MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Di-nucleotide Repeats of Streptomyces flavogriseus ATCC 33331 plasmid pSFLA02

Total Repeats: 243

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016115	CA	3	6	5	10	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
2	NC_016115	GT	3	6	774	779	0 %	50 %	50 %	0 %	357415566
3	NC_016115	TC	3	6	787	792	0 %	50 %	0 %	50 %	357415566
4	NC_016115	GC	3	6	1437	1442	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
5	NC_016115	CA	3	6	1691	1696	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016115	GC	3	6	1917	1922	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
7	NC_016115	GC	3	6	3731	3736	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
8	NC_016115	CG	3	6	4302	4307	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
9	NC_016115	GC	3	6	4559	4564	0 %	0 %	50 %	50 %	357415568
10	NC_016115	GT	3	6	4688	4693	0 %	50 %	50 %	0 %	357415568
11	NC_016115	TG	3	6	5162	5167	0 %	50 %	50 %	0 %	357415568
12	NC_016115	CG	3	6	7181	7186	0 %	0 %	50 %	50 %	357415570
13	NC_016115	CT	3	6	7448	7453	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
14	NC_016115	GC	3	6	8274	8279	0 %	0 %	50 %	50 %	357415571
15	NC_016115	TC	3	6	9900	9905	0 %	50 %	0 %	50 %	357415572
16	NC_016115	GT	3	6	9915	9920	0 %	50 %	50 %	0 %	357415572
17	NC_016115	AG	4	8	11063	11070	50 %	0 %	50 %	0 %	357415574
18	NC_016115	CG	3	6	11148	11153	0 %	0 %	50 %	50 %	357415574
19	NC_016115	AG	3	6	11390	11395	50 %	0 %	50 %	0 %	357415574
20	NC_016115	AC	3	6	13249	13254	50 %	0 %	0 %	50 %	357415576
21	NC_016115	AG	3	6	13716	13721	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
22	NC_016115	GC	3	6	14506	14511	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016115	CG	3	6	14760	14765	0 %	0 %	50 %	50 %	357415577
24	NC_016115	CG	3	6	15137	15142	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
25	NC_016115	GA	3	6	15774	15779	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016115	CT	3	6	16266	16271	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016115	CG	3	6	17079	17084	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016115	GC	3	6	19580	19585	0 %	0 %	50 %	50 %	357415578
29	NC_016115	AG	3	6	19650	19655	50 %	0 %	50 %	0 %	357415578
30	NC_016115	GC	3	6	20529	20534	0 %	0 %	50 %	50 %	357415579
31	NC_016115	TC	3	6	21019	21024	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016115	CT	3	6	22209	22214	0 %	50 %	0 %	50 %	357415581
33	NC_016115	AC	3	6	22245	22250	50 %	0 %	0 %	50 %	357415581
34	NC_016115	CG	3	6	22441	22446	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
35	NC_016115	GA	3	6	22517	22522	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_016115	CA	3	6	22581	22586	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
37	NC_016115	TA	3	6	23060	23065	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_016115	TG	3	6	23245	23250	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
39	NC_016115	CG	3	6	23613	23618	0 %	0 %	50 %	50 %	357415582
40	NC_016115	AG	3	6	24036	24041	50 %	0 %	50 %	0 %	357415582
41	NC_016115	GC	3	6	25211	25216	0 %	0 %	50 %	50 %	357415583
42	NC_016115	CG	3	6	25365	25370	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
43	NC_016115	GA	3	6	25480	25485	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016115	CT	3	6	25788	25793	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
45	NC_016115	GC	3	6	25807	25812	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016115	GC	4	8	26269	26276	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
47	NC_016115	GC	3	6	27065	27070	0 %	0 %	50 %	50 %	357415584
