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Tri-nucleotide Repeats of Methylomicrobium alcaliphilum chromosome

Total Repeats: 55582

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_016112	GAT	2	6	41	46	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
2	NC_016112	ATA	2	6	117	122	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_016112	TCT	2	6	144	149	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_016112	AAT	2	6	152	157	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403389
5	NC_016112	AAC	2	6	171	176	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403389
6	NC_016112	TTC	2	6	203	208	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403389
7	NC_016112	TTA	2	6	270	275	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
8	NC_016112	CAT	2	6	312	317	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403389
9	NC_016112	TAA	2	6	464	469	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403389
10	NC_016112	TTA	2	6	570	575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
11	NC_016112	ACA	2	6	710	715	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403389
12	NC_016112	GAG	2	6	748	753	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403389
13	NC_016112	AAG	2	6	808	813	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403389
14	NC_016112	GTT	2	6	836	841	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403389
15	NC_016112	TCG	2	6	892	897	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403389
16	NC_016112	ATG	2	6	999	1004	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403389
17	NC_016112	ACG	2	6	1088	1093	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403389
18	NC_016112	CAC	2	6	1130	1135	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403389
19	NC_016112	AAG	2	6	1147	1152	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403389
20	NC_016112	TCG	2	6	1251	1256	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403389
21	NC_016112	CAC	2	6	1370	1375	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403389
22	NC_016112	CCT	2	6	1402	1407	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	357403389
23	NC_016112	ATT	2	6	1438	1443	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403389
24	NC_016112	AGA	2	6	1508	1513	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
25	NC_016112	GCA	2	6	1699	1704	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403390
26	NC_016112	TTG	2	6	1895	1900	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403390
27	NC_016112	CGA	2	6	1933	1938	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403390
28	NC_016112	ATC	2	6	2028	2033	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
29	NC_016112	TAT	2	6	2111	2116	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
30	NC_016112	ATC	2	6	2234	2239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
31	NC_016112	GAT	2	6	2279	2284	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403390
32	NC_016112	TAA	2	6	2317	2322	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403390
33	NC_016112	AAT	2	6	2339	2344	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403390
34	NC_016112	TCA	2	6	2401	2406	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403390
35	NC_016112	TTA	2	6	2441	2446	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
36	NC_016112	TTC	2	6	2512	2517	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403390
37	NC_016112	GAA	2	6	2555	2560	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403390
38	NC_016112	GAA	3	9	2564	2572	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403390
39	NC_016112	TGC	2	6	2693	2698	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403390
40	NC_016112	ATT	2	6	2699	2704	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403390
41	NC_016112	CGG	2	6	2950	2955	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
42	NC_016112	GCC	2	6	2964	2969	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
43	NC_016112	ATT	2	6	3124	3129	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_016112	CAA	2	6	3141	3146	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
45	NC_016112	TTG	2	6	3157	3162	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
46	NC_016112	TAA	2	6	3207	3212	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_016112	GCA	2	6	3454	3459	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403391
48	NC_016112	AGA	2	6	3612	3617	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403391
49	NC_016112	AAT	2	6	3747	3752	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403391
50	NC_016112	ATT	2	6	3871	3876	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403391
51	NC_016112	GAT	2	6	3918	3923	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403391
52	NC_016112	ATT	2	6	4076	4081	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403391
53	NC_016112	GAT	2	6	4119	4124	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403391
54	NC_016112	CTG	2	6	4129	4134	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403391
55	NC_016112	GTA	2	6	4328	4333	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
56	NC_016112	CAT	2	6	4458	4463	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
57	NC_016112	GTG	2	6	4476	4481	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403392
58	NC_016112	AAG	2	6	4519	4524	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
59	NC_016112	TTA	2	6	4531	4536	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403392
60	NC_016112	ATG	2	6	4543	4548	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
61	NC_016112	GAC	2	6	4566	4571	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
62	NC_016112	TCA	2	6	4627	4632	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
63	NC_016112	TGC	2	6	4639	4644	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
64	NC_016112	CGG	2	6	4649	4654	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
65	NC_016112	GAG	2	6	4731	4736	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	357403392
66	NC_016112	GGC	2	6	5004	5009	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
67	NC_016112	AAG	2	6	5086	5091	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
68	NC_016112	AAT	2	6	5157	5162	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403392
69	NC_016112	CGG	2	6	5177	5182	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
70	NC_016112	CGA	2	6	5272	5277	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
71	NC_016112	TGA	2	6	5282	5287	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
72	NC_016112	CGA	2	6	5398	5403	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
73	NC_016112	ATC	2	6	5469	5474	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
74	NC_016112	CGG	2	6	5626	5631	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
75	NC_016112	TCG	2	6	5657	5662	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
76	NC_016112	AGA	2	6	5738	5743	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
77	NC_016112	CAT	4	12	5822	5833	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
78	NC_016112	TTC	2	6	5883	5888	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403392
79	NC_016112	ATC	2	6	5907	5912	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403392
80	NC_016112	CCG	2	6	5940	5945	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
81	NC_016112	AAG	2	6	5958	5963	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403392
82	NC_016112	TGC	2	6	6040	6045	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403392
83	NC_016112	CGA	2	6	6050	6055	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
84	NC_016112	ACG	2	6	6148	6153	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
85	NC_016112	AAC	2	6	6166	6171	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403392
86	NC_016112	CGA	2	6	6194	6199	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
87	NC_016112	GGC	2	6	6224	6229	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403392
88	NC_016112	TTC	2	6	6381	6386	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403392
89	NC_016112	CCG	2	6	6430	6435	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
