6	87734	87739	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016445	CTT	2	6	87751	87756	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
90	NC_016445	GGC	2	6	89247	89252	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
91	NC_016445	CGT	2	6	89286	89291	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016445	GAA	2	6	91356	91361	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016445	TAC	2	6	92064	92069	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016445	GAA	2	6	92204	92209	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
95	NC_016445	ACC	2	6	95123	95128	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
96	NC_016445	CAA	2	6	95335	95340	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_016445	GAC	2	6	95396	95401	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016445	TGC	2	6	97047	97052	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016445	CCG	2	6	97076	97081	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
100	NC_016445	CAG	2	6	98027	98032	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
101	NC_016445	CAA	2	6	98045	98050	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016445	TTG	3	9	98057	98065	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016445	CGA	2	6	99363	99368	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016445	TGA	2	6	101977	101982	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016445	TAA	4	12	102844	102855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016445	TAC	2	6	103241	103246	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
107	NC_016445	GAA	2	6	103381	103386	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016445	ATC	2	6	106432	106437	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016445	ACC	2	6	106530	106535	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
110	NC_016445	GTT	2	6	107393	107398	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016445	TTG	2	6	107585	107590	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016445	AAT	2	6	107911	107916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016445	CAA	2	6	108912	108917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016445	AAT	2	6	109331	109336	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016445	GAT	2	6	109346	109351	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016445	TAA	2	6	109355	109360	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016445	TTG	2	6	123681	123686	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016445	GGA	2	6	124491	124496	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016445	TGG	2	6	125338	125343	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016445	AAC	2	6	125395	125400	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
121	NC_016445	GAG	2	6	131543	131548	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016445	ACA	2	6	135711	135716	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
123	NC_016445	TGT	2	6	135732	135737	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016445	ATT	2	6	135785	135790	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016445	TAA	2	6	135828	135833	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016445	CTC	2	6	137729	137734	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
127	NC_016445	CCA	2	6	147562	147567	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
128	NC_016445	GCC	2	6	152738	152743	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
129	NC_016445	AAT	2	6	154305	154310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016445	GAA	2	6	154359	154364	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
131	NC_016445	CGC	2	6	154477	154482	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_016445	CAC	2	6	154583	154588	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
133	NC_016445	GAG	2	6	154982	154987	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016445	ATT	2	6	156344	156349	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016445	AGG	2	6	156587	156592	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016445	ACT	2	6	159575	159580	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016445	ACC	2	6	159581	159586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_016445	GTG	2	6	159615	159620	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
139	NC_016445	ACC	2	6	162842	162847	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
140	NC_016445	AGG	2	6	163832	163837	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
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