MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Penta-nucleotide Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 2884

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	AGGCA	2	10	551	560	40 %	0 %	40 %	20 %	357403389
2	NC_016112	AATTT	2	10	3291	3300	40 %	60 %	0 %	0 %	357403391
3	NC_016112	CTTGG	2	10	3662	3671	0 %	40 %	40 %	20 %	357403391
4	NC_016112	ACCGC	2	10	6057	6066	20 %	0 %	20 %	60 %	357403392
5	NC_016112	ACAAG	2	10	6206	6215	60 %	0 %	20 %	20 %	357403392
6	NC_016112	GCAAA	2	10	6266	6275	60 %	0 %	20 %	20 %	357403392
7	NC_016112	CCGCG	2	10	6699	6708	0 %	0 %	40 %	60 %	357403392
8	NC_016112	CCTCA	2	10	7848	7857	20 %	20 %	0 %	60 %	357403394
9	NC_016112	ATGAA	2	10	9036	9045	60 %	20 %	20 %	0 %	357403395
10	NC_016112	TAAAG	2	10	10008	10017	60 %	20 %	20 %	0 %	357403396
11	NC_016112	ATTTT	2	10	10226	10235	20 %	80 %	0 %	0 %	357403396
12	NC_016112	TCAAG	2	10	10532	10541	40 %	20 %	20 %	20 %	357403397
13	NC_016112	ATTGG	2	10	10868	10877	20 %	40 %	40 %	0 %	357403397
14	NC_016112	TGATT	2	10	13757	13766	20 %	60 %	20 %	0 %	357403398
15	NC_016112	CGACT	2	10	15509	15518	20 %	20 %	20 %	40 %	357403399
16	NC_016112	AGTTT	2	10	16595	16604	20 %	60 %	20 %	0 %	357403400
17	NC_016112	GGTAC	2	10	20335	20344	20 %	20 %	40 %	20 %	357403402
18	NC_016112	CAAAG	2	10	21283	21292	60 %	0 %	20 %	20 %	357403403
19	NC_016112	GAGCA	2	10	29681	29690	40 %	0 %	40 %	20 %	357403414
20	NC_016112	GAAAA	2	10	30458	30467	80 %	0 %	20 %	0 %	357403414
21	NC_016112	GACCG	2	10	32987	32996	20 %	0 %	40 %	40 %	357403415
22	NC_016112	GCGCC	2	10	34434	34443	0 %	0 %	40 %	60 %	357403416
23	NC_016112	CCGAC	2	10	35455	35464	20 %	0 %	20 %	60 %	357403418
24	NC_016112	AACCG	2	10	39973	39982	40 %	0 %	20 %	40 %	357403424
25	NC_016112	TACGC	2	10	43924	43933	20 %	20 %	20 %	40 %	357403426
26	NC_016112	GGTCG	2	10	46859	46868	0 %	20 %	60 %	20 %	357403430
27	NC_016112	CCGTT	2	10	48146	48155	0 %	40 %	20 %	40 %	357403432
28	NC_016112	AACTG	2	10	48168	48177	40 %	20 %	20 %	20 %	357403432
29	NC_016112	ATGCG	2	10	48486	48495	20 %	20 %	40 %	20 %	357403432
30	NC_016112	TTCGG	2	10	50894	50903	0 %	40 %	40 %	20 %	357403433
31	NC_016112	TCGAT	2	10	52714	52723	20 %	40 %	20 %	20 %	357403434
32	NC_016112	CAATG	2	10	54389	54398	40 %	20 %	20 %	20 %	357403435
33	NC_016112	CGGCG	2	10	54712	54721	0 %	0 %	60 %	40 %	357403435
34	NC_016112	ATCGA	2	10	56023	56032	40 %	20 %	20 %	20 %	357403436
35	NC_016112	TGGGT	2	10	56434	56443	0 %	40 %	60 %	0 %	357403436
36	NC_016112	TGGTT	2	10	56920	56929	0 %	60 %	40 %	0 %	357403437
37	NC_016112	GCATA	2	10	57832	57841	40 %	20 %	20 %	20 %	357403438
38	NC_016112	CGATC	2	10	58279	58288	20 %	20 %	20 %	40 %	357403438
39	NC_016112	AGGAT	2	10	58797	58806	40 %	20 %	40 %	0 %	357403438
40	NC_016112	TCGTT	2	10	60494	60503	0 %	60 %	20 %	20 %	357403438
41	NC_016112	TGTCG	2	10	60916	60925	0 %	40 %	40 %	20 %	357403438
42	NC_016112	TTTTG	2	10	64943	64952	0 %	80 %	20 %	0 %	357403440
43	NC_016112	TTAAT	2	10	68129	68138	40 %	60 %	0 %	0 %	357403443
