MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA02

Total Repeats: 384

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016115	TGGC	2	8	343	350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016115	GCTG	2	8	838	845	0 %	25 %	50 %	25 %	357415566
3	NC_016115	CGGC	2	8	1530	1537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4	NC_016115	CGGG	2	8	1613	1620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
5	NC_016115	CGCC	2	8	1662	1669	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016115	CACC	2	8	2717	2724	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
7	NC_016115	GCCG	2	8	3092	3099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016115	GTCG	2	8	3425	3432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
9	NC_016115	GTGG	2	8	4108	4115	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016115	ACCT	2	8	4621	4628	25 %	25 %	0 %	50 %	357415568
11	NC_016115	CATC	2	8	5472	5479	25 %	25 %	0 %	50 %	357415568
12	NC_016115	CCAC	2	8	5543	5550	25 %	0 %	0 %	75 %	357415568
13	NC_016115	GCAG	2	8	5805	5812	25 %	0 %	50 %	25 %	357415568
14	NC_016115	CCTT	2	8	5996	6003	0 %	50 %	0 %	50 %	357415568
15	NC_016115	TCCA	2	8	6635	6642	25 %	25 %	0 %	50 %	357415569
16	NC_016115	GGGA	2	8	6708	6715	25 %	0 %	75 %	0 %	357415569
17	NC_016115	GGAG	2	8	6906	6913	25 %	0 %	75 %	0 %	357415569
18	NC_016115	CGGT	2	8	7276	7283	0 %	25 %	50 %	25 %	357415570
19	NC_016115	GTGG	2	8	7574	7581	0 %	25 %	75 %	0 %	357415571
20	NC_016115	CCAG	2	8	7582	7589	25 %	0 %	25 %	50 %	357415571
21	NC_016115	CCGG	2	8	7600	7607	0 %	0 %	50 %	50 %	357415571
22	NC_016115	GGCG	2	8	7744	7751	0 %	0 %	75 %	25 %	357415571
23	NC_016115	CCGC	2	8	8033	8040	0 %	0 %	25 %	75 %	357415571
24	NC_016115	CCAG	2	8	8242	8249	25 %	0 %	25 %	50 %	357415571
25	NC_016115	TCCC	2	8	8436	8443	0 %	25 %	0 %	75 %	357415571
26	NC_016115	TCTG	2	8	8950	8957	0 %	50 %	25 %	25 %	357415571
27	NC_016115	ACGG	2	8	9086	9093	25 %	0 %	50 %	25 %	357415571
28	NC_016115	CAGG	2	8	9120	9127	25 %	0 %	50 %	25 %	357415571
29	NC_016115	AGTA	2	8	9163	9170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
30	NC_016115	GAAC	2	8	9561	9568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
31	NC_016115	CCGG	2	8	10453	10460	0 %	0 %	50 %	50 %	357415572
32	NC_016115	CCTT	2	8	10997	11004	0 %	50 %	0 %	50 %	357415574
33	NC_016115	CTCC	2	8	11043	11050	0 %	25 %	0 %	75 %	357415574
34	NC_016115	CCGC	2	8	11250	11257	0 %	0 %	25 %	75 %	357415574
35	NC_016115	TCCG	2	8	12360	12367	0 %	25 %	25 %	50 %	357415575
36	NC_016115	GCCG	2	8	12514	12521	0 %	0 %	50 %	50 %	357415575
37	NC_016115	CGGC	2	8	13002	13009	0 %	0 %	50 %	50 %	357415576
38	NC_016115	CGGT	2	8	13180	13187	0 %	25 %	50 %	25 %	357415576
39	NC_016115	GCAT	2	8	13550	13557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
40	NC_016115	CGTT	2	8	13776	13783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016115	GTCC	2	8	14131	14138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
42	NC_016115	GCCG	2	8	14356	14363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016115	CCCG	2	8	14527	14534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
44	NC_016115	CAGC	2	8	14977	14984	25 %	0 %	25 %	50 %	357415577
45	NC_016115	GTCC	2	8	15007	15014	0 %	25 %	25 %	50 %	357415577
46	NC_016115	CAGC	2	8	15512	15519	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016115	CGCC	2	8	16232	16239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
48	NC_016115	CCGG	2	8	16401	16408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016115	GGCC	2	8	16883	16890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
