MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 632

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016146	AAAAT	2	10	401	410	80 %	20 %	0 %	0 %	357420709
2	NC_016146	AGAAA	2	10	2048	2057	80 %	0 %	20 %	0 %	357420710
3	NC_016146	AATTT	2	10	5331	5340	40 %	60 %	0 %	0 %	357420711
4	NC_016146	AAAAT	2	10	5367	5376	80 %	20 %	0 %	0 %	357420711
5	NC_016146	TGGAT	2	10	5441	5450	20 %	40 %	40 %	0 %	357420711
6	NC_016146	TAAAA	2	10	7386	7395	80 %	20 %	0 %	0 %	357420714
7	NC_016146	CATTA	2	10	7711	7720	40 %	40 %	0 %	20 %	357420714
8	NC_016146	TCAGA	2	10	10959	10968	40 %	20 %	20 %	20 %	357420716
9	NC_016146	CAAAA	2	10	11496	11505	80 %	0 %	0 %	20 %	357420716
10	NC_016146	CAAAC	2	10	12049	12058	60 %	0 %	0 %	40 %	357420716
11	NC_016146	AAATA	2	10	12436	12445	80 %	20 %	0 %	0 %	357420717
12	NC_016146	TTCCA	2	10	12577	12586	20 %	40 %	0 %	40 %	357420717
13	NC_016146	TTGTA	2	10	13714	13723	20 %	60 %	20 %	0 %	357420717
14	NC_016146	TATGA	2	10	17578	17587	40 %	40 %	20 %	0 %	357420722
15	NC_016146	TTATG	2	10	18363	18372	20 %	60 %	20 %	0 %	357420722
16	NC_016146	AAAGA	2	10	19280	19289	80 %	0 %	20 %	0 %	357420723
17	NC_016146	GGAAG	2	10	20728	20737	40 %	0 %	60 %	0 %	357420724
18	NC_016146	TTATC	2	10	20755	20764	20 %	60 %	0 %	20 %	357420724
19	NC_016146	GTATT	2	10	20939	20948	20 %	60 %	20 %	0 %	357420724
20	NC_016146	CTAAT	2	10	21798	21807	40 %	40 %	0 %	20 %	357420725
21	NC_016146	CATAT	2	10	25665	25674	40 %	40 %	0 %	20 %	357420729
22	NC_016146	TATTT	2	10	25912	25921	20 %	80 %	0 %	0 %	357420729
23	NC_016146	AATAA	2	10	27052	27061	80 %	20 %	0 %	0 %	357420730
24	NC_016146	TATTT	2	10	28399	28408	20 %	80 %	0 %	0 %	357420731
25	NC_016146	CGAAT	2	10	29234	29243	40 %	20 %	20 %	20 %	357420731
26	NC_016146	GATCG	2	10	30066	30075	20 %	20 %	40 %	20 %	357420731
27	NC_016146	CTATT	2	10	31392	31401	20 %	60 %	0 %	20 %	357420733
28	NC_016146	AAAAT	2	10	32157	32166	80 %	20 %	0 %	0 %	357420733
29	NC_016146	ATATT	2	10	32258	32267	40 %	60 %	0 %	0 %	357420733
30	NC_016146	CCATT	2	10	32268	32277	20 %	40 %	0 %	40 %	357420733
31	NC_016146	TATAA	2	10	32864	32873	60 %	40 %	0 %	0 %	357420733
32	NC_016146	GAATT	2	10	32937	32946	40 %	40 %	20 %	0 %	357420733
33	NC_016146	TAGAA	2	10	34431	34440	60 %	20 %	20 %	0 %	357420735
34	NC_016146	TAAAA	2	10	36690	36699	80 %	20 %	0 %	0 %	357420737
35	NC_016146	AAAAT	2	10	36780	36789	80 %	20 %	0 %	0 %	357420737
36	NC_016146	TCCAA	2	10	37144	37153	40 %	20 %	0 %	40 %	357420737
37	NC_016146	TGATA	2	10	39197	39206	40 %	40 %	20 %	0 %	357420740
38	NC_016146	AAATG	2	10	39728	39737	60 %	20 %	20 %	0 %	357420740
39	NC_016146	CAAAA	2	10	41156	41165	80 %	0 %	0 %	20 %	357420742
40	NC_016146	TTCTA	2	10	43131	43140	20 %	60 %	0 %	20 %	357420742
41	NC_016146	AATGA	2	10	43354	43363	60 %	20 %	20 %	0 %	357420742
42	NC_016146	AGAAA	2	10	44841	44850	80 %	0 %	20 %	0 %	357420744
43	NC_016146	GTTAT	2	10	45457	45466	20 %	60 %	20 %	0 %	357420744
44	NC_016146	GAAAT	2	10	46942	46951	60 %	20 %	20 %	0 %	357420744
45	NC_016146	AGTTT	2	10	47148	47157	20 %	60 %	20 %	0 %	357420744