44	NC_016112	TGAGT	2	10	72993	73002	20 %	40 %	40 %	0 %	357403448
45	NC_016112	CTTGT	2	10	75389	75398	0 %	60 %	20 %	20 %	357403451
46	NC_016112	GTTTA	2	10	75619	75628	20 %	60 %	20 %	0 %	357403451
47	NC_016112	AGCCG	2	10	79279	79288	20 %	0 %	40 %	40 %	357403454
48	NC_016112	ATCGT	2	10	79987	79996	20 %	40 %	20 %	20 %	357403454
49	NC_016112	AAGGC	2	10	80396	80405	40 %	0 %	40 %	20 %	357403454
50	NC_016112	CCGAT	2	10	83901	83910	20 %	20 %	20 %	40 %	357403457
51	NC_016112	TTGGA	2	10	85725	85734	20 %	40 %	40 %	0 %	357403460
52	NC_016112	TATCA	2	10	85740	85749	40 %	40 %	0 %	20 %	357403460
53	NC_016112	ACCCT	2	10	88243	88252	20 %	20 %	0 %	60 %	357403461
54	NC_016112	ATTTT	2	10	88703	88712	20 %	80 %	0 %	0 %	357403462
55	NC_016112	AAGGC	2	10	90361	90370	40 %	0 %	40 %	20 %	357403464
56	NC_016112	TTGTT	2	10	91406	91415	0 %	80 %	20 %	0 %	357403467
57	NC_016112	GGGCG	2	10	91452	91461	0 %	0 %	80 %	20 %	357403467
58	NC_016112	TTGGC	2	10	92395	92404	0 %	40 %	40 %	20 %	357403469
59	NC_016112	TCGAC	2	10	93486	93495	20 %	20 %	20 %	40 %	357403471
60	NC_016112	ATTAC	2	10	94013	94022	40 %	40 %	0 %	20 %	357403471
61	NC_016112	AAAAG	2	10	98484	98493	80 %	0 %	20 %	0 %	357403477
62	NC_016112	GATCA	2	10	98746	98755	40 %	20 %	20 %	20 %	357403478
63	NC_016112	AAAGG	2	10	101720	101729	60 %	0 %	40 %	0 %	357403480
64	NC_016112	GCCGA	2	10	103786	103795	20 %	0 %	40 %	40 %	357403481
65	NC_016112	TGAGA	2	10	106341	106350	40 %	20 %	40 %	0 %	357403484
66	NC_016112	TCCGG	2	10	106918	106927	0 %	20 %	40 %	40 %	357403484
67	NC_016112	TTTTA	2	10	110089	110098	20 %	80 %	0 %	0 %	357403488
68	NC_016112	TTCAT	2	10	111543	111552	20 %	60 %	0 %	20 %	357403489
69	NC_016112	CGGGC	2	10	111876	111885	0 %	0 %	60 %	40 %	357403489
70	NC_016112	AGTCG	2	10	112841	112850	20 %	20 %	40 %	20 %	357403490
71	NC_016112	GCTTG	2	10	113714	113723	0 %	40 %	40 %	20 %	357403490
72	NC_016112	GAAAA	2	10	114826	114835	80 %	0 %	20 %	0 %	357403492
73	NC_016112	TTAGT	2	10	115044	115053	20 %	60 %	20 %	0 %	357403492
74	NC_016112	ATTTA	2	10	115708	115717	40 %	60 %	0 %	0 %	357403492
75	NC_016112	TTGAA	2	10	116102	116111	40 %	40 %	20 %	0 %	357403492
76	NC_016112	GTTTT	2	10	119900	119909	0 %	80 %	20 %	0 %	357403495
77	NC_016112	CGAGT	2	10	120244	120253	20 %	20 %	40 %	20 %	357403496
78	NC_016112	ATGGT	2	10	120378	120387	20 %	40 %	40 %	0 %	357403496
79	NC_016112	AGTCG	2	10	120809	120818	20 %	20 %	40 %	20 %	357403496
80	NC_016112	AACAA	2	10	122171	122180	80 %	0 %	0 %	20 %	357403498
81	NC_016112	ATCTT	2	10	122401	122410	20 %	60 %	0 %	20 %	357403498
82	NC_016112	GAATT	2	10	123174	123183	40 %	40 %	20 %	0 %	357403498
83	NC_016112	GTGCT	2	10	138032	138041	0 %	40 %	40 %	20 %	357403505
84	NC_016112	CCGCG	2	10	138314	138323	0 %	0 %	40 %	60 %	357403505
85	NC_016112	GATCG	2	10	139489	139498	20 %	20 %	40 %	20 %	357403507
86	NC_016112	GTTTT	2	10	139646	139655	0 %	80 %	20 %	0 %	357403507
87	NC_016112	CTTTT	2	10	141609	141618	0 %	80 %	0 %	20 %	357403510