48	NC_016115	GC	3	6	27132	27137	0 %	0 %	50 %	50 %	357415584
49	NC_016115	CG	3	6	27559	27564	0 %	0 %	50 %	50 %	357415585
50	NC_016115	GC	3	6	27708	27713	0 %	0 %	50 %	50 %	357415585
51	NC_016115	GC	3	6	28621	28626	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
52	NC_016115	GC	3	6	28706	28711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
53	NC_016115	CG	3	6	28786	28791	0 %	0 %	50 %	50 %	357415586
54	NC_016115	GC	3	6	28867	28872	0 %	0 %	50 %	50 %	357415586
55	NC_016115	GC	3	6	29981	29986	0 %	0 %	50 %	50 %	357415587
56	NC_016115	CG	3	6	30127	30132	0 %	0 %	50 %	50 %	357415587
57	NC_016115	CA	3	6	30501	30506	50 %	0 %	0 %	50 %	357415587
58	NC_016115	GC	3	6	31157	31162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
59	NC_016115	CA	3	6	31910	31915	50 %	0 %	0 %	50 %	357415588
60	NC_016115	GC	3	6	34257	34262	0 %	0 %	50 %	50 %	357415589
61	NC_016115	GA	3	6	35056	35061	50 %	0 %	50 %	0 %	357415589
62	NC_016115	CG	3	6	35278	35283	0 %	0 %	50 %	50 %	357415590
63	NC_016115	TC	3	6	35971	35976	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
64	NC_016115	CG	3	6	36650	36655	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
65	NC_016115	CG	3	6	36961	36966	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
66	NC_016115	GC	3	6	37456	37461	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016115	GA	3	6	38284	38289	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_016115	GC	3	6	38903	38908	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016115	CG	3	6	40476	40481	0 %	0 %	50 %	50 %	357415592
70	NC_016115	CG	3	6	40780	40785	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016115	GC	3	6	40911	40916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
72	NC_016115	AC	3	6	44334	44339	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
73	NC_016115	TA	3	6	44547	44552	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
74	NC_016115	CA	3	6	44566	44571	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
75	NC_016115	AT	3	6	44582	44587	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
76	NC_016115	GC	3	6	45332	45337	0 %	0 %	50 %	50 %	357415596
77	NC_016115	TG	3	6	45752	45757	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016115	TC	3	6	45765	45770	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_016115	GA	3	6	46033	46038	50 %	0 %	50 %	0 %	357415597
80	NC_016115	CA	3	6	46086	46091	50 %	0 %	0 %	50 %	357415597
81	NC_016115	CG	3	6	46103	46108	0 %	0 %	50 %	50 %	357415597
82	NC_016115	TC	3	6	47022	47027	0 %	50 %	0 %	50 %	357415598
83	NC_016115	AG	3	6	47907	47912	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016115	GC	3	6	48548	48553	0 %	0 %	50 %	50 %	357415600
85	NC_016115	CG	3	6	48563	48568	0 %	0 %	50 %	50 %	357415600
86	NC_016115	GT	3	6	48689	48694	0 %	50 %	50 %	0 %	357415600
87	NC_016115	GC	4	8	49120	49127	0 %	0 %	50 %	50 %	357415600
88	NC_016115	TG	3	6	49524	49529	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
89	NC_016115	GC	3	6	50199	50204	0 %	0 %	50 %	50 %	357415602
90	NC_016115	CG	3	6	50764	50769	0 %	0 %	50 %	50 %	357415603
91	NC_016115	TG	3	6	50933	50938	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016115	CA	3	6	52018	52023	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016115	CA	3	6	52300	52305	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
94	NC_016115	CG	3	6	53547	53552	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
95	NC_016115	CG	3	6	54068	54073	0 %	0 %	50 %	50 %	357415605
96	NC_016115	CG	3	6	54763	54768	0 %	0 %	50 %	50 %	357415605
97	NC_016115	CG	3	6	55291	55296	0 %	0 %	50 %	50 %	357415605