46	NC_016146	GATTT	2	10	47374	47383	20 %	60 %	20 %	0 %	357420745
47	NC_016146	GAATA	2	10	47686	47695	60 %	20 %	20 %	0 %	357420745
48	NC_016146	AAAAG	2	10	47768	47777	80 %	0 %	20 %	0 %	357420745
49	NC_016146	ATTTA	2	10	49883	49892	40 %	60 %	0 %	0 %	357420745
50	NC_016146	AAAAT	2	10	49954	49963	80 %	20 %	0 %	0 %	357420745
51	NC_016146	AAAAG	2	10	50338	50347	80 %	0 %	20 %	0 %	357420746
52	NC_016146	ATTTA	2	10	51350	51359	40 %	60 %	0 %	0 %	357420747
53	NC_016146	GATTT	2	10	53047	53056	20 %	60 %	20 %	0 %	357420749
54	NC_016146	TGAAT	2	10	53904	53913	40 %	40 %	20 %	0 %	357420750
55	NC_016146	AATTA	2	10	55002	55011	60 %	40 %	0 %	0 %	357420750
56	NC_016146	GAAAA	2	10	56154	56163	80 %	0 %	20 %	0 %	357420751
57	NC_016146	TTATT	2	10	56721	56730	20 %	80 %	0 %	0 %	357420751
58	NC_016146	ATAGA	2	10	56982	56991	60 %	20 %	20 %	0 %	357420751
59	NC_016146	TTTTA	2	10	57650	57659	20 %	80 %	0 %	0 %	357420752
60	NC_016146	AAATT	2	10	57964	57973	60 %	40 %	0 %	0 %	357420753
61	NC_016146	GAATA	2	10	61181	61190	60 %	20 %	20 %	0 %	357420756
62	NC_016146	ATTGG	2	10	62080	62089	20 %	40 %	40 %	0 %	357420757
63	NC_016146	GCGGA	2	10	63205	63214	20 %	0 %	60 %	20 %	357420758
64	NC_016146	ATTGC	2	10	64242	64251	20 %	40 %	20 %	20 %	357420759
65	NC_016146	TAAAA	2	10	64390	64399	80 %	20 %	0 %	0 %	357420759
66	NC_016146	ATTTT	2	10	65275	65284	20 %	80 %	0 %	0 %	357420761
67	NC_016146	AAAAT	2	10	66960	66969	80 %	20 %	0 %	0 %	357420762
68	NC_016146	ATCGT	2	10	67655	67664	20 %	40 %	20 %	20 %	357420763
69	NC_016146	CATTT	2	10	68141	68150	20 %	60 %	0 %	20 %	357420763
70	NC_016146	TTTAT	2	10	68232	68241	20 %	80 %	0 %	0 %	357420763
71	NC_016146	AACGT	2	10	74218	74227	40 %	20 %	20 %	20 %	357420766
72	NC_016146	TTGTT	2	10	75353	75362	0 %	80 %	20 %	0 %	357420767
73	NC_016146	TTTGA	2	10	75750	75759	20 %	60 %	20 %	0 %	357420767
74	NC_016146	ATGAA	2	10	76246	76255	60 %	20 %	20 %	0 %	357420767
75	NC_016146	TACAA	2	10	76377	76386	60 %	20 %	0 %	20 %	357420767
76	NC_016146	TTGGA	2	10	76451	76460	20 %	40 %	40 %	0 %	357420767
77	NC_016146	TAAAT	2	10	76675	76684	60 %	40 %	0 %	0 %	357420767
78	NC_016146	ATCCA	2	10	76753	76762	40 %	20 %	0 %	40 %	357420767
79	NC_016146	CTTTT	2	10	77223	77232	0 %	80 %	0 %	20 %	357420768
80	NC_016146	ATAAA	2	10	77918	77927	80 %	20 %	0 %	0 %	357420768
81	NC_016146	ATGAT	2	10	79922	79931	40 %	40 %	20 %	0 %	357420770
82	NC_016146	TTCAT	2	10	80567	80576	20 %	60 %	0 %	20 %	357420770
83	NC_016146	AAATT	2	10	81532	81541	60 %	40 %	0 %	0 %	357420772
84	NC_016146	AGAAA	2	10	81772	81781	80 %	0 %	20 %	0 %	357420773
85	NC_016146	CTAGA	2	10	82440	82449	40 %	20 %	20 %	20 %	357420774
86	NC_016146	AAGGG	2	10	83323	83332	40 %	0 %	60 %	0 %	357420774
87	NC_016146	TTTTC	2	10	83339	83348	0 %	80 %	0 %	20 %	357420774
88	NC_016146	ATACA	2	10	84224	84233	60 %	20 %	0 %	20 %	357420775
89	NC_016146	TAAAT	2	10	86380	86389	60 %	40 %	0 %	0 %	357420777
90	NC_016146	ATTTT	2	10	87368	87377	20 %	80 %	0 %	0 %	357420778
91	NC_016146	ATCGT	2	10	88106	88115	20 %	40 %	20 %	20 %	357420779
92	NC_016146	TTTTA	2	10	88896	88905	20 %	80 %	0 %	0 %	357420780
