MICAS: Microsatellite Analysis Server

Tetra-nucleotide Non-Coding Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 2276

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	GAAC	2	8	7432	7439	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
2	NC_016112	ATTG	2	8	7443	7450	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016112	GTCA	2	8	18095	18102	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4	NC_016112	TAAT	2	8	18128	18135	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_016112	CGAC	2	8	21862	21869	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
6	NC_016112	ATCA	2	8	22092	22099	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
7	NC_016112	TTAG	2	8	28509	28516	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
8	NC_016112	CCCG	2	8	28686	28693	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
9	NC_016112	CAGA	2	8	33143	33150	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
10	NC_016112	TTCC	2	8	33440	33447	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
11	NC_016112	AAAT	2	8	33853	33860	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_016112	CGGA	2	8	38152	38159	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
13	NC_016112	ATGG	2	8	39112	39119	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_016112	ATTT	2	8	39262	39269	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_016112	TGCA	2	8	39484	39491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
16	NC_016112	TCGA	2	8	39646	39653	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
17	NC_016112	TTTA	2	8	41152	41159	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_016112	TTGA	2	8	44525	44532	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
19	NC_016112	TCAT	2	8	44601	44608	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
20	NC_016112	CGAT	2	8	46515	46522	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
21	NC_016112	CAAA	2	8	47060	47067	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
22	NC_016112	TCGA	2	8	47372	47379	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
23	NC_016112	AAGC	2	8	50372	50379	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
24	NC_016112	ATGG	2	8	51542	51549	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016112	AATT	2	8	51693	51700	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_016112	CCAT	2	8	51794	51801	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
27	NC_016112	CCAT	2	8	57342	57349	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
28	NC_016112	CATT	2	8	57431	57438	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
29	NC_016112	TCCA	2	8	66512	66519	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
30	NC_016112	TCCA	2	8	66553	66560	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
31	NC_016112	TAGG	2	8	73141	73148	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
32	NC_016112	ATGG	2	8	75020	75027	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
33	NC_016112	ATGG	2	8	75069	75076	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
34	NC_016112	AATG	2	8	77474	77481	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
35	NC_016112	CCAT	2	8	77551	77558	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
36	NC_016112	TTAT	2	8	77722	77729	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_016112	ATCA	2	8	77804	77811	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
38	NC_016112	TCGA	2	8	84869	84876	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
39	NC_016112	TTTA	2	8	85530	85537	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_016112	AGTC	2	8	87516	87523	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
41	NC_016112	ATGG	2	8	91184	91191	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
42	NC_016112	TAGG	2	8	94981	94988	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
43	NC_016112	TTAA	2	8	95101	95108	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016112	TTAG	2	8	97084	97091	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
45	NC_016112	TGAG	2	8	100898	100905	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016112	ATTG	2	8	105363	105370	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016112	GAGT	2	8	110978	110985	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
48	NC_016112	ATCC	2	8	112459	112466	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
49	NC_016112	GGTC	2	8	116252	116259	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
50	NC_016112	ACGA	2	8	117867	117874	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
51	NC_016112	TGGT	2	8	120919	120926	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
52	NC_016112	TTTG	2	8	121706	121713	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
53	NC_016112	GCGG	2	8	122105	122112	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
54	NC_016112	GAAA	2	8	124102	124109	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
55	NC_016112	GCGT	2	8	124991	124998	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
56	NC_016112	GGAA	2	8	125125	125132	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
57	NC_016112	TACC	2	8	125399	125406	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
58	NC_016112	GTAG	2	8	125853	125860	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_016112	GCCT	2	8	126201	126208	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
60	NC_016112	AACT	2	8	126704	126711	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
61	NC_016112	GCGA	2	8	126860	126867	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
62	NC_016112	AAAG	2	8	127969	127976	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
63	NC_016112	CTGT	2	8	128329	128336	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
64	NC_016112	TGAT	2	8	128434	128441	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
65	NC_016112	GGTG	2	8	128506	128513	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
66	NC_016112	AGCG	2	8	130094	130101	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
67	NC_016112	GTTC	2	8	134029	134036	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
68	NC_016112	TGGG	2	8	134159	134166	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
69	NC_016112	TCAA	2	8	134290	134297	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
70	NC_016112	TCCT	2	8	134892	134899	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
71	NC_016112	AAAT	2	8	144419	144426	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_016112	GATT	2	8	156153	156160	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
73	NC_016112	CGAA	2	8	163719	163726	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
74	NC_016112	TACA	2	8	163754	163761	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
75	NC_016112	CCAG	2	8	163830	163837	25 %	0 %	25 %	50 %	Non-Coding
76	NC_016112	CAAC	2	8	164226	164233	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
77	NC_016112	GAAT	2	8	164345	164352	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
