MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Vibrio cholerae O1 str. 2010EL-1786 chromosome 1

Total Repeats: 5005

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016445	TG	3	6	316	321	0 %	50 %	50 %	0 %	360034409
2	NC_016445	AG	3	6	455	460	50 %	0 %	50 %	0 %	360034409
3	NC_016445	CG	3	6	1304	1309	0 %	0 %	50 %	50 %	360034410
4	NC_016445	GC	3	6	3033	3038	0 %	0 %	50 %	50 %	360034412
5	NC_016445	TG	3	6	3304	3309	0 %	50 %	50 %	0 %	360034412
6	NC_016445	TC	3	6	3978	3983	0 %	50 %	0 %	50 %	360034414
7	NC_016445	CG	3	6	4019	4024	0 %	0 %	50 %	50 %	360034414
8	NC_016445	GC	3	6	5310	5315	0 %	0 %	50 %	50 %	360034415
9	NC_016445	TG	3	6	5523	5528	0 %	50 %	50 %	0 %	360034415
10	NC_016445	TC	3	6	5678	5683	0 %	50 %	0 %	50 %	360034415
11	NC_016445	AG	3	6	5781	5786	50 %	0 %	50 %	0 %	360034415
12	NC_016445	AG	4	8	5850	5857	50 %	0 %	50 %	0 %	360034415
13	NC_016445	GC	3	6	6728	6733	0 %	0 %	50 %	50 %	360034417
14	NC_016445	GC	3	6	6920	6925	0 %	0 %	50 %	50 %	360034417
15	NC_016445	GC	3	6	7066	7071	0 %	0 %	50 %	50 %	360034417
16	NC_016445	GC	3	6	7968	7973	0 %	0 %	50 %	50 %	360034417
17	NC_016445	CG	3	6	8233	8238	0 %	0 %	50 %	50 %	360034417
18	NC_016445	GC	3	6	8465	8470	0 %	0 %	50 %	50 %	360034418
19	NC_016445	GC	3	6	9427	9432	0 %	0 %	50 %	50 %	360034418
20	NC_016445	TG	3	6	10813	10818	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016445	TA	3	6	10954	10959	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016445	GC	4	8	11397	11404	0 %	0 %	50 %	50 %	360034419
23	NC_016445	CG	3	6	11506	11511	0 %	0 %	50 %	50 %	360034419
24	NC_016445	CG	3	6	11676	11681	0 %	0 %	50 %	50 %	360034419
25	NC_016445	CG	3	6	11831	11836	0 %	0 %	50 %	50 %	360034419
26	NC_016445	CT	3	6	12519	12524	0 %	50 %	0 %	50 %	360034419
27	NC_016445	CT	3	6	12829	12834	0 %	50 %	0 %	50 %	360034419
28	NC_016445	GC	3	6	13316	13321	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016445	GC	3	6	13880	13885	0 %	0 %	50 %	50 %	360034420
30	NC_016445	TC	4	8	14097	14104	0 %	50 %	0 %	50 %	360034420
31	NC_016445	CG	4	8	14166	14173	0 %	0 %	50 %	50 %	360034420
32	NC_016445	GC	3	6	14423	14428	0 %	0 %	50 %	50 %	360034420
33	NC_016445	GT	3	6	14500	14505	0 %	50 %	50 %	0 %	360034420
34	NC_016445	CG	3	6	15706	15711	0 %	0 %	50 %	50 %	360034420
35	NC_016445	CT	3	6	15967	15972	0 %	50 %	0 %	50 %	360034420
36	NC_016445	CT	3	6	16587	16592	0 %	50 %	0 %	50 %	360034421
37	NC_016445	TA	3	6	16776	16781	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016445	AG	3	6	16853	16858	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016445	AC	3	6	16987	16992	50 %	0 %	0 %	50 %	360034422
40	NC_016445	AC	3	6	17107	17112	50 %	0 %	0 %	50 %	360034422
41	NC_016445	GT	3	6	18005	18010	0 %	50 %	50 %	0 %	360034423
42	NC_016445	CT	4	8	18090	18097	0 %	50 %	0 %	50 %	360034423
43	NC_016445	CT	3	6	18139	18144	0 %	50 %	0 %	50 %	360034423
44	NC_016445	GT	3	6	18218	18223	0 %	50 %	50 %	0 %	360034423
45	NC_016445	CG	3	6	19205	19210	0 %	0 %	50 %	50 %	360034424
46	NC_016445	TG	3	6	19224	19229	0 %	50 %	50 %	0 %	360034424
