MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 46

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016146	AAAGT	2	10	10525	10534	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016146	CAATT	2	10	10940	10949	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016146	AGATT	2	10	24227	24236	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
4	NC_016146	TTTAT	2	10	25655	25664	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016146	ATTTA	2	10	34326	34335	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016146	TTTAT	2	10	40586	40595	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_016146	TTTGT	2	10	60508	60517	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016146	TTTTC	2	10	83433	83442	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016146	ACAAT	2	10	100148	100157	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
10	NC_016146	TTTTG	2	10	105313	105322	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016146	TAATA	2	10	106089	106098	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016146	TTTTC	2	10	134996	135005	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
13	NC_016146	TAGTA	2	10	138917	138926	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016146	AAAAT	2	10	144407	144416	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016146	TTACA	2	10	176408	176417	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016146	AATTC	2	10	184651	184660	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
17	NC_016146	ATTTT	2	10	195195	195204	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016146	ATTAA	2	10	206163	206172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016146	TCCAT	2	10	244153	244162	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016146	TTAAA	2	10	256327	256336	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016146	CATTT	2	10	260716	260725	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
22	NC_016146	TATTT	2	10	319468	319477	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016146	TTTTC	2	10	323059	323068	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
24	NC_016146	TAATT	2	10	325257	325266	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016146	TGAAT	2	10	353610	353619	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016146	ATAAA	2	10	361281	361290	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_016146	CTTTT	2	10	391111	391120	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
28	NC_016146	AAATT	2	10	391191	391200	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016146	GATGT	2	10	395543	395552	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016146	ATTTT	2	10	403371	403380	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_016146	GATCT	2	10	440470	440479	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
32	NC_016146	TATTT	2	10	457955	457964	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016146	TAAAT	2	10	463629	463638	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016146	AGTTC	2	10	466521	466530	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
35	NC_016146	TAAAA	2	10	485855	485864	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016146	TAAAA	2	10	490223	490232	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016146	TTCAA	2	10	498633	498642	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
38	NC_016146	AAATA	2	10	501609	501618	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016146	GAAGG	2	10	516135	516144	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016146	GAAAA	2	10	516973	516982	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016146	GTATT	2	10	522342	522351	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016146	AGAAT	2	10	525484	525493	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016146	TCTAA	2	10	532183	532192	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
44	NC_016146	AAATA	2	10	556305	556314	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016146	CTATT	2	10	558464	558473	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
46	NC_016146	TAAAT	2	10	563195	563204	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.