93	NC_016146	TTTTG	2	10	90005	90014	0 %	80 %	20 %	0 %	357420781
94	NC_016146	GATAA	2	10	91689	91698	60 %	20 %	20 %	0 %	357420782
95	NC_016146	TGTTT	2	10	93971	93980	0 %	80 %	20 %	0 %	357420784
96	NC_016146	AATAT	2	10	95845	95854	60 %	40 %	0 %	0 %	357420786
97	NC_016146	TGGAT	2	10	95933	95942	20 %	40 %	40 %	0 %	357420786
98	NC_016146	TAACA	2	10	96518	96527	60 %	20 %	0 %	20 %	357420787
99	NC_016146	TTTCA	2	10	97238	97247	20 %	60 %	0 %	20 %	357420787
100	NC_016146	AAATC	2	10	97631	97640	60 %	20 %	0 %	20 %	357420788
101	NC_016146	TGGAT	2	10	104089	104098	20 %	40 %	40 %	0 %	357420793
102	NC_016146	GTATT	2	10	104512	104521	20 %	60 %	20 %	0 %	357420793
103	NC_016146	TGGAT	2	10	105410	105419	20 %	40 %	40 %	0 %	357420794
104	NC_016146	AAAAG	2	10	106181	106190	80 %	0 %	20 %	0 %	357420795
105	NC_016146	GAATG	2	10	106244	106253	40 %	20 %	40 %	0 %	357420795
106	NC_016146	TAAAA	2	10	107248	107257	80 %	20 %	0 %	0 %	357420795
107	NC_016146	AAAAT	2	10	107349	107358	80 %	20 %	0 %	0 %	357420795
108	NC_016146	TAGAA	2	10	109346	109355	60 %	20 %	20 %	0 %	357420797
109	NC_016146	CTTTA	2	10	109778	109787	20 %	60 %	0 %	20 %	357420797
110	NC_016146	ATTTT	2	10	110637	110646	20 %	80 %	0 %	0 %	357420798
111	NC_016146	TCTTT	2	10	110832	110841	0 %	80 %	0 %	20 %	357420798
112	NC_016146	TAAAT	2	10	111977	111986	60 %	40 %	0 %	0 %	357420799
113	NC_016146	ATAAA	2	10	112394	112403	80 %	20 %	0 %	0 %	357420801
114	NC_016146	TATTT	2	10	114541	114550	20 %	80 %	0 %	0 %	357420803
115	NC_016146	ATGAA	2	10	116363	116372	60 %	20 %	20 %	0 %	357420805
116	NC_016146	TTCAT	2	10	116905	116914	20 %	60 %	0 %	20 %	357420806
117	NC_016146	CTTTT	2	10	118125	118134	0 %	80 %	0 %	20 %	357420807
118	NC_016146	TCATA	2	10	118315	118324	40 %	40 %	0 %	20 %	357420807
119	NC_016146	TTTTC	2	10	118942	118951	0 %	80 %	0 %	20 %	357420808
120	NC_016146	GTTAT	2	10	119098	119107	20 %	60 %	20 %	0 %	357420808
121	NC_016146	TATTT	2	10	119216	119225	20 %	80 %	0 %	0 %	357420809
122	NC_016146	ATTCC	2	10	119645	119654	20 %	40 %	0 %	40 %	357420809
123	NC_016146	CGCAT	2	10	120080	120089	20 %	20 %	20 %	40 %	357420809
124	NC_016146	ATTTC	2	10	120174	120183	20 %	60 %	0 %	20 %	357420809
125	NC_016146	CTTTT	2	10	120687	120696	0 %	80 %	0 %	20 %	357420810
126	NC_016146	TATTC	2	10	121935	121944	20 %	60 %	0 %	20 %	357420811
127	NC_016146	AATCT	2	10	123015	123024	40 %	40 %	0 %	20 %	357420811
128	NC_016146	TATTT	2	10	123380	123389	20 %	80 %	0 %	0 %	357420812
129	NC_016146	ATTTT	2	10	123424	123433	20 %	80 %	0 %	0 %	357420812
130	NC_016146	TAATA	2	10	123452	123461	60 %	40 %	0 %	0 %	357420812
131	NC_016146	AGATT	2	10	124963	124972	40 %	40 %	20 %	0 %	357420813
132	NC_016146	TTTTA	2	10	125828	125837	20 %	80 %	0 %	0 %	357420814
133	NC_016146	AGGAA	2	10	126146	126155	60 %	0 %	40 %	0 %	357420814
134	NC_016146	ATTTT	2	10	126180	126189	20 %	80 %	0 %	0 %	357420814
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136	NC_016146	AATAG	2	10	126876	126885	60 %	20 %	20 %	0 %	357420815
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