MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Hexa-nucleotide Non-Coding Repeats of Streptomyces cattleya NRRL 8057 plasmid pSCAT

Total Repeats: 135

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016113	TGGGGG	2	12	8512	8523	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016113	CGTGCC	2	12	11300	11311	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
3	NC_016113	CGGGAA	2	12	29172	29183	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
4	NC_016113	CGACGG	2	12	43617	43628	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_016113	GTCCAG	2	12	45052	45063	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_016113	GCCGGG	2	12	51270	51281	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_016113	TGCATG	2	12	52654	52665	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
8	NC_016113	TGCGGG	2	12	54552	54563	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
9	NC_016113	CCGGAC	2	12	55344	55355	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
10	NC_016113	CCGTCC	2	12	66095	66106	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
11	NC_016113	CGTGCG	2	12	69921	69932	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_016113	ACGGTG	2	12	83092	83103	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
13	NC_016113	GCCGGG	2	12	109781	109792	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_016113	GACCGG	2	12	115233	115244	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_016113	GTGTCG	2	12	119412	119423	0 %	33.33 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
16	NC_016113	CGGGCC	2	12	182940	182951	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
17	NC_016113	CTCGGG	2	12	202694	202705	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
18	NC_016113	CCGGGC	2	12	203229	203240	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
19	NC_016113	CCGGTG	2	12	203307	203318	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_016113	GATCGT	2	12	220284	220295	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
21	NC_016113	CGCTCC	2	12	225026	225037	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_016113	TTCCGC	2	12	244793	244804	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
23	NC_016113	GCACCG	2	12	251560	251571	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
24	NC_016113	CGGGGC	2	12	258576	258587	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_016113	GGGTGG	2	12	288073	288084	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016113	GTGGCC	2	12	288214	288225	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
27	NC_016113	GGCCAG	2	12	296068	296079	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_016113	GCCGGA	2	12	301853	301864	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_016113	CCGCCC	2	12	401717	401728	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
30	NC_016113	CTGCGA	2	12	412195	412206	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_016113	CGGGCC	2	12	423121	423132	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
32	NC_016113	CCCCGG	2	12	425660	425671	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
33	NC_016113	GGCCGG	2	12	428898	428909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_016113	GCCGGT	2	12	437077	437088	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
35	NC_016113	CGGGTG	2	12	446523	446534	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
36	NC_016113	GGTACG	2	12	446642	446653	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
37	NC_016113	GGTACG	2	12	446711	446722	16.67 %	16.67 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
38	NC_016113	GTGCCG	2	12	447978	447989	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_016113	CGTTCC	2	12	471896	471907	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
40	NC_016113	CGGGCG	2	12	471947	471958	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_016113	GCGGTG	2	12	476513	476524	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
42	NC_016113	TCCGGG	2	12	476987	476998	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_016113	CTCGGG	2	12	477306	477317	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_016113	CTCGGG	2	12	481781	481792	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016113	TCACCG	2	12	482310	482321	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
46	NC_016113	GCCGTG	2	12	482422	482433	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
47	NC_016113	CCTGCG	3	18	482446	482463	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
48	NC_016113	CGTCCG	2	12	503050	503061	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016113	CGGGCG	2	12	510358	510369	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
50	NC_016113	CGCCCG	2	12	519116	519127	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
51	NC_016113	GGGTCG	2	12	532121	532132	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
52	NC_016113	CCCCGG	2	12	595007	595018	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_016113	GCCGGC	2	12	598380	598391	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
54	NC_016113	ACCCGG	2	12	602001	602012	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
55	NC_016113	GCACCG	2	12	612216	612227	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
56	NC_016113	GGCCGA	2	12	622888	622899	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_016113	CGAGGC	2	12	675280	675291	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
58	NC_016113	GGTGCG	2	12	698023	698034	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
59	NC_016113	CCGGTG	2	12	698064	698075	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
60	NC_016113	GCCGTG	2	12	720155	720166	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_016113	CACGGC	2	12	731315	731326	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
62	NC_016113	TCGTGC	2	12	756284	756295	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
63	NC_016113	GGAGCG	2	12	759850	759861	16.67 %	0 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
64	NC_016113	GTCAAG	2	12	764759	764770	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
65	NC_016113	TGACGA	2	12	770892	770903	33.33 %	16.67 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
66	NC_016113	GGCCCG	2	12	808625	808636	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016113	GGCCCG	2	12	808647	808658	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