50	NC_016115	CGCC	2	8	17105	17112	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
51	NC_016115	CCCG	2	8	17300	17307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
52	NC_016115	CACC	2	8	17444	17451	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
53	NC_016115	CACC	2	8	17453	17460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
54	NC_016115	GGAG	2	8	17863	17870	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016115	GAAA	2	8	18247	18254	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016115	CACC	2	8	18472	18479	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_016115	GCCG	2	8	19063	19070	0 %	0 %	50 %	50 %	357415578
58	NC_016115	GGCG	2	8	19083	19090	0 %	0 %	75 %	25 %	357415578
59	NC_016115	GGTG	2	8	19389	19396	0 %	25 %	75 %	0 %	357415578
60	NC_016115	GGGC	2	8	19399	19406	0 %	0 %	75 %	25 %	357415578
61	NC_016115	CCGG	2	8	20602	20609	0 %	0 %	50 %	50 %	357415579
62	NC_016115	GACA	2	8	21154	21161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
63	NC_016115	GCTC	2	8	21605	21612	0 %	25 %	25 %	50 %	357415580
64	NC_016115	CGCA	2	8	21786	21793	25 %	0 %	25 %	50 %	357415580
65	NC_016115	GGCC	2	8	22075	22082	0 %	0 %	50 %	50 %	357415581
66	NC_016115	GGCG	2	8	23164	23171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016115	GGGC	2	8	23381	23388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016115	CGGA	2	8	24762	24769	25 %	0 %	50 %	25 %	357415583
69	NC_016115	GAAG	2	8	24971	24978	50 %	0 %	50 %	0 %	357415583
70	NC_016115	GGCC	2	8	25048	25055	0 %	0 %	50 %	50 %	357415583
71	NC_016115	TCCA	2	8	25596	25603	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016115	GAGC	2	8	25687	25694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
73	NC_016115	CAGG	2	8	26387	26394	25 %	0 %	50 %	25 %	357415584
74	NC_016115	GGGC	2	8	26602	26609	0 %	0 %	75 %	25 %	357415584
75	NC_016115	GCCT	2	8	26937	26944	0 %	25 %	25 %	50 %	357415584
76	NC_016115	CGGC	2	8	27319	27326	0 %	0 %	50 %	50 %	357415585
77	NC_016115	GCTG	2	8	27361	27368	0 %	25 %	50 %	25 %	357415585
78	NC_016115	CGGA	2	8	27509	27516	25 %	0 %	50 %	25 %	357415585
79	NC_016115	GGCC	2	8	27977	27984	0 %	0 %	50 %	50 %	357415585
80	NC_016115	AAGC	2	8	28494	28501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016115	ACAG	2	8	28641	28648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016115	GGAC	2	8	28681	28688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016115	CGAC	2	8	28948	28955	25 %	0 %	25 %	50 %	357415586
84	NC_016115	CGGC	2	8	29012	29019	0 %	0 %	50 %	50 %	357415586
85	NC_016115	GGCG	2	8	29305	29312	0 %	0 %	75 %	25 %	357415586
86	NC_016115	TGAG	2	8	29789	29796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
87	NC_016115	CTGG	2	8	29994	30001	0 %	25 %	50 %	25 %	357415587
88	NC_016115	GGGA	2	8	30415	30422	25 %	0 %	75 %	0 %	357415587
89	NC_016115	TGGC	2	8	30516	30523	0 %	25 %	50 %	25 %	357415587
90	NC_016115	GCAC	2	8	30917	30924	25 %	0 %	25 %	50 %	357415587
91	NC_016115	AGCA	2	8	30972	30979	50 %	0 %	25 %	25 %	357415587
92	NC_016115	ACTG	2	8	31201	31208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016115	GGCA	2	8	31762	31769	25 %	0 %	50 %	25 %	357415588
94	NC_016115	TCGA	2	8	31975	31982	25 %	25 %	25 %	25 %	357415588
95	NC_016115	GCTC	2	8	32244	32251	0 %	25 %	25 %	50 %	357415588
96	NC_016115	GACC	2	8	32589	32596	25 %	0 %	25 %	50 %	357415588
97	NC_016115	CCGC	2	8	32996	33003	0 %	0 %	25 %	75 %	357415589
98	NC_016115	AGGC	2	8	33712	33719	25 %	0 %	50 %	25 %	357415589