78	NC_016112	AATC	2	8	164560	164567	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
79	NC_016112	CATA	2	8	164715	164722	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
80	NC_016112	ACGG	2	8	168949	168956	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
81	NC_016112	TTAT	2	8	169213	169220	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
82	NC_016112	AAGC	2	8	169359	169366	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
83	NC_016112	AATA	2	8	172393	172400	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_016112	AGCG	2	8	172687	172694	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
85	NC_016112	TTGA	2	8	174117	174124	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
86	NC_016112	TTCG	2	8	174944	174951	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
87	NC_016112	GACT	2	8	177232	177239	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
88	NC_016112	GTCG	2	8	178322	178329	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
89	NC_016112	ATCA	2	8	180690	180697	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
90	NC_016112	ATTT	2	8	186417	186424	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_016112	ATGG	2	8	188135	188142	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
92	NC_016112	TCGA	2	8	188307	188314	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
93	NC_016112	CTTT	2	8	188922	188929	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
94	NC_016112	GCTT	2	8	188960	188967	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
95	NC_016112	ATTT	2	8	188999	189006	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_016112	AATT	2	8	193905	193912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016112	AATA	2	8	196233	196240	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_016112	ATCG	2	8	196937	196944	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
99	NC_016112	TGAA	2	8	197214	197221	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
100	NC_016112	GATC	2	8	197389	197396	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
101	NC_016112	AAAC	2	8	198184	198191	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
102	NC_016112	GCCG	2	8	198827	198834	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
103	NC_016112	CATC	2	8	198872	198879	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
104	NC_016112	TCTT	2	8	199126	199133	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
105	NC_016112	TTCC	2	8	199395	199402	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_016112	GCAG	2	8	200786	200793	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
107	NC_016112	TTCA	2	8	204304	204311	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
108	NC_016112	CAAG	2	8	204328	204335	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
109	NC_016112	GATA	2	8	204351	204358	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
110	NC_016112	ATGC	2	8	206195	206202	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_016112	ATAA	2	8	206346	206353	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_016112	AATA	2	8	209138	209145	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016112	ATTT	2	8	211754	211761	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_016112	GACA	2	8	211946	211953	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
115	NC_016112	TTTA	2	8	212809	212816	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_016112	CTCG	3	12	220659	220670	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
117	NC_016112	TCTT	2	8	220676	220683	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
118	NC_016112	TAAA	2	8	221756	221763	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
119	NC_016112	CCAT	2	8	226410	226417	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
120	NC_016112	AAAT	2	8	230780	230787	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
121	NC_016112	ATGG	2	8	231635	231642	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
122	NC_016112	TTGA	2	8	234001	234008	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
123	NC_016112	TCCA	2	8	234054	234061	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
124	NC_016112	CCTT	2	8	235392	235399	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
125	NC_016112	TAAG	2	8	240824	240831	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
126	NC_016112	TTGA	2	8	240898	240905	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
127	NC_016112	TGCA	2	8	240930	240937	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
128	NC_016112	TAAA	2	8	241121	241128	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
129	NC_016112	CTTT	2	8	245691	245698	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
130	NC_016112	AAAC	2	8	245748	245755	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
131	NC_016112	ATGG	2	8	246821	246828	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
132	NC_016112	AAAC	2	8	247476	247483	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
133	NC_016112	GGAG	2	8	247797	247804	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
134	NC_016112	CGTT	2	8	248128	248135	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
135	NC_016112	GCCG	2	8	249714	249721	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
136	NC_016112	GACT	2	8	250805	250812	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
137	NC_016112	GACG	2	8	252704	252711	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
138	NC_016112	CTTT	2	8	252712	252719	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
139	NC_016112	TGCT	2	8	253023	253030	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
140	NC_016112	TAAT	2	8	253139	253146	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_016112	CCAT	2	8	253803	253810	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
142	NC_016112	TCAC	2	8	256006	256013	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
143	NC_016112	GTAT	2	8	256416	256423	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
144	NC_016112	CAAT	2	8	257111	257118	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
145	NC_016112	ATGG	2	8	259951	259958	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_016112	GTCG	2	8	260009	260016	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
147	NC_016112	AGGG	2	8	264114	264121	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
148	NC_016112	CCAT	2	8	267090	267097	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
149	NC_016112	ATGG	2	8	268299	268306	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
150	NC_016112	GTTT	2	8	270508	270515	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
151	NC_016112	ATGG	2	8	276701	276708	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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189	NC_016112	ATGG	2	8	346376	346383	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
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