47	NC_016445	AC	3	6	19340	19345	50 %	0 %	0 %	50 %	360034424
48	NC_016445	GC	3	6	20206	20211	0 %	0 %	50 %	50 %	360034425
49	NC_016445	CT	3	6	20788	20793	0 %	50 %	0 %	50 %	360034425
50	NC_016445	GC	3	6	21031	21036	0 %	0 %	50 %	50 %	360034425
51	NC_016445	TC	4	8	21381	21388	0 %	50 %	0 %	50 %	360034426
52	NC_016445	CG	3	6	21904	21909	0 %	0 %	50 %	50 %	360034426
53	NC_016445	GC	3	6	22107	22112	0 %	0 %	50 %	50 %	360034426
54	NC_016445	CG	3	6	22173	22178	0 %	0 %	50 %	50 %	360034426
55	NC_016445	AG	3	6	22789	22794	50 %	0 %	50 %	0 %	360034427
56	NC_016445	AG	3	6	22907	22912	50 %	0 %	50 %	0 %	360034427
57	NC_016445	TG	3	6	23006	23011	0 %	50 %	50 %	0 %	360034427
58	NC_016445	GT	3	6	25339	25344	0 %	50 %	50 %	0 %	360034428
59	NC_016445	AC	3	6	25435	25440	50 %	0 %	0 %	50 %	360034428
60	NC_016445	TG	3	6	26303	26308	0 %	50 %	50 %	0 %	360034428
61	NC_016445	GC	3	6	26550	26555	0 %	0 %	50 %	50 %	360034429
62	NC_016445	CA	3	6	27137	27142	50 %	0 %	0 %	50 %	360034429
63	NC_016445	CG	3	6	27944	27949	0 %	0 %	50 %	50 %	360034429
64	NC_016445	CA	3	6	28808	28813	50 %	0 %	0 %	50 %	360034430
65	NC_016445	GC	3	6	29006	29011	0 %	0 %	50 %	50 %	360034430
66	NC_016445	AC	4	8	29513	29520	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
67	NC_016445	TG	3	6	30240	30245	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
68	NC_016445	CG	3	6	30267	30272	0 %	0 %	50 %	50 %	360034431
69	NC_016445	GT	3	6	30807	30812	0 %	50 %	50 %	0 %	360034431
70	NC_016445	CA	3	6	30959	30964	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
71	NC_016445	CA	3	6	30988	30993	50 %	0 %	0 %	50 %	360034431
72	NC_016445	CA	3	6	33874	33879	50 %	0 %	0 %	50 %	360034434
73	NC_016445	TG	3	6	37229	37234	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016445	GT	3	6	37562	37567	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016445	CG	3	6	38357	38362	0 %	0 %	50 %	50 %	360034437
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79	NC_016445	GC	3	6	39214	39219	0 %	0 %	50 %	50 %	360034437
80	NC_016445	AG	3	6	39297	39302	50 %	0 %	50 %	0 %	360034437
81	NC_016445	GC	3	6	39705	39710	0 %	0 %	50 %	50 %	360034437
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83	NC_016445	TG	3	6	41169	41174	0 %	50 %	50 %	0 %	360034437
84	NC_016445	CA	3	6	41869	41874	50 %	0 %	0 %	50 %	360034438
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88	NC_016445	GC	3	6	45103	45108	0 %	0 %	50 %	50 %	360034441
89	NC_016445	GA	3	6	45500	45505	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016445	GC	3	6	45982	45987	0 %	0 %	50 %	50 %	360034444
91	NC_016445	CG	3	6	51973	51978	0 %	0 %	50 %	50 %	360034447
92	NC_016445	CT	3	6	52482	52487	0 %	50 %	0 %	50 %	360034447
93	NC_016445	CA	3	6	53760	53765	50 %	0 %	0 %	50 %	360034448
94	NC_016445	CT	3	6	53771	53776	0 %	50 %	0 %	50 %	360034448
95	NC_016445	CG	3	6	53844	53849	0 %	0 %	50 %	50 %	360034448
96	NC_016445	AG	3	6	54361	54366	50 %	0 %	50 %	0 %	360034448
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98	NC_016445	AT	3	6	59779	59784	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