98	NC_016115	CG	3	6	55656	55661	0 %	0 %	50 %	50 %	357415605
99	NC_016115	CG	3	6	56182	56187	0 %	0 %	50 %	50 %	357415606
100	NC_016115	GC	3	6	56286	56291	0 %	0 %	50 %	50 %	357415606
101	NC_016115	CG	3	6	56397	56402	0 %	0 %	50 %	50 %	357415606
102	NC_016115	GC	3	6	56417	56422	0 %	0 %	50 %	50 %	357415606
103	NC_016115	GC	3	6	56649	56654	0 %	0 %	50 %	50 %	357415606
104	NC_016115	GA	4	8	57914	57921	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
105	NC_016115	CG	3	6	58166	58171	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016115	GA	3	6	58230	58235	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
107	NC_016115	TC	3	6	58642	58647	0 %	50 %	0 %	50 %	357415607
108	NC_016115	CT	3	6	59056	59061	0 %	50 %	0 %	50 %	357415608
109	NC_016115	GC	3	6	60049	60054	0 %	0 %	50 %	50 %	357415609
110	NC_016115	GA	3	6	60158	60163	50 %	0 %	50 %	0 %	357415609
111	NC_016115	CG	3	6	60209	60214	0 %	0 %	50 %	50 %	357415609
112	NC_016115	GC	4	8	60312	60319	0 %	0 %	50 %	50 %	357415609
113	NC_016115	TG	3	6	61396	61401	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016115	CG	3	6	61435	61440	0 %	0 %	50 %	50 %	357415610
115	NC_016115	GC	3	6	62200	62205	0 %	0 %	50 %	50 %	357415610
116	NC_016115	GC	3	6	62255	62260	0 %	0 %	50 %	50 %	357415610
117	NC_016115	GC	3	6	62510	62515	0 %	0 %	50 %	50 %	357415611
118	NC_016115	CG	3	6	63538	63543	0 %	0 %	50 %	50 %	357415612
119	NC_016115	GC	3	6	63623	63628	0 %	0 %	50 %	50 %	357415612
120	NC_016115	GC	3	6	63652	63657	0 %	0 %	50 %	50 %	357415612
121	NC_016115	CG	3	6	63973	63978	0 %	0 %	50 %	50 %	357415613
122	NC_016115	TG	3	6	64140	64145	0 %	50 %	50 %	0 %	357415613
123	NC_016115	GC	3	6	64422	64427	0 %	0 %	50 %	50 %	357415613
124	NC_016115	AG	4	8	64742	64749	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_016115	GC	3	6	65383	65388	0 %	0 %	50 %	50 %	357415614
126	NC_016115	CT	3	6	65861	65866	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
127	NC_016115	GC	3	6	66141	66146	0 %	0 %	50 %	50 %	357415615
128	NC_016115	CA	3	6	66185	66190	50 %	0 %	0 %	50 %	357415615
129	NC_016115	GC	3	6	66405	66410	0 %	0 %	50 %	50 %	357415615
130	NC_016115	GC	3	6	69070	69075	0 %	0 %	50 %	50 %	357415620
131	NC_016115	GC	3	6	69154	69159	0 %	0 %	50 %	50 %	357415620
132	NC_016115	GC	3	6	69889	69894	0 %	0 %	50 %	50 %	357415620
133	NC_016115	CA	3	6	70105	70110	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
134	NC_016115	GC	3	6	70410	70415	0 %	0 %	50 %	50 %	357415621
135	NC_016115	AC	3	6	70991	70996	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016115	GC	3	6	71009	71014	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
137	NC_016115	GC	3	6	71515	71520	0 %	0 %	50 %	50 %	357415623
138	NC_016115	GC	3	6	72757	72762	0 %	0 %	50 %	50 %	357415623
139	NC_016115	GC	3	6	72918	72923	0 %	0 %	50 %	50 %	357415623
140	NC_016115	GC	3	6	73221	73226	0 %	0 %	50 %	50 %	357415624
141	NC_016115	GC	4	8	73915	73922	0 %	0 %	50 %	50 %	357415625
142	NC_016115	GC	3	6	74129	74134	0 %	0 %	50 %	50 %	357415625
143	NC_016115	CA	3	6	75146	75151	50 %	0 %	0 %	50 %	357415625
144	NC_016115	GC	3	6	76036	76041	0 %	0 %	50 %	50 %	357415626
145	NC_016115	GC	3	6	76157	76162	0 %	0 %	50 %	50 %	357415626
146	NC_016115	CG	4	8	76340	76347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
147	NC_016115	CG	3	6	76911	76916	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
148	NC_016115	GC	3	6	77141	77146	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016115	CG	3	6	77856	77861	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
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©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.