MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA02

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016115	CGCGC	2	10	1142	1151	0 %	0 %	40 %	60 %	357415567
2	NC_016115	GCGGG	2	10	1300	1309	0 %	0 %	80 %	20 %	357415567
3	NC_016115	GCCGG	2	10	1390	1399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016115	ACAGG	2	10	1697	1706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
5	NC_016115	CAGCG	2	10	1981	1990	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
6	NC_016115	CTCAC	2	10	2024	2033	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
7	NC_016115	CACCG	2	10	2496	2505	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
8	NC_016115	TCCGC	2	10	8422	8431	0 %	20 %	20 %	60 %	357415571
9	NC_016115	CCTCC	2	10	10174	10183	0 %	20 %	0 %	80 %	357415572
10	NC_016115	CAGAG	2	10	10950	10959	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
11	NC_016115	CCACG	2	10	11734	11743	20 %	0 %	20 %	60 %	357415574
12	NC_016115	GCGCG	2	10	12501	12510	0 %	0 %	60 %	40 %	357415575
13	NC_016115	GCGCC	2	10	12675	12684	0 %	0 %	40 %	60 %	357415576
14	NC_016115	TCATC	2	10	15149	15158	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
15	NC_016115	CTGGG	2	10	16189	16198	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
16	NC_016115	CGACC	2	10	16619	16628	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
17	NC_016115	CGCCA	2	10	17330	17339	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016115	GCCCT	2	10	18591	18600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016115	ACTTC	2	10	24553	24562	20 %	40 %	0 %	40 %	357415583
20	NC_016115	CGGTC	2	10	25169	25178	0 %	20 %	40 %	40 %	357415583
21	NC_016115	CGTGC	2	10	25229	25238	0 %	20 %	40 %	40 %	357415583
22	NC_016115	TGCCA	2	10	26415	26424	20 %	20 %	20 %	40 %	357415584
23	NC_016115	CGAAC	2	10	29808	29817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
24	NC_016115	TCGGG	2	10	30079	30088	0 %	20 %	60 %	20 %	357415587
25	NC_016115	ACGGA	2	10	30831	30840	40 %	0 %	40 %	20 %	357415587
26	NC_016115	CTGGG	2	10	32922	32931	0 %	20 %	60 %	20 %	357415589
27	NC_016115	CCGCA	2	10	34842	34851	20 %	0 %	20 %	60 %	357415589
28	NC_016115	GCCCC	2	10	35290	35299	0 %	0 %	20 %	80 %	357415590
29	NC_016115	GGTGA	2	10	35405	35414	20 %	20 %	60 %	0 %	357415590
30	NC_016115	CTTGC	2	10	37070	37079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
31	NC_016115	TCCGC	2	10	37723	37732	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
32	NC_016115	GATCC	2	10	38141	38150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016115	GCAAC	2	10	39622	39631	40 %	0 %	20 %	40 %	357415591
34	NC_016115	GGGGC	2	10	42598	42607	0 %	0 %	80 %	20 %	357415594
35	NC_016115	GCACG	2	10	43505	43514	20 %	0 %	40 %	40 %	357415595
36	NC_016115	GCCAG	2	10	43685	43694	20 %	0 %	40 %	40 %	357415595
37	NC_016115	CTGCG	2	10	45479	45488	0 %	20 %	40 %	40 %	357415596
38	NC_016115	GCGAC	2	10	45596	45605	20 %	0 %	40 %	40 %	357415596
39	NC_016115	TGCGC	2	10	46147	46156	0 %	20 %	40 %	40 %	357415598
40	NC_016115	TGATC	2	10	46258	46267	20 %	40 %	20 %	20 %	357415598
41	NC_016115	CCACG	2	10	47656	47665	20 %	0 %	20 %	60 %	357415599
42	NC_016115	TCGGA	2	10	48730	48739	20 %	20 %	40 %	20 %	357415600
43	NC_016115	GGCCT	2	10	50219	50228	0 %	20 %	40 %	40 %	357415602
44	NC_016115	CTCGT	2	10	51453	51462	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
45	NC_016115	ACCCA	2	10	52469	52478	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
