MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

Tetra-nucleotide Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 12379

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	ATTT	2	8	473	480	25 %	75 %	0 %	0 %	357403389
2	NC_016112	CCAA	2	8	505	512	50 %	0 %	0 %	50 %	357403389
3	NC_016112	ATGC	2	8	612	619	25 %	25 %	25 %	25 %	357403389
4	NC_016112	CGAT	2	8	721	728	25 %	25 %	25 %	25 %	357403389
5	NC_016112	GAAA	2	8	884	891	75 %	0 %	25 %	0 %	357403389
6	NC_016112	TAAT	2	8	1378	1385	50 %	50 %	0 %	0 %	357403389
7	NC_016112	CTGC	2	8	1985	1992	0 %	25 %	25 %	50 %	357403390
8	NC_016112	ATTC	2	8	3344	3351	25 %	50 %	0 %	25 %	357403391
9	NC_016112	GGGC	2	8	3446	3453	0 %	0 %	75 %	25 %	357403391
10	NC_016112	TGCT	2	8	3538	3545	0 %	50 %	25 %	25 %	357403391
11	NC_016112	ATTG	2	8	3563	3570	25 %	50 %	25 %	0 %	357403391
12	NC_016112	CAAA	2	8	3713	3720	75 %	0 %	0 %	25 %	357403391
13	NC_016112	TCCA	2	8	3732	3739	25 %	25 %	0 %	50 %	357403391
14	NC_016112	TCGA	2	8	4488	4495	25 %	25 %	25 %	25 %	357403392
15	NC_016112	CCGA	2	8	4824	4831	25 %	0 %	25 %	50 %	357403392
16	NC_016112	AATT	2	8	4847	4854	50 %	50 %	0 %	0 %	357403392
17	NC_016112	TAAA	2	8	5032	5039	75 %	25 %	0 %	0 %	357403392
18	NC_016112	ATCA	2	8	5223	5230	50 %	25 %	0 %	25 %	357403392
19	NC_016112	GAAC	2	8	7432	7439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016112	ATTG	2	8	7443	7450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
21	NC_016112	ATCG	2	8	7555	7562	25 %	25 %	25 %	25 %	357403394
22	NC_016112	TTAG	2	8	8396	8403	25 %	50 %	25 %	0 %	357403395
23	NC_016112	TTGC	2	8	8537	8544	0 %	50 %	25 %	25 %	357403395
24	NC_016112	CGGT	2	8	8567	8574	0 %	25 %	50 %	25 %	357403395
25	NC_016112	CATG	2	8	8599	8606	25 %	25 %	25 %	25 %	357403395
26	NC_016112	TCGG	2	8	9089	9096	0 %	25 %	50 %	25 %	357403395
27	NC_016112	AATC	2	8	9100	9107	50 %	25 %	0 %	25 %	357403395
28	NC_016112	TTTA	2	8	9239	9246	25 %	75 %	0 %	0 %	357403396
29	NC_016112	ATTG	2	8	10439	10446	25 %	50 %	25 %	0 %	357403397
30	NC_016112	TTTG	2	8	10448	10455	0 %	75 %	25 %	0 %	357403397
31	NC_016112	CGAT	2	8	10501	10508	25 %	25 %	25 %	25 %	357403397
32	NC_016112	CGAT	2	8	10678	10685	25 %	25 %	25 %	25 %	357403397
33	NC_016112	CGAC	2	8	10996	11003	25 %	0 %	25 %	50 %	357403397
34	NC_016112	CGGC	2	8	11940	11947	0 %	0 %	50 %	50 %	357403397
35	NC_016112	GCGG	2	8	11991	11998	0 %	0 %	75 %	25 %	357403397
36	NC_016112	GACG	2	8	12129	12136	25 %	0 %	50 %	25 %	357403397
37	NC_016112	TCAA	2	8	13198	13205	50 %	25 %	0 %	25 %	357403397
38	NC_016112	GCTT	2	8	14078	14085	0 %	50 %	25 %	25 %	357403399
39	NC_016112	CATG	2	8	14241	14248	25 %	25 %	25 %	25 %	357403399
40	NC_016112	ACTG	2	8	14298	14305	25 %	25 %	25 %	25 %	357403399
41	NC_016112	TCAA	2	8	14456	14463	50 %	25 %	0 %	25 %	357403399
42	NC_016112	GCCG	2	8	14553	14560	0 %	0 %	50 %	50 %	357403399
43	NC_016112	GATC	2	8	14685	14692	25 %	25 %	25 %	25 %	357403399
44	NC_016112	ATGG	2	8	14868	14875	25 %	25 %	50 %	0 %	357403399
45	NC_016112	TCAA	2	8	14984	14991	50 %	25 %	0 %	25 %	357403399
46	NC_016112	TGAG	2	8	15242	15249	25 %	25 %	50 %	0 %	357403399
47	NC_016112	CCGG	2	8	15899	15906	0 %	0 %	50 %	50 %	357403399
48	NC_016112	GATC	2	8	16347	16354	25 %	25 %	25 %	25 %	357403399