99	NC_016115	TGGC	2	8	33723	33730	0 %	25 %	50 %	25 %	357415589
100	NC_016115	CGGG	2	8	33837	33844	0 %	0 %	75 %	25 %	357415589
101	NC_016115	CTGC	2	8	34271	34278	0 %	25 %	25 %	50 %	357415589
102	NC_016115	CCCA	2	8	34287	34294	25 %	0 %	0 %	75 %	357415589
103	NC_016115	GCCA	2	8	34560	34567	25 %	0 %	25 %	50 %	357415589
104	NC_016115	CTGG	2	8	35674	35681	0 %	25 %	50 %	25 %	357415590
105	NC_016115	CCCA	2	8	35720	35727	25 %	0 %	0 %	75 %	357415590
106	NC_016115	GCCA	2	8	35871	35878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
107	NC_016115	CCGC	2	8	36037	36044	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
108	NC_016115	GCAC	2	8	37246	37253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
109	NC_016115	CCGG	2	8	37420	37427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016115	TGAA	2	8	37758	37765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016115	GCCA	2	8	38313	38320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016115	CAAC	2	8	38667	38674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016115	CTGA	2	8	38874	38881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
114	NC_016115	GACG	2	8	39271	39278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016115	GGGT	2	8	41018	41025	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016115	CGTC	2	8	41514	41521	0 %	25 %	25 %	50 %	357415593
117	NC_016115	GCCT	2	8	41666	41673	0 %	25 %	25 %	50 %	357415594
118	NC_016115	AGCC	2	8	42008	42015	25 %	0 %	25 %	50 %	357415594
119	NC_016115	TGGG	2	8	42179	42186	0 %	25 %	75 %	0 %	357415594
120	NC_016115	CGGG	2	8	42372	42379	0 %	0 %	75 %	25 %	357415594
121	NC_016115	CGGT	2	8	43010	43017	0 %	25 %	50 %	25 %	357415594
122	NC_016115	GCGG	2	8	43272	43279	0 %	0 %	75 %	25 %	357415595
123	NC_016115	AGGC	2	8	43532	43539	25 %	0 %	50 %	25 %	357415595
124	NC_016115	GCCA	2	8	43567	43574	25 %	0 %	25 %	50 %	357415595
125	NC_016115	AGGA	2	8	43578	43585	50 %	0 %	50 %	0 %	357415595
126	NC_016115	GGCG	2	8	44192	44199	0 %	0 %	75 %	25 %	357415595
127	NC_016115	GGAA	2	8	44235	44242	50 %	0 %	50 %	0 %	357415595
128	NC_016115	CGGC	2	8	44826	44833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016115	CCTG	2	8	44871	44878	0 %	25 %	25 %	50 %	357415596
130	NC_016115	CGCC	2	8	45042	45049	0 %	0 %	25 %	75 %	357415596
131	NC_016115	ACGG	2	8	45071	45078	25 %	0 %	50 %	25 %	357415596
132	NC_016115	GACG	2	8	45538	45545	25 %	0 %	50 %	25 %	357415596
133	NC_016115	GGGC	2	8	45547	45554	0 %	0 %	75 %	25 %	357415596
134	NC_016115	ACTG	2	8	45707	45714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016115	CGGG	2	8	45774	45781	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
136	NC_016115	GCCG	2	8	45864	45871	0 %	0 %	50 %	50 %	357415597
137	NC_016115	GAGG	2	8	46304	46311	25 %	0 %	75 %	0 %	357415598
138	NC_016115	GTTC	2	8	46403	46410	0 %	50 %	25 %	25 %	357415598
139	NC_016115	CGAC	2	8	47038	47045	25 %	0 %	25 %	50 %	357415598
140	NC_016115	GACC	2	8	47274	47281	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
141	NC_016115	CTCC	2	8	47671	47678	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
142	NC_016115	GGGC	2	8	47740	47747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
143	NC_016115	TGAT	2	8	47832	47839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016115	GGCC	2	8	47994	48001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
145	NC_016115	TTCC	2	8	48527	48534	0 %	50 %	0 %	50 %	357415600
146	NC_016115	CGGG	2	8	50438	50445	0 %	0 %	75 %	25 %	357415603
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.