46	NC_016115	AGCAC	2	10	52923	52932	40 %	0 %	20 %	40 %	357415604
47	NC_016115	CCGCA	2	10	53728	53737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
48	NC_016115	ACACC	2	10	53812	53821	40 %	0 %	0 %	60 %	357415605
49	NC_016115	ACGGG	2	10	53982	53991	20 %	0 %	60 %	20 %	357415605
50	NC_016115	CGGCG	2	10	56252	56261	0 %	0 %	60 %	40 %	357415606
51	NC_016115	GGCCG	2	10	56371	56380	0 %	0 %	60 %	40 %	357415606
52	NC_016115	GCGCG	2	10	57090	57099	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
53	NC_016115	CGGCG	2	10	57164	57173	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
54	NC_016115	CGCGG	2	10	57817	57826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
55	NC_016115	GCCGA	2	10	58995	59004	20 %	0 %	40 %	40 %	357415608
56	NC_016115	CCGGC	2	10	59120	59129	0 %	0 %	40 %	60 %	357415608
57	NC_016115	GAGCG	2	10	59674	59683	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
58	NC_016115	TCACC	2	10	62816	62825	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
59	NC_016115	TCTCG	2	10	64280	64289	0 %	40 %	20 %	40 %	357415613
60	NC_016115	GCCTC	2	10	64470	64479	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
61	NC_016115	ATCGA	2	10	64712	64721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
62	NC_016115	GCACC	2	10	64979	64988	20 %	0 %	20 %	60 %	357415614
63	NC_016115	CACGC	2	10	65223	65232	20 %	0 %	20 %	60 %	357415614
64	NC_016115	CACCG	2	10	65243	65252	20 %	0 %	20 %	60 %	357415614
65	NC_016115	GCGAG	2	10	66272	66281	20 %	0 %	60 %	20 %	357415615
66	NC_016115	TCGGA	2	10	66694	66703	20 %	20 %	40 %	20 %	357415616
67	NC_016115	CGCGG	2	10	66959	66968	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
68	NC_016115	CGACC	2	10	67343	67352	20 %	0 %	20 %	60 %	357415619
69	NC_016115	GACCC	2	10	68220	68229	20 %	0 %	20 %	60 %	357415620
70	NC_016115	CGACG	2	10	71939	71948	20 %	0 %	40 %	40 %	357415623
71	NC_016115	GGGCC	2	10	72395	72404	0 %	0 %	60 %	40 %	357415623
72	NC_016115	GCACC	2	10	72679	72688	20 %	0 %	20 %	60 %	357415623
73	NC_016115	CCGCC	2	10	73931	73940	0 %	0 %	20 %	80 %	357415625
74	NC_016115	CGCAC	2	10	73965	73974	20 %	0 %	20 %	60 %	357415625
75	NC_016115	GCTCC	2	10	76979	76988	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
76	NC_016115	TCATC	2	10	77928	77937	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
77	NC_016115	ATCGA	2	10	77942	77951	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
78	NC_016115	CAGGT	2	10	77959	77968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
79	NC_016115	CTGGG	2	10	78085	78094	0 %	20 %	60 %	20 %	357415627
80	NC_016115	TCCTG	2	10	78362	78371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
81	NC_016115	CACGA	2	10	82382	82391	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
82	NC_016115	GCCCC	2	10	84810	84819	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
83	NC_016115	ACCGG	2	10	85081	85090	20 %	0 %	40 %	40 %	357415635
84	NC_016115	TCAGC	2	10	85700	85709	20 %	20 %	20 %	40 %	357415636
85	NC_016115	CCCAC	2	10	86613	86622	20 %	0 %	0 %	80 %	357415638
86	NC_016115	CGTCG	2	10	88371	88380	0 %	20 %	40 %	40 %	357415641
87	NC_016115	GGGGA	2	10	88843	88852	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016115	GACCG	2	10	89428	89437	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
89	NC_016115	ACCGA	2	10	90809	90818	40 %	0 %	20 %	40 %	357415644