88	NC_016112	CGGGT	2	10	141795	141804	0 %	20 %	60 %	20 %	357403510
89	NC_016112	GCGTT	2	10	141961	141970	0 %	40 %	40 %	20 %	357403510
90	NC_016112	ACGAT	2	10	142027	142036	40 %	20 %	20 %	20 %	357403510
91	NC_016112	GGCAG	2	10	149452	149461	20 %	0 %	60 %	20 %	357403517
92	NC_016112	CCTTA	2	10	150537	150546	20 %	40 %	0 %	40 %	357403518
93	NC_016112	TTCGA	2	10	153512	153521	20 %	40 %	20 %	20 %	357403521
94	NC_016112	GGCCG	2	10	153637	153646	0 %	0 %	60 %	40 %	357403521
95	NC_016112	AACGC	2	10	153698	153707	40 %	0 %	20 %	40 %	357403521
96	NC_016112	GATTT	2	10	155714	155723	20 %	60 %	20 %	0 %	357403523
97	NC_016112	TGCCG	2	10	158875	158884	0 %	20 %	40 %	40 %	357403526
98	NC_016112	GCGAA	2	10	159411	159420	40 %	0 %	40 %	20 %	357403526
99	NC_016112	GTCAA	2	10	162350	162359	40 %	20 %	20 %	20 %	357403528
100	NC_016112	TGCCA	2	10	165786	165795	20 %	20 %	20 %	40 %	357403530
101	NC_016112	CGGCC	2	10	167486	167495	0 %	0 %	40 %	60 %	357403532
102	NC_016112	CGCGC	2	10	167982	167991	0 %	0 %	40 %	60 %	357403532
103	NC_016112	CAACG	2	10	168121	168130	40 %	0 %	20 %	40 %	357403532
104	NC_016112	CAACG	2	10	170470	170479	40 %	0 %	20 %	40 %	357403534
105	NC_016112	AGTAA	2	10	172091	172100	60 %	20 %	20 %	0 %	357403535
106	NC_016112	AATGC	2	10	173409	173418	40 %	20 %	20 %	20 %	357403536
107	NC_016112	TCGAT	2	10	175847	175856	20 %	40 %	20 %	20 %	357403538
108	NC_016112	ATCAA	2	10	176765	176774	60 %	20 %	0 %	20 %	357403538
109	NC_016112	AGCGA	2	10	176894	176903	40 %	0 %	40 %	20 %	357403538
110	NC_016112	AAATC	2	10	177259	177268	60 %	20 %	0 %	20 %	357403539
111	NC_016112	ATTCA	2	10	179391	179400	40 %	40 %	0 %	20 %	357403540
112	NC_016112	CCCAG	2	10	179584	179593	20 %	0 %	20 %	60 %	357403541
113	NC_016112	ATGCG	2	10	182229	182238	20 %	20 %	40 %	20 %	357403542
114	NC_016112	AAGCC	2	10	182386	182395	40 %	0 %	20 %	40 %	357403542
115	NC_016112	TACAG	2	10	182569	182578	40 %	20 %	20 %	20 %	357403542
116	NC_016112	TTTGA	2	10	184067	184076	20 %	60 %	20 %	0 %	357403543
117	NC_016112	GAGTT	2	10	186237	186246	20 %	40 %	40 %	0 %	357403547
118	NC_016112	GAAAT	2	10	189026	189035	60 %	20 %	20 %	0 %	357403550
119	NC_016112	TTTTG	2	10	189501	189510	0 %	80 %	20 %	0 %	357403551
120	NC_016112	CGCAA	2	10	191030	191039	40 %	0 %	20 %	40 %	357403553
121	NC_016112	TCGAT	2	10	193329	193338	20 %	40 %	20 %	20 %	357403554
122	NC_016112	CGCGG	2	10	194919	194928	0 %	0 %	60 %	40 %	357403555
123	NC_016112	ATTCA	2	10	195493	195502	40 %	40 %	0 %	20 %	357403556
124	NC_016112	AGCGA	2	10	195517	195526	40 %	0 %	40 %	20 %	357403556
125	NC_016112	TGCCG	2	10	197558	197567	0 %	20 %	40 %	40 %	357403558
126	NC_016112	TGATG	2	10	199566	199575	20 %	40 %	40 %	0 %	357403559
127	NC_016112	CGTTG	2	10	202670	202679	0 %	40 %	40 %	20 %	357403565
128	NC_016112	CGCAT	2	10	203752	203761	20 %	20 %	20 %	40 %	357403566
129	NC_016112	TTTCC	2	10	208875	208884	0 %	60 %	0 %	40 %	357403573
130	NC_016112	CGAAA	2	10	208913	208922	60 %	0 %	20 %	20 %	357403573
