MICAS: Microsatellite Analysis Server

Penta-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 702

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
501	NC_016112	ATTAA	2	10	3248843	3248852	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
502	NC_016112	TTTGT	2	10	3253383	3253392	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
503	NC_016112	CTGCC	2	10	3254656	3254665	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
504	NC_016112	TCTTT	2	10	3256639	3256648	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
505	NC_016112	ATTTT	2	10	3256665	3256674	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
506	NC_016112	CTGCC	2	10	3262933	3262942	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
507	NC_016112	TATTT	2	10	3263138	3263147	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
508	NC_016112	TTGCT	2	10	3263325	3263334	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
509	NC_016112	ACCCA	2	10	3263468	3263477	40 %	0 %	0 %	60 %	Non-Coding
510	NC_016112	TTAAG	2	10	3266514	3266523	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
511	NC_016112	CTTAA	2	10	3266622	3266631	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
512	NC_016112	TTAAG	2	10	3304999	3305008	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
513	NC_016112	CTTAA	2	10	3305106	3305115	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
514	NC_016112	TTAAC	2	10	3305432	3305441	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
515	NC_016112	AAACC	2	10	3306094	3306103	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
516	NC_016112	TTAAG	2	10	3324524	3324533	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
517	NC_016112	CTTAA	2	10	3324632	3324641	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
518	NC_016112	GCGGA	2	10	3327611	3327620	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
519	NC_016112	TTGAA	2	10	3329072	3329081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
520	NC_016112	TCGAT	2	10	3332012	3332021	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
521	NC_016112	TTCGA	2	10	3332932	3332941	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
522	NC_016112	TAATT	2	10	3339149	3339158	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
523	NC_016112	TTAAG	2	10	3346933	3346942	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
524	NC_016112	TCGCT	2	10	3354209	3354218	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
525	NC_016112	TGTTT	2	10	3360641	3360650	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
526	NC_016112	ACCCC	2	10	3363158	3363167	20 %	0 %	0 %	80 %	Non-Coding
527	NC_016112	CTTAA	2	10	3372022	3372031	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
528	NC_016112	TAATT	2	10	3375361	3375370	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
529	NC_016112	ATTAG	2	10	3387975	3387984	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
530	NC_016112	TTGTT	2	10	3396888	3396897	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
531	NC_016112	CACCG	2	10	3403743	3403752	20 %	0 %	20 %	60 %	Non-Coding
532	NC_016112	AAAAT	2	10	3433829	3433838	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
533	NC_016112	TTAAG	2	10	3434072	3434081	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
534	NC_016112	AACCA	2	10	3435115	3435124	60 %	0 %	0 %	40 %	Non-Coding
535	NC_016112	CGATC	2	10	3435128	3435137	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
536	NC_016112	AAAGA	2	10	3435167	3435176	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
537	NC_016112	CTTAA	2	10	3443663	3443672	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
538	NC_016112	CGTTA	2	10	3464979	3464988	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
539	NC_016112	TAAGC	2	10	3465657	3465666	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
540	NC_016112	TGGCT	2	10	3465726	3465735	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
541	NC_016112	ATATA	2	10	3486813	3486822	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
542	NC_016112	TTAAG	2	10	3491682	3491691	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
543	NC_016112	CTGCC	2	10	3492025	3492034	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
544	NC_016112	ATAAC	2	10	3494631	3494640	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
545	NC_016112	AATAA	2	10	3505259	3505268	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
546	NC_016112	ATTAC	2	10	3505658	3505667	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
547	NC_016112	CTGCC	2	10	3515052	3515061	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
548	NC_016112	GCGGA	2	10	3537256	3537265	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
549	NC_016112	CTTAA	2	10	3554895	3554904	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
550	NC_016112	TTAAA	2	10	3560051	3560060	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
551	NC_016112	TAAAA	2	10	3560083	3560092	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
552	NC_016112	AATCA	2	10	3565797	3565806	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
553	NC_016112	CTGCC	2	10	3586066	3586075	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
554	NC_016112	TTAAG	2	10	3592037	3592046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
555	NC_016112	CTTAA	2	10	3592145	3592154	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
556	NC_016112	GTAGC	2	10	3594849	3594858	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
557	NC_016112	TTAAG	2	10	3605053	3605062	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
558	NC_016112	CTTAA	2	10	3605096	3605105	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
559	NC_016112	ATTGC	2	10	3605612	3605621	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
560	NC_016112	AGCGG	2	10	3607258	3607267	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
561	NC_016112	GCTAC	2	10	3607306	3607315	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
562	NC_016112	CAAGC	2	10	3609712	3609721	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
563	NC_016112	TCCAG	2	10	3613220	3613229	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
564	NC_016112	AATTA	2	10	3650163	3650172	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
565	NC_016112	ACAGC	2	10	3661875	3661884	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
566	NC_016112	AACCG	2	10	3661935	3661944	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
567	NC_016112	TAGCG	2	10	3667756	3667765	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
568	NC_016112	TTAAG	2	10	3671945	3671954	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
569	NC_016112	CTTAA	2	10	3672053	3672062	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