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102	NC_016445	CT	3	6	62664	62669	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016445	TC	3	6	62809	62814	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016445	AG	3	6	62824	62829	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016445	GT	3	6	64240	64245	0 %	50 %	50 %	0 %	360034458
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107	NC_016445	GC	3	6	65546	65551	0 %	0 %	50 %	50 %	360034459
108	NC_016445	TG	3	6	66819	66824	0 %	50 %	50 %	0 %	360034459
109	NC_016445	GC	3	6	68329	68334	0 %	0 %	50 %	50 %	360034461
110	NC_016445	GC	3	6	68643	68648	0 %	0 %	50 %	50 %	360034461
111	NC_016445	GA	3	6	69270	69275	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016445	CA	3	6	69412	69417	50 %	0 %	0 %	50 %	360034462
113	NC_016445	TG	3	6	71069	71074	0 %	50 %	50 %	0 %	360034463
114	NC_016445	TG	4	8	71239	71246	0 %	50 %	50 %	0 %	360034463
115	NC_016445	TC	3	6	71865	71870	0 %	50 %	0 %	50 %	360034463
116	NC_016445	CT	4	8	72922	72929	0 %	50 %	0 %	50 %	360034464
117	NC_016445	GC	4	8	73035	73042	0 %	0 %	50 %	50 %	360034464
118	NC_016445	CT	4	8	73074	73081	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016445	GC	3	6	75352	75357	0 %	0 %	50 %	50 %	360034467
120	NC_016445	GT	3	6	75521	75526	0 %	50 %	50 %	0 %	360034467
121	NC_016445	AG	3	6	75715	75720	50 %	0 %	50 %	0 %	360034467
122	NC_016445	GA	3	6	76372	76377	50 %	0 %	50 %	0 %	360034468
123	NC_016445	CG	3	6	76487	76492	0 %	0 %	50 %	50 %	360034468
124	NC_016445	GC	3	6	76599	76604	0 %	0 %	50 %	50 %	360034468
125	NC_016445	CG	3	6	77261	77266	0 %	0 %	50 %	50 %	360034469
126	NC_016445	CG	3	6	77724	77729	0 %	0 %	50 %	50 %	360034469
127	NC_016445	GA	3	6	78173	78178	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
128	NC_016445	GA	3	6	78537	78542	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
129	NC_016445	AG	3	6	78690	78695	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
130	NC_016445	GA	4	8	78774	78781	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
131	NC_016445	AG	3	6	78935	78940	50 %	0 %	50 %	0 %	360034469
132	NC_016445	TG	3	6	79018	79023	0 %	50 %	50 %	0 %	360034469
133	NC_016445	TG	3	6	80140	80145	0 %	50 %	50 %	0 %	360034471
134	NC_016445	CG	3	6	80193	80198	0 %	0 %	50 %	50 %	360034471
135	NC_016445	TC	3	6	80362	80367	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016445	CA	3	6	80522	80527	50 %	0 %	0 %	50 %	360034472
137	NC_016445	GA	3	6	80601	80606	50 %	0 %	50 %	0 %	360034472
138	NC_016445	CG	3	6	80793	80798	0 %	0 %	50 %	50 %	360034472
139	NC_016445	TG	3	6	81111	81116	0 %	50 %	50 %	0 %	360034473
140	NC_016445	CT	3	6	81642	81647	0 %	50 %	0 %	50 %	360034474
141	NC_016445	GA	3	6	82335	82340	50 %	0 %	50 %	0 %	360034474
142	NC_016445	TG	3	6	82725	82730	0 %	50 %	50 %	0 %	360034474
143	NC_016445	GA	3	6	82774	82779	50 %	0 %	50 %	0 %	360034474
144	NC_016445	CT	3	6	83356	83361	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
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