90	NC_016115	CACGG	2	10	91433	91442	20 %	0 %	40 %	40 %	357415645
91	NC_016115	CGCGC	2	10	92849	92858	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
92	NC_016115	CGGCA	2	10	93935	93944	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
93	NC_016115	GCCCA	2	10	94629	94638	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
94	NC_016115	CACTT	2	10	94869	94878	20 %	40 %	0 %	40 %	357415649
95	NC_016115	TGCGC	2	10	97472	97481	0 %	20 %	40 %	40 %	357415650
96	NC_016115	CCGGG	2	10	97579	97588	0 %	0 %	60 %	40 %	357415650
97	NC_016115	CCCGC	2	10	97789	97798	0 %	0 %	20 %	80 %	357415650
98	NC_016115	CCCCT	2	10	97905	97914	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
99	NC_016115	ACCGA	2	10	98517	98526	40 %	0 %	20 %	40 %	357415651
100	NC_016115	GCGAG	2	10	99455	99464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
101	NC_016115	GCCCG	2	10	99529	99538	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
102	NC_016115	TGCCC	2	10	99938	99947	0 %	20 %	20 %	60 %	357415652
103	NC_016115	CGGCC	2	10	101969	101978	0 %	0 %	40 %	60 %	357415653
104	NC_016115	TGAAC	2	10	102502	102511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
105	NC_016115	GAAGA	2	10	102716	102725	60 %	0 %	40 %	0 %	357415655
106	NC_016115	CGCTG	2	10	103377	103386	0 %	20 %	40 %	40 %	357415655
107	NC_016115	GGCGG	2	10	103420	103429	0 %	0 %	80 %	20 %	357415655
108	NC_016115	CCGGG	2	10	104150	104159	0 %	0 %	60 %	40 %	357415656
109	NC_016115	GACCT	2	10	104879	104888	20 %	20 %	20 %	40 %	357415656
110	NC_016115	TCGCC	2	10	105841	105850	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
111	NC_016115	GCGCG	2	10	107345	107354	0 %	0 %	60 %	40 %	357415658
112	NC_016115	CGGTG	2	10	107877	107886	0 %	20 %	60 %	20 %	357415659
113	NC_016115	GGAGC	2	10	108746	108755	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
114	NC_016115	CGCGG	2	10	109727	109736	0 %	0 %	60 %	40 %	357415660
115	NC_016115	CACCC	2	10	111561	111570	20 %	0 %	0 %	80 %	357415661
116	NC_016115	CATGC	2	10	111664	111673	20 %	20 %	20 %	40 %	357415661
117	NC_016115	CCGGC	2	10	112495	112504	0 %	0 %	40 %	60 %	357415662
118	NC_016115	CAGCG	2	10	112653	112662	20 %	0 %	40 %	40 %	357415662
119	NC_016115	CAGTG	2	10	117426	117435	20 %	20 %	40 %	20 %	357415664
120	NC_016115	TGGGC	2	10	118700	118709	0 %	20 %	60 %	20 %	357415664
121	NC_016115	GGGGA	2	10	119958	119967	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016115	ATCCG	2	10	120230	120239	20 %	20 %	20 %	40 %	357415665
123	NC_016115	CGCCC	2	10	120336	120345	0 %	0 %	20 %	80 %	357415666
124	NC_016115	CCGCC	2	10	121043	121052	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
125	NC_016115	CGAGG	2	10	121404	121413	20 %	0 %	60 %	20 %	357415667
126	NC_016115	TCCGA	2	10	121522	121531	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
127	NC_016115	TGACG	2	10	125975	125984	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
128	NC_016115	GCACC	2	10	126522	126531	20 %	0 %	20 %	60 %	357415669
129	NC_016115	GCCCG	2	10	127170	127179	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
130	NC_016115	GCGCT	2	10	127843	127852	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
131	NC_016115	CAGAA	2	10	128175	128184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
132	NC_016115	GCCGA	2	10	128826	128835	20 %	0 %	40 %	40 %	357415672
133	NC_016115	CCCAT	2	10	130035	130044	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.