MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA02

Total Repeats: 52

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016115	GCCGG	2	10	1390	1399	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
2	NC_016115	ACAGG	2	10	1697	1706	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
3	NC_016115	CAGCG	2	10	1981	1990	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
4	NC_016115	CTCAC	2	10	2024	2033	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
5	NC_016115	CACCG	2	10	2496	2505	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
6	NC_016115	CAGAG	2	10	10950	10959	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
7	NC_016115	TCATC	2	10	15149	15158	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
8	NC_016115	CTGGG	2	10	16189	16198	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
9	NC_016115	CGACC	2	10	16619	16628	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
10	NC_016115	CGCCA	2	10	17330	17339	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
11	NC_016115	GCCCT	2	10	18591	18600	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
12	NC_016115	CGAAC	2	10	29808	29817	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
13	NC_016115	CTTGC	2	10	37070	37079	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
14	NC_016115	TCCGC	2	10	37723	37732	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
15	NC_016115	GATCC	2	10	38141	38150	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
16	NC_016115	CTCGT	2	10	51453	51462	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
17	NC_016115	ACCCA	2	10	52469	52478	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
18	NC_016115	CCGCA	2	10	53728	53737	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
19	NC_016115	GCGCG	2	10	57090	57099	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
20	NC_016115	CGGCG	2	10	57164	57173	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
21	NC_016115	CGCGG	2	10	57817	57826	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
22	NC_016115	GAGCG	2	10	59674	59683	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
23	NC_016115	TCACC	2	10	62816	62825	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding
24	NC_016115	GCCTC	2	10	64470	64479	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
25	NC_016115	ATCGA	2	10	64712	64721	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
26	NC_016115	CGCGG	2	10	66959	66968	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
27	NC_016115	GCTCC	2	10	76979	76988	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
28	NC_016115	TCATC	2	10	77928	77937	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
29	NC_016115	ATCGA	2	10	77942	77951	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
30	NC_016115	CAGGT	2	10	77959	77968	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
31	NC_016115	TCCTG	2	10	78362	78371	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
32	NC_016115	CACGA	2	10	82382	82391	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
33	NC_016115	GCCCC	2	10	84810	84819	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
34	NC_016115	GGGGA	2	10	88843	88852	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016115	GACCG	2	10	89428	89437	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
36	NC_016115	CGCGC	2	10	92849	92858	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
37	NC_016115	CGGCA	2	10	93935	93944	20 %	0 %	40 %	40 %	Non-Coding
38	NC_016115	GCCCA	2	10	94629	94638	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
39	NC_016115	CCCCT	2	10	97905	97914	0 %	20 %	0 %	80 %	Non-Coding
40	NC_016115	GCGAG	2	10	99455	99464	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
41	NC_016115	GCCCG	2	10	99529	99538	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
42	NC_016115	TGAAC	2	10	102502	102511	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
43	NC_016115	TCGCC	2	10	105841	105850	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
44	NC_016115	GGAGC	2	10	108746	108755	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
45	NC_016115	GGGGA	2	10	119958	119967	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016115	CCGCC	2	10	121043	121052	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
47	NC_016115	TCCGA	2	10	121522	121531	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
48	NC_016115	TGACG	2	10	125975	125984	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
49	NC_016115	GCCCG	2	10	127170	127179	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
50	NC_016115	GCGCT	2	10	127843	127852	0 %	20 %	40 %	40 %	Non-Coding
51	NC_016115	CAGAA	2	10	128175	128184	60 %	0 %	20 %	20 %	Non-Coding
52	NC_016115	CCCAT	2	10	130035	130044	20 %	20 %	0 %	60 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.