131	NC_016112	GGACT	2	10	209794	209803	20 %	20 %	40 %	20 %	357403575
132	NC_016112	GCGTG	2	10	209888	209897	0 %	20 %	60 %	20 %	357403575
133	NC_016112	AGCGC	2	10	210681	210690	20 %	0 %	40 %	40 %	357403575
134	NC_016112	TCCGG	2	10	211396	211405	0 %	20 %	40 %	40 %	357403576
135	NC_016112	GCCAT	2	10	214421	214430	20 %	20 %	20 %	40 %	357403578
136	NC_016112	TCAAA	2	10	215142	215151	60 %	20 %	0 %	20 %	357403579
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138	NC_016112	TGAAT	2	10	217708	217717	40 %	40 %	20 %	0 %	357403583
139	NC_016112	GGCGC	2	10	219329	219338	0 %	0 %	60 %	40 %	357403583
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141	NC_016112	GAGTT	2	10	223592	223601	20 %	40 %	40 %	0 %	357403588
142	NC_016112	GTTGG	2	10	224111	224120	0 %	40 %	60 %	0 %	357403589
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148	NC_016112	CAGGC	2	10	229374	229383	20 %	0 %	40 %	40 %	357403592
149	NC_016112	CGAAC	2	10	229983	229992	40 %	0 %	20 %	40 %	357403592
150	NC_016112	AGTCG	2	10	230081	230090	20 %	20 %	40 %	20 %	357403593
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156	NC_016112	CGTTT	2	10	260743	260752	0 %	60 %	20 %	20 %	357403620
157	NC_016112	TCTGA	2	10	260824	260833	20 %	40 %	20 %	20 %	357403620
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174	NC_016112	TTCGA	2	10	279286	279295	20 %	40 %	20 %	20 %	357403636
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178	NC_016112	GTCGG	2	10	282864	282873	0 %	20 %	60 %	20 %	357403639
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199	NC_016112	TCATT	2	10	308898	308907	20 %	60 %	0 %	20 %	357403660
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244	NC_016112	CGATA	2	10	391632	391641	40 %	20 %	20 %	20 %	357403742
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246	NC_016112	GCAAG	2	10	392064	392073	40 %	0 %	40 %	20 %	357403742
247	NC_016112	CGATG	2	10	393114	393123	20 %	20 %	40 %	20 %	357403742
248	NC_016112	TCGCA	2	10	393761	393770	20 %	20 %	20 %	40 %	357403742
249	NC_016112	ACGCC	2	10	395487	395496	20 %	0 %	20 %	60 %	357403743
250	NC_016112	CCGCG	2	10	396779	396788	0 %	0 %	40 %	60 %	357403745
251	NC_016112	GCGAG	2	10	396874	396883	20 %	0 %	60 %	20 %	357403745
252	NC_016112	CGATG	2	10	397065	397074	20 %	20 %	40 %	20 %	357403745
253	NC_016112	GCCGA	2	10	397247	397256	20 %	0 %	40 %	40 %	357403745
254	NC_016112	CCACG	2	10	397698	397707	20 %	0 %	20 %	60 %	357403745
255	NC_016112	GTTTT	2	10	400146	400155	0 %	80 %	20 %	0 %	357403747
256	NC_016112	GCGCG	2	10	401297	401306	0 %	0 %	60 %	40 %	357403748
257	NC_016112	GGTTT	2	10	401490	401499	0 %	60 %	40 %	0 %	357403748
258	NC_016112	AAGCC	2	10	401998	402007	40 %	0 %	20 %	40 %	357403748
259	NC_016112	GCGGG	2	10	405395	405404	0 %	0 %	80 %	20 %	357403751
260	NC_016112	CTCGA	2	10	406601	406610	20 %	20 %	20 %	40 %	357403752
261	NC_016112	GAAGG	2	10	406729	406738	40 %	0 %	60 %	0 %	357403752
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