90	NC_016112	GAT	2	6	6515	6520	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403392
91	NC_016112	GCC	2	6	6616	6621	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
92	NC_016112	CGC	2	6	6653	6658	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403392
93	NC_016112	CGA	2	6	6659	6664	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403392
94	NC_016112	CTG	2	6	6867	6872	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
95	NC_016112	CAA	2	6	6910	6915	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
96	NC_016112	AGA	2	6	6972	6977	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
97	NC_016112	ACA	2	6	6987	6992	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
98	NC_016112	GAA	2	6	7125	7130	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
99	NC_016112	GCA	2	6	7263	7268	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403393
100	NC_016112	CAT	2	6	7306	7311	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403393
101	NC_016112	ATC	2	6	7380	7385	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403393
102	NC_016112	TTG	2	6	7389	7394	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403393
103	NC_016112	GCA	2	6	7403	7408	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403393
104	NC_016112	CCA	2	6	7472	7477	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
105	NC_016112	CGA	2	6	7591	7596	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
106	NC_016112	CGC	2	6	7639	7644	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403394
107	NC_016112	ACG	3	9	7647	7655	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
108	NC_016112	ACG	2	6	7715	7720	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403394
109	NC_016112	CTG	2	6	7721	7726	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403394
110	NC_016112	CCG	2	6	7817	7822	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403394
111	NC_016112	CAC	2	6	7869	7874	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403394
112	NC_016112	GTT	2	6	7928	7933	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
113	NC_016112	CTG	2	6	7946	7951	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
114	NC_016112	TGC	2	6	8012	8017	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
115	NC_016112	CTG	2	6	8018	8023	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
116	NC_016112	TCG	2	6	8058	8063	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	357403395
117	NC_016112	AGT	2	6	8278	8283	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403395
118	NC_016112	CAG	2	6	8350	8355	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403395
119	NC_016112	TTG	2	6	8555	8560	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403395
120	NC_016112	CAA	2	6	8818	8823	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403395
121	NC_016112	CGG	2	6	8878	8883	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403395
122	NC_016112	CCG	2	6	9030	9035	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403395
123	NC_016112	GAA	2	6	9056	9061	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	357403395
124	NC_016112	ATT	2	6	9115	9120	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403395
125	NC_016112	CAA	2	6	9140	9145	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403395
126	NC_016112	GCG	2	6	9305	9310	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403396
127	NC_016112	CCG	2	6	9478	9483	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403396
128	NC_016112	TAT	2	6	9495	9500	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
129	NC_016112	ATT	2	6	9570	9575	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
130	NC_016112	ATT	2	6	9597	9602	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
131	NC_016112	GCA	2	6	9681	9686	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403396
132	NC_016112	ATT	2	6	9694	9699	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	357403396
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256	NC_016112	CTG	2	6	18352	18357	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
257	NC_016112	TCA	2	6	18550	18555	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
258	NC_016112	ATA	2	6	18632	18637	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403402
259	NC_016112	GAT	2	6	18645	18650	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	357403402
260	NC_016112	CGA	2	6	18666	18671	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
261	NC_016112	CGC	2	6	18733	18738	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
262	NC_016112	GCA	2	6	18763	18768	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
263	NC_016112	CCA	2	6	18835	18840	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403402
264	NC_016112	CCG	2	6	18862	18867	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
265	NC_016112	AAC	2	6	19037	19042	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403402
266	NC_016112	ACG	2	6	19058	19063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
267	NC_016112	CGC	2	6	19212	19217	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
268	NC_016112	CCG	2	6	19293	19298	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
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270	NC_016112	TTG	2	6	19507	19512	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	357403402
271	NC_016112	ATC	2	6	19612	19617	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403402
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273	NC_016112	TTC	2	6	19633	19638	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	357403402
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275	NC_016112	GCG	2	6	19838	19843	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403402
276	NC_016112	CCG	2	6	20020	20025	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
277	NC_016112	CGA	2	6	20058	20063	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
278	NC_016112	ACG	3	9	20168	20176	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
279	NC_016112	GCC	2	6	20290	20295	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	357403402
280	NC_016112	CGA	2	6	20309	20314	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	357403402
281	NC_016112	TAA	2	6	20409	20414	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	357403402
282	NC_016112	ATC	2	6	20461	20466	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403402
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286	NC_016112	ACC	2	6	20770	20775	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	357403402
287	NC_016112	GTG	2	6	20779	20784	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403402
288	NC_016112	GCG	2	6	20876	20881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403402
289	NC_016112	GGT	2	6	20907	20912	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	357403402
290	NC_016112	CAA	2	6	20916	20921	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	357403402
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297	NC_016112	CGG	2	6	21876	21881	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
298	NC_016112	CTA	2	6	21933	21938	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
299	NC_016112	GCC	2	6	21965	21970	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
300	NC_016112	CTC	2	6	22032	22037	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
301	NC_016112	TGA	2	6	22057	22062	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
302	NC_016112	AAG	2	6	22103	22108	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
303	NC_016112	CAT	2	6	22244	22249	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	357403405
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320	NC_016112	GTT	2	6	23320	23325	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
321	NC_016112	GCG	2	6	23424	23429	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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332	NC_016112	CGG	2	6	24217	24222	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	357403406
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500	NC_016112	CCT	2	6	39388	39393	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding

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