MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA02

Total Repeats: 133

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016115	TGGC	2	8	343	350	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016115	CGGC	2	8	1530	1537	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016115	CGGG	2	8	1613	1620	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016115	CGCC	2	8	1662	1669	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
5	NC_016115	CACC	2	8	2717	2724	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
6	NC_016115	GCCG	2	8	3092	3099	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016115	GTCG	2	8	3425	3432	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
8	NC_016115	GTGG	2	8	4108	4115	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
9	NC_016115	AGTA	2	8	9163	9170	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_016115	GAAC	2	8	9561	9568	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
11	NC_016115	GCAT	2	8	13550	13557	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
12	NC_016115	CGTT	2	8	13776	13783	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016115	GTCC	2	8	14131	14138	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016115	GCCG	2	8	14356	14363	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
15	NC_016115	CCCG	2	8	14527	14534	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
16	NC_016115	CAGC	2	8	15512	15519	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016115	CGCC	2	8	16232	16239	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
18	NC_016115	CCGG	2	8	16401	16408	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016115	GGCC	2	8	16883	16890	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
20	NC_016115	CGCC	2	8	17105	17112	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
21	NC_016115	CCCG	2	8	17300	17307	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
22	NC_016115	CACC	2	8	17444	17451	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
23	NC_016115	CACC	2	8	17453	17460	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
24	NC_016115	GGAG	2	8	17863	17870	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016115	GAAA	2	8	18247	18254	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016115	CACC	2	8	18472	18479	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
27	NC_016115	GACA	2	8	21154	21161	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
28	NC_016115	GGCG	2	8	23164	23171	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016115	GGGC	2	8	23381	23388	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
30	NC_016115	TCCA	2	8	25596	25603	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016115	GAGC	2	8	25687	25694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
32	NC_016115	AAGC	2	8	28494	28501	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
33	NC_016115	ACAG	2	8	28641	28648	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
34	NC_016115	GGAC	2	8	28681	28688	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
35	NC_016115	TGAG	2	8	29789	29796	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016115	ACTG	2	8	31201	31208	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
37	NC_016115	GCCA	2	8	35871	35878	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
38	NC_016115	CCGC	2	8	36037	36044	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
39	NC_016115	GCAC	2	8	37246	37253	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016115	CCGG	2	8	37420	37427	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
41	NC_016115	TGAA	2	8	37758	37765	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016115	GCCA	2	8	38313	38320	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016115	CAAC	2	8	38667	38674	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
44	NC_016115	CTGA	2	8	38874	38881	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
45	NC_016115	GACG	2	8	39271	39278	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
46	NC_016115	GGGT	2	8	41018	41025	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016115	CGGC	2	8	44826	44833	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016115	ACTG	2	8	45707	45714	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
49	NC_016115	CGGG	2	8	45774	45781	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016115	GACC	2	8	47274	47281	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
51	NC_016115	CTCC	2	8	47671	47678	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
52	NC_016115	GGGC	2	8	47740	47747	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
53	NC_016115	TGAT	2	8	47832	47839	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
54	NC_016115	GGCC	2	8	47994	48001	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016115	GTCA	2	8	50982	50989	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016115	CCCA	2	8	51512	51519	25 %	0 %	0 %	75 %	Non-Coding
57	NC_016115	GCCC	2	8	51892	51899	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
58	NC_016115	GACC	2	8	52176	52183	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016115	CCCG	2	8	52483	52490	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
60	NC_016115	CGCT	2	8	53574	53581	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
61	NC_016115	AACG	2	8	56889	56896	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016115	CGGC	2	8	57140	57147	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
63	NC_016115	CCGG	2	8	57383	57390	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016115	GCCA	2	8	57752	57759	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016115	CGCA	2	8	57843	57850	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016115	CCCT	2	8	57992	57999	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
67	NC_016115	CCCG	2	8	58239	58246	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
68	NC_016115	GAAA	2	8	59490	59497	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016115	CCGT	2	8	59697	59704	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
70	NC_016115	TCCC	2	8	62874	62881	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
71	NC_016115	TGCC	2	8	64730	64737	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016115	GCTC	2	8	64773	64780	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016115	CCGC	2	8	66937	66944	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
74	NC_016115	CCGC	2	8	68028	68035	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
75	NC_016115	ACCG	2	8	68094	68101	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016115	GGGA	2	8	71054	71061	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
77	NC_016115	CCGG	2	8	76370	76377	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016115	CGGC	2	8	76627	76634	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016115	CCGC	2	8	76780	76787	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
80	NC_016115	CCTG	2	8	76886	76893	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
81	NC_016115	GCAG	2	8	77126	77133	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
82	NC_016115	CTGC	2	8	77686	77693	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016115	CTGA	2	8	78484	78491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
84	NC_016115	CCGG	2	8	79232	79239	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
85	NC_016115	CGCA	2	8	79332	79339	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
86	NC_016115	GGCC	2	8	79386	79393	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
87	NC_016115	GCGA	2	8	79526	79533	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016115	AGCC	2	8	82348	82355	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
89	NC_016115	TCCC	2	8	85313	85320	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
90	NC_016115	CGGC	2	8	85409	85416	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
91	NC_016115	CCTG	2	8	86824	86831	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
92	NC_016115	GCAG	2	8	88670	88677	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016115	CCGA	2	8	89549	89556	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016115	GGCT	2	8	89688	89695	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016115	GCCT	2	8	90438	90445	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016115	CCGA	2	8	92866	92873	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
97	NC_016115	TGGG	2	8	93815	93822	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016115	AACC	2	8	93981	93988	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
99	NC_016115	CGGC	2	8	94069	94076	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
100	NC_016115	TGCC	2	8	94213	94220	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
101	NC_016115	GCAC	2	8	94818	94825	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
102	NC_016115	GCCG	2	8	95865	95872	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016115	GCTC	2	8	96164	96171	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016115	TGCG	2	8	96283	96290	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016115	AGGG	2	8	98121	98128	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
106	NC_016115	GCGG	2	8	98177	98184	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016115	GGCT	2	8	98331	98338	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016115	GGGC	2	8	99304	99311	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016115	CGGA	2	8	99328	99335	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
110	NC_016115	AGTT	2	8	105386	105393	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016115	CCGA	2	8	105513	105520	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
112	NC_016115	CGCC	2	8	106723	106730	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
113	NC_016115	TGCC	2	8	108221	108228	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
114	NC_016115	TCCT	2	8	108285	108292	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
115	NC_016115	GAGC	2	8	108960	108967	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
116	NC_016115	CCGC	2	8	110303	110310	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
117	NC_016115	ACTG	2	8	116760	116767	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016115	GTAC	2	8	119386	119393	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
119	NC_016115	CGGT	2	8	119597	119604	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
120	NC_016115	CAAG	2	8	121089	121096	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
121	NC_016115	GCCT	2	8	125374	125381	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016115	GGCA	2	8	125664	125671	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
123	NC_016115	GGGT	2	8	125764	125771	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
124	NC_016115	CCCG	2	8	125862	125869	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
125	NC_016115	TCCC	2	8	126179	126186	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
126	NC_016115	GTCC	2	8	126267	126274	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016115	CCTC	2	8	127228	127235	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
128	NC_016115	CCGT	2	8	127262	127269	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016115	GCGG	2	8	127817	127824	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016115	GGCG	2	8	127835	127842	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016115	CGTT	2	8	128503	128510	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
132	NC_016115	CTGC	2	8	129907	129914	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
133	NC_016115	GCAG	2	8	129928	129935	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.