570	NC_016112	CGCTC	2	10	3676229	3676238	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
571	NC_016112	CCCGC	2	10	3691904	3691913	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
572	NC_016112	TTAAA	2	10	3692273	3692282	60 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
573	NC_016112	AATCG	2	10	3694264	3694273	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
574	NC_016112	GCGGG	2	10	3694388	3694397	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
575	NC_016112	AACCG	2	10	3698565	3698574	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
576	NC_016112	CTCTC	2	10	3709617	3709626	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
577	NC_016112	TTAAG	2	10	3711462	3711471	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
578	NC_016112	GGACG	2	10	3725323	3725332	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
579	NC_016112	TAATC	2	10	3730949	3730958	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
580	NC_016112	CGCTC	2	10	3739136	3739145	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
581	NC_016112	AACCG	2	10	3746716	3746725	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
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583	NC_016112	TTTCA	2	10	3749438	3749447	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
584	NC_016112	TGTGG	2	10	3756184	3756193	0 %	40 %	60 %	0 %	Non-Coding
585	NC_016112	CCCGC	2	10	3756226	3756235	0 %	0 %	20 %	80 %	Non-Coding
586	NC_016112	TCAGC	2	10	3771954	3771963	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
587	NC_016112	CGGTT	2	10	3776715	3776724	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
588	NC_016112	TTCCG	2	10	3776831	3776840	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
589	NC_016112	TTAAG	2	10	3785411	3785420	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
590	NC_016112	CTTAA	2	10	3785519	3785528	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
591	NC_016112	GATTG	2	10	3785642	3785651	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
592	NC_016112	TGTTT	2	10	3785828	3785837	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
593	NC_016112	TTAAG	2	10	3788334	3788343	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
594	NC_016112	CTTAA	2	10	3788442	3788451	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
595	NC_016112	TTGGC	2	10	3794999	3795008	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
596	NC_016112	GTATC	2	10	3796102	3796111	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
597	NC_016112	GCGGG	2	10	3797683	3797692	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
598	NC_016112	CTGTC	2	10	3800714	3800723	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
599	NC_016112	CTTAA	2	10	3802281	3802290	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
600	NC_016112	GCGGG	2	10	3808533	3808542	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
601	NC_016112	GCGGG	2	10	3808653	3808662	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
602	NC_016112	GCGGG	2	10	3808773	3808782	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
603	NC_016112	GCGGG	2	10	3808893	3808902	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
604	NC_016112	CGTTT	2	10	3808922	3808931	0 %	60 %	20 %	20 %	Non-Coding
605	NC_016112	GCGGG	2	10	3809013	3809022	0 %	0 %	80 %	20 %	Non-Coding
606	NC_016112	TTAAG	2	10	3824671	3824680	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
607	NC_016112	CTTAA	2	10	3824779	3824788	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
608	NC_016112	TTAAG	2	10	3828357	3828366	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
609	NC_016112	GGACA	2	10	3829363	3829372	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
610	NC_016112	CATTT	2	10	3829488	3829497	20 %	60 %	0 %	20 %	Non-Coding
611	NC_016112	TTAAG	2	10	3829558	3829567	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
612	NC_016112	AACCG	2	10	3837849	3837858	40 %	0 %	20 %	40 %	Non-Coding
613	NC_016112	GTTTT	2	10	3839529	3839538	0 %	80 %	20 %	0 %	Non-Coding
614	NC_016112	TTTTA	2	10	3841854	3841863	20 %	80 %	0 %	0 %	Non-Coding
615	NC_016112	AGATA	2	10	3845132	3845141	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
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618	NC_016112	ATTTA	2	10	3890474	3890483	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
619	NC_016112	CTTAA	2	10	3891534	3891543	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
620	NC_016112	AAATA	2	10	3915568	3915577	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
621	NC_016112	ATCAA	2	10	3927776	3927785	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
622	NC_016112	TGGAT	2	10	3928087	3928096	20 %	40 %	40 %	0 %	Non-Coding
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624	NC_016112	GTATT	2	10	3942671	3942680	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
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630	NC_016112	CTGCC	2	10	4011116	4011125	0 %	20 %	20 %	60 %	Non-Coding
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639	NC_016112	CTCTC	2	10	4084276	4084285	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
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684	NC_016112	CTTAA	2	10	4492266	4492275	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
685	NC_016112	TTAAG	2	10	4516041	4516050	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
686	NC_016112	CTTAA	2	10	4516148	4516157	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
687	NC_016112	AGTTC	2	10	4520025	4520034	20 %	40 %	20 %	20 %	Non-Coding
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691	NC_016112	TAAGG	2	10	4524219	4524228	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
692	NC_016112	GTTCG	2	10	4554641	4554650	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
693	NC_016112	CCCTT	2	10	4567531	4567540	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
694	NC_016112	TTAAG	2	10	4567746	4567755	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
695	NC_016112	TTAAC	2	10	4567878	4567887	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
696	NC_016112	AGCCT	2	10	4572611	4572620	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
697	NC_016112	GCATC	2	10	4578140	4578149	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
698	NC_016112	GCATG	2	10	4593393	4593402	20 %	20 %	40 %	20 %	Non-Coding
699	NC_016112	TGAAA	2	10	4599223	4599232	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
700	NC_016112	TTAAG	2	10	4636390	4636399	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
701	NC_016112	ATGTT	2	10	4652359	4652368	20 %	60 %	20 %	0 %	Non-Coding
702	NC_016112	AAAAG	2	10	4664402	4664411	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding

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