MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tri-nucleotide Non-Coding Repeats of Blattabacterium sp. (Mastotermes darwiniensis) str. MADAR chromosome

Total Repeats: 422

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016146	GAT	2	6	1263	1268	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016146	ATA	2	6	7243	7248	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016146	ATC	2	6	10611	10616	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016146	GAA	2	6	10666	10671	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016146	ATG	2	6	10718	10723	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
6	NC_016146	AGC	2	6	10740	10745	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016146	TAT	2	6	10770	10775	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016146	ATA	2	6	10901	10906	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016146	TAT	2	6	16529	16534	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016146	TTA	2	6	17063	17068	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_016146	TAT	2	6	17069	17074	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016146	ATT	2	6	24171	24176	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_016146	GTT	2	6	24258	24263	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016146	TAA	2	6	24268	24273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016146	AAT	2	6	31157	31162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_016146	ATA	2	6	31179	31184	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_016146	TTC	2	6	31243	31248	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016146	TGA	2	6	31304	31309	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016146	TAT	2	6	31318	31323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_016146	TAA	2	6	33387	33392	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016146	ATT	2	6	37377	37382	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016146	TTA	2	6	37640	37645	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_016146	TAA	2	6	37662	37667	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_016146	AAT	2	6	39775	39780	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016146	ATA	2	6	40596	40601	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016146	TAC	2	6	40607	40612	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016146	TAT	2	6	47252	47257	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_016146	TTG	2	6	55172	55177	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
29	NC_016146	ATT	2	6	57353	57358	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016146	ATC	2	6	57477	57482	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016146	ATT	2	6	61953	61958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016146	TAG	2	6	69162	69167	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016146	CTT	2	6	69329	69334	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016146	ATT	2	6	69445	69450	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016146	ATA	2	6	69524	69529	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016146	ATT	2	6	69553	69558	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016146	TCT	3	9	69565	69573	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
38	NC_016146	CAT	2	6	70586	70591	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016146	ATG	2	6	70594	70599	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016146	GTT	2	6	72359	72364	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
41	NC_016146	GGA	2	6	72415	72420	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016146	ATT	2	6	72494	72499	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016146	ATG	2	6	74921	74926	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016146	AAT	2	6	74930	74935	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016146	ACT	2	6	75008	75013	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016146	TAG	2	6	83397	83402	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016146	ATT	2	6	83480	83485	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016146	TAA	2	6	92136	92141	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_016146	ATA	2	6	94866	94871	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_016146	TAC	2	6	94904	94909	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
51	NC_016146	CAT	2	6	98058	98063	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_016146	GAC	2	6	99282	99287	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_016146	CCA	2	6	99349	99354	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
54	NC_016146	CTT	2	6	99359	99364	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
55	NC_016146	TCT	2	6	99452	99457	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_016146	TCT	2	6	99542	99547	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016146	TTC	2	6	99800	99805	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016146	ATT	2	6	99881	99886	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016146	AGA	2	6	100010	100015	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
60	NC_016146	GGA	2	6	100064	100069	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
61	NC_016146	GAA	2	6	100074	100079	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
62	NC_016146	ACT	2	6	100088	100093	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016146	TTA	2	6	100359	100364	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
64	NC_016146	TTA	2	6	100392	100397	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016146	TAA	2	6	100467	100472	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016146	TTA	2	6	100481	100486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_016146	TAA	2	6	101907	101912	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016146	CTG	2	6	101988	101993	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
69	NC_016146	ATT	2	6	108041	108046	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_016146	ATA	2	6	108058	108063	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_016146	ATA	2	6	108097	108102	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016146	AGA	2	6	113470	113475	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016146	TGG	2	6	113534	113539	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016146	GAA	2	6	113717	113722	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
75	NC_016146	ATG	2	6	113768	113773	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016146	TCT	2	6	113897	113902	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
77	NC_016146	TGA	2	6	113945	113950	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016146	ATA	2	6	114091	114096	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_016146	TAA	2	6	114791	114796	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_016146	TTG	2	6	114840	114845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
81	NC_016146	ATC	2	6	115950	115955	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016146	TAC	2	6	133748	133753	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_016146	ATA	2	6	138911	138916	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016146	ATT	2	6	141866	141871	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_016146	CAA	2	6	143918	143923	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
86	NC_016146	AAT	2	6	148459	148464	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016146	TAT	2	6	148953	148958	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016146	CTA	2	6	151097	151102	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_016146	TAA	2	6	162965	162970	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_016146	ATA	2	6	162983	162988	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016146	TAA	2	6	163035	163040	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016146	GTT	2	6	175768	175773	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
93	NC_016146	ATT	2	6	176429	176434	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_016146	ACA	2	6	176442	176447	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016146	ATA	3	9	176470	176478	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016146	TAT	2	6	176490	176495	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016146	TGA	2	6	176499	176504	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016146	ATT	2	6	176510	176515	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016146	TTG	2	6	188909	188914	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016146	AGG	2	6	194097	194102	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016146	ACA	2	6	194133	194138	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016146	TAA	2	6	194160	194165	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_016146	TCA	2	6	194178	194183	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_016146	GGA	2	6	195250	195255	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016146	AAT	2	6	195258	195263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016146	TGT	2	6	195299	195304	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016146	GTA	2	6	195359	195364	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
108	NC_016146	AAC	2	6	195421	195426	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016146	TAA	2	6	195475	195480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016146	CTT	2	6	195484	195489	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_016146	GAG	2	6	195556	195561	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016146	TAC	2	6	196163	196168	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
113	NC_016146	AAC	2	6	212374	212379	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016146	TTA	2	6	213969	213974	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
115	NC_016146	ATG	2	6	216683	216688	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016146	ATA	2	6	223258	223263	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016146	GAT	2	6	230819	230824	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
118	NC_016146	TAT	2	6	230825	230830	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016146	ATT	2	6	233667	233672	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016146	GTT	2	6	234522	234527	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016146	TAT	2	6	237014	237019	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016146	AAT	2	6	237026	237031	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016146	AAT	2	6	237059	237064	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016146	AAT	2	6	237084	237089	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016146	ATT	2	6	237104	237109	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016146	GAA	2	6	243244	243249	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016146	ATT	2	6	243254	243259	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
128	NC_016146	AGA	2	6	243327	243332	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016146	TTA	2	6	243414	243419	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
130	NC_016146	TCT	2	6	243423	243428	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
131	NC_016146	ATA	2	6	243558	243563	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016146	AAC	2	6	244132	244137	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016146	ATT	2	6	244163	244168	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016146	ATA	2	6	244204	244209	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
135	NC_016146	AAT	2	6	248113	248118	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_016146	CAT	2	6	248365	248370	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
137	NC_016146	TCG	2	6	253359	253364	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
138	NC_016146	TAT	2	6	253407	253412	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
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407	NC_016146	TCA	2	6	552521	552526	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
408	NC_016146	TAT	2	6	557302	557307	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
409	NC_016146	TAT	2	6	557318	557323	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
410	NC_016146	TTG	2	6	557332	557337	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
411	NC_016146	TGA	2	6	557340	557345	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
412	NC_016146	AAT	2	6	564218	564223	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
413	NC_016146	TAA	2	6	565697	565702	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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416	NC_016146	AAT	2	6	570592	570597	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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420	NC_016146	ATA	2	6	577826	577831	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
421	NC_016146	ATA	3	9	587165	587173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
422	NC_016146	AAT	2	6	587200	587205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.