MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA02

Total Repeats: 81

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016115	CGGTGA	2	12	3076	3087	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
2	NC_016115	ACGGGG	2	12	3130	3141	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
3	NC_016115	CACATC	2	12	3147	3158	33.33 %	16.67 %	0 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016115	GCGAGG	2	12	3655	3666	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
5	NC_016115	GGACTG	2	12	3761	3772	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
6	NC_016115	AGGCGG	2	12	4065	4076	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
7	NC_016115	GAGCAG	2	12	4711	4722	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357415568
8	NC_016115	AGAGCG	2	12	6191	6202	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357415568
9	NC_016115	CGGCCA	2	12	7643	7654	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415571
10	NC_016115	GGTGTG	2	12	12760	12771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357415576
11	NC_016115	AGCTGG	2	12	19008	19019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357415578
12	NC_016115	CTGGCC	2	12	21590	21601	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357415580
13	NC_016115	GAGGTC	2	12	25071	25082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357415583
14	NC_016115	CCGGAG	2	12	25263	25274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415583
15	NC_016115	CACCGA	2	12	26165	26176	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
16	NC_016115	CTCGGG	2	12	31983	31994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357415588
17	NC_016115	GGAGTG	2	12	33932	33943	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	357415589
18	NC_016115	AGCGCG	2	12	35183	35194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415590
19	NC_016115	CGGTGC	2	12	36583	36594	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016115	GCCCGC	2	12	37881	37892	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
21	NC_016115	CCTCGA	2	12	38515	38526	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
22	NC_016115	TCCTCG	2	12	38844	38855	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016115	ACCGCA	2	12	39870	39881	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016115	CGGCAG	2	12	43093	43104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415594
25	NC_016115	TCGGTG	2	12	45000	45011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	357415596
26	NC_016115	GTGGCG	2	12	46707	46718	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	357415598
27	NC_016115	GCGCCC	2	12	52161	52172	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
28	NC_016115	TGCGCC	2	12	52401	52412	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
29	NC_016115	GGCGCG	2	12	56381	56392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357415606
30	NC_016115	TCACCG	2	12	58514	58525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357415607
31	NC_016115	GGCGAC	2	12	65092	65103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415614
32	NC_016115	GCGACG	2	12	66104	66115	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415615
33	NC_016115	CCGGCA	2	12	66865	66876	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
34	NC_016115	TACCTG	2	12	66925	66936	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016115	AACCGA	2	12	68335	68346	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	357415620
36	NC_016115	GGCCCT	2	12	69028	69039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357415620
37	NC_016115	GCCGAA	2	12	69131	69142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357415620
38	NC_016115	GCCCCC	2	12	71705	71716	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	357415623
39	NC_016115	AAGGGC	2	12	71978	71989	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357415623
40	NC_016115	CACCGG	2	12	72211	72222	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415623
41	NC_016115	GGCCCG	4	24	72371	72394	0 %	0 %	50 %	50 %	357415623
42	NC_016115	CACCCG	2	12	73106	73117	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357415624
43	NC_016115	AGCTGA	2	12	73148	73159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357415624
44	NC_016115	GGCTGG	2	12	73842	73853	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	357415625
45	NC_016115	GAAGCC	2	12	77166	77177	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
46	NC_016115	CGTCCT	2	12	79452	79463	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016115	GGGGCC	2	12	80464	80475	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_016115	GGGGCC	2	12	82624	82635	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
49	NC_016115	GGGGAA	2	12	86304	86315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357415637
50	NC_016115	CGGTGC	2	12	86572	86583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357415638
51	NC_016115	GACCTC	2	12	88207	88218	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357415641
52	NC_016115	GCCCCG	2	12	89204	89215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357415642
53	NC_016115	CGTTCA	2	12	89697	89708	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_016115	CCAGCG	2	12	90678	90689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415644
55	NC_016115	CCCTCG	2	12	96607	96618	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
56	NC_016115	CGGTTG	2	12	98764	98775	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	357415651
57	NC_016115	CAGCCG	2	12	100695	100706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415652
58	NC_016115	CAGCGA	2	12	102424	102435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357415654
59	NC_016115	CAGGAA	2	12	103718	103729	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	357415655
60	NC_016115	AGGTCA	2	12	104494	104505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357415656
61	NC_016115	CATCGC	2	12	106747	106758	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016115	GCCGCA	2	12	110089	110100	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016115	CGTCAT	2	12	111276	111287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	357415661
64	NC_016115	GTGGCT	2	12	116737	116748	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016115	CTGACT	2	12	117094	117105	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
66	NC_016115	CCTTCC	2	12	121184	121195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357415667
67	NC_016115	CCCCGC	2	12	121255	121266	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	357415667
68	NC_016115	TCGAGT	2	12	122008	122019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
69	NC_016115	TCGAGT	2	12	122110	122121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
70	NC_016115	TCGAGT	2	12	122212	122223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
71	NC_016115	TCGAGT	2	12	122314	122325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
72	NC_016115	TCGAGT	2	12	122416	122427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
73	NC_016115	TCGAGT	2	12	122518	122529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
74	NC_016115	TCGAGT	2	12	122722	122733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
75	NC_016115	TCGAGT	2	12	122926	122937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
76	NC_016115	TCGAGT	2	12	123028	123039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
77	NC_016115	TCGAGT	2	12	123232	123243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
78	NC_016115	TCGAGT	2	12	123334	123345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
79	NC_016115	TCGAGT	2	12	123436	123447	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
80	NC_016115	TCGAGT	2	12	123538	123549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
81	NC_016115	CCCGAC	2	12	125341	125352	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357415668

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.