49	NC_016112	GGCA	2	8	16422	16429	25 %	0 %	50 %	25 %	357403399
50	NC_016112	CCGT	2	8	16627	16634	0 %	25 %	25 %	50 %	357403400
51	NC_016112	TGCG	2	8	16737	16744	0 %	25 %	50 %	25 %	357403400
52	NC_016112	CGGT	2	8	16898	16905	0 %	25 %	50 %	25 %	357403400
53	NC_016112	CAGC	2	8	16990	16997	25 %	0 %	25 %	50 %	357403400
54	NC_016112	TTGG	2	8	17240	17247	0 %	50 %	50 %	0 %	357403400
55	NC_016112	CGCT	2	8	17421	17428	0 %	25 %	25 %	50 %	357403400
56	NC_016112	GTCA	2	8	18095	18102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
57	NC_016112	TAAT	2	8	18128	18135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_016112	GCAT	2	8	19064	19071	25 %	25 %	25 %	25 %	357403402
59	NC_016112	CCGA	2	8	19186	19193	25 %	0 %	25 %	50 %	357403402
60	NC_016112	CGGC	2	8	19304	19311	0 %	0 %	50 %	50 %	357403402
61	NC_016112	ACCG	2	8	19603	19610	25 %	0 %	25 %	50 %	357403402
62	NC_016112	GCGT	2	8	19793	19800	0 %	25 %	50 %	25 %	357403402
63	NC_016112	GCTG	2	8	20706	20713	0 %	25 %	50 %	25 %	357403402
64	NC_016112	CGAA	2	8	20756	20763	50 %	0 %	25 %	25 %	357403402
65	NC_016112	AAGG	2	8	21208	21215	50 %	0 %	50 %	0 %	357403403
66	NC_016112	CGAC	2	8	21862	21869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
67	NC_016112	ATCA	2	8	22092	22099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016112	ACGA	2	8	23926	23933	50 %	0 %	25 %	25 %	357403406
69	NC_016112	CGGA	2	8	24371	24378	25 %	0 %	50 %	25 %	357403407
70	NC_016112	TCAT	2	8	24419	24426	25 %	50 %	0 %	25 %	357403407
71	NC_016112	TTAG	2	8	25562	25569	25 %	50 %	25 %	0 %	357403409
72	NC_016112	ATCG	2	8	25623	25630	25 %	25 %	25 %	25 %	357403409
73	NC_016112	CGAT	2	8	26096	26103	25 %	25 %	25 %	25 %	357403410
74	NC_016112	ATAA	2	8	26482	26489	75 %	25 %	0 %	0 %	357403410
75	NC_016112	GTCG	2	8	26903	26910	0 %	25 %	50 %	25 %	357403411
76	NC_016112	GTTT	2	8	26944	26951	0 %	75 %	25 %	0 %	357403411
77	NC_016112	TGTT	2	8	27329	27336	0 %	75 %	25 %	0 %	357403412
78	NC_016112	CATC	2	8	27650	27657	25 %	25 %	0 %	50 %	357403412
79	NC_016112	TGTT	2	8	27783	27790	0 %	75 %	25 %	0 %	357403413
80	NC_016112	CATA	2	8	28069	28076	50 %	25 %	0 %	25 %	357403413
81	NC_016112	GAAA	2	8	28377	28384	75 %	0 %	25 %	0 %	357403413
82	NC_016112	AAAG	2	8	28411	28418	75 %	0 %	25 %	0 %	357403413
83	NC_016112	TTAG	2	8	28509	28516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016112	CCCG	2	8	28686	28693	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
85	NC_016112	AGCG	2	8	29694	29701	25 %	0 %	50 %	25 %	357403414
86	NC_016112	CGGC	2	8	30324	30331	0 %	0 %	50 %	50 %	357403414
87	NC_016112	CGAA	2	8	30355	30362	50 %	0 %	25 %	25 %	357403414
88	NC_016112	ATGA	2	8	31052	31059	50 %	25 %	25 %	0 %	357403414
89	NC_016112	GATG	2	8	31402	31409	25 %	25 %	50 %	0 %	357403414
90	NC_016112	CCAA	2	8	32219	32226	50 %	0 %	0 %	50 %	357403415
91	NC_016112	CGAA	2	8	32339	32346	50 %	0 %	25 %	25 %	357403415
92	NC_016112	TGAA	2	8	32756	32763	50 %	25 %	25 %	0 %	357403415
93	NC_016112	GCCT	2	8	32855	32862	0 %	25 %	25 %	50 %	357403415
94	NC_016112	CAGA	2	8	33143	33150	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016112	TTCC	2	8	33440	33447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
96	NC_016112	AAAT	2	8	33853	33860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016112	AATA	2	8	34194	34201	75 %	25 %	0 %	0 %	357403416
