MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Coding Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA02

Total Repeats: 55

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016115	GAGCAG	2	12	4711	4722	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357415568
2	NC_016115	AGAGCG	2	12	6191	6202	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357415568
3	NC_016115	CGGCCA	2	12	7643	7654	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415571
4	NC_016115	GGTGTG	2	12	12760	12771	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357415576
5	NC_016115	AGCTGG	2	12	19008	19019	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357415578
6	NC_016115	CTGGCC	2	12	21590	21601	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357415580
7	NC_016115	GAGGTC	2	12	25071	25082	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	357415583
8	NC_016115	CCGGAG	2	12	25263	25274	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415583
9	NC_016115	CTCGGG	2	12	31983	31994	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357415588
10	NC_016115	GGAGTG	2	12	33932	33943	16.67 %	16.67 %	66.67 %	0 %	357415589
11	NC_016115	AGCGCG	2	12	35183	35194	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415590
12	NC_016115	CGGCAG	2	12	43093	43104	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415594
13	NC_016115	TCGGTG	2	12	45000	45011	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	357415596
14	NC_016115	GTGGCG	2	12	46707	46718	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	357415598
15	NC_016115	GGCGCG	2	12	56381	56392	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357415606
16	NC_016115	TCACCG	2	12	58514	58525	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357415607
17	NC_016115	GGCGAC	2	12	65092	65103	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415614
18	NC_016115	GCGACG	2	12	66104	66115	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	357415615
19	NC_016115	AACCGA	2	12	68335	68346	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	357415620
20	NC_016115	GGCCCT	2	12	69028	69039	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	357415620
21	NC_016115	GCCGAA	2	12	69131	69142	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357415620
22	NC_016115	GCCCCC	2	12	71705	71716	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	357415623
23	NC_016115	AAGGGC	2	12	71978	71989	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	357415623
24	NC_016115	CACCGG	2	12	72211	72222	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415623
25	NC_016115	GGCCCG	4	24	72371	72394	0 %	0 %	50 %	50 %	357415623
26	NC_016115	CACCCG	2	12	73106	73117	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357415624
27	NC_016115	AGCTGA	2	12	73148	73159	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357415624
28	NC_016115	GGCTGG	2	12	73842	73853	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	357415625
29	NC_016115	GGGGAA	2	12	86304	86315	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357415637
30	NC_016115	CGGTGC	2	12	86572	86583	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	357415638
31	NC_016115	GACCTC	2	12	88207	88218	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	357415641
32	NC_016115	GCCCCG	2	12	89204	89215	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357415642
33	NC_016115	CCAGCG	2	12	90678	90689	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415644
34	NC_016115	CGGTTG	2	12	98764	98775	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	357415651
35	NC_016115	CAGCCG	2	12	100695	100706	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	357415652
36	NC_016115	CAGCGA	2	12	102424	102435	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357415654
37	NC_016115	CAGGAA	2	12	103718	103729	50 %	0 %	33.33 %	16.67 %	357415655
38	NC_016115	AGGTCA	2	12	104494	104505	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	357415656
39	NC_016115	CGTCAT	2	12	111276	111287	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	357415661
40	NC_016115	CCTTCC	2	12	121184	121195	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357415667
41	NC_016115	CCCCGC	2	12	121255	121266	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	357415667
42	NC_016115	TCGAGT	2	12	122008	122019	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
43	NC_016115	TCGAGT	2	12	122110	122121	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
44	NC_016115	TCGAGT	2	12	122212	122223	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
45	NC_016115	TCGAGT	2	12	122314	122325	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
46	NC_016115	TCGAGT	2	12	122416	122427	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
47	NC_016115	TCGAGT	2	12	122518	122529	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
48	NC_016115	TCGAGT	2	12	122722	122733	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
49	NC_016115	TCGAGT	2	12	122926	122937	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
50	NC_016115	TCGAGT	2	12	123028	123039	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
51	NC_016115	TCGAGT	2	12	123232	123243	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
52	NC_016115	TCGAGT	2	12	123334	123345	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
53	NC_016115	TCGAGT	2	12	123436	123447	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
54	NC_016115	TCGAGT	2	12	123538	123549	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	357415668
55	NC_016115	CCCGAC	2	12	125341	125352	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	357415668

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.