68	NC_016113	CTACCG	2	12	811884	811895	16.67 %	16.67 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
69	NC_016113	GCCCTC	2	12	813891	813902	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
70	NC_016113	CCGACC	2	12	879799	879810	16.67 %	0 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
71	NC_016113	TCCACC	2	12	879822	879833	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
72	NC_016113	CTCCAC	2	12	879984	879995	16.67 %	16.67 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_016113	CGTCGG	2	12	880928	880939	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_016113	GGTCGG	2	12	929811	929822	0 %	16.67 %	66.67 %	16.67 %	Non-Coding
75	NC_016113	GCGCCC	2	12	955009	955020	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
76	NC_016113	TGCCGC	2	12	979918	979929	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016113	CGGGCC	2	12	985142	985153	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
78	NC_016113	CGGGGG	2	12	989375	989386	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
79	NC_016113	CCCTCT	2	12	1000782	1000793	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
80	NC_016113	ACGTCA	2	12	1000808	1000819	33.33 %	16.67 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
81	NC_016113	TCCAGG	2	12	1010752	1010763	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_016113	GACACC	4	24	1020629	1020652	33.33 %	0 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
83	NC_016113	CGGCAC	2	12	1020726	1020737	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
84	NC_016113	CCGGGG	2	12	1044611	1044622	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_016113	CCCGGC	2	12	1049482	1049493	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
86	NC_016113	CCGTCC	2	12	1059516	1059527	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
87	NC_016113	GGGTGG	2	12	1069918	1069929	0 %	16.67 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
88	NC_016113	CCCCGT	2	12	1081498	1081509	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
89	NC_016113	CGTGAT	2	12	1081995	1082006	16.67 %	33.33 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
90	NC_016113	CCGGCC	2	12	1083325	1083336	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
91	NC_016113	TCCGGA	2	12	1117420	1117431	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
92	NC_016113	GGGCCC	2	12	1131484	1131495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
93	NC_016113	GACTTC	2	12	1131583	1131594	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
94	NC_016113	CCCCCG	2	12	1144805	1144816	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
95	NC_016113	GGGCCG	2	12	1170264	1170275	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016113	CTCCGC	2	12	1187341	1187352	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
97	NC_016113	ATGAAA	2	12	1198074	1198085	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016113	GGCGCG	2	12	1205093	1205104	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_016113	CCACCC	2	12	1219732	1219743	16.67 %	0 %	0 %	83.33 %	Non-Coding
100	NC_016113	ATGGTT	2	12	1233221	1233232	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
101	NC_016113	CGTAGC	2	12	1233798	1233809	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
102	NC_016113	CGAAGC	2	12	1233846	1233857	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
103	NC_016113	GCCGCG	2	12	1280151	1280162	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016113	GCCGGC	2	12	1280264	1280275	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
105	NC_016113	GCCGTC	2	12	1282849	1282860	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016113	CCCGCG	2	12	1286351	1286362	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
107	NC_016113	GCCCGC	2	12	1296024	1296035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
108	NC_016113	CCGTGG	2	12	1359016	1359027	0 %	16.67 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_016113	CTCGTC	2	12	1359908	1359919	0 %	33.33 %	16.67 %	50 %	Non-Coding
110	NC_016113	CGGCAC	2	12	1398402	1398413	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
111	NC_016113	CTGGTC	3	18	1399856	1399873	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
112	NC_016113	CGGACC	2	12	1405674	1405685	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
113	NC_016113	CGGGGG	2	12	1413180	1413191	0 %	0 %	83.33 %	16.67 %	Non-Coding
114	NC_016113	CCCGCG	2	12	1422467	1422478	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
115	NC_016113	CGTCCC	2	12	1429380	1429391	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
116	NC_016113	GGGGGA	2	12	1467213	1467224	16.67 %	0 %	83.33 %	0 %	Non-Coding
117	NC_016113	CGGACC	2	12	1478912	1478923	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
118	NC_016113	CCGACG	2	12	1546365	1546376	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
119	NC_016113	TCGACG	2	12	1606528	1606539	16.67 %	16.67 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
120	NC_016113	GCTGCC	2	12	1608426	1608437	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
121	NC_016113	CCCGGG	2	12	1611213	1611224	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
122	NC_016113	GCCCCG	2	12	1636697	1636708	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
123	NC_016113	GGCCGG	2	12	1636725	1636736	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_016113	GAGCCG	2	12	1637647	1637658	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
125	NC_016113	CCCGGC	2	12	1640434	1640445	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
126	NC_016113	GCGCGG	2	12	1650230	1650241	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_016113	GCCGAC	2	12	1661335	1661346	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding
128	NC_016113	CCCGGG	2	12	1661846	1661857	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
129	NC_016113	GCCGGA	2	12	1672815	1672826	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_016113	CCGTCC	2	12	1687666	1687677	0 %	16.67 %	16.67 %	66.67 %	Non-Coding
131	NC_016113	AGCGGA	3	18	1690426	1690443	33.33 %	0 %	50 %	16.67 %	Non-Coding
132	NC_016113	GCGGAC	2	12	1692141	1692152	16.67 %	0 %	50 %	33.33 %	Non-Coding
133	NC_016113	CCCGCC	2	12	1703403	1703414	0 %	0 %	16.67 %	83.33 %	Non-Coding
134	NC_016113	GGCGCG	2	12	1743313	1743324	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
135	NC_016113	CAGCCG	2	12	1791179	1791190	16.67 %	0 %	33.33 %	50 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.