98	NC_016112	ATTG	2	8	34372	34379	25 %	50 %	25 %	0 %	357403416
99	NC_016112	TCGG	2	8	35115	35122	0 %	25 %	50 %	25 %	357403417
100	NC_016112	TCGT	2	8	35712	35719	0 %	50 %	25 %	25 %	357403418
101	NC_016112	GGTT	2	8	35913	35920	0 %	50 %	50 %	0 %	357403419
102	NC_016112	GTAA	2	8	36194	36201	50 %	25 %	25 %	0 %	357403419
103	NC_016112	GATA	2	8	36460	36467	50 %	25 %	25 %	0 %	357403420
104	NC_016112	ACGG	2	8	37061	37068	25 %	0 %	50 %	25 %	357403420
105	NC_016112	TGCC	2	8	37074	37081	0 %	25 %	25 %	50 %	357403420
106	NC_016112	ATTG	2	8	37625	37632	25 %	50 %	25 %	0 %	357403420
107	NC_016112	CGGA	2	8	38152	38159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016112	GATC	2	8	38320	38327	25 %	25 %	25 %	25 %	357403422
109	NC_016112	ATGG	2	8	39112	39119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016112	ATTT	2	8	39262	39269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
111	NC_016112	TGCA	2	8	39484	39491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
112	NC_016112	TCGA	2	8	39646	39653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
113	NC_016112	TCCA	2	8	39824	39831	25 %	25 %	0 %	50 %	357403424
114	NC_016112	TTGA	2	8	39856	39863	25 %	50 %	25 %	0 %	357403424
115	NC_016112	CGGC	2	8	40040	40047	0 %	0 %	50 %	50 %	357403424
116	NC_016112	GGCA	2	8	40080	40087	25 %	0 %	50 %	25 %	357403424
117	NC_016112	GCCG	2	8	40281	40288	0 %	0 %	50 %	50 %	357403424
118	NC_016112	ATCG	2	8	40294	40301	25 %	25 %	25 %	25 %	357403424
119	NC_016112	TTTA	2	8	41152	41159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
120	NC_016112	CGGC	2	8	41606	41613	0 %	0 %	50 %	50 %	357403425
121	NC_016112	GAAT	2	8	41945	41952	50 %	25 %	25 %	0 %	357403425
122	NC_016112	TTCG	2	8	42237	42244	0 %	50 %	25 %	25 %	357403425
123	NC_016112	GGAC	2	8	42769	42776	25 %	0 %	50 %	25 %	357403425
124	NC_016112	CATC	3	12	42786	42797	25 %	25 %	0 %	50 %	357403425
125	NC_016112	TTTC	2	8	42831	42838	0 %	75 %	0 %	25 %	357403425
126	NC_016112	ACCA	2	8	43000	43007	50 %	0 %	0 %	50 %	357403425
127	NC_016112	CGAT	2	8	43508	43515	25 %	25 %	25 %	25 %	357403425
128	NC_016112	GATT	2	8	43535	43542	25 %	50 %	25 %	0 %	357403425
129	NC_016112	GATC	2	8	43608	43615	25 %	25 %	25 %	25 %	357403425
130	NC_016112	GGGT	2	8	43981	43988	0 %	25 %	75 %	0 %	357403426
131	NC_016112	CGAC	2	8	44213	44220	25 %	0 %	25 %	50 %	357403427
132	NC_016112	ATGG	2	8	44401	44408	25 %	25 %	50 %	0 %	357403427
133	NC_016112	TTGA	2	8	44525	44532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016112	TCAT	2	8	44601	44608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016112	TACT	2	8	44724	44731	25 %	50 %	0 %	25 %	357403428
136	NC_016112	CATC	2	8	45681	45688	25 %	25 %	0 %	50 %	357403429
137	NC_016112	CGAC	2	8	45935	45942	25 %	0 %	25 %	50 %	357403429
138	NC_016112	GATT	2	8	45969	45976	25 %	50 %	25 %	0 %	357403429
139	NC_016112	AATG	2	8	46300	46307	50 %	25 %	25 %	0 %	357403429
140	NC_016112	CGAT	2	8	46515	46522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
141	NC_016112	TCGA	2	8	46959	46966	25 %	25 %	25 %	25 %	357403430
142	NC_016112	CAAA	2	8	47060	47067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
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